EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM092-02204 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Liver_E14.5 
Coordinate
chr11:69473360-69475970 
Target genes
Number: 48             
NameEnsembl ID
Trappc1ENSMUSG00000049299
Chd3ENSMUSG00000018474
Lsmd1ENSMUSG00000059278
Cyb5d1ENSMUSG00000044795
Tmem88ENSMUSG00000045377
Kdm6bENSMUSG00000018476
Efnb3ENSMUSG00000003934
Wrap53ENSMUSG00000041346
Trp53ENSMUSG00000059552
Atp1b2ENSMUSG00000041329
ShbgENSMUSG00000005202
Sat2ENSMUSG00000069835
Fxr2ENSMUSG00000018765
Mpdu1ENSMUSG00000018761
Cd68ENSMUSG00000018774
SNORA67ENSMUSG00000065862
snoU6ENSMUSG00000089542
SNORA48ENSMUSG00000084708
Eif4a1ENSMUSG00000059796
Senp3ENSMUSG00000005204
2010012P19RikENSMUSG00000085890
Tnfsf13ENSMUSG00000089669
BC096441ENSMUSG00000018752
Polr2aENSMUSG00000005198
Zbtb4ENSMUSG00000018750
Chrnb1ENSMUSG00000041189
Fgf11ENSMUSG00000042826
Tmem102ENSMUSG00000089876
Nlgn2ENSMUSG00000051790
1810027O10RikENSMUSG00000070394
Plscr3ENSMUSG00000019461
Tnk1ENSMUSG00000001583
Kctd11ENSMUSG00000046731
Acap1ENSMUSG00000001588
2810408A11RikENSMUSG00000018570
Neurl4ENSMUSG00000047284
Gps2ENSMUSG00000023170
Eif5aENSMUSG00000078812
Ybx2ENSMUSG00000018554
Slc2a4ENSMUSG00000018566
Cldn7ENSMUSG00000018569
Ctdnep1ENSMUSG00000018559
Rai12ENSMUSG00000018565
GabarapENSMUSG00000018567
Dvl2ENSMUSG00000020888
AcadvlENSMUSG00000018574
0610010K14RikENSMUSG00000020831
RnasekENSMUSG00000040904
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr11:69474690-69474706ATTTATTTACTTTATG-6.18
Nr5a2MA0505.1chr11:69474956-69474971GCTGTCCTTGAACTC-7.06
PROX1MA0794.1chr11:69475190-69475202GAAGGCGTCTTG-6.27
ZNF740MA0753.2chr11:69475624-69475637GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr11:69475625-69475638GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr11:69475626-69475639GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr11:69475627-69475640GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr11:69475628-69475641GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr11:69474561-69474574TCTCCCCCCCCAC+6.24
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01268chr11:69475516-69496723Th_Cells
mSE_11858chr11:69474933-69480491Placenta
Enhancer Sequence
TGGCCTCGAA CTCAGAAATC CGCCTGCCTC TGCCTCCCGA GTGCTGGGAT TAAAGGCGTG 60
TGCCACCACG CCTGGCTGAA AAAAAATTTA AAAAGTCATA AGGGATGTGT GTTGTAGTTC 120
AGGCTTTTAG TCTTATTTAA TCATCTCTGA GTTCAAAGCC AGCCAGAATT ACACAGTGAG 180
ACCCTATCTC AAATACTTAA AAACTATTGT CAGGTGTGGT GGCAAAAACA TTTAATCTTA 240
GCACTTGGGA TCGAAGGACA GCTATGTGAG TTCAAAGCCA GCCTGGTCTA CATAGTGAGT 300
TCAGGCCAGC CAGGGTGATA TAGAGAAACT ATTAAAAAGG CTGGAGATAT GGCTCAGTGT 360
