EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM101-01424 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Mammary_gland 
Coordinate
chr1:134284110-134286470 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr1:134286152-134286171CAGCCAGCAGAGGGAGGTC+6.3
IRF1MA0050.2chr1:134285502-134285523AAAATGAAAGCAAAAGCAAGC-6.8
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr1:134284846-134284857CTTGAGTGGTT-6.32
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:134286165-134286180GAGGTCGAAAGGTCA+6.92
RARAMA0729.1chr1:134286165-134286183GAGGTCGAAAGGTCACCC+6.12
RarbMA0857.1chr1:134286164-134286180GGAGGTCGAAAGGTCA+6.82
Number of super-enhancer constituents: 8             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_03609chr1:134284362-134285638Bone_Marrow
mSE_03609chr1:134285724-134288828Bone_Marrow
mSE_04094chr1:134284087-134288215Cortex
mSE_06071chr1:134283900-134288225E14.5_Liver
mSE_06983chr1:134283941-134288817Heart
mSE_08541chr1:134284063-134288148Liver
mSE_09006chr1:134283971-134288852Lung
mSE_11086chr1:134284178-134287026Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
CCTATTTCAA TGTTTATAAT AACATCTTTT GGTCTTAAAG TGCCCAGTTA TCTGTTAGTC 60
AACAGACTAA CACAAACCTA CCCTCTTGCC AATAGACTGA ATGGGGAAGT AACAGGAGCT 120
ATTCGCAGGA TGCTGAAACA CCCTCAAACA CCGGACCAGG AAAACCACCT AGGGTTCAGC 180
TCTAATTTCC CTTGGTGTCT GTTGTCTTCC CTGATCCTCA CTCAGTAGGA AGAGAGAACA 240
GAATAAGCTA TGAACAGAGG AACAGGATCT GAGCCTTGAG TCAAGAGCGC TTCCAACAAC 300
ACAGGAACAA CATGAAGGTG GAACTCTCCT ATCTTCTTTA AGGAGTGATG ATGATGCTGT 360
TCAGAAATCC CAGAGGACAG AGCACCTCTG GGAACTTTCC CTGGCCAGCA TCCTCTGGCT 420
TTTCCTCTCA GAAAAGGCTC TGTTCCTGCA CGGAGCGGTG GGATTGGAGT GGTGGAGGGT 480
GGGCAATGCC TTCAGGAAGA GCTGCACACT ACGCTCAGCC ATTCTCCCAG GCCTCAGCCA 540
CAGGCTGTAT TCTAAACAGG ATCTCTGTGT GCGGAGTTCC CCTAAGCTCC TCCCCACCCC 600
TTCTCACTAC AGCCAGTCTC CTCACTAGAG AATTCTGTTA CACTTTAGGT CAGCCAGCCA 660
GTCTCTCCTC AACAAGCAAG GACTCTGGAT AGCAGCAAAG GATGGAATCA TGAGACCAAG 720
TGAATGGAGA TGTGAGCTTG AGTGGTTAAA GGAATCCATT TTAACTATCA GGCTCCCCTT 780
ACATACTGTC TGCTGAGATC TTTCCCCCTG GAGGATTCAT GCTTATCTGA AGCTCTGGCA 840
AAGCCTCAGA AGTGTTTACA GAAGCCTCCT GTGGGGCCGG GCCCATTCGC AGGTTGCTTT 900
TCTGTTATAG TTACCATTTT AAAATGTTAC TATGTAACTA TTTTCCAGAC CCCCACCCCC 960
ACCCCCTAAC CACATAATCA CAGATTCCAA GCTACCACAG AAGAAATTTA CGGTGATAGA 1020
GGGCTTGTCT AGTATGCTCA AGACGCTGGT TATGATCTCA GGACATCCAC CCCTACCCCA 1080
ACCTCCACAC AAAATAAGCC AAGAAATGCA CATCGTGCAG TATGATCATC CTTGAAGGAC 1140
CAGAGATAGC CGAAGCCCCT GACACTGCTG AGCATCACTA GCCGGGCATC ATTCAGATCT 1200
CTAGCAAAGA CCAGATTCTC CTCTTTCTCT CCTGCTATGG AGGTGCTTTA GACAGAGCTT 1260
TCCATGCCTT CGCTCCTTGC TCAACAATCA AGATGACTGT CTCCATTGAC ACACAATCAG 1320
TCCCCATGCC TGGAGCTGTC ACAAGAAAAT AGAAGTGGGA CTAAGGGACT GAAAGTTCCT 1380
ATCTCCAAGT TCAAAATGAA AGCAAAAGCA AGCCAGAGCT CCTGAACAGC ATCAACTAAA 1440
CACAGGCACG GGAAAGGCAT TCCAGATTAA AAAGCAAACG CATTTCCTCT TGGTATCATT 1500
GTCAAATTCA GAACAAGTCA GCCCCCACCC AGTTCCAGAG ACAATGATGA AATTTTTCCA 1560
CTAAACTGTC AGCCATGGGA AACTTGTCCA GCACTGGAAA ACAAGTTTAG CCACACTCCA 1620
ATATCCCTTG TTCCTTTCTT CAGAAAAGTT AAGTGACATG TCACATTTTG GTAGCCCTGA 1680
GTCACATCTG GTAGAGAGGT CTCTGTCCTG CAGTAAACAT GTTGTGATGA GACAGACAGA 1740
GATAAACAGG CAAGTGCTCT GTGAGTCTCC CCGTGCTTGC ATAAGCTTGG ATCCACACTG 1800
CCTGGGCTAT ATAGAAGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTAAGG 1860
GTCCTCAATT CTCAATTCCT CCTCAGGACG GCTCAGCGGT TAACATATTG TAGTCAAGTG 1920
CAGTGCTATC GCTCTATCTG CCCCTGTTCA AAATGAATGT CATCAAAAAA GATGACACAG 1980
GAGGGTACAG ACAAGGAGCC TTGGGCAGCT TTATAGACAC AGAAACTACA GCCCCCTTAG 2040
CACAGCCAGC AGAGGGAGGT CGAAAGGTCA CCCCCTGTTC CTCTCGGCAG CATTAAAGGG 2100
ACTTACCATC TCAGTTAAAA CAAAAAACAT GTCACTTGGG GGAGGGAGTG ACACTTCTTG 2160
GAGCCTGAGG GAATCACAAG CTTTGTGAAG AAAGCCTAGG TGTTCAACTA GTCCATCATT 2220
ACACATAAGG TGGGTGGAAA GAGGTCAGGT TTGCAAAACT TCCACAAAAA TTTAAAAGTC 2280
CCACAAGGAG TGAGTGGGCT CTCTTCCCCA AGGGACAACA CACACACACA CACACACACA 2340
CACACACATA AAGCACACAT 2360