EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-00244 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr1:42595080-42598750 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gfi1bMA0483.1chr1:42595477-42595488AGCTGTGATTT-6.14
Nkx3-2MA0122.3chr1:42597226-42597239ATTAAGTGGTAAT-6.07
RFX3MA0798.1chr1:42597262-42597278GGTTTCCACGGCAACC-6.01
RFX5MA0510.2chr1:42597262-42597278GGTTTCCACGGCAACC-6.03
RREB1MA0073.1chr1:42598365-42598385TGGGTGGGGGTGGGGGGGGA-6.45
SP2MA0516.2chr1:42596286-42596303ACAAGCCCCCCCCCCCC+6.33
STAT1MA0137.3chr1:42595700-42595711TTTCTGGGAAA+6.02
STAT3MA0144.2chr1:42595700-42595711TTTCTGGGAAA+6.32
ZNF740MA0753.2chr1:42596291-42596304CCCCCCCCCCCCC+6.03
Enhancer Sequence
AGAACCCTGG GAAGTTGGTG TTACAGGTGT GAGCCTTTTA ACATGGGTAC TAAAACAGAA 60
ACTGAGATTC TCTGCCAAAG AGGAGTACGC TCTCAAACAC TGAACCATCT TCTGGTCCCT 120
GTGAATTAAC ATTATTAGAA AACACGTGCT CAGATTTATC CAGCCATGGA GTAGGGGAAA 180
AAAAAAAAAC ACGCAACAGA AGAATCATTA TGGTCCCCAC CCAACACCTA GCTCGTCACA 240
GTTCAAAAGC TATCAAGGCC TGTGCCCAGA TGCTTCGGGT CCAGGGCACT GGGAAGGAAT 300
AATTTGACTA GGTCCACACC AGGGTAATGG AAAGCCCAGA ATTTTACCTC TGGAATTTAC 360
TCATACTTTG TCCCTAAAGT CACATGTTCC TAAAGACAGC TGTGATTTTC GTGTGTCAAA 420
TGCAGTGACA ACATGATCCT GCCACTCCGT ACTGCCACAC CTACTGCAGT GGCCTTGCTG 480
TCCCTGATGG AAACTGAGCG CCAAGCAGCA GGTTTCTCCT GCTCCCGTTG ACTTGTTAGA 540
GTCTACCTTG GCTCAGCTTG TCTAGGCCTG GGGTTTGCAC TCAAGCATCT GTCCTTTGTC 600
CCATGACTTC CTGGAGTGGC TTTCTGGGAA AATGTCATCA GCGATGTTGA TTTCCTGTCT 660
TCTCATCACT GGATCTGGGA GGTGGATTCT CTTCACACTG GGTTTTGTTT TTTTGGTTTT 720
TGGTTTTGTT TTTTTTTTTT AATCTGAAGA ATGCACAGGA GCCTCTTGCC TTGTAATACA 780
CAGTCTGTCT CATTCATAAA ATCTTGTCCT GGAAAAAGCC TCATTCATTC CCACAGAAGA 840
GCCGCAGTTG GGAGGGCAAG GGCATTCAAA ACCTTGGGAG ATAGGAGACA ATAGCGGAGC 900
GCTTGGCAGC CGCTCCTGGG CGGCGTTAGC AACGTGTACC GACGCCAGGG AGAGGATAAA 960
ACGCTGTAGT TATTTACTTG TCTCTTAGGA GCAAAAGAGT CTCTTTGCCT CTAATATAGA 1020
TGCCAAATCC TCAGGACCCA AGCGAGGAAA TGATGAGCTG TGCGGAGGAT TGGCACGAAG 1080
TCCTGTGCTC CGAGATAGTG AGGCATTTTG CTTGAAAGCA TCCGTTGTTT AAAGAGAAAA 1140
CGAGAATTGT GGGATTTTGT TGTCAATCAA GGGTCAGCAG CTTCCTCTCC CACTGGACGC 1200
TCACACACAA GCCCCCCCCC CCCCAACACC CGGACCCTCC TCCCCCATCC TGCCAGAAAG 1260
CCAGGCTGTC CTGTTCCTTG GCCACCAAAG GCCAAGGCTT CCCTTGCAGA ATCTCAACGC 1320
AGTTGGTAAC TTCAATCTTG CCAACGCTTC CCACGTTAGT AATCACCAAA TACTAAACAT 1380
GACAAAAATT CAGACAAATA GGGCATCCGT CCGGTGTAAC TCCGTTTGCC GAGAGCCCTC 1440
CAGAATCCGG AGCACAATAG GTCTGTGTTT ATTTTTCCAC CAGTAGCATA ATGTGACTGA 1500
TTTACAAGAG TTTCACTGGA GTGGTAATCT GACAGTGATG AAGGGGCTCC TCACTAGCGC 1560
