EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM092-09630 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Liver_E14.5 
Coordinate
chr3:60302220-60305040 
Target genes
Number: 1             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F6MA0471.1chr3:60304879-60304890CTTTCCCGCCC-6.32
HNF1AMA0046.2chr3:60304167-60304182TTTTAATAATTAACA+6.05
HNF1BMA0153.2chr3:60304168-60304181TTTAATAATTAAC-6.14
IRF1MA0050.2chr3:60302571-60302592CATGGCTTTCTTTTTCTCTTT+6.37
Lhx3MA0135.1chr3:60304197-60304210AGTTAATTAATTA-6.64
Lhx3MA0135.1chr3:60304204-60304217TAATTAATTATTT+6.71
Lhx3MA0135.1chr3:60304200-60304213TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr3:60304201-60304214AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr3:60304202-60304212ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:60304202-60304212ATTAATTAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr3:60302868-60302888ACCAAAAACAACCCCCTCCC+6.22
RREB1MA0073.1chr3:60302887-60302907CCCCAAAAAACCCAAAACCA+6.54
TEAD1MA0090.2chr3:60304019-60304029CACATTCCAT+6.02
TEAD4MA0809.1chr3:60304019-60304029CACATTCCAT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02212chr3:60275845-60315730Macrophage
mSE_06725chr3:60302694-60304136Heart
mSE_06725chr3:60304246-60308185Heart
mSE_07877chr3:60302536-60304206Intestine
mSE_07877chr3:60304291-60306932Intestine
Enhancer Sequence
TGTGTGCATT CATGAGCCTG CAGAAGATAA CGACAACTCA CAGTGTAGGA GAAACCTAAG 60
TGCTCTCCTG GCACTGAAAA GGAACCAGTA GATTCTAAAT GGGGCAGCGA TTAGCTTTTT 120
ATTGCTATAA TGATTTTTTA CTGTTTCCAC AACTTGAAAT GTGACTATTG CTAGTTGAAG 180
GTAACATACT TTAATATTTT TAACATATGA TTAGATAGTT TGTTTTTTTT TTTCTCCTAG 240
TGGTTCAAAC TTTTCAATAA TAACAGGTTA GGCTTACTGA TGGCAACATT GTTTCAGGCC 300
TTACTTTATT TTGGCTCACG TCTAAGGTTT AGATTGGCTT GGATGCCTTG TCATGGCTTT 360
CTTTTTCTCT TTATCTCTGT AAAATAACAT TTTCCTTTGA TTTGCTCTTT CCTAGACTAT 420
TGTATTGTTT CTAACATTCA GGTGCCTTTC TTGTATTCCT TTTTTGTTCT ATTTGATGGA 480
GCAGAAAATT TGAGTTTGTT TCGATTTTTC TTTTGTTTCT AGCAGTTAGT CACCCTGCAG 540
TGTTAGAGTT GATAGTTTCC CCTCTTGTAC TACACGGAGG TTCAAAGTTC TGTTTTTTAC 600
TGCGTTCAAT TGCAAAGGGC AAATTTTCTA GCAAATGGGG GGAAAAAAAC CAAAAACAAC 660
CCCCTCCCCC CAAAAAACCC AAAACCAAAA AACCCAACAA GTCTCTAACT CTGAGTGGGT 720
CTGAGTGCAA CTGTAAATTA ATCCTTCAAA CAGGATTAGG TCTAGGCAGT AGGCAAGGAA 780
GCTAGCTCAC ACAGCAGCAG GTGCAAAGGT AGCCTATGCT TTCAGGAAGC CAGAGCTCTT 840
