EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM092-03697 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Liver_E14.5 
Coordinate
chr12:88156500-88160070 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
1700019E19RikENSMUSG00000007867
6430527G18RikENSMUSG00000034168
2310044G17RikENSMUSG00000034157
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr12:88159117-88159135GAAAGAAAGGAGGGAAAG+6.33
Foxd3MA0041.1chr12:88157006-88157018AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr12:88157010-88157022AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr12:88157014-88157026AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr12:88157018-88157030AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr12:88157022-88157034AAACAAACAAAC-6.32
MEF2CMA0497.1chr12:88159328-88159343GAGCTAAAAATAACA+6.4
Nr2f6MA0677.1chr12:88159579-88159593TAACCTTTGACCTA-6.51
Nr5a2MA0505.1chr12:88159712-88159727GAGTTCAAGGCCAGC+8.25
PKNOX2MA0783.1chr12:88158084-88158096TGGCAGCTGTCA-6.02
PLAG1MA0163.1chr12:88159384-88159398CCCCCCAGGGCCCC-7.03
RXRBMA0855.1chr12:88159579-88159593TAACCTTTGACCTA-6.04
RXRGMA0856.1chr12:88159579-88159593TAACCTTTGACCTA-6.39
RxraMA0512.2chr12:88159579-88159593TAACCTTTGACCTA-6.24
SOX10MA0442.2chr12:88157843-88157854AAAACAAAGAC+6.14
TGIF1MA0796.1chr12:88158084-88158096TGGCAGCTGTCA-6.04
TGIF1MA0796.1chr12:88158084-88158096TGGCAGCTGTCA+6.18
TGIF2MA0797.1chr12:88158084-88158096TGGCAGCTGTCA+6.07
TGIF2MA0797.1chr12:88158084-88158096TGGCAGCTGTCA-6.44
ZNF263MA0528.1chr12:88159110-88159131GAAGAAGGAAAGAAAGGAGGG+6.75
Number of super-enhancer constituents: 11             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00507chr12:88151708-88178129pro-B_Cells
mSE_01277chr12:88127683-88178050Th_Cells
mSE_03860chr12:88156238-88159616Cerebellum
mSE_04026chr12:88156887-88158603Cortex
mSE_04392chr12:88155275-88159353E14.5_Brain
mSE_04811chr12:88156930-88160639E14.5_Heart
mSE_05545chr12:88157021-88158215E14.5_Limb
mSE_06635chr12:88156946-88159646Heart
mSE_08022chr12:88156119-88159455Kidney
mSE_10068chr12:88155514-88159197Embryonic_stem_cells
mSE_10703chr12:88155356-88160063Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
