EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM101-19534 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Mammary_gland 
Coordinate
chr3:27090390-27094280 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:27091370-27091388GGAAAGACGGCAGGAAGT+6.18
HNF4GMA0484.1chr3:27093860-27093875GGAGGTCAAAGTTCA+6.98
Hnf4aMA0114.3chr3:27093861-27093877GAGGTCAAAGTTCAAC+7.49
Lhx3MA0135.1chr3:27093258-27093271GAATTAATTAACT+6.15
MEF2AMA0052.3chr3:27091265-27091277TCTAAAAATAGC+6.52
MEF2BMA0660.1chr3:27091265-27091277TCTAAAAATAGC+6.22
MEF2CMA0497.1chr3:27091263-27091278GGTCTAAAAATAGCT+6.82
MEF2DMA0773.1chr3:27091265-27091277TCTAAAAATAGC+6.14
NR2C2MA0504.1chr3:27093860-27093875GGAGGTCAAAGTTCA+6.72
Nr2f6MA0677.1chr3:27093861-27093875GAGGTCAAAGTTCA+6.83
RARAMA0729.1chr3:27090812-27090830AGGATCAGAAGGTCAAGT+6.14
RXRBMA0855.1chr3:27093861-27093875GAGGTCAAAGTTCA+7.22
RXRGMA0856.1chr3:27093861-27093875GAGGTCAAAGTTCA+7.42
RxraMA0512.2chr3:27093861-27093875GAGGTCAAAGTTCA+7.38
SOX10MA0442.2chr3:27092734-27092745AAAACAAAGCA+6.02
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02708chr3:27087619-27112080HFSCs
mSE_08319chr3:27091750-27093749Kidney
mSE_08319chr3:27093811-27094750Kidney
Enhancer Sequence
TTACGGGAAC ATGGGTAACT CAAAGGCAGT ATGTCATAGA AAAGCCCACT CCGGCATGGG 60
TGATGCTGTC CTGGCCTCCA GCAGAGAGTC ACCGATCCCA GCCATTATTA ACCTGTATTC 120
CCATGGGGGG GAGTGTGTGT GCAAATTTTA TGAATTTTGT ACCTTTCATG AGCTTCCTGG 180
GCTTTAGAAA CCTTCCTGGG AAGTTTCAAT TAGCACAACA AGAACTGGCT ACACAACAAG 240
AGTTGCCAGC TGAATGAGAT GTGAGGGGCC ATCTGATAGT AACCGGGGCT ATACTCAAAT 300
GACAGAGCAT AAGTTACAGA TGGGGCTTTT ATGGAGCCCA CAAAAGAACA CCAGACACAG 360
ACCTGGAGTC AGGGCTAGGT GGTACACACC TGTAATACCA GCACTGGAGA GGTGGAGGCA 420
GGAGGATCAG AAGGTCAAGT CTGCATGAGA CCAAGTAGCA GAAAGTGGCC CTGGGTACTG 480
GGCCTGTTCC CTCTTTAATC TGTTAGCAAG ACTGAGTATT GACAGCACAC TCAGTCTTTA 540
AACATCACGA GCACTGCCTC TCTCAGATCC TGTGCTTCGC ATGTGATTCA TTGCGTCACT 600
CCAGCAACAT GGCATTTTTC TTTATGTGAC AAGAGGAGAG GACTCAAAAG GAAGAAAAAT 660
AACTTGCTCA GTATGGCAGC GCTGAGGAGG TGGGGCAGGT GAAGGCCAGG CTGCCTCGAT 720
GCCATGCCTA GGAGCTTCAC CATGGTGCTA ACTAACGTGG CACAGGGACC AGCTGAGAAA 780
ATGGAAGTCA GGCTCTCACA AGAGAGAGGC AAAGGGCATT TTAGCAACAG AATATGAATG 840
AGGGGCTCAA GGAGAGATTG TGATATAGTT GAGGGTCTAA AAATAGCTTA AACCAGCTAG 900
AGCCTTGGAA GTTTTAAGGC CAGAGTGGAG GTCAGAGGGA AGTGTGGGCT GGGTAAGGAG 960
TGGCTTTTTG TCTGTGGTCT GGAAAGACGG CAGGAAGTTG CATGGTAAAG TCTGTGTGTT 1020
AGAACAATCT TCAGCATTTA TTTTAGATTC TCATAGCCCA GGCTGGTCAC CAACTCCATG 1080
TATCCTCTGA GGAAGGACCC TGAGCTTGGG ATGTTCTTGC TTCTGTCCCC CAAGGTGCAG 1140
AGATCACATG TATTTAGCAT CCTGCTGCTG ATGAGGTGCT GACAACCCCT GGCTTCCACC 1200
ATGCTAAGGC AAGCACTTCC CAAGGAAGTC TACTACTAGC ACTCAGGAGT GTTATGGTTT 1260
GTTTTCTGGT TCTGATGCTA GGGCCTCGTG CATACTAGGT GTGGTGGTTT GTATATGCTT 1320
GGCCCAGGCA GTGGCACTAT TTGGAGGTAA GGCCCTGTTG GAGTAGGTAG ATGTAGCCTT 1380
GTTGGAGTAG GCATGGCACT GTGTGGGTGT AGACTTTAAG ACCCTCGTCC TAGCTGCCTG 1440
