EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM111-00813 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
MSC 
Coordinate
chr1:135994140-135997810 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr1:135994647-135994664GTGTTTGTTTATTTGTG-6.51
Nr5a2MA0505.1chr1:135994842-135994857ACTGGCCTTGAACTC-7.4
TCF3MA0522.2chr1:135996587-135996597AACACCTGCT+6.02
TP53MA0106.3chr1:135997691-135997709AACAAGCCCGGGCTTGAT+6.14
TP53MA0106.3chr1:135997691-135997709AACAAGCCCGGGCTTGAT-6.28
Number of super-enhancer constituents: 12             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01169chr1:135945308-136008057Th_Cells
mSE_02680chr1:135989644-136013255HFSCs
mSE_03412chr1:135994137-135996732Bone_Marrow
mSE_04347chr1:135994484-135996722Cortex
mSE_04817chr1:135994315-135997432E14.5_Heart
mSE_06037chr1:135992860-135996988E14.5_Liver
mSE_06619chr1:135992060-135997265Heart
mSE_07309chr1:135988354-135997070Intestine
mSE_08945chr1:135988492-135997234Lung
mSE_09588chr1:135994199-135999076MEF
mSE_11210chr1:135993564-135997433Placenta
mSE_11929chr1:135993665-135996950Spleen
Enhancer Sequence
ACATTCTGAA CTGACTCTAG AAGCGGGAGT CAGTGAGTCC TGTATCCTTG CCCACTGGTA 60
CCTACTGGAT AATACTGTCC TACCCTGCCA TGGGGAACAG ACAGTCAGCC CACCCACCCC 120
AGCTCTCCAG CATGAAGCCA GAAGTCAAGT GCCTCTGGAA CTCCCTGGCT GTGCCACCAT 180
CTTGCTGGGC CCCGGTCTCC CTCACTGTAA ACTGGGATTG TTGGCTGACC ATGAGTTAAG 240
ATACCCAGAT AGCTTGATAA TTTTCTTTGT ACCTTGTGCT CCCAACGCCC TCCATCCTCT 300
GCCACTTGCG TTCGCTTGGC TGGCCTTGTG TACATCCTAT TAAAGGCCTT TTGTTATGTT 360
TTTTTCCTCA CTCCCCAAAC AACTAGTAGT ACACACTAGG CAGGTACTGG AGAAATCTGC 420
AGTGGCCACA GAGTAGTAGA GAGGACCCGC AGGCCAACAA CTGATAAAAA TCAAGATCTC 480
GGGGGAGGAG GGCAGGTTTT GAAGTTTGTG TTTGTTTATT TGTGACTCAG GCTAGCCTAG 540
GCTGGTCAGG AATTCACACT TAACCCAGTA ACTCCTTGTG GGTTTGAACC TTGCGCAGTA 600
CTTCTACCTC CGCTTCCTGA ACGCGGAGGC TGCAGGCTCC AAACACCACA AGCTGCTCCC 660
ACTGTCCTTC CTTCCTTGAG GCAGTCAGAC CATGCTGCCC AGACTGGCCT TGAACTCTCA 720
ATCCTCCTGC CTCAGCTTTC AAGTGCTGCC ACACACCAGG TTATATGAAC CTTTTGAGTA 780
CCCAAGAAGC AGCTTTTGAA TTTCAGCTCA GAGTGCCATG CTATAGGGCT AGGTCAGGCT 840
TTCCTTTCTG ACAGAGAGGC TGTATACTTT CCAGCCGGAA TATAAGGGAG CAGATGCCCG 900
AGACTGCTGT CGCTTGAGGT CTAGGTCCTG CTGGCCCTTT CTGAACCCTC CTGGCTCCTC 960
CTCCCAGCCA CTGGAGAACT GCCACATTGA GAGGCAGAAC CTGGGAGGCG TCGGAGCCCA 1020
TTCATTTTTA ATAGTCCAGC TGCCATGGTC TCCCAGAAGT TCCGCTGCAC ACAAGCACTC 1080
TCAGTTGCCA GGCCTGGGTC TTGTCAATGT TTAATGGAAG CAAGGATCTT ATCTGGAGTT 1140
CCAAGTCGTT TAGATTACTC CTGTGTAAGG ACCTGTAGTG TGGGATGGTG AAGACAGATG 1200
GAAGACTCCT CAGAGTGACC CTGCTGCTCC CCGGGGCAGG AAGGGGTTCT TAGAGTTAAA 1260
AACAGTGTGT GGGTGGCCCA GGAAACAACG CAAACGGGAC AGAAAGCCCT ATCTCACTTT 1320
GGTCAGGGTC TGACCACACT GTCAACAGCT CTGCCTTGGA GTCGATTCCA GGTGCCCAGT 1380
