EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM102-01203 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
MC3T3-E1 
Coordinate
chr1:93995050-93998870 
Target genes
Number: 1             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:93998543-93998561CCTGCCCTCCTTTCTTCC-7.13
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:93998547-93998565CCCTCCTTTCTTCCTTCC-8.03
Foxd3MA0041.1chr1:93996971-93996983GAATGTTTGTTC+6.14
Foxd3MA0041.1chr1:93997774-93997786GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxq1MA0040.1chr1:93997916-93997927AATAAACAATA-6.62
HNF4GMA0484.1chr1:93996506-93996521AGGGTTCAAAGTTCA+7.64
Hnf4aMA0114.3chr1:93996507-93996523GGGTTCAAAGTTCAAG+6.93
Nr5a2MA0505.1chr1:93996514-93996529AAGTTCAAGGCTAGC+6.14
RXRBMA0855.1chr1:93996507-93996521GGGTTCAAAGTTCA+6.91
RXRGMA0856.1chr1:93996507-93996521GGGTTCAAAGTTCA+6.96
RxraMA0512.2chr1:93996507-93996521GGGTTCAAAGTTCA+6.84
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02655chr1:93982944-94040567HFSCs
mSE_03244chr1:93972239-94013222TACs
Enhancer Sequence
ATTTTGACTT TGAAAGGAAC TTGCTCTCAG AGATGTCACC ACTATGGAGG AGCTGGTGTG 60
GTGACAGGGT GGTAACAGGA AAGTTCCCCT AAGAGGCTGG AGCCCATGCC AAGGAGCCTA 120
TGAACAAGAG AAGTGCCCCT GGGACCAGGA CAGGAACACT GTGAATGAGC AAAGCTGGAC 180
ACCAACAGCA TGACCCTGAC ACATGACAGT GCAGCTGCTC AGGGGAAGGA CAAAAGCTCC 240
GACATCAAGG GAACATGGGA AGGGGGATGA AGACCATCCC TGCTCCAAAG ACTCACTCCA 300
ACGAAGACAG AACTTCCAAC GCTACTGGAG AATCAAGGGC TAGCAATCTA TAGCCTAGGT 360
AGAAGCTTCA CTGCTGTTTT GTTTCTTAAT AAAATATAAA AGATAAACCA CCAAAGGAAA 420
AATGTTAAGT TTTGGCTCAG CCACAGTACA ATTTAAGAAG CATTTTTGTA TATAATCTTT 480
CTTGTACTAA ATAATGTCTT TAAAACCATG CTTGACAGTA ATCAGAGAAA AATCCACTTT 540
TTAAATTAAA ACCTAAGAAT ATACTAATAG TTTTTAATAA ATTTGTTATT TCTTTTCCAA 600
ATATGAGCTA TTATTTCCTG TATTATTACT CTTACATGGT TCCATGCTCA GTTAAATCCT 660
CACGTGGGGA AGAGAAGCCT TCCCAAAAAG CTGACCATGG GGACAGCCAG TGCCAATGAC 720
ACAGGGACCC CACAAACCAA GGCACATCTA TTTTCATTGC TGAAGGACAT TTCTTTCTGT 780
GTATAACAAG AGGAGGGGGA GATCTCTGAG ATTTCCAACA GAGTTTTAGA CAGACAAGGG 840
ATTCTGAGTC CCATCAATTA CAAATTAAGG TTCTCAATTT GAAAAGCTTT ATACAATATG 900
ATTGGCAGAA TAAATAATCT AGACAGCAAG AAAACTGAAA GGAAAGAGCT GCTCAGAAGT 960
GGGTGCCCAC CCCACTTTAT CATGTATGTC CCACAGGATG TCTGCATGTC CCGGGGTAAC 1020
TCTCAAACAG AAACCTATAC TACTAACAAA GGACTCAGCT GCACAGGCTC CCTGGGCCTT 1080
GTGCAATGGA ACACAAGGAT CACCAACACA AGGACCTGGG AGTTTTGTGA GAAAGCCAAG 1140
AACCAAGGCA GGGAACGGAC TTGCAAGTCA TCCTGGCCTG CCATGACTGG CCCAGGCTGG 1200
CCAGGCCAAG TGTGAGCTTC CAGGGCCAGC TGCGGGGCCA AGGACTGCCT TCCTGGCCAA 1260
CAAGACAAGC CACAACAGCT GTGACACTGA CGACGGGCAC ACTAAAATAG AAGGGTGTTT 1320
GTTTGCATCT CCTGTGATAA AGACCTGTGT GGGGGTGGAG CACTGAGAAG ACCAGAGCAG 1380
ACTGGAGTGA GATTTTAATA AAGTTAAATA AAGCCTTGTG CAGTATTATA TGCCTACAAT 1440
CCCAACTACT GTCAGGAGGG TTCAAAGTTC AAGGCTAGCC TGCACAACAG CATGAAACCT 1500