GAAGCCAGTA TTTTCCTAGC AGCCTCCAGT TGGAGATGTA GAACTCTTGG CTCCTCCTAC 1500
ACCATGTCTG CCTGGATGTG CTTGCCATGC ACCCACTTTG ATGATAATGG ACTGAACCTC 1560
TGAACCTAGA GTCTGTTGTC CTTATAAGAG TTGCCTTGGT TCATGGTGTC TGTTCACAGC 1620
AGCAAAACCC TAACTAAGAC ACTAGGTCAG CCCTGCATCA CTGAGCCTTA GAGGAGTCCC 1680
CACTGGTAGT GTAGGAACTG AAATTTCAAG CAGAATCTAG TTATCTAGGA GAAAAAGTGA 1740
AGAAAGAAAT GAGTTAGGAG TTGTTTGGAG GGCAGCTGAC GAGGGCTGCC AATGTGGGAT 1800
GGGTGAGAGG GAGGAGGTCT GGTGAGCCTT GGGCTGGATT CTGAGAACTG CAGCGATGGT 1860
GGCAGTGAGC CTGATTGAGA GCATCTGCTG GTGGGTGAGG TGAGGTTTGG GTCCTTGGAG 1920
GGCACTACTG GGATATAAGA GGCCTGTTAG TAAACAGTTG GGTATGCTGG CTAACTGGAA 1980
GGTAACCTGT TGAGGTCAGG GTCACAGCAA AAGGGTGGTT GTGTGTGGAG TTGGATGGAG 2040
ACTGGGAAAT CTAGTCCAAG GCACTCCTGG GACACGCAGT ATCTTACTGT GAAAAGACAC 2100
TCTGACTTCC ATTGTGCTCA CGCCCCATAC CTCATATTCC AACACTCATG ACACAAAGGC 2160
AAGTAATACT GAGAACTCAA GGCCAGACTG AGCTACCTGA GTTAGCCTGG GCTATGTACA 2220
ACACCTCATC CCAGAAAATT AGATCCAGCC AACCATTCGA ACAAGCATGG CTTTTCTGTA 2280
CTTTATGTAA CACTAAGGAT TATGAAAGAT GTCCCTACTG CCTCATTTAA TATAGTAAAG 2340
ACACAAAACA AAGCAGTTAA CTGGCTTCCA TTGCTGTGTG CCTTGTGCTC TGTTCTGACT 2400
TTATCTCCCA TCAGCAGTCC TCTACCCAGC TTCCTGTCCC CCAACAGCCT TGCTGTGAGT 2460
TTGTTTGTCC TTGTGTGTGT GACACCTTGT CTCCTGTCCC CATGCCTCAG AGGCCCCGCT 2520
TACCCTCTTG CTTTGGCCAA TAGCCCATGC ATCTCTCAAC AGCAGCTTCT CCCCTCCGCA 2580
GTGTTCCCCT CCACCGGGCA GATTGCTCTC TGACAGGTTT TGGTTTTGAC AGTCATTTAC 2640
GATAAAGGAG CCAGAGGAGT TTCTGGTTCT GATTTCCTTC GGTCTGGTGC CCTCACTGCC 2700
TCAAGGATCT GACCTCAGTG CTCACGTGCT TCTGACTCTC AACTTGGCTG AAAACCTCCT 2760
TTTGTTTCCT CTGCAGGCTT TTTTTTTTTT TTTCTTCAAG CCTGTTGTTT TCTGGGCTTC 2820
CAACTTCCTC ATAATAATTT TAAAGATTTA TGCTTGTTTT TGACTTTGGA ATTAATTAAC 2880
TACAGGCTTT TGGGGGGGGG GGCTAAATAC TAGCTGCTAA TTCTAGGCCG TCTTTTCCAA 2940
AGATGGCCGG CAAGCTTGCA CTTCACATGG AGGTGGTCTA GCCTTCTCTT TCCAGGTTGA 3000
ATACAGAGTT CCTCTCCCTC CTTCTTTTCC TGTTTAAAGA GACAGGGTCA CACCATATAA 3060
AATGGCCCTG AACTCAACCT CCTCCTGCCT CAGCCTCTTA AGTGCCTGGA TCACACGCTT 3120
GTAAGTCGAG GGGTAACCTG TAGGAATTGG TTTTCCCCCT GTCCCTGGGG TCAGGTCTCA 3180
GGTGGTCAGT GTGTGTGTCT GTGTGTGTTC TGCTATGTAA ATTGAGGGGC AACACACATA 3240
CATGCATACT GACACACTAA CATACATACA CACATTACAC ACACACATAC TCTCACACAC 3300
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAT ACTAATCAAC TTACAAGCTT 3360
GTGCCACACA TTTTTTTTCT TTCAAATGCT TAATTTTAAA AAAAATTTCT TTTGCTTTTA 3420
TTTATTTTGT GTGTGAGTGT GTGGGCACAG GTCTGTCAGA GCACACACGT GGAGGTCAAA 3480
GTTCAACTTG TAGGATTCAG TTCGCCTCCT CTTCATCAGC CTCAGAGGCT GGACTCAGGT 3540
CCTTAGGCCT AGCCGCAGGT GCCTTTACCT GCTGAGCCGT CTCCCTGACT CTCTTCTGAA 3600
TGATTGAACG TCCATTTTGA TGAGGCTGTT GAGCTTGCTA CAAAACCTCT GACTGAGGGT 3660
TTTTTTTAAA ATTTGTTTAA TTTTTTAAAA CTTTTTATTG ATTCATTGTG AGTTTCACAT 3720
CATACATCCA ACCCCACTCA TCTCCCTGTC CCTTCATTTT CTCCCTCTGC CCTTGTAGCT 3780
TCCCCCCAAA AGAAAAAAAA ATGCCTTGTG TGGAAGCTGT GGCGTGTCAC AGTGTGTCAC 3840
GTGGTACACC CTTTTATCCA CACATCTTGA CTTGCACATG TTCACTGCAG 3890