EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM092-01096 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Liver_E14.5 
Coordinate
chr10:79442490-79446650 
Target genes
Number: 48             
NameEnsembl ID
Mier2ENSMUSG00000042570
Gm16517ENSMUSG00000020308
Cdc34ENSMUSG00000020307
BsgENSMUSG00000023175
PolrmtENSMUSG00000020329
Rnf126ENSMUSG00000035890
Fstl3ENSMUSG00000020325
Prss57ENSMUSG00000020323
PalmENSMUSG00000035863
Ptbp1ENSMUSG00000006498
E130317F20RikENSMUSG00000091994
Gm17134ENSMUSG00000090860
Prtn3ENSMUSG00000057729
BC005764ENSMUSG00000035835
ElaneENSMUSG00000020125
Med16ENSMUSG00000013833
Kiss1rENSMUSG00000035773
C030046I01RikENSMUSG00000035781
Arid3aENSMUSG00000019564
Wdr18ENSMUSG00000035754
ORF61ENSMUSG00000013858
Cnn2ENSMUSG00000004665
Abca7ENSMUSG00000035722
Hmha1ENSMUSG00000035697
Polr2eENSMUSG00000004667
Gpx4ENSMUSG00000075706
Sbno2ENSMUSG00000035673
Stk11ENSMUSG00000003068
Atp5dENSMUSG00000003072
DosENSMUSG00000035640
MidnENSMUSG00000035621
CirbpENSMUSG00000045193
1600002K03RikENSMUSG00000035595
Efna2ENSMUSG00000003070
Mum1ENSMUSG00000020156
Ndufs7ENSMUSG00000020153
GamtENSMUSG00000020150
Dazap1ENSMUSG00000069565
Gm15122ENSMUSG00000087672
Rps15ENSMUSG00000063457
2310011J03RikENSMUSG00000020133
Pcsk4ENSMUSG00000020131
Reep6ENSMUSG00000035504
Mbd3ENSMUSG00000035478
Uqcr11ENSMUSG00000020163
Tcf3ENSMUSG00000020167
Fam108aENSMUSG00000003346
Mknk2ENSMUSG00000020190
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESR1MA0112.3chr10:79443616-79443633GGGGTCACCATGACATG+6.76
ESR2MA0258.2chr10:79443617-79443632GGGTCACCATGACAT+6.06
EWSR1-FLI1MA0149.1chr10:79445705-79445723GGAGGGCAGGAAGGAAGA+7
FOXD2MA0847.2chr10:79443553-79443566ATGTTTACATTAC-6.2
Foxd3MA0041.1chr10:79443223-79443235GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr10:79443219-79443231GTATGTTTGTTT+6.37
NR2C2MA0504.1chr10:79446617-79446632TGGGGTCAGGGGTCA+6.67
NR2C2MA0504.1chr10:79446631-79446646AGAGGTCAGGGGTCA+7.19
NR2C2MA0504.1chr10:79445281-79445296TGCCCTCTGACCCCT-7.58
NR2C2MA0504.1chr10:79446624-79446639AGGGGTCAGAGGTCA+9.03
Nr2f6MA0677.1chr10:79446625-79446639GGGGTCAGAGGTCA+7.03
Nr5a2MA0505.1chr10:79443260-79443275TCTGGCCTTGAACTT-7.29
RXRBMA0855.1chr10:79446618-79446632GGGGTCAGGGGTCA+6.04
RXRBMA0855.1chr10:79446625-79446639GGGGTCAGAGGTCA+7.06
RXRGMA0856.1chr10:79446618-79446632GGGGTCAGGGGTCA+6.1
RXRGMA0856.1chr10:79446632-79446646GAGGTCAGGGGTCA+6
RXRGMA0856.1chr10:79446625-79446639GGGGTCAGAGGTCA+7.01
RxraMA0512.2chr10:79446625-79446639GGGGTCAGAGGTCA+6.98
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_03404chr10:79445313-79453117Bone_Marrow
