EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM105-11259 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
MEL 
Coordinate
chr15:85487170-85489550 
Target genes
Number: 7             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr15:85489195-85489206TTTTATGGCCT-6.02
Foxd3MA0041.1chr15:85487319-85487331GATTGTTTTTTT+6.44
IRF1MA0050.2chr15:85488327-85488348TCTTGGTTTCAGTTTCTATTT+8.03
IRF9MA0653.1chr15:85488331-85488346GGTTTCAGTTTCTAT-6.51
RUNX1MA0002.2chr15:85488600-85488611GTTTGTGGTTT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 13             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02573chr15:85486145-85531265HFSCs
mSE_02940chr15:85441364-85534582TACs
mSE_03674chr15:85487277-85489442Cerebellum
mSE_03998chr15:85487244-85489374Cortex
mSE_06607chr15:85482862-85489449Heart
mSE_07161chr15:85487186-85489391Intestine
mSE_07955chr15:85487149-85489627Kidney
mSE_08419chr15:85487202-85489411Liver
mSE_08956chr15:85487243-85489362Lung
mSE_10695chr15:85487155-85489415Olfactory_bulb
mSE_12162chr15:85487320-85488434Spleen
mSE_12162chr15:85488539-85489315Spleen
mSE_12597chr15:85487302-85489234Testis
Enhancer Sequence
GCCCAGTGTT AAGGAGAGGA AGTAAAATAA ATCTTTTGAA AGTGTGCCCA TCCATTCATG 60
GCTTAAAAAT TCCAAGTCCC AGACTTTGTT CTCCTTTCTC TCATTGAGTT GGAGGAAATA 120
AAAATGTGTA CTCATGCAAC TCACCTGTTG ATTGTTTTTT TTTTTAAGTT ATTTGTTTTA 180
TAGTCTAATC CCCATTGAGC ACCGAGATGT CTAGCAAGGC TGGGTCTGTA TGGTCTGTGA 240
GAGGTTGGTG CCTCACAGGT CCTGGGCCTG GCAGGAGTCC GGGCCATCAG CTCATGGGTC 300
AACACATGTC TGTGTGCGGC AGCTCAAACT GCCTTCAGAA AGCCAGGAGT GGTGGGAGAC 360
ATATGCTCTA CACACAGCAT TTTGTTCTGA TTTATTTTAG GCCATTTAAG ATGCTGTTAG 420
CACGAAGAGT GGCGGATCTC ACTCACGTTC TGAAAACCAT TGGAGTTTCA AGCTCAAGTA 480
CTTTTTTTTT CCAATCCAAA TTTAGGAATT GCCTTTTAGA GTAGAAAACA GCACAGGGGC 540
ACTCCTTTTA TCCCACTTTT AAAGGAAGAT ATTTAAGCCA CCCTCATTGG ATCTGGAGAC 600
CCATCCCTGC AGCTGGAATC TAGAAACAGC CCACTGTAAA CAAGTGAGAA ACAAGATACA 660
CTCTCACAGG GGTCAGGGTC CTGGGATTGG AGTGTCCTTA GACATACACT GAGCCCTGGT 720
CTGTGCACAG ATCTTCCTTC TAAGGCTGTC ATGTTATCAG AAGGGAGACT ACCAACCCAG 780
CTGAGACACT GTCACACTCC ACAGAGTCAC TAGTCAGACC CACAAGCTGC ATCATGCCCT 840
TTGAGTGATA AAGGGACCCG TGTAAGTACC ATTACTTTAA GGCGAACCTA GACGGTCTTT 900
GTTCCCTGTA GCTCTGCCCT GGCTCCAGGC GCTACTACTG ACACTGTGAA AACAGCAGAC 960
AGACAAACCA AACTCTATAG GAAATACAAC GACTCTCCGA CTCTCCAAGG AAAATGGTCT 1020
GGAAGCTGTT AGAGGGGTAT AGAAAGGCTC CTTGAAATTT GAAGGTGCTT CACTCCTGGT 1080
ATAAACAGGA GCCTGCTCGC TTGTAGCTGT TGGGGCTACT GCAGGCCAGT GACACCAGCA 1140
GCCAGTGTTG GCGGATCTCT TGGTTTCAGT TTCTATTTGA GAAACAGAAG CTTTCCCTAC 1200
AGGGTCAAGG GCTGGAGATA AGGGAATAGC TATAAACTAA CTTTTTCTTA AAAAGAGGCA 1260
ATGGGTGATA ATCAGTATTT GCATTAAATT CATAAACAGT AGCCATTCAC ACACTTCATT 1320
CTCCATGTGA ATTATATCTT TGTGATATAA CATAGTCCTG TGATTCTGAA CGCATCATGG 1380
ATACATTGTA AACAATTTAG AGGTTACAGA AATGAATGCA AGGAAAGGTG GTTTGTGGTT 1440
TCTACAAAGA GACAAGCTCT CCTCACGTTT TCCTGGGCTT CCTCCCTCTT GACTCTTGCA 1500
GTATCTGTTT GCACGATGCC TGTCTGCTCC GTTGTCCCCG TTTCTTTGCC ATTTGGTTCC 1560
AGAGGCACTT CTTCCTCCCA GGCGAACCCG ATCTGTCTCC TCCAAGTGGC CAGCTCTGGC 1620
CCTTAGGTAT TCAAGGAGAA GGCCTCCGGC TCCCTGATAC CAGATTTCTT CCCTGAGGTT 1680
TTGTGAGCCC AGATCTGGCA GCCGGACCTT AATCATTCCA GCAGCAGACA GCCACACTGC 1740
AAAGCTAAGG ATGTACAAAA ACTCTGGGTG CATGGGAGTA GAGCGGCCCA GAACCTTGCT 1800
ATTAAGGTGG AGAAGGGAAA CTGAGGCTTT CCTTGGGGTA GGGGTAGAGG CAGGTAGGGA 1860
ACATGGCGGT CAGCACAGGG ACCTGCAGTA TGGCGATATG ATAAACAGCA GTATTGGTGT 1920
TTGGATCCTG GGCAGAGTAA AACAGTTGGG CCAAATAAAG CAGGCCTCTT GTTAGCTGTG 1980
AAGTGGCCGT CGGCTCTGTT GAGATAGTTG CCTCTAAGGT GTCCATTTTA TGGCCTTGAC 2040
TTAAATCTAC CAAGTGGATT GCCAATGGGG ACAAGGGGCT TGCAAGCAGG GAAACACCAG 2100
AAAGGTTAAT GTAGGGATCC AGTCCCCAGA TGCCATATCA TAGTTAGGCA TGTACCTCAG 2160
CTGGCCCTAC AAATTAGAAA AAAAAAAAAG TTCCACAGAA CCAGGCCTCT AGAAAGGGAG 2220
CTAACAAATG TATATACAAT GTATACATGG AGTCAGCTAA ATTAAAAAGA AATTTCAAAA 2280
TTGTTAAATT TTGAGTTCCT TGCTGAGAAC TAGAGATGTC TTTATGTTTC TCTTTCTTTC 2340
CCTATTTTTT CTTTTCTTAA AAAAAACTTT TTAAAAAGAT 2380