EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-00240 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr1:42408090-42411360 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr1:42409180-42409196TTTTATTTACATAATA-6.36
FOXB1MA0845.1chr1:42409182-42409193TTATTTACATA-6.02
LMX1BMA0703.2chr1:42411225-42411236TTAATTAAATT-6.32
Enhancer Sequence
CAAAAACTTG TATGACAGGT TGATGATGCT TAAATCTCTC GAGATTGGCT CTTAGTGAAT 60
GGAAGTGCGC AGATTCTGTC CCCAGCTCAT TCTAAACTCA AATCTGAATG CGCTCATTTA 120
AATTGTCACC AGGGGCAGTG GTAAGTATTA GTTAGTGAGA GCCATCATCT AAAATACACA 180
TTCTACACGT GTCCCGACAT CCAGCAGCGT GACAAGGATA GTGAACAGTT TAGGTTCATT 240
CTTGAGAAAA TGCAAACTAC ACATCACTGA AAGGCAAACT CTCAATGAAG CATCTTCATT 300
GGTACCAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAGTGG GTCCCGCTTC CACACTGTTT 360
CCCACAGAAC TACCACAGGG GGAAGATGCC AGCACATGAG AGCCATAGCA AAGGAAGCAC 420
AGAGTAATAA ATAATAAGAT TCATTAAGAA AAAACAATAG AATGGGAAGC AGCAGTCATT 480
GGCTCCAGAT TCTTAACTCT TCAGTCTGCT CGTCCACAAT AAGCTTTGTG GTGTGCCGCA 540
GATTTTAATA GTCTAACAAT CTTTTTCTTC TATTTTTTTT TAATTCCTTT TCTTAAAAAG 600
ATGGTTGGTT GGCTTTGAAT GCTGGAATAT GCAAAGCCAT ATGAAACACT GGCCATTTCT 660
TTGTGTTTGG GTGTACATTT CTGTATGTCA TGATATTTCC ACACGCACTG CCTTCCTGGC 720
ATGAAAATGT TTATTGCGCT CATTAGCTAA GAGGGTATCG GCACTGGTCC AATGAACACA 780
GATCTGCCTT CTGATTTCAG CCATTAAATT GCAATGGGAT TCACAAGCTT AACATTGTGG 840
GTGTGAGAAT AATAAAATGG AACTCCATCT TTAGCCCAGT TACCATGGAT GCAGTTAAAG 900
GTCATGGTGG CAGCTGCTAA CTAGTTGCCT TTTGAGCAAT GTTCCCCTCT GCTGTGCATT 960
TTTTTTTTCC AGCACTTCCC TAGCTATAAG TCAGTCGTGG AATACCTTCA CTACTTTAGT 1020
GGCACACTAA CCTCCTCTTT AAGACAATGA ACTTCTGTTT TTCCAGACAA CCTTTGCCAG 1080
GGCCCTCCAC TTTTATTTAC ATAATACAGG AAGGCTACGG AATCAAAAAG TAAAAGCCTC 1140
AATAGAAATA CACGTGGCTC TTGCTGTGGC ATCCTGAATT ACTTTCTTAT TTTCTCCACA 1200
CCGCTCTACA TTCCCCAACC CGAAGAAAAC AGTGTATTGT AAATTCCCAT CTCCGTTTAA 1260
ACTGGTAATG GGTTCAGCCA CTGATGCATT CATTGCGAGA GACATCAACT TCTTCATTCG 1320
GCCCCAAGTC CTAGGAGTTA ATTCCGTGTA CTGCATGAGG TGTCAGGGTA ATTACTGCTG 1380
ATCAGCCCTA TTTCTTTGCA CTGCCTGGCT TCTCGCCCCC CTCCCCACTA CAAACGCAGT 1440
GCCGCTCCCC CCCCCTCGCC CCCCATCACA GACGCATCAC CACAGCACTG CAACGCTTAA 1500