mSE_06348chr10:79445348-79451828E14.5_Liver
mSE_07798chr10:79445937-79453081Intestine
mSE_12142chr10:79446084-79453231Spleen
Enhancer Sequence
AACAGGGCCT AGGGGTGAGG GGGGTGGGGT GAGCAGTCAG CAGGGCGGGG GACACACCCC 60
TCCCAGGCAG GAGAAGCAAT GGCTGCCTGT GCCTCCTTGG GAACTAGCTG GCTGAGGGTC 120
CCCACTGCAA GGGTTCCCTG TACCACCACC CTCCAGCTGT CTCATGACCT TCAGGCCCAG 180
CAGGTGCTCC AACGCAAAGC TGCCTTTAGG GGACCCTTGA TCTCACTGGC TAAGAATAGC 240
CACTGTCCCT AGGGAAGCAC CCTCTGCCCT GCTCCTGGGG CTGGCAGAAG CCACAAGGAC 300
ACAGCTGATC GGCCCTGGTA GGGCCCAGGC ACCTCAGCAG GACCAGGCTA CCCTGCCTGG 360
GAAATGTGGC TTCATCTAGA AAAGGCGCAT CCAGGAGAGC CAGGGCATGT TAAGAACATG 420
AGTGGCTCAC CACTGGGTGG CTCCTGGCGT GAACTCTGCT CAGCACCCTG GAGGTTTTAG 480
GATGCCCTGC TGATGCTGAC CCAGCCACAC ATATTCAAGT ACATTTAAAA GGGGTGGGGG 540
AGGGAATGTG GGCCATCAGA TGGCTCATTT GATAAAGGAG CTTGCCAGGA AGCCTGAGAA 600
GCTGAGGTCA ATCCTCAGGC CATACATGTA AGGTGCAGGA GCAATCTGAC AGCTGCAAAC 660
TGTTCTGACT TCTACACACA TGTGGGATAC ATGCCCCACA CATATATGAA TACACACATA 720
ACAAAATAAG TATGTTTGTT TGTTTTCAAG ACAGTGTCTG TGTAGACAAG TCTGGCCTTG 780
AACTTGTTCT GTAGACCAGG CTGGCTTTGA ACTCAGAGAT TCCCCCTCCC TCTGACTCTG 840
GAATTGAAGG CATGCATCAA CTATTAATAT TACTTATTAA TCTCAAACGC CCCTATGCTG 900
GAGCAGAGTT ACTCAAGGGG TCCCAGCCTC TGGGAACACC CTTCTCTTTT CCTGCTCAGT 960
GTGTGGGTGG CTATGTGTCT GTGTGTAGGG GGGTCGCCTA ATTCAGTGGT ACCTGTGGGT 1020
CGCAACCCCT TCAGGGGTTG CCTAAGACCA CTGGAAAACA CAGATGTTTA CATTACAATT 1080
AATAATAGCA AAATTAGTTA TGAAGTAGGA ATAGAAACTA TGGTTGGGGG TCACCATGAC 1140
ATGAAGAACT GTATTAATGG GTTGCAGTAT CAGGAAGGGT GAGAACCGCT CGCTGCCCTA 1200
ACCCATGCTG AGTGGAAGCA GGGATGTCGT GCAACACTTG CAGACAGCAC ATGCGCACCA 1260
TGAGCACTGG GCTGAAAGAG ACCCAGTACT CCATGTAGCT GTCTAGGGTC ACCCTCCTCT 1320
GTGGCCCCAA CTGACACCCT AGCTTCCCAC CATGTCTCTG CTGGCCAGCA TAGGACCCTG 1380
GCCCAATAAG GTGCCCAACA TAGAGTAGGG TGATGGGACT CATGAGGTCC TTACATCCCG 1440
GCACACCCAC TGTGTGCACT CACATCCCTG CACCCTTCAG GGACGAGACT GGATTCCCAG 1500
ACCACAGTCC TAAGGGACTC AGCCACAGCA AGCACAGTAG GGCCCTCCCC ACCTGCTGTT 1560
AGGCAGCAGT GTAAGGGACA GAAGCAGGCA AAAAGGCCCT GCTCCATATC CTGATGTGCC 1620
TGTAGCCAGG CCTCTCCTCT GCAATCTAGT GACAGAGCTG GACCCACAAA GCACTCAGCC 1680
CATCTAGCAG TGACCTGAGG GAATACAGAG CATGTGTGGA AGGCCCAGGG ACTGAGACCA 1740
AGGCTACAGT CTCCAGCGAG CCACACCTGA AGCTGCACCC ACCCTGTCAA CTGTGAGGTT 1800
CACCCTGGGC AAGAAATCAT TTCTGTATCA GGTGAACTGA AGGCCAAGCA GCCCAGGCTG 1860
AGACCGCAGC AGTCACTCCT CCCAGTCCAA TCCAAGAGCC AGGAACTGTA TCCCAGGTCC 1920
TGTTCCACCT ACTGGGCATC TAGAGTCAAC ATAAGATAGC CACTGGACAG GGGTTATAGC 1980
CTGGGTCCTC TCTTCCCACC ATGGCCACTG TGGCCAGCCC ACGAGTCCTC ACTGGTCACT 2040