TCCTCCTTTT GGGCTCCCAC TGGGATGGGT GGCCTGCTGT CTTGCCTGTT TTTTCTCAGC 60
CCACCCCCCA TTGCTTCCAC CTGCAGCAGC TTAGTCCTGA ACACCCTGTC ATACATCATG 120
TCATGACAAT GTCATGTTAT AGCCTCTTCC TTGGAGACAG GGAGCCACAA GATTGCCTCC 180
AAAGTGCCCT CCCCAGCAGC CTCCCTTAGC TTTTTCAGTG CACACCAAGT CCGAGGGTTC 240
CAGACAGAGC CTAACTAAGC TGGAGGAGGC AGTCACGCCT CATGCTTATC CAGTCATCCA 300
ATCATGGAAT TTACTCTGTA ATAGCTTCTT GGGTTAGAGG CTCTGCATTT CCCTTCTGAG 360
CAAAAAGACA AACTCAGAGA TGTCAAGAGA CTGGTCAGGT ATGCTGGCAA ACACCTGTCA 420
TCCTAGCACC TGATAGTGGA GACAAGAAGA TACTCAGCAA TACAGCCAGT TCCAGACCAG 480
TCTGGGCTAC ATGAGACTCT ATCTCAAAAC AAACAAACAA ACAAACAAAC AAACAAAAAA 540
CCTGAAGAAA GAAAGAGGTT TATTTTATGA GAGTAAGGTC ACAGCAGCAG CAAAAGGCAG 600
GGTTCGGCTT CTCATCTGCA AAGTGCCCCT TAGAGATGAC TACTGTCAGA GAACACCCCC 660
AACCCAGTTT GCAATCCTTC TTAGAGCCAG AGCTGTGGGG GGTAGGGATG CCACGCCTAG 720
CTGGCTGGGG ATGCTGCATC TCTGTCTGCC ACTGAAGGAC CTAACTGCTA ATCAGCAGCA 780
CTGGTATCCA GGCAACCAGC CTCCCTGGCT TCAGATAAGC AGAAACAGCT GGAGCTGCTG 840
AGGCTGGGAG CCGCAGGGGA GGAAAGGAGC CAGCCTATCC TCGCAGGTTA TTTTGAGCCT 900
GTTACACGCA CTATCCAGAC ATCAGCTTGA GCTAGGGCCG TTCCCCTGGT GTGTCCTTGC 960
CACAGCCTTT GGGGAAGGGT TTCTAGGGCT CAGCCCAGCA GGGAGCTTGG CACACTCGAG 1020
GATGGGGTGG GCTGAAGAAC TCCTGGTTTT TCCCTTTCTT GAGCAAGAGA GGGAGGAAAA 1080
TTGGTACTAT ATCTAGAGGT AAAAGCTTAA GTCCATCTGG TAAACCACAG TACTTGAACT 1140
CAGCCTTTTG GGGCCTCCTG ACCTTAAGGG AAGTCAGGCC AGGCTTGAGT GCATTTTCAT 1200
TTATCCTGTA CAACCTCTTA GGAGCACTCC AGGAGGGCAG TGGCCATTGA GCAAAGGGCT 1260
AGGTCAGACA AGCTAGGTCT GGATCTGTCA GGCTCTGTTC TTTTAGGTTT GGCCTTTCCT 1320
CTCTGACTCG GGTTCCGTTG CACAAAACAA AGACAAACCC CACCTGCAGA GTGGATGCTG 1380
GAAACTGAGG AAGTGGCATG TGGCCTAGCC AGCAGGGTGC CTGGCACAAG GGATGCTGAG 1440
GTGGCTCTCC CCTGCCAAGT TGCTGGGCCT GCCCTGCCAG CCTGAACCTC TCTCCCACAC 1500
AGGAGCATAT CCGTCCCTCC ACCCCTCTCT CACCCCGGGC TATTTCTGTC TCCCTCTCTA 1560
AAGGTCAATG CCTTTCCCGG GATATGGCAG CTGTCACCTT TTTTTCCTTC TAAGTGACCT 1620
TGGCTCCATG CCCAGGGGCA AGAGGTTGTC CGGATGATGT TCCCCACCCC GTCCTCTACC 1680
ACATCTGGCC TGGGCATGCC CACACTACAG TACACAGGGC CCTCAGGTCA TTTCTGGGTC 1740
TGGTGTGTGT GTGTGTCCAG CTCTGGACTG ACACACTGGC CACACCAGCA GCCAGAATCC 1800
