EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM108-00185 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Midbrain_E11 
Coordinate
chr18:3004400-3006090 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESR2MA0258.2chr18:3004848-3004863AAGCCAGGGTGACCT-6.31
ESR2MA0258.2chr18:3004536-3004551AAGTCAGGGTGACCT-6.94
LMX1BMA0703.2chr18:3005401-3005412AATTTAATTAA+6.32
LMX1BMA0703.2chr18:3005390-3005401ATTTTAATTAA+6.62
LMX1BMA0703.2chr18:3005393-3005404TTAATTAAAAT-6.62
Nr5a2MA0505.1chr18:3004543-3004558GGTGACCTTGAACGC-6.41
Nr5a2MA0505.1chr18:3004855-3004870GGTGACCTTGAACGC-6.41
POU4F1MA0790.1chr18:3005378-3005392CATTTATTATGCAT-6.59
POU4F2MA0683.1chr18:3005376-3005392TTCATTTATTATGCAT-7.58
POU4F3MA0791.1chr18:3005376-3005392TTCATTTATTATGCAT-7.04
PPARGMA0066.1chr18:3004533-3004553TGTAAGTCAGGGTGACCTTG-6.1
RARA(var.2)MA0730.1chr18:3005598-3005615AGGTCACATGAAGGCCA+6.28
Rarb(var.2)MA0858.1chr18:3005598-3005615AGGTCACATGAAGGCCA+6.47
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00597chr18:3005575-3006413pro-B_Cells
Enhancer Sequence
CTTTCTCTCT CTTTCTCTCT CTCTCTTTCT CTCTCTCTCT TTCTTTCTTT CTGTCTGTCT 60
GTCTGTCTTT CTGTCTTTCT ATTATTTTTT TCGTTTTTTT TCTGATATAT GATTTCTCTA 120
GCCCTAGCTG ACTTGTAAGT CAGGGTGACC TTGAACGCAG AAATCTGCCT GAGGTTGAAG 180
GTGTGTTCCA CAATTGCCCC AGCTCTACTT TAATTCTCTT TTTAAAAATT GTGTGTATGT 240
TTGTATGTAT ATATGTATAT ATAGAAGTAA TATTAATCCA TTAATATCTG TTTCCTAAAA 300
TTCATGTCTT TCCTTCTCTC TCTCTCATTC TTCTTTCTTT CTTTCTTTCT TTCTTTCTTT 360
CTTTCTGTCT GTCTGTCTTT CTTTCTGTCT TTCTATTATT TTTTTCGTTT TTTCTGAGAT 420
ATGGTTTCTC TAGCCCTAGC TGACTTGTAA GCCAGGGTGA CCTTGAACGC AGAAATCTGC 480
CTGAGGTTAA AGGTGTGTTC CACAATTGCC CCAGCTCTAC TCTAATTCTC TTTTTAAAAA 540
TGTGTGTGTG TATATATGTA TATATGTATA TATAGAAGTA ATATTAATCC ATTAATATCT 600
GTTTCCTAAA ATTCATGTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT 660
CTCTTTCTTA AATTTATTCT TTTCATACAT AGTTTCATAA TGTAAGCAGC CCTGGCCGTC 720
TTGAAGACAC TTTGTAGGCC TCAATCCTGT AAGAGCCTTC CTCTGCTTAT CAAATGCTGC 780
CATGAATGTT GTACCTCACT ATGACTGGCT GAGATTCTCA CCTTTTCTTC CCCCCCCCTT 840
TCTTTTTATG ATTCTATCTT TGGCCACGCA GTGGTGGTGG TGGTGGCAGA GGGAGGTGGA 900
TCACTGTAAC TTTGCAGCTA GCTTAGTCTT CAGTCTGATT TACTCGAAAG GAGTTCCAAG 960
AAGACTGGTT ATATTTTTCA TTTATTATGC ATTTTAATTA AAATTTAATT AAACCCAAAG 1020
AATTTAGACT GACCAATTCA GAGTCTGCCA TTTAAAAGCA TAAGGAAAAA GTAGGAGAAA 1080
ACGTGAGGCT GTCTGTGGAT GGTCGAGGCT GCTTTAGGGA ACCTCCTCAC CATTCTGCAC 1140
TTGCAAACCG GGCCACTAGA ACCTGGTGAA GGGAGAAACC AAAGTGACCT GAAACAATAG 1200
GTCACATGAA GGCCAGCCAC CATCTTGTTG TGCAGGTGGT CAGTTAGCAG ACAAGATAGC 1260
TGACATGCAC ATGTTGTCTT TCATCTTGGT GAGGTCAATG TGCAACCGAG TGACAGGACA 1320
AGGAAGTAGA CATGCAGACA ACAGACATGC AGGTGCACCA CCTCCCTTCT GTGTTTGTAT 1380
AAAACACACA CAAAAATTTT CATTATTTAC AGTAAGCCTT AAAAAGCACT CTGACAGCCT 1440
CGCATATATC TACATTCTAT GTGATTAGAA TTTCCTTTTT TTGTTGTTTT TTAATTTATT 1500
CTCAAGAGCT GCATGGTGGT TTCTCCTAGG TTCTGTTGCT CTCTCCTGGC ATGCAGGTAT 1560
ATACACAGCA GATAAAGCAC AAACACACAT TTACATTGAA AAATAATTGT AATAAGAATG 1620
AAAGAAAGAA AGAAAGAAAG AAAGAAAGAA AGAAAGAAAG AAAGAAAGAA AGAAAGAAAG 1680
AAAGAAAGAA 1690