EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM093-00624 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Liver_neonate 
Coordinate
chr1:88375000-88378590 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXK1MA0852.2chr1:88375861-88375875GCCTTGTTTACAGA-6.21
Foxd3MA0041.1chr1:88375141-88375153AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:88375155-88375167AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:88375159-88375171AAACAAACAAAC-6.32
NFYAMA0060.3chr1:88378473-88378484TCTGATTGGCC-6.02
Nr5a2MA0505.1chr1:88377281-88377296GCTAGCCTTGAACTT-6.14
Nr5a2MA0505.1chr1:88376975-88376990GAGTTCAAGGCCAGC+8.25
PROP1MA0715.1chr1:88376786-88376797TAATCAAATTA+6.02
TBXTMA0009.2chr1:88375814-88375830TCCCACCTAAGTGTGA-6.19
TBXTMA0009.2chr1:88375814-88375830TCCCACCTAAGTGTGA+6.3
TFAP2B(var.3)MA0813.1chr1:88377822-88377835TCCCCTTAGGGCA+6.34
Number of super-enhancer constituents: 6             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02944chr1:88330130-88420834TACs
mSE_05516chr1:88377944-88379398E14.5_Limb
mSE_06338chr1:88375157-88378626E14.5_Liver
mSE_07256chr1:88375426-88376799Intestine
mSE_10015chr1:88377368-88379289Embryonic_stem_cells
mSE_11278chr1:88377349-88379466Placenta
Enhancer Sequence
TGGGAGCTGG GCGTAGTGGC GTGTATCTTT GATCCCAGTA CTCGGGAGGC AGAGGCAGGT 60
GGATTTCTGA GTTCGAGGCC ACCCTGGTCT ACAGAGTAAG TTCCAGGACA GCCAGGACTA 120
TACAGAGAAA CCCTGTCTCC AAAACAAACA AACAAAAACA AACAAACAAA CAAAAAGAGT 180
TGCTGGGGCT GGAGAGATGG CTCAGAGGTT AAGAGCACTG AGTTCAAATT CCAGCAACCA 240
CATGGTGGCT CACAACCATC TGTAATGAGA TCTGATGCTC TCTTCTGGTG CATCTGAAGA 300
CAGCTAACAG TATACTTACA TATAATAAGT AAATCTTTAA AAAAAAAAAA AAAGAAAAAA 360
AAAGAAAGAA AAGAAAAGAA TTGCCATAGT TGTGGTGTCT CTTCATAGCA ATAAAACCCT 420
AAGACACATG CTGAGTCCTA ACCACTAGGC TTCACCACCA GATCTAACCA GTTTTAAATC 480
TATTTCAACA CGCCTAAGTT TCACACGAGA CTTGCACCTG TAATACTCTT TTGCAGCTCG 540
ATCTATCAAT CCACAGCTGT CCTTAATGTT AATCCCACTG GATAAGAATA AGACCACTAC 600
CACAAACTTG AGCCAAATTT AAAGCAAGCT TTACTAAATG CTGGCCAGGA TAATGGACAC 660
TGGTCAGGTC CATTCCCAGG ATCCCCAGAG AACGGTCATG AATTATGTTA GTCCATTGTT 720
TACAAAGGCA AAGCCCACAA GGCTACATAC ACACTTCCCA CCTCCTTCAA TGGAGGGCAA 780
GCATCCATCC TGACACACTT CCTGCCTGTG CACCTCCCAC CTAAGTGTGA TCAAGCGTAG 840
ACTGTGCAGT TGGGGCAACC AGCCTTGTTT ACAGAAGCGA AAACATGTGA CTTGTTATCT 900
TAATTGAGCA ACAGTCCCCA GCATTTCAGG AAGTTATCTG TCCTTGGGCA AGTGGGGCTT 960
GCAGGTTAGA GGCATTTCTG GTATAGAGAT CTTTCAAGAA CAGAAATGTG AACTTAAAGC 1020
GTAACGTAAG CCCTCGTGCT TAAGAGCATT CCTACTTTAT GTTATTGCTA TAAGTGCAAG 1080
AACTGGTCTT GGGTCCAACT TGACATTAAG TTGTTCAACT AGGACTTAGG ATAAAAGAGG 1140
CCAGTGCTAA TTAATGGTTA TTCTTGAGAG GAACAAGAAA ACCATGAAAT CCTGGGGTGG 1200
TCAAAGGTTG AAAGTTGTAA AATCTGGGTG AGGTGGGTTA ATGAATCCTT TCAATACTTT 1260
TCTGCTTTTT AGGGTTTTGT TTTTATTTTC CTGTTGGACT AGATTTTATT CCTTGGTCCA 1320
