EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM111-00242 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
MSC 
Coordinate
chr1:53878360-53882070 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HSF4MA0771.1chr1:53881984-53881997GAACTTTCTGGAA-6.02
MEF2AMA0052.3chr1:53879313-53879325TCTATTTTTAGA-7.22
MEF2DMA0773.1chr1:53879313-53879325TCTATTTTTAGA-6.27
PKNOX1MA0782.1chr1:53881161-53881173TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX1MA0782.1chr1:53881161-53881173TGACAGCTGTCA-6.92
PKNOX2MA0783.1chr1:53881161-53881173TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX2MA0783.1chr1:53881161-53881173TGACAGCTGTCA-6.92
POU2F2MA0507.1chr1:53880797-53880810AAATGCAAATGCA-6.16
POU4F1MA0790.1chr1:53879927-53879941GTTCATAATTAATG+6.32
POU4F1MA0790.1chr1:53879881-53879895CTGCATTATTGATG+6
POU4F3MA0791.1chr1:53879881-53879897CTGCATTATTGATGAT+6.19
TGIF1MA0796.1chr1:53881161-53881173TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF1MA0796.1chr1:53881161-53881173TGACAGCTGTCA-7.22
TGIF2MA0797.1chr1:53881161-53881173TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF2MA0797.1chr1:53881161-53881173TGACAGCTGTCA-7.22
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00627chr1:53870893-53913933Myotubes
mSE_01654chr1:53874723-53882197Macrophage
Enhancer Sequence
GTTTTTTCGA GACAGGGTTT CTCTATATAG CCCTGGCTGT CCTGGAACTC ACTCTGTAGA 60
CCAGGCTGGC CTCGAACTCA GAAATCCACC TGCCTCTGCC TCCCAAGTGC TGGGATTAAA 120
GGTGTGCACC ACCACCGCCT GGCAGTCCTG AGCTTTTGAG ATGAACATAG AAAGTCAAAT 180
TTAAAAACAT TCTACAAACA GTATGCCTTG GGTGTCAAGT GTTCAGCTCA CTGGTAAGGT 240
CAAATGCGAA CTAAACTTCA TGGGTGAATT AGGTAAGTCC TCTAACAGAA ATAAGGCATC 300
CAGAACGATG AACAGAAATC CTGAGTGATG AAGTCGGGTG GACTCTTCTG AGGGGGTTAC 360
ATCTCAGCTG AATTCTCAGG GATGTGGACC AGCAGAAAGT AGACTTGGGC AGCAGGTCCC 420
ACAGTCTTCA ACTAGAACTG GATCTTTATG TTTGAAGAAC AGCCAAGAGG TAGTGGCTAA 480
GGCAGGTGTG GGCTGAGAGG TCTGAGTTAG GGTCCTGACC AGGTCTCCCA CCTTCCAGTG 540
CTTCAGAAGG AGCCTGAATT TTATTTCAGC AACTGAAGGC TGCAAGTAGG GGAGAGAGAT 600
GATCTTAACA AGTGGGATGA ATAATATGAG GGTGGATGAA GCAGAGTAGG AGGAGTCTGG 660
CTGGCTGCCT GCTGCAGTGA TCCAGGTGAG AGGTGAGTGT GTCATGGAGT AGGCTGGTGA 720
TAAGAGATGA ACCTAGTTTG TGCTCTTGAA GCCAAAGGAA AGGAACAGCT TAATCTTTAG 780
CAATTGTGTT GCTTGTTGCC CACCAATAAT AAACTTACAG ATTGATTTAT GAAACAGCTT 840
TCAAGGTCTG TTAGTAAATT TGACTTGGAT TATGTCATCT CCTACTGCAG GTAGCAAGAT 900
AATCTCTTCA TTAAAATTTT GCAAATTCTT TCAATGTTTT CTTTTTACCA GAGTCTATTT 960
TTAGAGCCCC CTCCACCCCT CCCCCCCAAT TTAAAGATAG GGAACTTTGA AGCTGGTCTT 1020
GAACATTCAA CCTCTTTGTC TCTGCTTTCT GGAATTACAG GTAGGATAGG CACCACCTGG 1080
CCTGGATTCA CAATCTACTT TTATAATAAA TTACCTACCT ACAAAGCAAA GACCAACCCA 1140
AAAGTGCTAT CACGTTTACA TATGCTAATA AGCTCATAAA TTGATTCAAT GGAAGAATAA 1200
GGTAAAAATC TTTAAGTATT TCGGTTATAG GGAACTGAGT GGGTGGGCAG GGGGTGTTGA 1260
AGAGAGAGAT TGTTTTAGAG GTTAAACTAT GAGAACCTAT CAGAAGCCCT CTCACATTAA 1320
