EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM098-25144 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Lung_neonate 
Coordinate
chr8:129375890-129377550 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr8:129377229-129377241AAACAAACAAAC-6.32
HNF4GMA0484.1chr8:129376257-129376272TGCCCTTTGGCCTCT-6.13
HOXA13MA0650.2chr8:129375910-129375921ACCAATAAAAC+6.32
IRF1MA0050.2chr8:129376112-129376133AATTTGTTTCACTTTTCCATT+6.27
IRF1MA0050.2chr8:129377217-129377238AAAAAGAAAAAGAAACAAACA-6.57
IRF2MA0051.1chr8:129376111-129376129GAATTTGTTTCACTTTTC-6.22
NFYAMA0060.3chr8:129375986-129375997TCTGATTGGCT-6.32
RREB1MA0073.1chr8:129377260-129377280GGGGTGGGGTGGGGTTGGGG-7.06
RREB1MA0073.1chr8:129377270-129377290GGGGTTGGGGTGGGGGGGGG-7.19
RREB1MA0073.1chr8:129377265-129377285GGGGTGGGGTTGGGGTGGGG-8.13
SPI1MA0080.4chr8:129376984-129376998CACTTCCTGTTTTT-6.36
ZNF740MA0753.2chr8:129377446-129377459GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr8:129377279-129377292GTGGGGGGGGGGG-6.92
Number of super-enhancer constituents: 15             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01555chr8:129347495-129453882Th_Cells
mSE_02472chr8:129351918-129414858Macrophage
mSE_03411chr8:129375935-129377263Bone_Marrow
mSE_04318chr8:129376074-129377138Cortex
mSE_06864chr8:129375371-129377263Heart
mSE_07142chr8:129370792-129377557Intestine
mSE_08017chr8:129375644-129377205Kidney
mSE_08552chr8:129375728-129377250Liver
mSE_09029chr8:129375828-129377435Lung
mSE_09437chr8:129371700-129377265MEF
mSE_09437chr8:129377287-129377590MEF
mSE_11183chr8:129376107-129377142Olfactory_bulb
mSE_11598chr8:129375763-129377272Placenta
mSE_12002chr8:129375763-129377418Spleen
mSE_12948chr8:129375645-129377505Thymus
Enhancer Sequence
CACCAGCAGA CACAGTGTGT ACCAATAAAA CTTTATCAAC AACGTATTAT AAACACTCAG 60
TCTAGCTCAG GCAATGTTTG GGCCTGAACC TAAATCTCTG ATTGGCTTCC TTCCCATCAC 120
CTCAGATTCT GCAGATATCA GGGAATGAAC CATCACCGTG TCCCTGCTGC TGTAGATCCA 180
GCCCTCAACT GAGAACAACC AAGGACAAGA AGCACAAGAA AGAATTTGTT TCACTTTTCC 240
ATTAAACATG ATGAGTTCTT TGAATTTCTA ATTGGAAACT TTCACACATC GCTTGAGGTT 300
GCTGCAACTC ACTTCCTGCC ACCCTTTGAC TGTGTATCTT GAGCAAAACT GTGGTAAAGG 360
CCAAGGCTGC CCTTTGGCCT CTGGTGGTTG TCTGGAGTGC ACTGCCCTGA CTCACGGGTA 420
CTCAGACAGC TACTGCAACA TTCTTCACCC CCTTCTCATA AAGCTCTGAC TGCTTTCATA 480
GCCGGGGCCT AAACTAAGAA CTCAAAACCA AACGGAACAC AGCTAGGAAG ACTGCAGCCT 540
TCCCTCCTGT GAGTAGAGAC TATGAACCGA GCAGAAGGAC ACTTACTTGC CCACTTTCTT 600
GTGGGACTCC CCAGAGTTGC TCCCTTCTCC CACAGATCTT CCTGATGAAT CGAGAGGGAA 660
GACAGGGCAG CCTCCTTGGA GCGTCACCCA GCTCCAGTCA GTGGTGTAGA GGCAACTGAG 720
CTAGTCCTCA CACTGAGAGC TATAAGGATA TGAGATATCC TCACCCTGAG GATGTGAGTT 780
CTTCTGTGAT TGGCATTTCT GGATCTTCCC TGAAGAAATC TCACTGAAGT CAGGGCAGCA 840
GCCTCCCTGT GCTGTTGCTC ACACTTAAGC ACTGGGGGCA TCTACAAATG TGCCTCTCTT 900
AGCATCCTCC CAGTGACTCC GGGTCACAGG GAGATGAAGC AGGACCCCGA GGCTCTGCAC 960
TAAGGGCTGC TTTCCTATCA AGGCATATTC ACATCTCAGA GCTTCCAGGG GACTGCGGCC 1020
ACGCATTTCT TCCCTTTTCT TGTTCTATTG GGATGCTTTT CTCAGCCTTC CCATGGAAAA 1080
ATCTCAGAGC AGGCCACTTC CTGTTTTTAT TTTCTTTTCC TGCCCTTCTG GTGTACCCTT 1140
CGACCTTCTG TCCTGTGTCA AGATCCTTGT CCTGAACTGA GAACTAGGCG CAGGCATGTG 1200
TCCCAGCACC GAGTAGCTGG CTCAGCAACT GGGAAAGGAA AGACCCAGCA TGCCCTGCTC 1260
ATTCCTGTCC GCATGCTTGT GGTTAAAGAC AATGGCTACT TTCAAGCCCT GAGTCACTGC 1320
CTCAACTAAA AAGAAAAAGA AACAAACAAA CAAAAAAAGA GGCCCAGGCG GGGGTGGGGT 1380
GGGGTTGGGG TGGGGGGGGG GGGAACGAAG GAACCCGGAA GAATCTGTAG GCAGTTAGTG 1440
GTTGCTTCAG TAGCTCAGCC ACTACTTGGT AGCCCATGCT CCTGAAGCAA TTCTAAGGAC 1500
ACTCTGCCTC CCACCACATA AAAAGCTGGG AAAGTAGAAA AAGAGCTTAG TGGGAAGGGG 1560
GGGGGGGGGT GAGAAAGTCA TAGAAATGAC TGTGACCAAA GTAACATTAT ATACAGGTAC 1620
GAAAATATAG TACGTGGCTA GAGAGATGGA TCTGCAGTTA 1660