GTCTAAAAAT ACAAAGAAAG ATGGTCAGCT CATCACCTAA AGAGAGACTA GGGAGCTGGG 1560
TGGCTCTGGA AACAGGCACA TACTCCCCTC CCTGAACTGG GGCTGTGCGG GTGCCAGTAT 1620
GTAATACCTC ATGGGAGAAC CCACAGCCAG CCTGCTGCCA GGGCCTAGAG TACAAAAACA 1680
GCTTTAGAAG ACAGCATACA ATTAACACAG CAACAATCAT CTTCCTAATT TAGGGTAATC 1740
TCTGCTTCGT AGCCCTTTTT GGCAGTGGGT GTACTAGAGC TATCTGTGTG GGTGCTTTTC 1800
ATCTGGTTAC TCGACGTCCC CAGTTGGAAG ATATCAAGGA AGATCTTAAA TGTCCACTAG 1860
CACCTTCTAG AGAAAGGGTG AGACTCAAAA GAGTTAGTAG GCCTTGCCCT CCCAGAAGAA 1920
GGAATGTTTG TTCGCAAGAG TTCATGACTA CTGATCAGGC TTTTGTCTGC AGCCTGGCAG 1980
CAGATCAGGG TAGGACACTG CTGTTGGGGC AAAAGCCTGG CTGGGGGTGG GAGGGATTGG 2040
AACTTCAGCT CTCTGAAAGA AGTGGGGACA CAGAGACAGG TCTGGCCCCT GGTGGCTGGG 2100
AACCTGGGTG CAGTATAAGA GTGTCAACAG TTCAGGTGAC CCTGTGCACT GCCTGTCGAG 2160
GAGCACCAAG TGCTGTCTTT GGTCTGGCCC ACAGGCATTG AGGTCCAGGT TCATCCAGTC 2220
CTGGCTCCAA AGAAAGCAGA GTTCTCTGGC ACAGTGCTCT GGGTGAGAAC ACAACCTCTG 2280
GCCAGCATTT GTTGTTTGCT GGACATGTGA CGCAAAGGCT TTTGAGAGCT TCTGAGAGAG 2340
AATAGCAACC CCATAAACAC AGACGTCCTT GAGGCAGGGG CCAAGAGAAT CCAAGAATCT 2400
GATGGACTGG GGGCAGTGAC CCAGATGCAC TACAAGAGCC TTGTACCACA GCGGACAGGC 2460
ATAGAGCCTG GAAACAGAGA CCTACCAAAA CTTTATTTAA AATCACCTAT CTTTATTCCA 2520
GAAAAGCAAA TCAAAGTCTA TCTGGGGATT CAAACAAAGT AATGAGTGAA GTCAGGTCCA 2580
GTGACCAGTG ATCACAGGCA CAGCCATTGG ACCAAAGAAA GAAAATTTTA TTTCTCTCTC 2640
TGTTTTTTCT CCTTTTAGAG GAGGAAGGCA GAATAGAAGA CAGCCAGTGA GGCCATCTTT 2700
CACAAAAACC TTTAACTGTT TTTTGTTTGT TTGTTTTAAA AAAAAAAAAA AAAGCCTACA 2760
AGGGACCAAA CCCCACATGG GAAAGGTACC CAACAGCACC CCACAGGCAA GTTCATTCCA 2820
GCTCTCTGGC AGGCACGAAG TCAGTAACTT TAAATTATCA CATCACAATA AACAATAAGC 2880
CCCATTAGAT GTATGTAGCC TTACTTTAAA GAACATGCAA CCAAACATCC CTACAGTAAT 2940
ATACCAGGAA TAGCTACTAG CCTGGGGGTT GAAGGAACCC AGAGCCTCCA ACCCCACCCC 3000
CAACAGAGGC CTATGAAGGG ACTGAGATCT ATGGAATTTG GATTCCTTGA AATAGCAGAG 3060
GCCAGCTGAC TTTTGAACTT TAGGGTCCCA GGATTTCGAT ATAGTAGCTG TCCTTAGAAT 3120
GATGGAGATT CCCTTTCCAG AAGTTTGGCT AAGACCTGAT CCTTTCCCAA TGTTAGTGAA 3180
GAATTTTAAG CATCTTGCAG AAAACTCACT TTTAGAAATA AAGTGCCCAA CCCAAAGATT 3240
AATAAACATG GCACAGTCGA GCCCAAGGAG TGAAGACACA AGGCGGGACT CCAGAGAAGC 3300
AGGAAGGCCA GACCCTGGCT ACCCCGAGGA ACTGAGGAGC AGGGAGAACT CAGGCCTTCT 3360
GGTGTCTTGT AGCTGCTGCC CAGGTTGTTC TATTTGTCTT CTCTCTGGAT CCACTCAAGG 3420
CCCACACTGA GATACTGGCC TATGCTCCAT GAACACTCTA AGTGGTTGGC TTGAAGACCC 3480
CAGAGGCAGC AAACCTGCCC TCCTTTCTTC CTTCCTGGTG GAAACCAAGG CAATGGGCAT 3540
TTACTAATAA GCACCTGCTG GGGGTAAACA CTGAGAGAAG ACTTCAAATG CCATAAGAAA 3600
AAATATAGCA AACCACCCAC AGAAATGTCT ATAGAGGGAG CCAGGCCACC CTTCCTCATC 3660
ACCAGCCTGT CTCCCAATCA TCCTACAGGA GCTGCTAATT CTCAAATAAA ACAACACACT 3720
TTGGCAAGCA CGCCAAGTAC TGTAGGTCAG GCAACACTGA TGTCCAAATA CAAGTACCCT 3780
TCATGCTATT ATCCAAGAGG ACATGGAGGA CCAAGTTCAC 3820