CAGCCTCACT GGACACCAGC AGCAGGACAG ATCCACAAAA GGGACACCAA TGGGTGTCCA 1380
GAACTCATCC TTATCCTTTT TTTTTTTTTT TCTTAAATTG TGCAAAGAGC CATTTTATTT 1440
CAGGACTCCT CTGTGCTTTT CTATTGACTA GCTGAAAGAG GGCCTGGATG GTAAACGCTC 1500
TTTTATTGGA GGAGGAAAAA ACTGCATTAT TGATGATACT GCAGAGCAAT AAAAGACATG 1560
GAAAGAGGTT CATAATTAAT GGTGTGAAAC ACACACACAC AAAAATCAGC TTGCAGACAG 1620
GTTATGCAGC ACAGTTTTTG TTTTCAAATC TGTACACGTG TGTGTCCACA TGCGAGCAAC 1680
TTAAGGACGA GTAGAAGCAG ACACTCCAGA CTGTTGGACA TTTGACTGGA GATATATATA 1740
TATACTTTAT ACACATTTAA TGTATTTACA TTTTAAATAT TTTCCTTGGC ATGTTTGCAA 1800
AAAGTTTTCC TTTTATACCA CAAATAAAAA GTATAATTTT CCAGTGAGAA AAAGATTCTC 1860
ATTAAAGAGA GAGAGAGAAA AAAAAAACAA AACCAAACCT ACTATATGTT TCTAGGTCTA 1920
TTCCATTGGG TGTGGCAGTG TGTGCGCCTC AGACACCAGC ACCCTTGAGA GTAAGGCTAA 1980
GCCAGGGAAT TACAAATTCT AGGTCAACCT GGGCTCCAAA AATCACAAAC CAGCAGTGCC 2040
GTTCTGTTGT ATAAAATCCT TTCCTGGAGA CTTCTGTTCC AGAGTGAGTT TACTCCCCTA 2100
ACTTTACTTT ACTCTCCTAA CTTCTGGGTT GACATTTCAG TCTTCTCAAA TTCATGACAC 2160
AACTAACTTC CTATATGAAC ATCTTCTCTT TGGTCAAAGA GAAGCGGCTT CCCCAAGCCT 2220
TCCCCAAGCG GCTGCAGTCC CTGCTGCTCT CTAACTCTCT CTCTCCCTCC ATTTTCAATC 2280
AGCCGGCAGA AACCTCAGAT GAACTCAGGA GAGAGCACTG CTCTGCACTT TGCAGACTGG 2340
CATGTGAACT GACTGCTTAA GAGGAAATGC CATAAAGTGA GTTTACTCTT TACTCATAAA 2400
ACCCCCAGAG CTCCAGGGGG TAGGAAGTCT TCTACAGAAA TGCAAATGCA GAGCGAAACC 2460
AGCAGCCACC AAGCAGAGGA AGTGCAGTAA TCCGTTCAGG CTGCTAGTCT CCATGGAAAC 2520
GCCATTGAGT AAGTCTCAAG TCTCTATCAG CTAAATCACT GGTTACTTTA TTACTACAGA 2580
AGAAGGGGGG AAAGTCGTGG ATACAACTTG TTCCGGCTTC AGAGACTACC ATATATACTT 2640
TAATAAACAC ATTTCTTGAG GAACATTTGA TCAGAGCTAC CCAGGGCTAC CACGGAATGA 2700
GCATAAGGAA TCAAAGAGCA CAAGTCACAC TAGCTTGCTT GGAAGGTTGA AAGACTGAAT 2760
TATCTGTCCA AGAGCCTCTC TGTCATCACT CTGGCTTGCA GTGACAGCTG TCACCCTTCA 2820
CACCCTTCCA ACTCTGCGGG TTAGAGCTTC TCATGGGAAG ATGATAATAT ACTTGTGAGA 2880
AGGAAGTTTC AAAAAAGTAT ATTTATTTTT AGTAAGGAGG ACATTGGTTC TATCTAGTAT 2940
ATTTGTACAG TATCACAACT TAAATGATAG ACACAGAATC ACTAAGAGGG AAAAGAATAT 3000
ACTGGAGCTG ACTGGCTTGA GGCCTACCAG CCGCCTAGCT CTGTGAAGCC AGGAAACAGC 3060
AAGGGGGCGG ATGGCTTTAG TGTGTATGTT TTGGTCTTTG GAGTATTAGA CTCAGTAATA 3120
TAAAGCAATG TCACCGATTT CTTTATACTC AAGTGATACT TTAAATCTCA TAAAAGGTTA 3180
TCAGTGAAAA AGTTGCTTCT GATAAAACTT ATACTGCTAT GTCCTGAAGT GATTTCTCTT 3240
ATGTTTTTGT CTAAATGAGG TATGTGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG 3300
AGAGAGAGAC AGAAAGCATT CATCTGAGTA GTACGGAAGC TACACAGGTT AAAGATTAAA 3360
GGCTTAAACG GAAACAAGAA AGCATACACT CCCTAAAGAC TTTCTAATAC ATTATCTCAT 3420
TCAGGTGTTA GAAATACTCT CTGAGCCCGG GCATTGTTAC TTCTGTTCTA TGGAGAGGGA 3480
TAACACCTTT CTTTGTGCTG CATTATGATA AGGGTAGGAA CAGGCGCCCA TACAGCAAGA 3540
GAGGAAGAAT GACAATAGCT CTTACCCAAC TGTGCGTTTG CAATGATTCT GACAAACAGC 3600
TCCATCTACA ATGAGTCAGC CTGAGAACTT TCTGGAACTA CCAGGGGAAG TAGCGATGCC 3660
AGCATAGACA ACCATCAAGA CTCTTCAGCA ATTCTATGGT GTTACCACTC 3710