EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM092-09887 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Liver_E14.5 
Coordinate
chr3:95445750-95450460 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr3:95448147-95448157TTTAATTAGA-6.02
EsrraMA0592.2chr3:95448861-95448872GTCAAGGTCAT+6.32
EsrrgMA0643.1chr3:95448862-95448872TCAAGGTCAT+6.02
Foxd3MA0041.1chr3:95448925-95448937AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr3:95449195-95449207AAACAAACAAAC-6.32
JUN(var.2)MA0489.1chr3:95449994-95450008GAGAGATGACTCAG+6.02
KLF14MA0740.1chr3:95449417-95449431GGCCACGCCCACAT+6.74
Klf12MA0742.1chr3:95449417-95449432GGCCACGCCCACATG+6.51
Nr5a2MA0505.1chr3:95448858-95448873AAGGTCAAGGTCATC+7.16
POU2F1MA0785.1chr3:95448088-95448100CATTTGCATATT-6.74
POU2F2MA0507.1chr3:95448086-95448099TACATTTGCATAT+7.12
POU3F3MA0788.1chr3:95448087-95448100ACATTTGCATATT-6.03
RREB1MA0073.1chr3:95449048-95449068TGGGAGTGGGTAGGTTGGGG-6.8
SP1MA0079.4chr3:95449415-95449430TCGGCCACGCCCACA+6.19
SP2MA0516.2chr3:95449839-95449856AAGTGGGAGGGGTTTAT-6.29
SP3MA0746.2chr3:95449417-95449430GGCCACGCCCACA+6.64
SP4MA0685.1chr3:95449415-95449432TCGGCCACGCCCACATG+6.19
SP8MA0747.1chr3:95449418-95449430GCCACGCCCACA+6.22
TFAP2AMA0003.3chr3:95449395-95449406TGCCTGAGGCA-6.02
Number of super-enhancer constituents: 9             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00303chr3:95449171-95480090pro-B_Cells
mSE_01444chr3:95428517-95481073Th_Cells
mSE_06241chr3:95446906-95447909E14.5_Liver
mSE_07147chr3:95446553-95448078Intestine
mSE_10020chr3:95445599-95446274Embryonic_stem_cells
mSE_10020chr3:95446891-95447752Embryonic_stem_cells
mSE_10020chr3:95448022-95449187Embryonic_stem_cells
mSE_10020chr3:95449226-95450668Embryonic_stem_cells
mSE_11924chr3:95449275-95450017Spleen
Enhancer Sequence
CAGAAAGATC ACAAACTCTA AGCCAATCTG AACCTACTTA GGAAGTTTGC AGCCTAGGAA 60
AGGTGAGGGA GCAGTAGACA CATTTGAAGG ACTCAGTAGA AAGGCTAAGT AGACCTTGAA 120
GCTCATTCCA CAATGGTATT AACTAAACCT GGGCTCTCGG AGGAAGAGCG GACATGGGCG 180
GGCAAGCCCA GGTGCAGGTG GTTCCGTTAT ATAACAGCCT CAGTCAGCGC ACATTTATTG 240
AGCTCCCACT GTGTGCCAGC CTACCCTAGA TGCTCTATTT CTTCTGGGTG GGAATCTGAG 300
TAAGGAATTA GTTATAAGGG CGTTATCCTT GTCCTGTCTG GACTCACAGC AGTTTATGGT 360
TGGAGCTAGG CAACCAGTGG CTGCCTTCTC TGGCCACTAC CTTGTTCTTT ATTGAGAAGA 420
CTGTAGATTG AACCCAGAGC CTCACATGTC TATCTGGGCA AGTACTTTAC CACTGAGCTA 480
CTCTCCCAGC CCTGTGAACT CAAATGTCAA AGTTACTTGT TGAATTGGGG TGGAAGTTGG 540
GTTGGGAGTT TTAAAAGAGC AACCAGGGGC TGTCGAGATG GCTCAGTGGA TAAGGGCACT 600
