EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM092-01225 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Liver_E14.5 
Coordinate
chr10:79808440-79810300 
Target genes
Number: 43             
NameEnsembl ID
Rnf126ENSMUSG00000035890
Ptbp1ENSMUSG00000006498
Prtn3ENSMUSG00000057729
ElaneENSMUSG00000020125
C030046I01RikENSMUSG00000035781
Arid3aENSMUSG00000019564
Wdr18ENSMUSG00000035754
ORF61ENSMUSG00000013858
Abca7ENSMUSG00000035722
Hmha1ENSMUSG00000035697
Polr2eENSMUSG00000004667
Gpx4ENSMUSG00000075706
Sbno2ENSMUSG00000035673
Stk11ENSMUSG00000003068
Atp5dENSMUSG00000003072
DosENSMUSG00000035640
MidnENSMUSG00000035621
1600002K03RikENSMUSG00000035595
Efna2ENSMUSG00000003070
Mum1ENSMUSG00000020156
Ndufs7ENSMUSG00000020153
GamtENSMUSG00000020150
Dazap1ENSMUSG00000069565
Gm15122ENSMUSG00000087672
Rps15ENSMUSG00000063457
Apc2ENSMUSG00000020135
2310011J03RikENSMUSG00000020133
Pcsk4ENSMUSG00000020131
Reep6ENSMUSG00000035504
Plk5ENSMUSG00000035486
Mex3dENSMUSG00000048696
Mbd3ENSMUSG00000035478
Uqcr11ENSMUSG00000020163
Tcf3ENSMUSG00000020167
Rexo1ENSMUSG00000047417
Klf16ENSMUSG00000035397
Fam108aENSMUSG00000003346
Csnk1g2ENSMUSG00000003345
Btbd2ENSMUSG00000003344
Mknk2ENSMUSG00000020190
Sf3a2ENSMUSG00000020211
Plekhj1ENSMUSG00000035278
3110056O03RikENSMUSG00000035206
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr10:79809521-79809539CCTTCCTGCCTCCCCTAC-6.15
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr10:79808947-79808962AAGGTCAGGAGTTCA+6.04
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr10:79808947-79808962AAGGTCAGGAGTTCA-6.04
RARAMA0729.1chr10:79809507-79809525CCTTGAACTCGTGACCTT-6.01
RarbMA0857.1chr10:79809510-79809526TGAACTCGTGACCTTC-6.13
RarbMA0857.1chr10:79808946-79808962GAAGGTCAGGAGTTCA+6
RarbMA0857.1chr10:79808946-79808962GAAGGTCAGGAGTTCA-6
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_06354chr10:79805875-79808734E14.5_Liver
mSE_07738chr10:79806261-79808815Intestine
Enhancer Sequence
TCTTGTCTCT AAAAACAATT GAGGTAACAG CAGCCTTGCC CCATCTCTGG AAAGCCTTGA 60
GGGCGTTATA GGCTCAGGTC AGACACAGGG TGGGGAACTA GGAACTGTAT GTGTTGTTAT 120
TTGGTTTTAA AATTAATGTT ATTTGTAGAA GGGCACGCTC CTTTAATCCA GCACTTGGGA 180
GACAGGCAGA TCTGAGTTCG AGGCCAGCCT GGTTTACAGA GTGAATTTCA GGACAGCCAG 240
GACCACTGTG TCTTGAAAAC AGCATACATA TACATACATG TGTACATGCA TGCATGCACA 300
CACACACGCG TGCACACACA TGCACACAGT GCAGCGCTGG AAGATGCCAG CAGCATTGAC 360
TCCCTTCGCT GAGCTGAGCT ACAGTTGCTC CCAACTTGGC ATGGGTGCTT GGAACCAATT 420
GTGGGTTCTC TTAAGGAGCA AGGTAAGATC TTGAACACTG GGCTGGTGAG ATGGCTCAGT 480
GGGTAAGAGC ACCCGACTGC TCTTCTGAAG GTCAGGAGTT CAAATCCCAG CAACCACATG 540
GTGGCTCACA ACCATCCGTA AGGAGATCTG ACTCCCTCTT CTGGAGTGTC TGAAGACAGC 600
TACAGTGTAC TTACATATAA TAAATAAATA AATCTTAAAA AAAAAAAAGA TCTTGAACAC 660
TGAGCATCTC TCCACCTCCT CCTGTGTTTA TTTGAGACAC TCTCGCTATG TAATCCAGGC 720
TGTCCCAAAA CTCTCTATGT GGCCCAGGCT GGTCTGTCAA CTCACAGAGG CCCGCCTGCC 780
TCTGCCTCCC AGGTGCTGGG ACTAAAGATT TGCACACGTG CTTTTCTTTT TTTCTTTTTT 840
TGGTTTTTCA AGACAGGGTT TCTCTGTGTA GCCCTGGCTA TCCTGGCACT CACTTTGTAG 900
ACCAGGCTGG CCTCGAACTC AGAAATCCGC CTGCCTCTTC CTCTCGAGTG CTGGGATTAA 960
AGGCGTGCAT CACCACGCCC AGCTTTCTTT TTTTCTTTTT TATTTTTTTT TTAGATAGGG 1020
TCTTGTAGCC CAGGTTGGTC TTAAACTTCC TGAGTAGCTA AGGATAACCT TGAACTCGTG 1080
ACCTTCCTGC CTCCCCTACT AGCTCCTGGA CAGTGGGCAC TGGGCTTTTG CTCTAGGACA 1140
GGCTTCTGCT TTCCTTTTGA GATGGGAGTC TTGATCTGTA GCTCAGGCTA GGCTCAAACT 1200
CTGAAAAATC CTCCTCCCTT AGCCTCCTGG GACAAAGTTG CTAGTCCTGG ACTGCCACAC 1260
ACCCACCTTA ATCAGTTCTT CCTATAGACA ATGTGTTCTT TTATTTTGTT TTTGTTTTTT 1320
TTTAAAGATT TTTATTTATT TATTATATGT AAGTACACTG TAGCTGTCTT CAGACACTCC 1380
AGAAGAGGGA GTCAGATCCC ATTACGGATG GTTGTGAGCC ACCATGTGGT TGCTGGGATT 1440
TGAACTCAGG ACCTTTGGAA GAGCAGTCGG GTGCTCTTAC CCACTGAGCC ATCTCACCAG 1500
CCCCAGTGTG TTCTTTTATA ATGCACAAGG AATCCTTTAA GGACAGTTTT TAGGTGGCTG 1560
CAAGTTTAGT CACCCCTTTC ATCTACCTTC CTGGGTGGCC AGGAACCAAC CATTCCATTT 1620
CTCCAGGCCT CGGTTTCCCC ATCTGTGCAG TGAAAACCCG CGGAACCCCA TCCCTGAGTC 1680
TCTGAGAGCC TGTAGAGGGA TAATTAATGG AGGCTCATCC AGAAACTCAG GGTGGAATGG 1740
ATGTCCCCCT CCCAGCTGCC CCCCAGCCTC TGGGGACCGC TGTGCTCCCA GGTACCCCAT 1800
AGCCTAAGGG ACCTCCTCCC CACCCCCAAC CCCACCCCGT GGCAGGCGCT GGGCGGCTGA 1860