EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-00155 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr1:35926120-35927720 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXK1MA0852.2chr1:35926175-35926189TCCTTGTTTACCCA-6.26
NFYBMA0502.1chr1:35926725-35926740CAGCCAACCAATCAG+6.02
POU1F1MA0784.1chr1:35926969-35926983GTTATGCTAATTAA+6.16
POU3F1MA0786.1chr1:35926970-35926982TTATGCTAATTA+6.92
POU3F2MA0787.1chr1:35926970-35926982TTATGCTAATTA+6.92
POU3F3MA0788.1chr1:35926969-35926982GTTATGCTAATTA+6.48
RFX1MA0509.2chr1:35926652-35926668TGTAACCATGGTAACA+6.7
RFX1MA0509.2chr1:35926652-35926668TGTAACCATGGTAACA-6.7
RFX2MA0600.2chr1:35926652-35926668TGTAACCATGGTAACA+6.57
RFX2MA0600.2chr1:35926652-35926668TGTAACCATGGTAACA-6.5
RFX3MA0798.1chr1:35926652-35926668TGTAACCATGGTAACA-6.51
RFX3MA0798.1chr1:35926652-35926668TGTAACCATGGTAACA+6.65
RFX4MA0799.1chr1:35926652-35926668TGTAACCATGGTAACA-6.69
RFX4MA0799.1chr1:35926652-35926668TGTAACCATGGTAACA+6.75
RFX5MA0510.2chr1:35926652-35926668TGTAACCATGGTAACA-6.02
Enhancer Sequence
CACAAAACTA GCCAGTACAG GAAGAGAGGA AGATTTCCAG TGCCAAGCAT TGGTCTCCTT 60
GTTTACCCAT ATATAAGTCC ACACACACAC ACATACAAGT ACATATAATG TGTGTGTACA 120
CACAATACAC AAGCACATGT GCACACGCGT GTGCACACAC TGTTCTCTAA TTGTGAGTTT 180
GTGTGGTTTA AAGCATCAGA TAACTGTACA AAGTTGGACA AACAGCTATG ACCTCAATTT 240
GGCCCAGAGC GCGTGTGACT CCTCGGAGGA AACAGTTCAT TTGAGGTTAT AGTTATCAGT 300
CTAAGGAACT GCATATCGGG TTAACTTTGC TTTCCTGGGT GTTACCCTTC TCCTCACACT 360
GGAAGGCGGG TATTTTCTCC TCGTAGAGGC TTCTGCTCCC CAGCAGTCAG CAGGACCACA 420
CACAAGTTAT GCAATTTCCA ACACTCGTTG TCAACAGCAC AGTTACATCC TAATTCTGGA 480
TGGACTGAGA GCGCAGAAGT TCCCACACTC CTGGGGAAAA GCCCAATTGT GTTGTAACCA 540
TGGTAACACA GCAGCCGAAC CAGTGCTAAA GCCTTTCAAA GGCCTCCGGG AAGACGGTTT 600
TTGTGCAGCC AACCAATCAG CGTCATCCTT GTGTGAAATT CAGCCAATCG GGAAACAGGC 660
TCCCTCAGTC CTCAGCTTCA GTGGTTGGTG GGTCAGAACT CCTGCTGCTT GGCTCCCTCC 720
TGGAGACAGC CTATACCACA GTGTCCTGCT TGCTTGAGTG AGCAGTGAGT CCAGTTTTGC 780
TTTTGACTTC TGAGTTGAGA GATGGTCTCG GTGTGCTTGA TAAAGTTATC GTTCAATGTA 840
TACATTGTGG TTATGCTAAT TAAGACTTTC ACGCCCAAGT CCTTACCTTC GTAACTTTTT 900
ACTATTTCCC ATAGTTACTC TTTGCTTTGT GACTTTCATC TGCTTAATTT TCTGTCTTTG 960
GTTGTGGTTC GTTTTACCCA AACTGCCTAA TTATCCTATA GTACATTTGT TTATTTCCGT 1020
ATAAACTGAA GACACGATCA CTCTAAGGTA TGGTGACCCA AGCACCTGGG TTTTATTGTA 1080
GATATGAGGT AGAGTACAGC GAGAGGCATC TGGAAGAGTC CAGAGCAGGG AGAGAGTAGT 1140
AGACTGAACA CAGTCACCAA ACTGGACTGG GGTATGAAGG GAGAGAGAGA GAGATGGGGG 1200
AAGAGTGAGA AAGGAAGGCA AAGAGGGGAC CAAGAGGGGG AAACCATGGC AGGAATAGCA 1260
AGGCTATCTG GAGAAATGGT TAGCCTAGTG GGGAAGCTCA TGAGCTGGAG AAGGATGGGG 1320
TAGGGCAGTG AGAACAGCCA GGATGCCAGC ATAGACTCAG AAATGTGTGA TGGGCACTTA 1380
GGATCCGAAT GAGCTTTGGT GTGCTAATAG GCACCACAGA TAGCCATATG TCCTTCTGCC 1440
AGCGATAAGG AAACTGACTC CTTTTGGTAG TTCCTGAGGA TTGTTGGCTT TTGTCTAACT 1500
GTCAGAATTT GGGGGAAGCT GCCAGTGGTT TCCTTCGGAC CTGGTACTTT TTGTATTTGT 1560
TCCAGAATTA TCCCCAAACT CTGATCCATC CCAGCACCCC 1600