TTACGAGTAC TGACTGTTCT TCCAGAGGAC CTGGGTTTAA TTCCTGACAC CCACATGGAG 420
TTCACAACTC TTAACTCTAT TTCGAGGAGA TCTGACACCC TCATTCATAC ATACATTCAG 480
GCAAAACACC AGTGTACATA AAACAAAAAT AAATCTTTAA AGAAATCATT AGGCCAACAA 540
GATGGCTCTG CTGCCAACTC TGTTGACCTG AGTGTATATA AGGGAATACC ACAACAGAAA 600
TACATTTTAA ACATTTGGGA CTGGAAAGAT GACTTAGTGG TTAAGAGCAC ATCTCTGCTC 660
TTGCAGAGAA GATCTGAATT CAATTTTTAG CATCCTTCTC CAGTGACTCA CAAATGCCCG 720
TAGCTCCAGC TCCAGTGGCA TCTTCAGGCC CTTGCAGTCA TGTATAGTAT ACATATACAC 780
ACACATATAC AAGTGAAAAG ACACACATAA AAAAAAAAAA TCTACATTTC AAAACAACCC 840
TGGCTGGCGA GATGGCTTAG TGGGTAAGAG AGCTGACTGC TCTTCTGAAG GTCCTGAGTT 900
CAAATCCCAG CAACCACATG GTGGCTCACA ACCACCCATA ATGAGATCTG ACGCCCTCTT 960
TTGGTGTGTC TGAAGTCAGC TACGGTGTAC TTATGTATAA TAATAAATAA ATATTAAAAA 1020
ATAAATAAAA AATAAAACAA CCCTATTTTG TGTGTGAGCA CATAGGTGCA TGTGTTCAGG 1080
TCAGAGACTT TGAGGAGCCA GTTCTCCCTT TTTGCCTTTC TGTGGGTTCC GGGAATTGTA 1140
CCCAGGTTGC CAGCCTTGCA AGCCACCCCT CCAGTCCCAC AGGCGTTCCC TGACTCTTTT 1200
CTCTCCCCCC CCACCCCATT CCCACATTCA TACATTCCTG AACCTTCAGG TTGTCCCCAC 1260
TCTTCCAGGA CATTTATCCT TGTTCTTCCA CTATCTCTAT CATTTACTTC TTTTTTTTAA 1320
AGATTTATTT ATTTATTTAC TTTATGTGTG TGAGTACATT GTAGCTATCT ATCTTCAGAC 1380
ACACCAGAAG AGGGCATTGG ATCCCATTAC AGATGGTTGT AGGCCACCAT GTGGTTGCTG 1440
GGAATTAAAC TCAGAACCTC TGGGAGAGCA GTCAGTGCTC TTAACCACTG AGCCATCTCT 1500
CCAGCCCCTA TCATTTACTT CTTATCTTGG TTTTTCCAGA CAAGGCTGCT CTGTGTAGCC 1560
AGCCCTGGTT GTATTGGAAC TCATCCAGTT GCCTAGGCTG TCCTTGAACT CCCGCCTCTG 1620
GGTCCCTCCC AAGGGCTGGG ATTAAAGGTG TGGGCCACAG TTCCTGGCAA TTTCTCTAAT 1680
TTTTTTTAAA AAACATTTTT CTTTCAAACC CTGTGTCCAG GGCTGATTTT CAATAGATTG 1740
CAGCGAGTGA GCTGAGCTGC TGCCTACAAA ACCCTGATCC TGGCAATCTC TCTACCACTG 1800
AATCTTTGAC CTGGTGGGCA TTTGGCCCAG GAAGGCGTCT TGACTATTGT AAGCCAAAAG 1860
TCACTTAGAA TAGAGAGATG GAGAAGGCTT ATCAAAGGCC TTTGTAAAGA AAAAGGAAAG 1920
GAAAAGTGCT ATACTCCCAA CACTCTAGTG ACTGAGGCAG GAGGACTGTT GCCAGTTCAA 1980
GGGCAGTCTG TGCCACATAG TAAATTCCAG AAGCTGGTGC TGGAGAGAGG GGATAAAAAA 2040
AAAAATTTGT GAGCCTCTGT CAGTTGAGTG CTTGGGGCGA AAGGAGGCCT ACATGCCTGG 2100
CTGGGGTTTT AATTTTGTTT TATAAAATAC GAGTTTTCCG CCGAGGATTG GTGGCACACA 2160
CCTTTAATCC CAGCATTTGG GAGACAGAGT CAGGTGGATT TCTGAGTTCG AGGCCAGCCT 2220
GGTCTACAGA GCGAGTTCCA GGTCAGCCAG AGCTATACCC TGTCGGGGGG GGGGGGGGGG 2280
GTACGACAAA AAAGCTCCGA GTTTTCCAGC CTGGGGCTAG AGCCTGGTTA GCAGAGTAGC 2340
ACATGCCGCC CTGAGTTCGA CTCCCAGCCC AGAAAGGGAT GAGGGTTGGG TACAGACTTC 2400
CGAGATTGTA AAACACAAAT TTAACTTTTT TTCGGGAGAC ACCCCTTCAT GCCCAAATAT 2460
GGCACTTTTC CTATGCAGGG CCCCAAACAC TTCCGCCCTC GTCAGAACCG CCTTCTGCCC 2520
AGCTTCGCGG TGACATTAAT CGCCACTGTC ACGCCAACTT ACGGTTCAAG GCTGCTCCAG 2580
CTAGACCTTG AAGGCTGAAA TAAAACTCAC 2610