EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM111-00145 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
MSC 
Coordinate
chr1:40289420-40291900 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PKNOX1MA0782.1chr1:40290705-40290717TGACACATGTCA-6.62
PKNOX2MA0783.1chr1:40290705-40290717TGACACATGTCA-6.74
RARAMA0729.1chr1:40291871-40291889CATTGACCTTTTGGACTC-7.32
RarbMA0857.1chr1:40291874-40291890TGACCTTTTGGACTCT-6.01
TGIF1MA0796.1chr1:40290705-40290717TGACACATGTCA-6.52
TGIF2MA0797.1chr1:40290705-40290717TGACACATGTCA-6.52
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_08686chr1:40289368-40291119Liver
mSE_08686chr1:40291176-40291957Liver
mSE_11857chr1:40288441-40291965Placenta
Enhancer Sequence
GGGAGAGAAA GAGTGGGTTG AGAAGGAAAC ATCAACATTG ATTGGGAGAA TTTGGCAGTC 60
TACCCTGAGA CATGTCAGCT GCTGACCATC AAATGGATGC AGACAGTGGG TAGTGAGGAA 120
GGCCCAGCCA CTTCAGAGTA CAATATCAAA ACAAGCCTAG TAAGCATGGC TGCCAAATCT 180
CATTGAGGCT CCACCTGGAG ATTGCTGTTG GTGGAGTCTT GTAGATCCTT CTGTCTAGCT 240
GCACGTGGGG CTATGGTCAC CTTGGTGGGG TCTTCTTATA CATCCTCTGC ATAGCTGCAG 300
GTGGGCTACA GTCACCTTTA GAGACAGAAA TAGGAGGCTT CCTCAGCACC ACTGCATGGA 360
CAAGGGGTGA AGCTGAGGCT TCCTGGTTTC AGGGAATGAT GAACACTGCA CAGCTGAGCA 420
AAGTTTGCAG TAGTCCTGGA GTCTGTAGCG ATAGTGAGAT GGTGTCCTCT TGCAAGTTAT 480
CTTCTCTTCT GGTCCATTAC TGCGGGCTGA CTGGCTCATG AGTTGGATGT GGGCTGGACC 540
ACGGTTTCCA TTTTTATTGG CTCCAAGTGC ATAGGTGTGC TCTCATTATG GAAGAAGAGG 600
GGAAAGAGAC AACACAGTTT TGATCAGACA CAGTCAGACC CATCTCTAAG GCTAAACTGT 660
CCTAGGTAAT CGTTGGTGGC CAGAGAAGAG TAGAGTTAAT GTGTACGTGC ACGGGAGTGG 720
GAAGCTTGGG ATACAGCTTT CAGTAAATAT GACTCCAGGG AAGCAGTGCT AGATCAGGTT 780
TCTGTGGACC CAGGCACAGC TGGACAGGAA GTGCGGGAGC TGTCAGGTCA GCTAATCTCC 840
TAGCAGCTTT ACATTCTAGC CCAGGGAGAA GGACAAGGGT TATTTCTGAG AAATGGCTCC 900
GTGTGTGAAG TCCAAATGTA TGACGCACAC AGAACTGCTC CTGGCAGACT CAGCAGGGGC 960
TGCAACGTGT CAGTGACAGC ATGAAGTTAA AAGGCAAGCA AAGGGAAGTC CTCTCTGGTT 1020
GTCTGCAGGG GACTGACTCC TGAGTCTTTA GTTAGCATCA TACAAGATTG TATGGTATCT 1080
ACTTAAAACC TTCTGTATTC TTTATACTGT TTCTATGTAA TATGAATTCT CTCTCTATGT 1140
TATTATACTA GACTGTATAC AAAATAGTGA CATAGGAAAT ATCTGTGCAT GATCAGCAGA 1200
GACATGCTGT GGTTGTCTGG ACTCATCAAA GTGGAATGTA AGGCTATGAA AAGCCAGTGA 1260
TTTACAAAGC AGGAGTCATA AACTTTGACA CATGTCATAG TAACTGAAGT TCATACTGTA 1320
GGATTCGGAG CTATTAGGTG TTTGGTTTTC CTGTACTTGT GTGGAATGCT TGTTCAGCCT 1380
TTAACCTCAA TGTGAGGATC GCAGACGGTA GGCTCTCTTG GAGACCCTTA GGTTCTGAGG 1440
CCCTTGTGCA TACAGCCAGC ACAGCTATTA GAAGCTGCTT AGCTTTCTTT TTGCCACATG 1500
TGCACACAGC AAGAAGCAGG CTCTGGAAAG CCAGGATGCA AGCTGTCACC TGGTAGTGGA 1560
TTTGCAGGCA CCTGGATCTT GGACTTCCAG CCTCCAGAAC TGTGAGAAAT ATGCATTTTT 1620
TTTAAATCAT GCTGTTCCTG GTAGCTTGTT TTAGCCGTCA TAATAAACTG AGACACCATG 1680
CCAGATCAGT TCACAATGAT GGTGTGAACA GATTTAAATA ATAAAAACAA AACAAAACAA 1740
AAAAAACAAC AAAAAAACCA GCCTTAGCAT GGATTTCAGC CAGTGTTTAT CTGAACACTG 1800
CCAAGACAGT GAAAGAACAG GGCAGCTTTG TTTTAGGATG GCAAGAGCAC ATCTTCATCC 1860
TTTGCGGGTT CCTGGATCAT TTTACCAGTT GAGGGGGAAT TAACACGAAC TTGAACATGT 1920
CTTTTCTGTG GAGACACTGA ACCTCTCCAC ATAAGATTGT TTCCTCTTGT TTGAGGTCAA 1980
CAGCGGGGCT GCTCAGGCAT TGCTACCAAG AACACAGCCC AACATAACCA CAAGGCCAAC 2040
ACATTCTAGA GCCATAATTA CACCCCCAGA GGTTCGTGTA GCTCCCACAA TTCTAGAACT 2100
TGACTGGAAA TCCTGAGTCA ACCCCTTCTA GATGCTTTCT TGCCTATGGT TTTATTTGCT 2160
CACCTCTTGG CCTCTCTCTG TTCTTGAGAT GGATGAGTGG CCATCCAGTC TTAGAAGCTG 2220
TACCACCTGG CACTGCCTCT TAGCTTAGAG GCTACCTCAC TTGGAAGTTC CAGAACAAAG 2280
AGTTAGCAGG CATCCCTCCC TCACTGCCAC ATCTGGGAGC TTTCAAGGCA TTACTTCCCT 2340
TTCTCTTGTA GGTTTTGTAA ATTTCAATTT CTTCCTAAGG AAACTGAGGT TTAGTGATAG 2400
GAGTCATGGT TCTTGGACTG TAGCAAATCA ACAGGAGACT TTGGAGTAGC ACATTGACCT 2460
TTTGGACTCT CAAACTTCTT 2480