EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM108-00355 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Midbrain_E11 
Coordinate
chr9:110150440-110153460 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr9:110150698-110150710GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr9:110150702-110150714GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr9:110150706-110150718GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr9:110150710-110150722GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr9:110150714-110150726GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr9:110150718-110150730GTTTGTTTGTTT+6.32
Nr5a2MA0505.1chr9:110151893-110151908GAGTTCAAGGCTAGC+6.13
Nr5a2MA0505.1chr9:110151548-110151563GCTGACCTTGAACTC-8.73
RFX2MA0600.2chr9:110152828-110152844GGTTCCCATGGAAACA+6.05
RFX2MA0600.2chr9:110152828-110152844GGTTCCCATGGAAACA-6.08
RFX3MA0798.1chr9:110152828-110152844GGTTCCCATGGAAACA+6.21
RFX3MA0798.1chr9:110152828-110152844GGTTCCCATGGAAACA-6.28
RFX5MA0510.2chr9:110152828-110152844GGTTCCCATGGAAACA-6.04
RFX5MA0510.2chr9:110152828-110152844GGTTCCCATGGAAACA+6.05
Enhancer Sequence
GGCAGCTTTC TTCCATTGGT GACCGCCTGT CCTGGGTTAG TAAGTCCGTA ATCTCCAAGA 60
ACATTGTCAA AAGCTACCTA CCATCCCACA CCTCATCAGT AATTTCTCGG TCACCTCACC 120
TCTGGGAATT GACTCACAGG GAGAGATTTG CCTGATGGAG ACCATGACTT GTGGAAGATC 180
CTAGGTCAAG GGTGGTCTGG GGGTGCTTTA AGAACTTTAA AAACTTGGTT TTTGGTTTGG 240
TTTGGTTTTG GGGGCTTTGT TTGTTTGTTT GTTTGTTTGT TTGTTTGTTT TTTTTAGACA 300
GAGTTTCTCT GTGTAGCCCT GGCTGTCCTG GAACTCACTC TGTAGACCAA GCTGGCCTCG 360
AACTCAGAAA TCCCCCCCAC CTCTGCCTCC CAAGTGCTGG GATTAAAGAC ATGCGCCACC 420
ACTGCCTGGC AAGAAGAGCA TACTCTTGTG CTCACTGGCC TCTGAGGAGC ATTCCTACCC 480
TCTATAGATC TCCTTTTTTT TTTTTTTTCC TTTGTTTGTT TGACTGGTTG GTTTTGTCTT 540
TCAAGACAGG GTTTCTCACA AAAAATCCCT GGCTGTACTG GAACTGGCTC TGAAGACCAG 600
GCTGACCTCC AATTCAGAGA TCAGCCTGTC ACTGCCTCCT GAGTGCTGGG ATTAAAGGCA 660
TGCACCATCA ATCATCAATA GCCTTACCCC CATTGGTTTT TTTATTTTAG ATTTATTTTA 720
TTTATTATAT GTAAGTACAC TATAGCTGTC TTCAGACACC AGAAGAGGGA ATCAGGTCTT 780
GTTACAGATG GTTGTGAGCC ACCATGTGGT TGCTGGGACC TGAACTCAGG ACCTCTGGAA 840
GAGCAGTCAG TGCTCTTAAC CTCTGAGCCA TCTCTCCAGC CCCTTGTTTT TTATTTTTAT 900
ACACTTATTT TGAAACAAGG TCTCACTGTA TGGCCCTAGC TGGGGCTACT TCACAGAGGA 960
GACTGGCCTC GAACTCATAG AGATCTGTCT GTCTACCTCT GAATGAGATC TGTCTGTCTG 1020