ACCCCTGGGC TCTCAGCCAT TCTTTGTCTC AGCCTCACCA GTGCTGGGAT AGCAGGAGCA 1380
AGCCATCGGA TCCCGCCAGT ACTTTAGTTT CTTCCTAGTT TTCAATTGTT TCTTATTTAT 1440
TTTTGTATAT GTTCAGGTAG TGTATTTGTA TGCACATGTG TGCACACTTG AATTCGAAGC 1500
CAGAGACTGA TATTAGGTGT TTTTCCCAGT TCCCTACATC TTACTTTTTT GGAGATAAGT 1560
TTCTCACTGA CCCTAGATCT CACTAACTGG CTAAACTGGA TGTCCAGCAG GCTCCAAGGA 1620
TTTGGCTGTC TCCCATGCCC CTCCTTACCT CTTGCCTTCT CCCCCAGCTG TGTTACAGAT 1680
GTGTACCATC AATACCCAGC TTTTATGTGG GTGCTGGCAA TCTAAATACA ACCCTCATGC 1740
TTGTGTGGCA TGCATTTTAT TGACTTGAGT TATTTCCCCA GCTCCTTAAT CAAATTAAAT 1800
TTGAATTTAA TTCATGGTCT TGCTATGTTG CCCTGACTGG CCTTAACTCC TGAGTTTAAG 1860
TGATTCTTGA ATCTTGGCTC CCTGAGTAGC TGGTAATAAA AGAGTTGTAA TAGGTCAGGT 1920
GTGGTGCTGT ACACCTGCAA TCCCGGCACA AGAGAAACCG AGGCAGGACA ATCAGGAGTT 1980
CAAGGCCAGC CTGGGCTGAA ATAGTGATAT TCTGCCTCAA AAGAAAGAGG GGGCCCAGTG 2040
AGGTGGCTCG GGAGGTCAGG CCTCCTGGGC GAGCTTGATA ACCTGAGTTT CATCCATCAA 2100
GCTGTGGCAT GAACACACAC ATGCACACGC TCACGCACAG AAATGTGTGC ACACCATTAA 2160
TGATCTTTAA TAATAACTGT TTTTGTTTTG ATGGCTTTTT TTTTTTTTAA GGAGGGGCAG 2220
GTTTCAAGAC AGGGTTTCTC TGTGTAGCCC TGGCTGACCT GCAACTTGCT CTATAGACTA 2280
GGCTAGCCTT GAACTTAGAG ATCCACCTGT CTCTGCATTA CTAGTTCTGG GATTAAAGAT 2340
GTGCACCACC ATGCCCAGCA ATAATAATAC ATTTTCAAGA TATAAAAATA ATCTTTTTGT 2400
AACAAAGTGT AACAACACAC ACACACACAC AAAAACCAAC TACACTGAGA AAGAAAACAT 2460
AGTATGAGCA GCCCCTTGAG ATAAGTCCGG GCAGAGCAGA GCTGGAGGCT TCTTGATATG 2520
TCAAAGGTCC TGGAGGAGGA GGTAGCTCAC TCCGGTGTTC TTGACTATCA CCAGGTGAAG 2580
CAATCTGAAA GATGAGGCCC CTGGGATATT TTCTGATCGC AGGGACTCAT GGTCAGTCAC 2640
CTAATGTGAA ATGACCCTGG ACATCTGGGA GAAGAGCCCA GTCTGCCACT CTTGCATGGC 2700
TTTATCACCC AAGGGCTTAG AGGCACCGGA TAGAGCAGCC ATCCATGTAT ACTACAGACA 2760
GGCCTCCTTC CAACCAAGGC AAAGTGTCCA GGGTGGCTGA GACAGTCTTC AGTCTTGCTC 2820
TGTCCCCTTA GGGCAACTCT ACATTATACA CAAAGGGCTG GAGTAGGGTT GGCCCACTCT 2880
GAACTGCTGG ACTTCCAGGA CTGAAGTCTG TTCTCCTCCG GGCCACACTT TCAGTGCGCT 2940
TAACTCAGTG TGATTGGGTA AAAGAATGTC AAGGCCCTTG TTAAAACACA AACGGCGGTT 3000
CAGTGGGTTG GAGAGGGGTG GGAGACTGCA CTGCTTTTTT CTTTTTAATA TTTGTCGTGT 3060
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTACAC ACACACACAA AGAAGGTAAG AGGAACAAAG 3120
AAGGTAAGAG GACAACCATG TCCGGTATTG ACCCTTGCCT CACATCTTGC TTAGAGCAGG 3180
CGCCTCTTGA TTACCGCTGT GTACTCCAGG CGGGGTGAGC CTTGAGCTTC TGGGAACTCC 3240
CATCTCTGCC TTCCATCGCT GTAGAGTGCT CAGATTACAG ACCTGCCTAG CATGCATGAT 3300
CAGCTTTTAC AGAGGCCTGA ATTCAAGCGT GGCCAGAGGT GTCTGTACTC ACTGAGCTGT 3360
GCCCCCTGTC CCCTGACATT TCTAACTAGT GTTGGTGGGA AATGTGGGGC TCTTGGGACT 3420
CACTAATCAG ATTGTGCCTA GAATATGCCA TCAAGAGCTC GTAATCTGTC CCTTCTGATT 3480
GGCCTGTGAA TGTCCATCAA GGTGTGGGTA CCCAGTAGGC CATAATTGCC CTGACTTGTA 3540
ATCCCAAGAT GTGAGATATA AGAGGAAGGA GCAGAAGCAT TTAGTGTTCT 3590