TGATAGAAAA TGGAAAGCAA CTGAAAACAA GGAAAGGCTA GAAACAATCC TGTAGGCTAA 900
GCTAGCCTTG GGAGTTTCCC AAGGCCCATC CCTTCCTCCA TCCCTGCATG AGTCAGTTTT 960
CCAGTGGGTC TACACCCATT TACCCTTCCT TTGCCAACAT CCCTGAATAC ATTCTCAGTA 1020
ACCCTCTAAG CATTTGCCAA AGATCTTTCT AGAGTGCAAG TCCAGACTCC ACCCTATCGC 1080
CCTGGTCCTG CGAACTAGTT CATAGTTTGC TGAATAACGT TGAAGTTCCT GGCTTCCTTC 1140
TCTGCCGACA AGTTAATCTC CTTTTAAAGA AAGGAAACAG ATGACTGTAT TGATTCTACA 1200
GGGCATTGAA ACAGATAGGC TTCTTGCACG TGCTCTGCAC TTTGCTCCAC CGTCCCAGGG 1260
CCCACTTGTG CCACACTCCC TGTGCCTATG ATTGTGTGCA CGTGGAAGCC AGGGGTCCAC 1320
ATTAGGTGTC TTCTGAAATT TACCTTCCAT CTTATTACTT ACTTTTTTGA GTGTCTCTCA 1380
TTGAGTCTGG AATTCAGAGT TAACTGGCTA ATGGGCTGTG AATATCTCCC ATTCTCTACC 1440
TGATCCCAGC ACTGTGGTTA CAGACACTTG CCTAGATGTT CGGAATTTGA ACTCAGGTTC 1500
TCAGACCTGA GCTCCAGCTT CTTTACGCAG GAGTCATCTC CCTAGCCAGC TAGCCTATCC 1560
AGGCAACTCT CTTTTTATCT TAGCAACTTC TGCACATCCT TCAAGGCGCT GCTTGCATAA 1620
GTTCCTCCAG GGAGCCTTCC CTCCTTTTCT CAAGGGCATT TTGGATATTT GCCTACCATC 1680
TTAGCACCAG CTGGCTGGTG CTCTTTTCTA CCATGCTGCT CCAAAAAGTA CAATCCGTGT 1740
ACTCCATCCT CCTGCACTTA CCTCCATCCT ACCTATACTT AACTACTTCT GCCATAGCTC 1800
ACATTCCATC CAGTTGCTGG AATGAATGCT GAGAAAGTCC TCAGGCGCTG GTGGTTACTA 1860
ATTGTCAGTT AGAAACTCCC TGTCTCTGTT CTCTGAGAAA ATGCTACTGT CATTCTACTT 1920
TGTTTCCATT GTTGGGGACT TGGGAACTTT TAATAATTAA CACTGAGAAG TGGTACTAGT 1980
TAATTAATTA ATTATTTCAG GAAGGGATCA GTAAGCAGCA AGTCCGTGTT TCATGGACCA 2040
GCAGAGGATC AAGATCTGTT ACTAGTACCT CTGCAAACTA GTGGAGTACT TTATTTATTT 2100
ATTTATTTAT TTACTCCGCC TAGGAGAGTG TGCCTGACCC ACTCAACAGA AACAGGGAGG 2160
GAGAAATCCA GTTTGCATTC ACTCACCTCA ACTCATGTTC AAACCATGAA ACAAACGTTT 2220
TTATAGTTAA AAATCATCCC TGACGAAGTT ATCAGAATTC CTTGAAATTC ACTGGAAATC 2280
CCGTCCGCAG ATCTTCAAAC TTTATCTCTT CTCAGAAGCC CAGAATTCTT TTCTTTCAAA 2340
GCCAAGTTAC AGGACAGCAG CTAATGAACT AGGAGCTGGT GTTTCATTTG CTCAGGCGGG 2400
CAGTTGCCCA GGGCTTGTTT GCGTGGGAGT ACCTCTGCAG CGCCTAAGAT GTTATTTTAT 2460
TTTAAAAGAG GGAGCCCTGC TTGCTTTCTG TACACCACAC TGCAGAGTTG GAAGTAAGGG 2520
AGCCTTTAAA CTGCAAGTTT TATTTGCCGA TAGGACAGGA AGGTGGCCTG GGTTTGTGTT 2580
TGGGTGACGA TCAGTTTTCT CGCAGAACTC CAAAACTGTG AGTGCTGAGA AAGATACCCA 2640
CCAACACCCG TGCAAGCTTC TTTCCCGCCC TTCGCCTTCC AGGTTCCAGG CGATGCGCTG 2700
CTTCTGCTGC TGCAGGCCGG GCAGCTAACT CTAACCTTCC GTCTAACCTT GCGGGCCTCG 2760
CGGGCTGGGC GCGGAGCCCC GGGAGCTGGA GCGGCGGTGA GCGGCGCGGG CCCGGGCGAG 2820