AGTCGCTCAC ACTATCATAT TAGTTGCCTC TAGCAAGGCA GTGTGGTCGA TAATTGGAAC 1620
GCTTTTATGT CTAGTGGTTC TGACAAACCT CTTCTTCAGG TCACATATGG GCGGTCTAGC 1680
TCTCTACTCA GCCCAACAGT GGCAAATACT TTAGACTGAG AAAGTATTGT TCTCTTCACA 1740
TTGTAGAGCA ATGGCAGTTC AAGGGAAGTG AGGCTGCGTG CCGGCTACCT GCTGGTGTGT 1800
AGTAAAATGA AATGGACATG ATACCGAGCC GGGAGTACAA TTAAATCTAT TTTGCACCAA 1860
TGTGTTGCTG GACAGATGAG TTTCCACATG ACAGAACTTT ATGATCTTTA AGGTAGACTG 1920
AACTAATAGA TTGGTGTGGA GCGCACTGAA GTTACCAAGG ACTGGAAAGC AGGCAGTGGT 1980
ACATTTGAAC TACAGGTTTC TCATATGCCC CGCGTCATGC TGAGTTTTTA TAGCTCCTGG 2040
CTTTCAAAAA GCCTGTTTCA AAGAGGTTTG CGCTAGACTG GGCATGCAGT TTTGCTCTGC 2100
AGATATTGTC GCTGCCGATT TAGTGGAATG CAATTAGGAA GCCTAAATTA AGTGGTAATG 2160
GAGAACCAGC TCTTGAAACT GGGGTTTCCA CGGCAACCGC TGCTTACAAT ACAGCCTTCA 2220
GTTAGTTTTC CCACTTTATC TGCAAAATGC ACAATTGAGC TTTAAAACAG CTCGGTACTG 2280
AAAAACGCAC TGTAAACAAC TGTTTGCAAT GAGAGTTTTA CACTGTCTTT AAATACAACA 2340
AACCATCACA TAAAATTTAC TTGCCCGCAC TAATAATGTG AAATCCGGTT GCGGGTCGGG 2400
TGAGGAATTT TTTTTTTAAT GTGTTATTCC TCTGTCACCA TCGGATTTAT TTTTAAGGAG 2460
AGATGTCACG AGTCATTAGG TCGTTCAACT TTGGTCATCC CTGCACTATT TTCAGCTCCC 2520
CTGACAATCT GTGTATCCCA ACAGTCCTAC ATTAAGACAC ATTTTCTCTC TCAGCACGCA 2580
GAGCATTGTC TTAAATAATT GTATAATGCT CTTTGTCAAT ATTCCTTTTT CTCTAACAAC 2640
ACTTTGTAGA TGTTTCTTGT AGTTTCACCT TTATAGCATA CTGTACACCT GCAAGATTTT 2700
CATATTTACT AATCTGGACT TTTCCTTTCT TCAGATGAGA CCAACATTCC ATCTCTCTAT 2760
ATATTTAAAG GTTAACCAAC CAGGAAGCTC TTGTGCCATT CTAACAGACA AGACAGTTGA 2820
AATATAGCAA GAAGTAGGTG TATTTTCCAC CACACAGTTC TTTGAAGTGA CTATGGGGGA 2880
TTTGCACCTT TGTAAAATTC ATTTTCTTCT ATGGTAGGGA ATCTGTATTT TATTATACAG 2940
GGCTGGCACT TTTGTTTCCC TGTGTCAGGG TTATACGCAT ACTCCCATCA ACGACCCATG 3000
CATACTTTTC TCTGCACAGG AGGAAAAAAA AATCAAATTG AGTTCTGCAA AGAGGAAAGA 3060
AGGATAGAAT CAAATTTGGG GTCTCCTAGC TATAACACTC TGTTTAATTG CCAGTCTTAA 3120
CAGGGTGATC ACTGGAACAT GTCTGGACAG AGCCAAGCAG CTGGTGGGAA CTCATGAATC 3180
CGCCACAGCC CAGAAGGTAA TGTTCCCCGG CAGTTTGTGT TCTCGCAAGG TTGGCGTATT 3240
ATACGTGTGT TATTTTCACT GTGAGAACAT GCAGAGAGAA AGGCATGGGT GGGGGTGGGG 3300
GGGGACAGAA AATGAGACAG GGGGGGGGGA GAGAAGGAGA GAGAGAGATG GAGACAGAGA 3360
CAGAGAGACA GGGAAACACA GAGAGAGACA GAGAGAGAAT AAGACCTGTT ACTCATACGG 3420
TTCAGGTGGA AGGCTACATT CTGGTGGCAA GGGTCATATC TGTGTGTTCT GCATGTTGAT 3480
GCATCAAATT CTCTGTAGCC TTGACACATG CCAGGGAGGG AGTGTGCTCT CCACAGGAAG 3540
TAGATCTCTT CAGCGGCAGC CCTCCCCCCC ACCCCCCACT GTTGGAACCC AGACTTGGTT 3600
GGGGCCTTTA TTTTTGACAT CAGCTGATTT AAATGGCACA GAGGTTTTGT TAAATACTTT 3660
TCCCCCCATT 3670