EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-00114 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr1:31289870-31291130 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:31290937-31290949AAACAAACAAAC-6.32
GFI1MA0038.2chr1:31290264-31290276GAAATCACTGCA+6.74
POU3F3MA0788.1chr1:31290852-31290865AGTATGCTAATTT+6.32
Enhancer Sequence
GACATATTCA CATTCATGCA TGTGTGCATA TTGCTGGTAA TCACAAGTCA GGTATTTTTA 60
ATTTTCCAGT CTCAGTCTAC CTCTAAAAAA TACATTGCAC GGTAAAGCTC CTGTTTAGAG 120
AACTCAGGTA ATCTATGCAT ATTATTTGAA ATGTGTGCCG GTCTCATTAA ATTAAGCTGC 180
TTTACGCACT GCCAATAAAT GCCAAGCATG ACTAAAATAA TACACGGCAG AGAAGATAAT 240
CTCAGTTTCA AACTGCACAC CTGTTTTACT GGGAAAAGAA AAAGCCTCTT CGATTTTTAA 300
AATATAATGT TCAACACTAG GGATTCATAG GAGATACAGT CTAAATATAT ATTCTCAGAA 360
AAACAGACAC AGCTCCTTCC AAACAACATG TCCTGAAATC ACTGCATAGA CAAGGGCAAT 420
TATAACACAT TTCCAGATCA TTTTCCCAGA GGCAGTAGGG TGTGAGTCCA GCCTAGGGGT 480
TCACTGCTAG CTCTTCAGTT TGGTGTGTGG CCATTTGTTT AATGGTTCTA ATGATCACTC 540
TTATGTATAA AAGAGAGAAA ATAGTTCTGG CAGGTCATTA GAATTAAATG CATAAAACAC 600
TGTGTAACTC CAGGCAAGTT CCAGGTTTCT GTGTCCTGAA ACAAAGGATT GAATAGAGGC 660
ACACAGTTAG AGCACAAGCC AGGGCATTTT ATTGGAGAAA AGTGCACTCC AATGCAGGGA 720
ACAGGCCAGA GGTTCCTAGT GTCCCACTGT GGGGACTTTT GTGTTCAGCA GTGGTGGCTT 780
TTTGGCACAG TGCCTAGCCC AAGCTTTCTC ATTAGCATCT TAGAACTCCA CTGTGGGTTG 840
TGCAATTTAG CATCATAATG AGGCTTCATT CACCCCCTCT CCCCCAGGCA CTCTGGGGTT 900
TCCCTGTGCC TGAGCTCTTA GCCAGAGGTG CTCATCCTTG ACCAGGGTTA ACCAGACTTC 960
CTTTTTGCCA ACTGGTTTTC TAAGTATGCT AATTTTGTGC ATGGCTTGTC TGATTTCACT 1020
CCTTATTCTC TTGCCTCAAA ACCAAGCATC ACAACAAACA AACGAACAAA CAAACAAACA 1080
AGCAATAACC CAGAGATTGA CAATTTCTTG ATGTCAAAAT AATTTTAAAC ATTTCTACAT 1140
CCTTTAAACA TCCCTGAAAT GTTCTAGTAT GGGCCTAAGA GAAGGCTCCT TATGTGTTGA 1200
TTCCTCCTGG TGACTTCCAA AACGGGATTC TGGCATGAGA GATAGCACGG TGCAGTGATG 1260