EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM105-00530 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
MEL 
Coordinate
chr1:72272130-72274600 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:72272724-72272742GGAAGGCAGGAAGTGAGG+6.53
KLF5MA0599.1chr1:72272573-72272583GGGGCGGGGC-6.02
Nkx3-2MA0122.3chr1:72272902-72272915ATTAAGTGGATTT-6.2
PKNOX1MA0782.1chr1:72273839-72273851TGACACCTGTCA-7.22
PKNOX2MA0783.1chr1:72273839-72273851TGACACCTGTCA-7.22
SP3MA0746.2chr1:72272558-72272571CGCCACGCCCCTC+6.18
TGIF1MA0796.1chr1:72273839-72273851TGACACCTGTCA-6.92
TGIF2MA0797.1chr1:72273839-72273851TGACACCTGTCA-6.92
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_10125chr1:72271505-72272551Embryonic_stem_cells
mSE_10125chr1:72273712-72274091Embryonic_stem_cells
mSE_10125chr1:72274131-72275027Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
TCACCCAAAA ATTTGCTGAA AACTTACTTT TTTTTTTTTT TTTTTTGCGC ACCTGATAAG 60
GGCTGGCGCA CTGAGAAAAG TCCAGATGAT ACTACAGCCA ATAAAGAGAG CAGACTGGAG 120
TAAAAGAGTC AAAAAGCTGA ATTAGCTGTG AATGCCTGGG CGACAGAACA TCCCAGGATC 180
GCGCTTGTGA TGGGCTCAGG AGAAGCTTTT GGTAGTTAAA TAGCCAAGTG AGAAAGGGGA 240
GGATACGGTG TCAAGTCACA TACAGCCTCA GGACTGGAGG AAACAGCACG GACGAAGAGC 300
AGACTGCCTG AATCGAAACC AACCCTCAGC TCCTCAGGCT ACCTGTTCCC ACCTCGCTTT 360
CCTCTGTGGA GGAAGAAGCG TAGGTGGGCC GCTTTGAGAC TGCCAGGAGG AGGCGGCTCA 420
GTGCGAACCG CCACGCCCCT CGTGGGGCGG GGCATGCAAA TAATACTCGG CGTGCGCGCT 480
CGAGAACGCC GGGAGAGCCG GGGTCGTGGA CGTTGTAGCT GAAGCTGTGG GTGCTGGAGT 540
GGGAGTGAGG CGTGGAGGAT GCAAGACGCG CACGGGAGGA GGAAGGAGCC GCGGGGAAGG 600
CAGGAAGTGA GGGTTGCGAG CGGTCACCAC GAAGTTAATG TGTCTCGCGG ACGCAGAGCA 660
CGGCTGCATG GTGTGTGCTG GGTATCGCTT CTCGGCCTTT TGGCTAAGAT CAAGTGTAGT 720
ATCTGTTCTT ATCAGTTTAA TATCTGATAC GTCCTCTATC TGAGGACAAT ATATTAAGTG 780
GATTTTTGGA ACTAGGAGTT GGAATAGGAG CTTGCTCCGT CCACTCCACG CATCGATCTG 840
GTATTGCAGT ACCTCCAGGA ACGGTGCACC CCCTCAGGGG AATAATATTT GTTTAAAATT 900
AGAGCTAATT ACTCGTTTTC CCTTTGTCTT CCAAAGGTTT GTTTGATTTG GGGCTAACTT 960
TAGAAGCATC TTTTCAGAGC CCTAATACTT GAGAGGCAGG TGAATTTCTG AGTTCTGAGG 1020
CCAACCTGCT CTACAGTGAG TTCCAGGATA GCCAGGGTTA CGCTGAGGAA CCCTGTTTTG 1080
GAAAACCAAA TAAAATACGT TTCTAGTCTT TATCTTTTGT AGTATTTGAG TACCTAATAA 1140
AACTCTGAGC TTCTAGTGTT ATTATCTGTA TCCTTTGTAG TCAAGATTAT TATTATGATG 1200
TGCAAGTTCC AGCTTGGCGT AACACAAAGC ACCTAATGAC TGTTGTATCT AACACCCTTG 1260
ACTAAGGAAC CAGCTGGTGG TGTCAAAAAC TCTAGTATTT ACTAAAACTT TTGAAAGTCA 1320
ATTTTTTAAA AATAGCTTTC TGTGTATGCA TATGCGTAGT GTGTTTGTGG GCACACAGCC 1380
ATAGGAGTGG GTTCTTTACT GACTTCAGGT GAGTTCTATA CTGGCAGTAT ATGTCAGGGA 1440
AAGCTGTGCG TATTTATACC TGCCTTAGCC TCCTAATTTC TAGGGGTTTC CCCCTCATGG 1500
TCTTTTTTTT TTTTTTAAGA TTTATGTATT TATTATGTAT ATAGCATTCT TCCTGCATGT 1560
ATACCTGTAG GCCAGAAGAG AGCACCAGAT TTCTTTATAA GTGGTTCTGA GACACTATGT 1620
GGTTGCTGGA AATTGAACTC AGGACCTCTG GAAGAGCAGC TCTGAACCTG ACCCATCTCT 1680
CCAGTCCCTG TTACAGTCTT AAAACTTTTT GACACCTGTC AAAGAATGTT AGGATTCAGA 1740
GAACTGGCTG TTCTCCCAGA GATCCCTGTA ATTTCAGGTC CCCCATGCTT CAGGTCCCAA 1800
TACTCAGTTG GGAGCTCACA GTGTTTTGTA AGTAAATAAA CATGCCCAAA CCACCCGTGA 1860
ACACACACAC ACACCACAAT AAATCCAAGT TTAAAGAGAA AAACTCGGGG GGGAGGGTAT 1920
GGGGGACTTT TGGGATAGCA TTGGAAATGT AATTGAGGAA AATACGTAAT AAATAAATAA 1980
ATAAATGAAT AAATAAAAAA AAAAAAAAAA AAAGAGAAAA ACTCAATAAA AGTGGGATAG 2040
TGGTATGTGC AGAGGACAAG TTAAGAGCTA ATACCAAAGC ACCATTTCCA GGTACATACT 2100
GACTGTGAGC TAGCTACAAA ACAGGATGGA CAAAAATGCA GTCCCACTGA CGGCAGGCCA 2160
CATACATGCG GTACACGCTG TGATGATGCT AGTATTTTTC AGTCATTTGG TGCTCTTGCC 2220
TGCATTGTCT TGTTGGTCAC ATGTCCTGTA ATTTCAGGTC TCCCATGCTT CCAAACAAGT 2280
ATTCACTCAA CTACAAGAGC TCAGATTGTC ATATACGCTC AAGGCCCTGG TTACTGGTTG 2340
GAGACAAATA GGAGTGTCCC AAGCCCATCT CTCAGGAGGC AGAGGCGGGC AGTTTCCTGT 2400
GAGTTCAAAA CTGGTTTGGT CTACTGATGA TAGAGTTGCA GGCCAGCCTG GAATAATACA 2460
TAGTAAGATC 2470