EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-00239 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr1:42313990-42319190 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr1:42316421-42316431TCTAATTAAA+6.02
IRF1MA0050.2chr1:42315863-42315884AAAGAAAAAGAAAAAGAAAAA-6.17
IRF1MA0050.2chr1:42315869-42315890AAAGAAAAAGAAAAAGAAAAA-6.17
PKNOX2MA0783.1chr1:42314071-42314083TGATAGGTGTCA+6.02
POU1F1MA0784.1chr1:42317057-42317071GTCATTTGCATATT-6.75
POU2F1MA0785.1chr1:42317059-42317071CATTTGCATATT-6.74
POU2F2MA0507.1chr1:42317057-42317070GTCATTTGCATAT+6.74
POU3F1MA0786.1chr1:42317058-42317070TCATTTGCATAT-6.18
POU3F2MA0787.1chr1:42317058-42317070TCATTTGCATAT-6.37
POU3F3MA0788.1chr1:42317058-42317071TCATTTGCATATT-6.02
RREB1MA0073.1chr1:42319044-42319064CCCCCACCCCACCCCCTCCA+6.14
RREB1MA0073.1chr1:42319045-42319065CCCCACCCCACCCCCTCCAC+7.01
Stat6MA0520.1chr1:42317150-42317165CTCTTCCTCAGAAAC+6.37
ZIC3MA0697.1chr1:42318783-42318798GGCCTCCCGCTGCGA+6.22
ZNF740MA0753.2chr1:42319038-42319051CATCCCCCCCCAC+6.01
Enhancer Sequence
TAAACAGCAC TCTTCTTGTC CCAGGCAGGA ACCCTAAACT GTGAAGTGGG GAAAAGAAGT 60
GGAGCAAGAT TGAGGCCATA ATGATAGGTG TCAATCAAGT ACTGTGGATG GTGACACCCA 120
GGGTGGAGTG CGGCATTTTG GAACATTTAA ATCTGCACTT ATAATCTCAG ATGGAGGTTA 180
TAGCTGAAAA TAAACAGGGG AGGAACATTC AAAGGTTGTA AATTCTAATT ACGCATTGAG 240
ATCAGCTTGC AAAGCTTTTT TTTTCCCTCC CCCAAATGTT GGGCTGTTTC AGATTCTGTC 300
TGCTTTCTAC TAAGAACACC GAAAAGGAAG GTTTTTGAAG TCTCATCTGA CAACCCGGAT 360
GGAGAATGTA AAAGGTAGCC AAAGACATGG TTAGGGGGTC TCCTTTCCTC AACAGAAAAC 420
AATGAGGAGG AGAAAAAAAG TTTAAAAAAA AAGATAAAAG AAAAAGTGAG CTTTTGTGTG 480
CCTAGGTATC CTTCCCAGCC CCTGCAAGGC CTGGGGCATC ACTAGCCACG AATCCCTCCC 540
CGAGTTCCCG GTCCTCATTC TGGTTTTACC CCATGGCCAC TTGGACTGGC TTTGATTCCC 600
CAGGGTAAGT GTTCATGATC ACAAATTTGG CCAAAAGATT TTTCATTACC CTCCAACATT 660
TCTTTTCACC TCCAACCTCT AGGCAGGACC CTGGCTTTCC CTTTGGAGCC AGGAATATAA 720
AGACACGGGG CCATCGGGCT GACCCAGAGG GCCCAGCTGT CAATCACAGT CTCGCCATCT 780
CTGCTGCCTT TCACACCAGG CAGCTGGACC CATCGCTGTC AACCAGGTAA CAACCCCCAG 840
ACAATAGCGG CCTGAAAGCC TGGTCTAGAC ACTCTTTTAG CCACTTACTC GCTGCTCTTG 900
GCAGCTGTTG AAGCATAAAT AAGCAGTTTG TAATCAGAAA GCTGACATCA TCGCAGCGCG 960
GCTGAGAGGG GAGACTGTTC CTGGGCACTG AACGGTTTTT TTCTTGTGTG TGTATGTGTG 1020
TGACAACAGA TTCCGGGGTG GGGATGCAGA TTTGTGCCAT GCTAAGCTGG TCTTTCTTTG 1080
ATTTACAGAA AACAATTGGA TCAGGTCCCC AGCTCCAGGG AACACCAGGA TTATTTTTTC 1140