CCTCTGAATG CTGGGCTTTA GGTGTCAACC ACCATGTCCA GCCCTTTCTT GTTGTTCTTA 1080
AAAGACGGGG TCTTCTTGTG TGGTCTAGGC TGACCTTGAA CTCCCCAACC TCCTGCTTCC 1140
ACCTCCCAAG TGCTAGGATC ACATGCCTAA GACACACCCA GTTTTAAATG TCTCCATGTT 1200
TATGTTCTGT AGGAAGTACT TAAGATTTTC CTGTAGCACC TTGGCATTGA AACTTGAGTT 1260
CTAGTTGTGT CTGATGTCAT TTCCTAGATG ACACTAAGGA TCAGCCCTAG AGGATGTGAC 1320
CACATAGTTC TGGTTGGAGT TGTGCACCCA TTCCCAACAG TAATTTCTTT AATCACAAAA 1380
CTATGGTGAT GGAGGAACAT AGTAACTAGT GCCTGTGATC CCAGCACTGG AGAGGCAGAG 1440
GCAAAGGAAA TAGGAGTTCA AGGCTAGCCT AAGCTACATT ATGGGTTTGA AGCCACCAGG 1500
AGTTACGTGA GATCCTGACT CCAAACAAAT TATGATAGTC TTAGAAAGAA CTTGCCAGTT 1560
AGTTAAAGAC CACCAAAAAT GTAAAAGACC CTGTGAAGTT TGTACTCTCT TTGATCTGGG 1620
GAACTGTGGC CATGACTTCA GGCTAGGAAT AGCAAGCAGT CTCTGCAAAA CCATCTTTCA 1680
TCCTACCGGA GGCTGACATT TTTTACCTTC AAAGTGATCT TCCCAGCACA GTGTGGATTC 1740
CAGAGCCTCT GGAGAGCTGG GGTAGCAGCG GAGCCTCCCA GTACTCTCGG GGAATTCACT 1800
AAAAGGAGAA AGACTGCCTT CCTGGATAGT CTACCGAGCT GCTGTCTCCA ACGGGGGGCC 1860
TTCCCACACG GCCCACGCCA AGTCCCCTTG CTCAGCTCCT ATCCCGAGAT CACACACAGA 1920
CCTCTGTCCC CAGGCCTCTC TTCAGCTTTG CACACCCAGG CCTGGCGGCT GCTCCCAAAC 1980
TGTTTTACAT TCCACTCACA GATGACTGCT GAGTCTTTGG TTGCAGACTG CAGCATGTCT 2040
TTGTCTCCGC CACCCTGACC CACTGCAGGG AGAGGATCTG AGCTACAGCA AAACTTTTCT 2100
AGAACACTGG GTGAGAGGGG CCCCACATAG AGGGGTCTGC ATTCCCTGGC AACCTCAGAC 2160
AGATCGTCTG TACCTCCCAT CTCAGAGAGA TTCAGCTGGA AAACAAAAAT TCCTTATTTG 2220
GCACATTTCC CCACCCTGTT TTGGGTGTGT GAGGGAGCCA TCTCGCTAGC ACATAATTTC 2280
CTCGTCTCTG GGCCCCTTTC TCTAGTCTGT CATTCACCCG GGGTTCATGT CCTCCCTCCT 2340
TTGCCTGCCT CTGTATCCTT CCACGTCTCT CTCTCTTTGA AGCAGCCTGG TTCCCATGGA 2400
AACAGCAATG TCATTGGAAG AGTTGGAGCC TGGGAATGTC CCCAAGGGCA AGAGAAAGTC 2460
ACTCAACAAA AGAACGAAAA CCCACCCAGA GGGGTTGACT CTCGCTATGC TGGCAGGGGG 2520
TTCTCACAAT CCTAAGAAGG TTTAGGGCAG AACCTTTGCA GGGGTAAAAA GGGGATATCC 2580
ACCCATCTCT GTCTGTCAGG TCCCGTCTTT TCGGTGTCAT AGGAGCTGGA TGGGATAGAG 2640
GCTACCACGT GCGGGGCAGG TTCCAGTATT TCACACCACC ATCTATCTTA CACCCAATGC 2700
CAGGGCGGGC AGAATTCTGG GCATCTCTGC AATGCAAAAG CTCAGGATTC TGTCCCCGCC 2760
CCGTCACCTA CAAGTCAGTT TCTCTGCTTT GCTCATTTAT TTATATCCCA AGTTTTGGAA 2820
CACCTGGCCC ATTTCACAGA ACACCTGTAA CTAACACTGG AGTGAAGACA GGGACGAGGT 2880
CTGTTCAGAC TGGGGCTGCC GCAGTCCCGC AGTCGGTCCT CAGAGCAGGC TATTGAGTTG 2940
AGTGTTGTTG GCATCAGAGC CGGGCTCTTG CTGTGGCCAG GACTGCCTGC CCCATTACCT 3000
GAGAGCCTCT GTGTCCTTGT 3020