GACTGCTCTT TTGAAGGTCC TGAGTTCAAA TCCCAGCAAC CACATGGTGG CTCACAACCA 660
CCCCTAATGA GATCTGACAT CCTCTTCTGG TGCGTCTGAA GTCAGCTACA GTGTACTTGT 720
GTATAATAAA TCTTTGGGCT GGAGCAAGCG GGGCCGAGCC CACTGGAGTC AGCAGAGGTC 780
CTAAAAATTC AATTCCCAAC AACCACATGA AGGCTCACAA CCATCTGTAC AGCTACAGTG 840
TACTCACATA CATAAAATAA GTAAGTAAAT CTTTAAAAGA GGGACCAGGA AAGGATGCAG 900
AAGAGAAGAT GAGCCGAGCA GTGAAGCACA TCTTTAATCT CAGCACTTGG GATGCAGAGA 960
GGCAGATGGA TCTACAAGTT CAAAGACAGC CAGGGCTACA CCGAGAAACC CTGTCTAAGG 1020
GAAAAAGAGG TGAGGTCGAG GACTAAAAAA GAAGGGAACA GAGCTGGGCG TGGTGGCGCA 1080
CGCCTTTATT CCCAGTACTT GGGAGGCAGA GGCAGGCGGA TTTCTGAGTT CGAGGCCAGC 1140
CTGGTCTACA AAGTGAGTTC CAGGACAGCC AGGGTTACAC AGAGAAACCC TGCTTCGGGA 1200
AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA GGGAACAGAA GAAATCCAGC CCAAAAATAA TAGGCAAAAA 1260
GGAAGCCAGG ATGGATGGTA TGCAACCGTA GAATCAATCG ATATTCCAGA GGCAGCCAAG 1320
ACCACGTGTG GAGAGCATCT CAAATAAACC AAAGGTTAAG GAAAAAAATG AGGACCAGGA 1380
CCTCTTTAGT ACTCGGCTGC GTGGGTGAGC AAAGACACAA CTGTGTTGTT CTGGATCATG 1440
GTTTATAGAC ACAAAGTAGA TTAGCAAGAG CGCAAAGGGG TAAAGGTCCT GGTGACAGAC 1500
AGTTTGAAGA CTCCACCTGT TCTAGTTAGA TAAGCCTAGG AAGTCACGGT AAACAGTTCA 1560
ACAAAAATCT TTACAGAGTG AAAGAATGGA TGATTCAGCT GTGGCAGAAG TGACTAACTG 1620
GGAAGCTCCT GACAGTGTCA CTGGGATGGT GTTGGAATTT GAAACTTGGG AGTCAGACTG 1680
AGTTGGGTGC ATAGGGTGTA AGGTGTGAGA GTTGGGGTGG TTCAGTTACT AAGGGACTTA 1740
GCACGTTAGG CTGTGAAGTT GAGGACTCAT ATATCTGAGG TTTGCTCTGT TATTTTTGGA 1800
AGTTGGGATT TTGTTTGTTT TGAAAGGGGG TGTCCTGCCT GAAGCCCAGG CTGGTCTGCA 1860
CCTCCTTAAA TAGGTATTTA ACCTTGAGCC CCTGCCCTCC CCTCCCTACA CTGCTGAGAC 1920
AGGCTTCCAG CCACAGCAGT TTTGATGGTG GTAGTTCCCC AAGCTTAATA ACACACAATT 1980
TTAAAAAGAA GAGCTAATGG CCTGAGAGAT GGCTCATCAG AGAACCCAGG TTCAATTCCC 2040
AGCACTCATG CGGCAGCTTA CAACCACATA TAAACTCCAG TTCTAGGATA ACCCCTGTAT 2100
AAACTCCAGC CTCTACAGGC ACCAGACACA CTTGAGGTGC ATGCAAATAC TCATACACAT 2160
AAAATATTGT TTTAAACTTA AATGTCCAGA TACGTTTTAA AAAGAAAAAA GAGAGCATGT 2220
GCCTGGTAAT GGCTGACGAC TAGAGGAAAC TCACCTGGTC ACTGAATCGG AACCCCGTTC 2280
TGTTAGCTTC TGTTAGCGCT TACTGATGAT ACACTTGTTA GGACACTATA CATATGTACA 2340
TTTGCATATT ATATTCCCAC CCATCGCCTC CCATCCTTCC CACTGATCCC AGCGAGTTTT 2400
AATTAGAAAT GCCTTTCTTG TTTTTGTTTT TCAAGCAGGG TTTCTCTGTG TAACCCTGGC 2460
TGTCCTGGAA CTCACTCTGT AGACAAGGCT GGCCTCGAAC TCAGAAATCT GCCTGCCTCT 2520
GCCTCCCAAG TGCTGGGATT AAAGGCGTGC GCCACCACAC CCGGCTAGAA ATGCCTTTCT 2580
TAAAAAACCT TTTTTGTTTT ACCTTGTTGA GACAGGGTGT CTTGTAGTCC AGGCTAGTCT 2640
