EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM102-19368 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
MC3T3-E1 
Coordinate
chr3:60302140-60305100 
Target genes
Number: 1             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F6MA0471.1chr3:60304879-60304890CTTTCCCGCCC-6.32
HNF1AMA0046.2chr3:60304167-60304182TTTTAATAATTAACA+6.05
HNF1BMA0153.2chr3:60304168-60304181TTTAATAATTAAC-6.14
IRF1MA0050.2chr3:60302571-60302592CATGGCTTTCTTTTTCTCTTT+6.37
Lhx3MA0135.1chr3:60304197-60304210AGTTAATTAATTA-6.64
Lhx3MA0135.1chr3:60304204-60304217TAATTAATTATTT+6.71
Lhx3MA0135.1chr3:60304200-60304213TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr3:60304201-60304214AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr3:60304202-60304212ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:60304202-60304212ATTAATTAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr3:60302868-60302888ACCAAAAACAACCCCCTCCC+6.22
RREB1MA0073.1chr3:60302887-60302907CCCCAAAAAACCCAAAACCA+6.54
TEAD1MA0090.2chr3:60304019-60304029CACATTCCAT+6.02
TEAD4MA0809.1chr3:60304019-60304029CACATTCCAT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02212chr3:60275845-60315730Macrophage
mSE_06725chr3:60302694-60304136Heart
mSE_06725chr3:60304246-60308185Heart
mSE_07877chr3:60302536-60304206Intestine
mSE_07877chr3:60304291-60306932Intestine
Enhancer Sequence
ATATAGTTTT ATTTTATCTG AAATAGTTTT CTATAATTTC TCTTTCCTCC TGAAAATGGC 60
ATCCCTTTTG TGCTAAGGGC TGTGTGCATT CATGAGCCTG CAGAAGATAA CGACAACTCA 120
CAGTGTAGGA GAAACCTAAG TGCTCTCCTG GCACTGAAAA GGAACCAGTA GATTCTAAAT 180
GGGGCAGCGA TTAGCTTTTT ATTGCTATAA TGATTTTTTA CTGTTTCCAC AACTTGAAAT 240
GTGACTATTG CTAGTTGAAG GTAACATACT TTAATATTTT TAACATATGA TTAGATAGTT 300
TGTTTTTTTT TTTCTCCTAG TGGTTCAAAC TTTTCAATAA TAACAGGTTA GGCTTACTGA 360
TGGCAACATT GTTTCAGGCC TTACTTTATT TTGGCTCACG TCTAAGGTTT AGATTGGCTT 420
GGATGCCTTG TCATGGCTTT CTTTTTCTCT TTATCTCTGT AAAATAACAT TTTCCTTTGA 480
TTTGCTCTTT CCTAGACTAT TGTATTGTTT CTAACATTCA GGTGCCTTTC TTGTATTCCT 540
TTTTTGTTCT ATTTGATGGA GCAGAAAATT TGAGTTTGTT TCGATTTTTC TTTTGTTTCT 600
AGCAGTTAGT CACCCTGCAG TGTTAGAGTT GATAGTTTCC CCTCTTGTAC TACACGGAGG 660
TTCAAAGTTC TGTTTTTTAC TGCGTTCAAT TGCAAAGGGC AAATTTTCTA GCAAATGGGG 720
GGAAAAAAAC CAAAAACAAC CCCCTCCCCC CAAAAAACCC AAAACCAAAA AACCCAACAA 780
GTCTCTAACT CTGAGTGGGT CTGAGTGCAA CTGTAAATTA ATCCTTCAAA CAGGATTAGG 840
TCTAGGCAGT AGGCAAGGAA GCTAGCTCAC ACAGCAGCAG GTGCAAAGGT AGCCTATGCT 900
