EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

EnhancerAtlas 2.0

Tag

Content

EnhancerAtlas ID

MM098-02859

Organism

Mus musculus

Tissue/cell

Lung_neonate

Coordinate

chr10:117301250-117301780

Target genes

Number: 5
Name	Ensembl ID

Mdm2	ENSMUSG00000020184
Slc35e3	ENSMUSG00000060181
Nup107	ENSMUSG00000052798
Rap1b	ENSMUSG00000052681
Mdm1	ENSMUSG00000020212

TF binding sites/motifs

Number: 27

JASPAR ID

Coordinate

Motif Sequence

Strand

-Log10(p-value)

Myod1	MA0499.1	chr10:117301416-117301429	AGGAACAGCTGCT	-	7.22
POU2F2	MA0507.1	chr10:117301764-117301777	GTCATTTGCATAT	+	6.74
POU3F1	MA0786.1	chr10:117301765-117301777	TCATTTGCATAT	-	6.18
POU3F2	MA0787.1	chr10:117301765-117301777	TCATTTGCATAT	-	6.37
RREB1	MA0073.1	chr10:117301695-117301715	TGGTGGGTGGTGGGTGGTTT	-	6.03
RREB1	MA0073.1	chr10:117301625-117301645	GTGGGGGTGGTGGGTGGTGG	-	6.87
RREB1	MA0073.1	chr10:117301699-117301719	GGGTGGTGGGTGGTTTGTTT	-	7.18
RREB1	MA0073.1	chr10:117301632-117301652	TGGTGGGTGGTGGGTGGTGG	-	7.77
RREB1	MA0073.1	chr10:117301639-117301659	TGGTGGGTGGTGGGTGGTGG	-	7.77
RREB1	MA0073.1	chr10:117301646-117301666	TGGTGGGTGGTGGGTGGTGG	-	7.77
RREB1	MA0073.1	chr10:117301653-117301673	TGGTGGGTGGTGGGTGGTGG	-	7.77
RREB1	MA0073.1	chr10:117301660-117301680	TGGTGGGTGGTGGGTGGTGG	-	7.77
RREB1	MA0073.1	chr10:117301667-117301687	TGGTGGGTGGTGGGTGGTGG	-	7.77
RREB1	MA0073.1	chr10:117301674-117301694	TGGTGGGTGGTGGGTGGTGG	-	7.77
RREB1	MA0073.1	chr10:117301681-117301701	TGGTGGGTGGTGGGTGGTGG	-	7.77
RREB1	MA0073.1	chr10:117301688-117301708	TGGTGGGTGGTGGGTGGTGG	-	7.77
RREB1	MA0073.1	chr10:117301629-117301649	GGGTGGTGGGTGGTGGGTGG	-	7.85
RREB1	MA0073.1	chr10:117301636-117301656	GGGTGGTGGGTGGTGGGTGG	-	7.85
RREB1	MA0073.1	chr10:117301643-117301663	GGGTGGTGGGTGGTGGGTGG	-	7.85
RREB1	MA0073.1	chr10:117301650-117301670	GGGTGGTGGGTGGTGGGTGG	-	7.85
RREB1	MA0073.1	chr10:117301657-117301677	GGGTGGTGGGTGGTGGGTGG	-	7.85
RREB1	MA0073.1	chr10:117301664-117301684	GGGTGGTGGGTGGTGGGTGG	-	7.85
RREB1	MA0073.1	chr10:117301671-117301691	GGGTGGTGGGTGGTGGGTGG	-	7.85
RREB1	MA0073.1	chr10:117301678-117301698	GGGTGGTGGGTGGTGGGTGG	-	7.85
RREB1	MA0073.1	chr10:117301685-117301705	GGGTGGTGGGTGGTGGGTGG	-	7.85
RREB1	MA0073.1	chr10:117301692-117301712	GGGTGGTGGGTGGTGGGTGG	-	7.85
RREB1	MA0073.1	chr10:117301622-117301642	GGGGTGGGGGTGGTGGGTGG	-	8.13

dbSUPER

Number of super-enhancer constituents: 1
ID	Coordinate	Tissue/cell

mSE_01201

chr10:117273455-117357093

Th_Cells

Enhancer Sequence

TATTACCATT ATTAAGAAGG AAAAAAAATC TTAGTTCAAT ACTGTAAAGC AAATTTTGGT 60
GGGGTCTCAT AGATAATCGG CAAAGTCTAC GTGAACTTTA GCTGTTAGCT TGCCCACTCT 120
GATTTTGGTT TGATACTGCA CAGACAGATC CCAGCATTGC AGCAAGAGGA ACAGCTGCTT 180
TCCAAGGACA TGGGTCTCTG TGGTTGCCTC CTAGTACCTA GGAATTCCTT TGCTCTGTTC 240
TTAGGGAGTC ACACAGTCCT GACCCTGACA GGAAGAAAAC AACTTCAGGT TGAGCACCAC 300
TTCAAAAAGT CTTCCTTTGG TTTAGACTTC CTGTGTCGAA ACTTTCAAAC CTTCTGACAC 360
TGTAGCCATT CCGGGGTGGG GGTGGTGGGT GGTGGGTGGT GGGTGGTGGG TGGTGGGTGG 420
TGGGTGGTGG GTGGTGGGTG GTGGGTGGTG GGTGGTGGGT GGTTTGTTTT TATACCCACA 480
GGCTAGTAGA AGGTGGCTGG ACACAGCAAG ACTGGTCATT TGCATATCTG 530