TGGACTCACT GTGTGGCTGA GAATGATCCT GGTCTGCTGT CTCTCTCTAC CTGTCAAGTG 2700
TCATAACCTT GAACCTGGGC TGCATGCTTG CGATTTTAAC TAAGTCTGTC TACCCCCTAA 2760
CCCAAATGTA CTTGTTGCAA AAGAAAAATT AAATTATCTA ATTCAGAAAA GAACTAAGAA 2820
ACTTGGAGAA TTGAGTTGGT GAAATATTTA AATGGATGCA GAATTTTTGG AGAGATACGG 2880
AAGACATTCG CGTCCTTCCT AGTGTAGGAA AAAGAACAGG AAGAAGCAAG CGTTTAGGCT 2940
GATGGAATCG AAGCTGCAGC AGGAAGGGCC AGGTGCTGAG AGCCACCTCC TTAGCAGAAC 3000
CTTTACCTTG GAAGGCCCTG GTTCCAGCTC CAGGGCTTCA ATAAATAAAA GTGGATGGAA 3060
GAGCTACCCC ATGGCACTTA AACCAGGGCA CAAGGATAGA TGAGGTAGAA GGTCAAGGTC 3120
ATCTTTAGCC GTAAGGCAGG TTTGGGTCAG CCTGGGCTAT GAGAGCCCAT CTTAAAAACA 3180
AACAAACATA ACTGCATCTG TAGCAGAGGA TGGCCTAGTC GGTCATCAAT GGGAGGAGAG 3240
GCCCTGGGTA CTGTGAAGGT TCTATGCCCC AGTATAGGGG AATGCCAGGG CCAGGAAGTG 3300
GGAGTGGGTA GGTTGGGGAG CAGGGGAGAG GAAAGTGATA GGTGGTTTTC AGAGGGGAAA 3360
CCAGGAAAGG GGATAACAAT TGAAATGTAA ATAAAGAAAA TATCTAATTA CAAAAAAAGA 3420
AAAAAGAAAT CTAAAAAAAA AACACAAACA AACAAACAAA AACAGATGGA AATCCAAGTG 3480
ACTAGGAAAC TATATCTGCT TACAGGATGG GAACAAATTG AGCAGAGCAA ATTTAGTCTA 3540
AAATTTCCCA AATTTGTAAG TCTGCTTTTA CTCAGGAAGA GTAGCAAAAT AGCTGGCCCT 3600
GGGAGGAAGT GAGAAACCCC AGGGAGGGAA GGGGCAACTT CCTCCTGCCT GAGGCATTGG 3660
TGACCTCGGC CACGCCCACA TGGAAATGTC TAGACCTCAC AGCGTTTGTC ACCGTTAGCT 3720
AAATGAAGCA TTGGCACGTA TTGTACCTGT GATAAGCTCT CAGTTGGGTG CTGAGGTACA 3780
CGTGACTAAT CCCAGCTACT ACAAAGGTTG AGATGAGGGT TGGGGGTGGA CACCTGACCA 3840
CTGCCAAGGA GTCCCATGGT GCTTGCTTCT CAAAGTGCTG AGTGGTAGTG TTAAGTCCTA 3900
CTTCTGAGCT GGGCAGTGGT GGCGCACACC TCTAATCCCA GCACTTGGGA GACAGAGTCA 3960
GGTGGATTTC TGAGTTCGAG GCCAGCCTGT TCTACAGAGT GAGTTCCAGG ACAGCCAGGG 4020
CTACACAGAG AAACCTTGTT TCCAAAAAAT AAAAATATAA AAGTAAAAGC CACTTATTAA 4080
TCTAATGAGA AGTGGGAGGG GTTTATAGGC CTCACCCCTA AATAAAGAGC TATATGGACA 4140
TTTGATGGCT TCTGGGGAGG GCGCTCCAGT TTTAAGGCTG GCTGTGCTCC TGTGGGTAGA 4200
GCACAAAGCA GAGCTCACAG GTTTCTAACA GTGATAAGAG GCTGGAGAGA TGACTCAGTG 4260
CTAAGACTCA GTGCCGCTCT TCCAAAGGAC CTGGGTTTGA TTCCCAGTGC CCACATGTAA 4320
CTCCAGTACT AGGGGATCTG GCTTCTGTGG GCACTAGGTA CCCACATGTG CACTGACAGA 4380
CATGCAAACA AACCACCTAA ACACAATATA ACCCAAAAGG ACACAAAGTC GGGGAGATGG 4440
ACTTGGGAGG AGCTAGGGTA AACATGACTG AAATACACTA TTGTGAAATT CTCAAAGAAT 4500
TGATTAAGGA AAGTGAGAAT GGAGGCTTAG AAAGGTGGTC CGTGATTTTA AGCCAAGCAC 4560
TAGGGAAGCA GAGGTCAGTA GATCTACATA GGCCAGCCTG CTCTACATAG CAAGTTCCAG 4620
GCCAAAGTTC CTAAGCACAA TTCCCCTGGA AGACTCTCCA GACCAAAATC CCCAGGACAA 4680
GGTAAAGACC TGAGTGTTTC AACCTTGTGT 4710