ACGTTCAGCT CCTGATGGCC AGTCACATCG AATAATAAAC TGGGTACCAA TGGCACATGA 1200
GCTCTGCAAA GATGGAAACA TAGCAGGGTG GATTGCAAGT TTGGATAGGG GAGGTTTGCT 1260
GGGCCACGGG GTAACTCCTC AGCCCCTGGC AAGGTACCAT GTAACAGTTT TGGTGGGGGA 1320
CACACAGACG GGTTGCTGCT GCAGGAGAGT CTGCCCGCCC TGCAAGACTG GTGGTTTCAG 1380
GAAAAGCAGC AGAGAAACTG AGCATGCTTA TTTCTGTTTC CCGTGTCTGC GCGTGCCTGT 1440
GTGTGTTTCA GGACCAAGGT CTGCCTTTCA AAGTGACTGG CAGCTATCCT CAAGAGAGCA 1500
GAAGATAGGA GCCGTCCACC AGAAGCACTA ACTACCCTAT CACCTCTACA GCTAAGCAGG 1560
ACCTCTTGTA GATTTCCCTG TTTTCCCCAA CACTGGCTTT GCCACTAGAA AAGGGAGAGG 1620
TAGTCTACGT TATTTGCTTA TCATAACGGA TTTCTTATCA TTGTTTGAGG TTGCTCCCAA 1680
AGGAGTGAGG GCTTCTTGGG TTTCTTTTAG CACTCGGGTT CTGATTGCCC TGATGTCTGC 1740
TGGTAACACT GGACTCAAAC CCTGTTGGTC CATAGCGGCC AAATCTATGC CAGGACGCTA 1800
TAGACCTTCC CACCTGAATA GCCCATTCAG GTAGTTATGC CCATCTCCAA TTTCCTCTAC 1860
CAAAGGGGGA AAAAAAGAAA AAGAAAAAGA AAAAGAAAAA AGTCCAGTTC TACAAAAATA 1920
TTGCCGTCCT ATCTCCCTGA GGGGCTCTGG TATTAGTTTG TTCTAAGTAG CTCATGATTT 1980
AGAATACAAA GGCATTTCCA GAGTGCATGT TTAACAAAAT GACATAGCAG ATAATTGAAA 2040
TTTATTTGCA ATTTTCAAAC TACAATAAAC ACAATTCTCC TTTTCTTTCA TTAATAATCG 2100
CACGGCTAAT GCATAGCAAT CCCTCTGCAG CTTTTACAAG CAAACTTGAG CTGCCGTGCT 2160
GTAATAGCTG GAAAAGTTAA TGTAGCTTGA ACGAGGTTTC TAATTGTCCC TGTCTCTGTC 2220
ATATTTGTCT ACTTGAATGG TCCTAAATAC CACAGCGATT AATTACTACA GAGCAGGTAT 2280
TACAAGATGT TATCATCTTT CCCCAACCGT CTGGGTGAAT GGAGAGAAGG GGAGATTGTT 2340
ACAGTGTTTC ATCTCTGCTC TTCCTGTAAG ACACTTTAAC CAGAAGATTT AACGTGTCAA 2400
AGTTAACAGC GTTTCTAGCA GATATTCACA TTCTAATTAA AGATTAAGAA CGTAGTACAT 2460
TACACTGTGA TTTGTCATAC ATGGCTTGTT AAATAGGAAA CCTACCGGGA TTCCCTAACA 2520
TTTTATAAAC ATTATTCAGG GCTTTTAATG TGGGCAAAGT GAAAGATTGT TCAACTGCAT 2580
TGCAGCACAG AAAGCAGGTC GCCCTCAGTC CCTCCCCCAC CCAACTCCCA ATAAATAACA 2640
AGATGAGACA AGTTAGGCTG CTGAGAGGCT GGCTTGCACT GGAGGTTCTC TTGGAGCCAT 2700
GAATCACCTC TGGTTAGTAT TTGGTGGTAG AGGGAAGATC TTTATTATTA ACCCTAGACT 2760
CCCCTCGTTT CTTCTTCTTT TATTTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC 2820
TCTCTCCCTC CGTTCTTTTT TTTTTTTTTT CCACTTTTGC TTTTGGCTGC CCGCTAAGTA 2880
GAGGAAGGTA AGAGTCTTTG TTTGAATTGG AGTGCCAAAG GACAGAATAA AGATGAAACA 2940
GTATTTCAAT ATGCAGCCAC AGCCTTCAGC TGCTTCCAGC AGCCCTGATC GTACCAGTTC 3000
CGGTACTAGT GGTACAGGAC TGGTTCACAT TCGAAGATTG CCTGCGGAAT AAATTAATGA 3060
GATACTGGTC ATTTGCATAT TCACGGTTGC ATACTAGGTA GAAAGCAAAG GCCAGGTGTG 3120
TTGAATTTGG GGGTTAGATC TGCTAAGAAG TCACATCTTT CTCTTCCTCA GAAACAGGGT 3180