GCACACCCTG CCAGGGGCCT CCTGGGAAAT CCAAGACACA AGGTAATGGA TGAAGTCTGG 1440
AGGGACTTAA AAATAGATGT CCATTGAGCC TGTTCTGGTG TCCCTCAGCA ACCAAATCTG 1500
CCTGTATTTG GGAGAAGAGA CACCATCTGG CTTGCCTCTA GTATCAAAGT GTTGCATGGA 1560
ATGACTACAA GTCCACACTA ACCTGCCAGA CTGAGCTGGG CCGCTCTGTG CTCCCGGTCC 1620
TGACTCCAGA GCAACTAGGG GAGGGACTAG TGCAGCTCCC CAAGGCCCCG AGGAATGCCT 1680
TACGCAGAGA GTCAAGTTCT ATTTGGGGAA TGGAACATCA CGGTTCTAAA CACAAGCCGG 1740
ATGTTATTTA CAAAACTTGT CTAATGGCCC AGCCTCCATA CCGGTAGCTC ATTGGCTGCT 1800
CGTCTAATGG CTCAGCCTCC ATACTGGCAG CTCATTGGCT TCCAGCTCAG GTTTCTCTAG 1860
CGGCTTTCTC CGGACTTTCT CCCGTCCTAC CAGTTTCCTC CGCTTACAGA TCAACATTCC 1920
AGCCGAAGTG TCTCACTGAC CACTGACTGT CACTCACCGA TGAGACCTGT GGAGGGAAGC 1980
TGGCAGGAGC AGTTCCTAAC TGGGAGACTG AGGCTTGGGA AGGGGAGACC GGCAGGAAAG 2040
AAAGTCAGAA TGATATCACC CTGCCCTGCT GTCTGCCATT CTTATGAGGG TTAAAATGAA 2100
AGACGGCCGA GGGCCTCTCC CAGTTCACCC GTGAAGCTCG AGTCTAAGTG ATGGGTCAGG 2160
TGATTTAAGC TTTTTCACTC CAATTCAGAC GGTGGAGAAG TCTGGCTGAA TGGATCAAAA 2220
CTGGCCAGCA CACTGGACAG ACCATTCCTA ACACCTGGCC TTTTGCTATG TTGTGTTTGG 2280
GGAGGTTGGA CTAGAGACTG GAAAATCCCA ACAGACATTC CTAAGTCCCG GGAAAGTCTG 2340
ACGCTGAGGT GTCAGGACTG TGGGCACATG CTCTTCTTGA ATATCCCTGG GTCTCTTAGG 2400
CCACTCTGTC CCCTTTGCTC ATCATCTTGT CTCATGCCTG TTCACCCAAC ACCTGCTCCA 2460
TCACCACCTC TCCCACACAG CGCAGGCCCG TGGGCTGCAT GTGGTATGTA TAATAGTAGT 2520
CCTTGCCCCA GTGACCCGTG AATATTCAGT GAGCTAACTC ATGTGGAATG CTTGGACCAG 2580
CATGGAGTAA AACCTCAATA AATATTAACT GCTACAAATG CCTGTTGCTG TATGGTTTCT 2640
CATCCTCCAT CCAGGGTAAA GGAACTTTAA AGGAACCCTG TCACGCGAGC CCTTCTAGGC 2700
CCTAGCATGA TCCCAGACCT GAACACGGAC AGCTGTGCCC CGTGGGTTTT CTCTAAAGGT 2760
CACAAAGACT CATCGAGAAA TGTCCAGGCT TAGGCGCTGA CCTAGGAAAC TAAAGACGAG 2820
GCTTTATTCC ATCAGCAAAC AGGTGGGCTT CCTGAGAACG CAAGGACACC TGTGAACGGC 2880
TCATGAGCAA CACAGTGGCC TGGCTAGCCA CCAAATACTA CCATGATGGT GCTGACCACT 2940
GGGTCCTTAG GATCTAGAGC AGAGGAGGTT TGGCAGGGCA GCTCAGGTAA ACCTCCTGGT 3000
GAGAGAGAGC TGCAGAGTCG TGGCTACTTT AAATTGGGGG GGGGGGCATT GCTGGATGAA 3060
GAGAGAGCCT CACCTAGGCT CCACACATTC TGTGAGTGAG TAGCTCAGCA CTCAGGCCCG 3120
TGGCAGAGGG TGTAGAGTGG CGCAAGCCTC TTACATAGAA GATACTAGAT AGCACCTTAT 3180
AGGTAGACTA ACTCCAGGTT CCACCCTATC TGGGGCCTCT GTGAGTCCTT GTGGGCTGGG 3240
GACAAGATCA TTGTGGGAGA TTATCACCTT CCTCCTTAAA TAGTACCTGC TCTACCCCGC 3300
TAATGAGCCC TCATCCAGAA GGGCTTGGGG ACAGAGATCC ATGACTTTTA CCAGGCACTT 3360
CCTAAGGATG AAGATGAGAC ATAGGCAGAG GCCACAGGAG AGGATGAGGA AACCAAATAG 3420
TGGGGAAGAG GGAGACGTTA CCCTGAGTAG CAAGAACAGA AGAGGCTCCC ATTCCTACCC 3480
CAGGCAGCCT CCCATCCTCC TGCCAGCTCC CTTAGGGTAG ATCGGAGAAT ATCTAGACAA 3540
GAGTTGCAAG GAACAAGCCC GGGCTTGATC CCAGAGTGTG AGGATCTGGT TCACTTAGAG 3600
GAATGTTGCT ATTCTTAGAA TCTAAATCCC AGGATGGTGA CACTAACTTC CCCCTAGGAA 3660
GGCCCTGTGA 3670