GTTCAGCCAA GCTTCTTAAT CCAAAAGGTT TGGACAATGT TGGATTTGCA AAGAGAAGCG 1560
AGGGAGAGGA GGAAAATTAA AGGTAGCCAA GCAAAATAAA GTACACGGCA AGAAACGGAA 1620
AGCAATACAG AATATTCCTG ATGTCAACAC TTCATTTCAA TAGATTCTAA AACTCTTGGG 1680
ATTTTTTTCT TTTCCCCAGA GCCTTGCCTC AAGCAACCTC ACTACAAGCT CACTACAGGG 1740
CCGTGTTTTG AAATATTTGA GAGGGTACAT TGCCTAAAAA GAAACATTTT GGGAAAACTT 1800
ACTGGGTTTT GTTGTTGTTG CTGTTGTTGT TCTTGCTGTT ATTCTGTTTA GCTGTGCCAT 1860
AGCTATGTGT AGCTGTGTAA GCCAGAATAC AAAGAAATTT ACTGAAAAAA AAAATGTTGT 1920
GCTTCTCTAT TTTAAACATA CATTTATATA ACGTGTCATT TCATAAAAAT AAATTAAGTA 1980
TTATATGAGC CAAATGTTTC AATTCCACAC AAGAGTGGTT TCTAGGACTC TTGGCAGGGT 2040
GCCACGATAT TCGTTTTTAT TTCAAACACA ATGTGAAGTC TTTAATTTTA ACATACTTGG 2100
TAACTATAGT GGTTAGAAGG CATTTGCTGT ACTAATTCAC CCGCATCCTC TCCTGATTCT 2160
GCAGAGGATT CACTCCGGAA CAGAAAAATA CGTTGATGAA AAAAATTACT ATTAATTTTG 2220
AAACCAGACA CCGGGACGTG ATGCCCCAAA TTTGTGACTC TGTTTTTGGT CCCTGGCTTC 2280
TGAGTTCAAT AACATCCAAC TATTAATACA GAGGGTGGAT GATATCAGGT CCACTGCCAC 2340
CCGAGGCCAA TTTCCAGCTT GGATCCTTGC TTTATAGCTG AGACAAGAAA GGTTCCCCTT 2400
GGGCCAATGA CGGGAGCCTT TCCGTGTCTG CCCAATTTGA TAGCAGCCAG GTCCTGGGCC 2460
AAATTCACAC ACAACTCCTT CCTTCTCTGC AGTCACACTG GCCAAGAGTC AAAACTGGAC 2520
ATAGACAAGG AAACCGGAAA GACCTAGACC CCCTCGAATC TGCCATACCC CCGCTAGAAA 2580
TGGGCAAGGC TGATCCTAGT AAGAGGGGAC AGTGTGGTAT TGACAAGTCC ATACGTGAAT 2640
CCACACATGC CCAGAAATGG TCCTGGGCTT CCAGTGACCT CAGTGGCAGA GTAATATTTT 2700
TTCATTAAAG GGGTTGGGTG GAGGTGGCAG GAGAAAGAAG TGGCTTTCAT TTGCTGGGCG 2760
GCTGTATTAT GGGGACACCA CAATAACATG TTTCATGCGA TCACAGAGAC TTCAGCTCTT 2820
CTCTTCCGAC GCTACACTTC AAATCAGAGA ATTTCTTCCT GTGCCTTGTT TACTGTTGAT 2880
ATTTTCTGGC TGATTGGAGA GGGATGACAT TTTGACAATT TACTGTAGCA GTAAGCACTG 2940
TACAAACAAA AGGTGCTGAT GAGAACTGGA ACCCATTATT ATGTAAATGA CGGCTGAGTA 3000
ACACAGAATC CATCTCACAG CCACCATCAT TGAGACCAGT TTTACTCAAT GATAATAATT 3060
TTCATGATTG CAGACTTCAG AGTGATCAGA AATACTCTTT AGCTGTTGCA TTTATCGACT 3120
GCTGGTACTT GACCCTTAAT TAAATTCCGA AACTTTTTTA TATAATAAAG TAAAATACAG 3180
CTGACATTTC TGTTCAAACA AAGAGGCTCA GACACAGAGC GGCCAAATAA GATAAAGGTG 3240
TTTCAGACTT ACCTCTCTGT ATTTATAGTA 3270