EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM092-00427 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Liver_E14.5 
Coordinate
chr1:135014230-135017740 
Target genes
Number: 5             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr1:135014527-135014538TTTTATTGCTT-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:135014575-135014587GTTTGTTTGTTT+6.32
Gata4MA0482.1chr1:135015658-135015669GAGAGATAAGA-6.32
JUN(var.2)MA0489.1chr1:135015601-135015615CTGAGTCATCTCTC-6.02
Klf1MA0493.1chr1:135014438-135014449AGCCACACCCT+6.02
MEF2CMA0497.1chr1:135016310-135016325GATCCAAAAATAGAT+6.99
Nr5a2MA0505.1chr1:135015468-135015483GTGTTCAAGGCCAGC+6.83
PKNOX2MA0783.1chr1:135016401-135016413TGACAGCTGCCA+6.02
TGIF1MA0796.1chr1:135016401-135016413TGACAGCTGCCA+6.04
TGIF1MA0796.1chr1:135016401-135016413TGACAGCTGCCA-6.18
TGIF2MA0797.1chr1:135016401-135016413TGACAGCTGCCA-6.07
TGIF2MA0797.1chr1:135016401-135016413TGACAGCTGCCA+6.44
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01631chr1:135016352-135030682Macrophage
mSE_03469chr1:135016818-135017245Bone_Marrow
mSE_07341chr1:135014898-135016230Intestine
mSE_08766chr1:135015890-135018602Liver
Enhancer Sequence
TTCTCATGAG AATTGGACGG ACACATCCTA TTCTGTCAAA TCTTTCTCTG ACTTATCACT 60
TTGTCTGCTA CTCAATTAGA CATTGATTTC AAACATGGGT GCTTCATTCT ACAAACTAAC 120
TTTACATTCA ATGTTTGGGA TTAAAGGAGT GTACTAAGGG CATGTCTATA TACCAGCCAG 180
AAAGATCAAA AGTGTGTGCT AAGGGCTGAG CCACACCCTA ACCAGAAACA GATTCAAATA 240
TCCTGTAACA CAGACTATTA TACCCAAGAA AACTATCAGT CACAGGTTGC TTTAGGGTTT 300
TATTGCTTCA AAGAGACACC ATGACCATGG CAACTCTTAT TTTTTGTTTG TTTGTTTGGT 360
TTTTTTTTTG TTTTTCCAGA CAGGGTTTCT CTGTATAGCC CTGTCTGTCC TGGAACTCAC 420
TCTGTAGACC AGGCTGGCCT CAAACTCAGA AATCCGCCTG CCTCTGCCTC CCGAGTGCTG 480
GGATTAAAGG CGTGCGACAC CAGGCCCGGC GCAAAAAAAA TTTTTTTTAA TTGGAGTGGG 540
TTTACAGTTT TAGATCTTTA GTCCATTATT GTTATGGCAG GAAGCATGGC AGCACACAGG 600
CAGACATGGT GCTGGAGAAG TTGCTGAGAG CTCTAGATTC CAGATCAGCA GGCAACAGGA 660
AGTGAGTATT ACACTAGACC GGAGTTTGAG CATTTGAGAT CTCAAAGCCC ACCCCCTAGT 720
GACTCACTTC CTCCAACAAA GTTCCACCCA CTACAGCAAG GCCACACCTC CTAATAGTGC 780
CACTCCCTAT GGCCAAGCAT TCAAACACTT GAGTCTCTGA GAGCCAATCC TATTCAAACC 840
ACCACCAGAG TGAAGAGAAA AAACAGCTTC TCATGAGAAA AGCCGGCTAG AAGAATTCAT 900
GGCCATTGAT CAAGTCTCAC AGCAGATACA GAAAGAAATA CTACAGACTA AAAATAAGAA 960
TAAACACATT CCAAAAGCTA CTGGGAACTG AATAAGCAGC ATGAAGAGAG TCGTTAAGAG 1020
AACTAAGAAA ACCCTTGACC CGGCAAATAT CTGTGTGCAG ATATGTGCAT GAATCCGTGG 1080
ACGATGTCAG TGCCTCTGGA GCTGGAGTTG CAGAATATGT GCCACGCATT GAGGGTGATG 1140
GGAATATATC CAGTTCTCTG CAAGAGCAGA ACAGTTAGAT ATAGTGACAC ACATCTGTAA 1200
TCCCAGCATT AGGAAGGAAG AGGCAGGTGG ATCTCTGTGT GTTCAAGGCC AGCCTGGTCT 1260