GACTCGTGCC AGTCACCCCA CTCAGGCCCT TGGGCACTCC TCCCTCATGT GCCCACTTGA 2100
TGCCACATAC ACAGGCACTG AACTTGGTTA TACCGGCCTG GTGGGGCTGC ACACCATCAC 2160
CTCCTACAGA CACCTCAATG CCAAGACCTA GGGTTCTTGG GAAACCTCCT ACCCTGTAAG 2220
CGGGGGTGGG ATGGAGTATT GCATTGTCAC CCCAGTCTTG TGTCTGGGCT GTCAGTTCAT 2280
CTGACCAATG GGAAGCCTGC ACTGGGGTCA GAATACCAGC CTCACTCATA TGCTTGCTTC 2340
TCTCTTGTCC TCTTGGGCTC TTCCTTTCCC CCTCTCTCCC CATGCTCACG GCTGTGGCCG 2400
GCCTCGACTT CTCTACTCTC TATCTCTACT ACACTCTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT 2460
TTTTTGAGAC AGGGTTTCTC TGTGTAGCCC TGGCTGTCCT GGAACTCACT TTGTAGACCA 2520
GGCTGTCCTC GAACTCAGAA ATCCGCCTGC CTCTGCCTCC CGAGTGCTGG GATTAAAGGC 2580
GTGCGCCACC ACCGCCTGGC TCTCTATTAC ACTCTTAACT CCCTTCCCTG AGCCATGAAT 2640
AAACTCTATT CTACACTATA AAGACAAAAC CAAATACCAG CCTCAGCCAG GATCTCCACG 2700
AGATCATGAC CCACCCAAGG GTGCCACTTA GCACCTTTCA GGGCTCAAAT CCACTTGGTG 2760
CAGGGACTTG AGCTGGTGCC ACATACCTCC TTGCCCTCTG ACCCCTGCCA CATCCTAAGG 2820
TCTAAGGCAC CATGCTGTGC CCCCCTATCC CATGGCTGCC CAGTTTCGGT CCTTGAGGCT 2880
CTGAAGCCAG CAGAGGAGAT ACCAAGCCCA ACAGTTCTTC TCTGGGCCTC TGTAGGAGCT 2940
GACACCTAGG CTGGGGTGGG AACAGGGCGC AGGGTGGTAC AAGCCTAGCA GGCCTTGGCT 3000
GTGAGGCGTC CCTTCTAGGA AGGTTGGGTG GAAGCTGGGC AGGCAGGACG GGCAGGAAAC 3060
ACAGCAAATG GGCTCCCAGA AACGTCAGCA GCTCCAGAAA CCAGCTGCTG TGTGGCTTGT 3120
TTATCCCAGT TAAGAAAGAG GATAAGGTCT ACTGTCATCC AGCCGACCCT GTCTCTGACT 3180
AGACATTGGG CACCCACCCG GAGCCCTGAG GGTGTGGAGG GCAGGAAGGA AGATGGAGCA 3240
TGGGCTCATC TGCAGCCAAT GAACTGGGGC CTGAGGGGAT GCCCACAGCT GTCTTGAGCT 3300
CAAGCTAGAT CTACCTATGA AACCCCCGAA CGCTCAGTTC TGAGAAGCAC CAGGAGTGAG 3360
TCCCAAACTC ACCAATGCCC TCCAATATCA GCATGCCAGC CACCAAGCCA TGACCCCAAC 3420
ACCAGAAGGC CCAGGCAGCT CCTCAGAGAG AGCCTGGTGC CATCCCTCGA GTAGCCTTTG 3480
TGACCGAGAA CCGGGATCTC CCGGGAGCAC ATGAAGAAGA CACAGCCAGG GCAGGTGCTG 3540
GCTGTAGAGG TCCCTGGCCA ATCTGGCTGT GACTCTGTGG CTGACCCTAG TGAGATGACC 3600
TCACCCAAAG CCACAGAAAA CCTGGCAAGA GTCTGAAAAC AGTGAAGTAA CAGAAAATTT 3660
GAGCAGTGAC ACTGGGGGGT AGGGGGCTGT CCCCAGGGGG TTGGTTCAGG GTGTGCTGGA 3720
ATGGGACTGA CTAGTAGAGA CTGGACTGAG AGAATCAGGG TAGAATAGAA ATGACAGGCG 3780
GGACAGGGCC TCCAGCACAG GAGGTGGTCT ACAGTGGAAA GTCAGGAATG GAATGGAAAT 3840
GACCATATTG TTCTCAGTGG AGGTGCAGGA CAGGATGGGA GTGACAGGTG GGAAGGTGGA 3900
CCTCGAGTCC AAAATCCTAC TCCAAGAGGA CACTGGGCTC TGGTCTTGAG TGGAAAAATT 3960
TGGGGCCTAG GCTCCCAAGT GGCAGACTGA GGCCAAAGGG CAGGAGGCGG GGCCTGAGAG 4020
CTGAGGAAGT GAGGACCAGA GATAGCATCT GTAAGAGTGG TATCAGGGTA TCCAGGCGTC 4080
AGGAGCCAAG TGGTAAAGTT GCCGGGGGTG GGCGAGCGGA TGACAGCTGG GGTCAGGGGT 4140
CAGAGGTCAG GGGTCAGAGG 4160