GCCCTAACAG TAAAAACAAT AGTAAGGCGA AACTCTTGCT TAATGAACAC TCTGAGTAAT 3240
TATAGCAGCA AGGCAAGGAG GGTACGTTTA GCTTACAAGC CCCAGTGAAG CCAACATACT 3300
GCCCTAGTTA TAGAGAGGCC TAGATGCAAT AGTTCAGGGG TATAAAGAGA ACAAATCCCA 3360
CTGGCTCTCT CTGGATTTTA GGTTTTAATT ATGCTGGTGG TGTGCATTCG TACCTAATGC 3420
AAAATGATCA ATTGAAGGAG ACCTTTACAT TTGTAAACAT TATTATTGAC TGGTTGCCAG 3480
TCTAAGTTGG AAAAGGGGAA AGCTGTTCTA AGAAAATTAC TGGCAAACCC AAATAGGGGG 3540
GATGAATCTG GGCTGTTTCA GTAAGGAGTG TGGGTCTCTC CACTTCCTCT GCTAGTGGCT 3600
GCTGCCAGGG CATGGGGAAA GCACATTGTT TAAGGCATTT GTATCTCACT GTGGAGCTAA 3660
GTCTCTGTGC AGCTGTGGGT CCTGGCTTGG AAGCTCCCTC AGAGATGAAG GACACATAAC 3720
ATACTCTTCA GGACCCTGGG ACCGTTATAA CATACAAGAG TGACCATTCA TGGTTTTCAG 3780
GGCTGTCTCA AATTTTTAAT ATTTTGCTTT TATTTTATAC AGCTAGATAT TTTTTCTTTC 3840
AAAATTGCTT TTAATTTTTT CTTTCAAGAA AACAATTGAA CAGCACCCAA ACTCTAGGAA 3900
CTGAATATCA AAATGAAAGT ATAGTATAAT AAGTTTTTTT TTTTTTTTAA ATGATGCCTA 3960
TTTACTAACA AGTCCCACTC TCCCTATTCT GCCTTCCCAC TTCACAGGAC CTCTTCCTGG 4020
CCAAGGCAGG CGGTGACCCT TCGTTAGACA CAGTGTGCAC ACACACAGCA AGTGTGCATG 4080
CATAACAAAC AGATGCCCAC GGATCCCACA ATGGGTTTTC TCTATACAGC TGAGTCTTTT 4140
TACTTAATTT AAAGATATTA TTGCCAACAT CTAAAGCTCT TTTTTTAAAA AAAAGAAGAC 4200
TTTCTTCTCA TATTTACAGA TAGTCTCTGA ATATGAATTA TTTAAGTGCC TTCCCAGGGA 4260
AAAATCAAAG AGGCTCTTAG TGCTGTTTAG AACTTAAGCT TTTAATTTAT TTTATCAAGG 4320
CTCAGAGGGT ACACTAATTG TCAGGACAAG CCCTCCACCC CCCTCAAAAT AATCTGCACA 4380
TGTTTGAAAA TTCAATTTCT TTTTTTCATA TACAAATTTT GGTGTGCTCA CTAATACACA 4440
GAAATCAATT ATTTCTGTGG TACAGTTACA TGCAGGAAAC TGCATACCCT CCTAAACTAA 4500
AGGAATATAG ATTTATTAAT ACATATCTGT AATATCTCTT AAGGATTTTT GAACGTGTTT 4560
TTCACCTTGA AAGGACCTGC CTGAAGCCTA CACAGCAGCG AAATCATTGT AGTCCAGTGT 4620
TTTTTTGTCA CACACACAGA GAGCACAGAT TTTTTTGATT ATGTAGATTT CTTTTCCTAC 4680
TGCAGTTTCA TATGCAAAGC ATGCATCGGC CACATCCATG CTATCTCCTA AAGCAGTCAT 4740
TCTGAAACCC AATCTGGGGA CAGTGCAGAC TAAATAAAAT TTCATTTTGA TTTGGCCTCC 4800
CGCTGCGAAC GGGACTGCTT TGTCTCGGCC GACAGAACCA GCAAGCCAGA AAGGTATGTG 4860
GCGTTTTGCA TGGCTGGTGG TGTGTCTGGA AGCTCAGGAT CGCCTCTGCT CCTGGCTCGA 4920
AGCTCTCCCA CTTCCTGCTC CCCTTTTTCT CTCAGCACTG TGTGCCTTCT ACCTGCCGGG 4980
CAGAGCGGTG GCTAACCCGC ACCAGTTGTT GACTTTGGCA TATGTTTAAT CGCTCCTGTG 5040
GCTGTTTGCA TCCCCCCCCA CCCCACCCCC TCCACTGTCT TTGTTATTGT TAAGCTTTGG 5100
TTTTTGTTTT TGTTTTCTTT TGTTTTGTTT TCTCTGCCTC TATTTTCTGT TCTTGTTTTT 5160
TTTTTTTTTT TTTTTTTTTG TTTTTGTTTT TGTTTCTGTG 5200