ACATAGACAG CTCCAGGCTA TCCAGAGCCA CCCAATAACA ACCTGTCTCA CACACCCATG 1320
CACACATGCA CACGTCACCA TGCAAGCACT TGCAGTGCAT GCTCTTATTT ACTGAGTCAT 1380
CTCTCCAGTC CTATTCTTGC CTTCTCTTTA AGCCACACTT TGTGGCTGGA GAGATAAGAC 1440
AGAGATTATG AGCACTTGCT GCTCTTCCAA AGGACTCGGG TTTAATTATT ATCTGTAACT 1500
CCAGTTTCAG AGGCCCGGAC TGTCTCTCCT GGCTTCTGTG GGCAGCAGGA CACCTGTGGT 1560
GCACAGACAT ACAGGCAGGC AAAATACCCA TACACATTAA AAAGAAATCT AAATTTCATG 1620
TCAAGACATC AAAGATGGGG GTCACTGGAC CTCTTTGCCT CCCTTCCTGA TGTATGTTAT 1680
ATTCCTAATG TGGTTAAACT GAATAATTGC CTGCTTTTTC TTATTGCTTT TTTTTTTTCA 1740
ATTGGCCTAC TGAGGCTAGG TGGTCAAATC TGGTTTGTTA GGGCTTCCAG GGTCCAGGCT 1800
CTGACCACAA GAACTACAGT AGGTTTGTGT ATCCCTTGAT CTTGTGCTAG ATCTCCTAAG 1860
CAACGTGCAA CAGTCTCTTA GCATGATGGT TGATAGTTTT AGGGTGTCTT AATGGAGTTG 1920
TTGTCAACCT TGGAAAGTAG ATACGTCTCA TTGATCCTGC CAGCAATCAC ACACTGAATA 1980
CATTGGTGCT CCCTAGTGAC TTGCCATCAT TTGCAGAGAA TACAGCCTGA AAGATGTTTC 2040
TGGAAATGCA CACTGGTTCC TGTATCAGGT ACCTGACTGG GATCCAAAAA TAGATCAAGA 2100
CAATTCTTTG CATTTGAAAA GCTTGCTCTG TCCCAATTTA TAATCCCAAA GATGGAACCT 2160
CTCGAGGCAC GTGACAGCTG CCAACTCTTA AGAGCAGAAT TGTGGCCCAG AAGTCTTAAA 2220
ATCACGCCGG TGGAGAGTCG GGTTTCAGAC AAGGGGATTT TGTGGGGCTT CCAAGGGAAT 2280
TGTCCTCAGT AAATGGTAAA AAGTGTTACG TGTTATGTTT CTAAGTGGTT TTATAGCACT 2340
GTATCCCCTA TGGGGCTTTT AAAAGTTTGA ACTTGAGTCT GGCAAGGCTC ATCTAAGGAT 2400
TTTTCTAAGC CAAGTGGGGT AGAAATCTGA CCCCCCTGAG GGAGTGAGAA CTAGGATTGG 2460
GAAAGAGAGG TCACTAGAGA GGAGAGAAAC AGAAGAAGCC CTCGGGGGCT GGGCTACACA 2520
AGTGTAGTTA CCCAACACTG AGGTTTGGGG GTGCAATGAC TAGTGTGGAT TTCAAAAGTG 2580
AGAATTCTGG GTAGTCTAAA TTGTGAGGAA ATCCTGCTGG CTGGGACGCC TCTGGGCTGG 2640
TTGATCTCTT CCACAAACAA CACAGACAAC CTTCTCAGTG TCAGGTGAGG TGTCAGGCAC 2700
TGTGGCTACT CAAGGGATAA ATAGGTGGAT GGCTTCAAGG AGTTCACATG CAAGTGAGGC 2760
AGCCACGGGG ACAAACACGA CAGTCCCTGC ATTTCTCAGA CAACTCTGTC TTCTGGACTT 2820
CAGCCAAGCA GATGGAAAAT ATCTGTACAA ATATCTATGT ATTTGTACTG AACATATACA 2880
AACTCCTCCT TGTGGTCATT CATTTCCTAA ACTCTACCCC AGGACAGCTG TTTACAAAGA 2940
CTCACGTTGT ATCAGTCGTG GGATATCATC CAGAAGTGTT TTAAATGTGT AGGAGAGACA 3000
GGTACAATGA TCCCAACTTG TAGTCCTAGC ATTCAGGAGG AGCAGGCAGA ATTGATCATT 3060
TGTAGGCTCC ATGACAAAAG CCAGTCTCAA AATGTAGAAA ACAAACCACG GTGGAGGTTG 3120
TGTATACATA TATGCATATA CTGTGCCTTT CATTTTATTT TTTGAGACGG GCTCTCTAGG 3180
TGCCCTGGCT GGCCTCAGAA CTTCCTAGAA AGGAGAGAAA GACACTGAAC TTCTGATCTT 3240
CCTGCTTCAC CTCCCTGATC ATGTATATGA AGCTCAAAGT GTGGGCTTTG TCCAGTATGG 3300
GATATATCTA CATAAGGGCT CTAAAAACCA TTTTAAAATT GTGTTATTAA AAAGATTTAG 3360
AAAGGCGGTG CACACCTTTA ACCCCAGCAC TCCAGAGTCA AAGGCAGATA GATCTCTGTG 3420
AGTTCCAGGC CTGGTTGACA GAGTGAGTTC CAGGGTTCCT TATTTTGATG TTATTTACAT 3480
GAGTGCTTTA CCTGCATGCA CATAAGTACT 3510