TCCTATTGTC CCCTCAAGTG TGGGACAACT GGGGTGTGTG CTGACGGCTT GTTCCAGTGC 1860
TCAGCCGGCT TGAAGGAGAG CACAGGACGA GGCAGCCTGG CTCCCTGAGA AAGTCCTCAC 1920
GAGAATATCA AAGCAGTGCT GCCCTCCACC AGCTTGGCAT CTGTGCCCTT GAGATCTAAG 1980
TCTTTGACTG GGAACAGGAG GTAATTGCCC CTCACTTTTA ACATTAGAGC AGATCTTTTG 2040
GAGTGGTATA GGAAGAAAAG CAGCAGATGA TAGCTCCTTA TCATCCCAGA GTAGAACCTT 2100
CCAGATCTAA GTCAGCCCTC TGAGAAGGAA ATGGCTTCTT CCAAGTGACC TACAAAGACC 2160
TCTGGAGACT CAGGGCCCCT TAGTACCCTT GGCGCTGTTG CCATGTGACT GACCGTAGGT 2220
AGACCTGTCT GATTCTTATT CAACAGTGTT CCAGCATCAG GAAAGTTCCC TATTTCTGTG 2280
TTGCTCTCAA CTTCATAGAG GAAAGGGCAG ACTCCAAGCT GATTATGTTC AATCTTGTGG 2340
TTCCTGCTGT TCAAGAGAGC TACGGTGTGT TCTGAGGTGC TGGAAGGACA ATGGGGGAAT 2400
CCTGGCTAAA CAGTGAAGGG CCTGCGCTGG ACAGCACAAC TGAATGGGAG CCAAGGTTTC 2460
CCAGAGCCGG GCGTCTCCAT TTCACCAACT AAAAATCAGA AGGGAAGGAG AGGACCCTGG 2520
TGTGGTGTAT AGCCCGCAAA TCTACTGTTC TGAGGGCTGA GGCAGGAGGA TCCTGAAAGT 2580
CTGTCTCCAA AAAAGAAAAG AAAGGTAAAA GAAGAAGGAA AGAAAGGAGG GAAAGCCAAC 2640
CCTTGATCAA TGGATGGTAG AGAGGGGGAG GGAGGACCCA CCCCAGCTGG TCTCTTGTCT 2700
CTCCCATCTT TCCCCCATAT GACACCCTCA GGTCCCCTGC TCTCTCCCCT GATACTGACT 2760
TGCCAGAGGG AATCAGGACT CCAAAGCAAG ATAAGCAGAA GGGAAGGGGG CTCAGGAGAC 2820
ACATTCCAGA GCTAAAAATA ACAGGGTCAG CTGGCAGGCT GGCAGCCTCA GCCTTCCTCG 2880
GGGTCCCCCC AGGGCCCCAG CCAGTCTCCT CCTCTCTCCC AGCTCTCTGC TGGGCCCCAA 2940
TCTGGGAAGC CTGGACTGCA TCTGCTGAGA CAAGGCCAGC ATCTCCTCCC GACTCTATCT 3000
CAGCTAGAGA AGGTAGAGGA GCCACCCTGG CAAGGCTCCC TCCTCCACCT CATCTAACAC 3060
TCTCCCCAGC TCATCATCTT AACCTTTGAC CTACATTCTC TTAATGTTAT CACAAAATGC 3120
AAAATTTTTG GTCCACTAGG CAAAGGCTGT TTGGGTCATT AAAGAAGAGT TCTCCTTTGA 3180
AACATACCCT ACACTCACAC CTGCAGGAAT GGGAGTTCAA GGCCAGCCTG TGCTACACAT 3240
ACCTGTCAAA CTTAAGGCCT GAGATCATGT CTCACTACAA CAGGAGCAAG AGCTCCACAC 3300
AGGCAACAGA AAGCATGCCT AACTGGTTGA CGTGCCTGTT AACTCCTGTG ACACTGTGTC 3360
TCCCACATCT GTGTACAGCG CCATTCACTC AGACTCTGAC AGGTCTGTCC TCGTAGGCTC 3420
TATGGTGAGT TGGGGGTTTT CTTTGACAGT GTGGGCACTG TATTATCTAT CATGCATGCT 3480
GGGACCCTTC ACCTTGAAAC CTGAAGTCTG TGACTCTCCC CTCCCTACCC CAGCCCACAA 3540
ACGGTCCTTG AGAACCAATC CCCCCCCCAC 3570