TTCAGGAAGC CAGAGCTCTT TGATAGAAAA TGGAAAGCAA CTGAAAACAA GGAAAGGCTA 960
GAAACAATCC TGTAGGCTAA GCTAGCCTTG GGAGTTTCCC AAGGCCCATC CCTTCCTCCA 1020
TCCCTGCATG AGTCAGTTTT CCAGTGGGTC TACACCCATT TACCCTTCCT TTGCCAACAT 1080
CCCTGAATAC ATTCTCAGTA ACCCTCTAAG CATTTGCCAA AGATCTTTCT AGAGTGCAAG 1140
TCCAGACTCC ACCCTATCGC CCTGGTCCTG CGAACTAGTT CATAGTTTGC TGAATAACGT 1200
TGAAGTTCCT GGCTTCCTTC TCTGCCGACA AGTTAATCTC CTTTTAAAGA AAGGAAACAG 1260
ATGACTGTAT TGATTCTACA GGGCATTGAA ACAGATAGGC TTCTTGCACG TGCTCTGCAC 1320
TTTGCTCCAC CGTCCCAGGG CCCACTTGTG CCACACTCCC TGTGCCTATG ATTGTGTGCA 1380
CGTGGAAGCC AGGGGTCCAC ATTAGGTGTC TTCTGAAATT TACCTTCCAT CTTATTACTT 1440
ACTTTTTTGA GTGTCTCTCA TTGAGTCTGG AATTCAGAGT TAACTGGCTA ATGGGCTGTG 1500
AATATCTCCC ATTCTCTACC TGATCCCAGC ACTGTGGTTA CAGACACTTG CCTAGATGTT 1560
CGGAATTTGA ACTCAGGTTC TCAGACCTGA GCTCCAGCTT CTTTACGCAG GAGTCATCTC 1620
CCTAGCCAGC TAGCCTATCC AGGCAACTCT CTTTTTATCT TAGCAACTTC TGCACATCCT 1680
TCAAGGCGCT GCTTGCATAA GTTCCTCCAG GGAGCCTTCC CTCCTTTTCT CAAGGGCATT 1740
TTGGATATTT GCCTACCATC TTAGCACCAG CTGGCTGGTG CTCTTTTCTA CCATGCTGCT 1800
CCAAAAAGTA CAATCCGTGT ACTCCATCCT CCTGCACTTA CCTCCATCCT ACCTATACTT 1860
AACTACTTCT GCCATAGCTC ACATTCCATC CAGTTGCTGG AATGAATGCT GAGAAAGTCC 1920
TCAGGCGCTG GTGGTTACTA ATTGTCAGTT AGAAACTCCC TGTCTCTGTT CTCTGAGAAA 1980
ATGCTACTGT CATTCTACTT TGTTTCCATT GTTGGGGACT TGGGAACTTT TAATAATTAA 2040
CACTGAGAAG TGGTACTAGT TAATTAATTA ATTATTTCAG GAAGGGATCA GTAAGCAGCA 2100
AGTCCGTGTT TCATGGACCA GCAGAGGATC AAGATCTGTT ACTAGTACCT CTGCAAACTA 2160
GTGGAGTACT TTATTTATTT ATTTATTTAT TTACTCCGCC TAGGAGAGTG TGCCTGACCC 2220
ACTCAACAGA AACAGGGAGG GAGAAATCCA GTTTGCATTC ACTCACCTCA ACTCATGTTC 2280
AAACCATGAA ACAAACGTTT TTATAGTTAA AAATCATCCC TGACGAAGTT ATCAGAATTC 2340
CTTGAAATTC ACTGGAAATC CCGTCCGCAG ATCTTCAAAC TTTATCTCTT CTCAGAAGCC 2400
CAGAATTCTT TTCTTTCAAA GCCAAGTTAC AGGACAGCAG CTAATGAACT AGGAGCTGGT 2460
GTTTCATTTG CTCAGGCGGG CAGTTGCCCA GGGCTTGTTT GCGTGGGAGT ACCTCTGCAG 2520
CGCCTAAGAT GTTATTTTAT TTTAAAAGAG GGAGCCCTGC TTGCTTTCTG TACACCACAC 2580
TGCAGAGTTG GAAGTAAGGG AGCCTTTAAA CTGCAAGTTT TATTTGCCGA TAGGACAGGA 2640
AGGTGGCCTG GGTTTGTGTT TGGGTGACGA TCAGTTTTCT CGCAGAACTC CAAAACTGTG 2700
AGTGCTGAGA AAGATACCCA CCAACACCCG TGCAAGCTTC TTTCCCGCCC TTCGCCTTCC 2760
AGGTTCCAGG CGATGCGCTG CTTCTGCTGC TGCAGGCCGG GCAGCTAACT CTAACCTTCC 2820
GTCTAACCTT GCGGGCCTCG CGGGCTGGGC GCGGAGCCCC GGGAGCTGGA GCGGCGGTGA 2880
GCGGCGCGGG CCCGGGCGAG CGAGCGGGCG GGCGGGCGGG GGCCGGGGCT GCGCGTGGGA 2940
GCTCTGCGCG TCCGCGCGCC 2960