EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM092-00302 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Liver_E14.5 
Coordinate
chr1:89543790-89546970 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4GMA0484.1chr1:89544150-89544165TGACCTTTGTCCTCC-6.14
NFE2L1MA0089.2chr1:89545353-89545368CGGTGACTCAGCAGC+6.03
Nfe2l2MA0150.2chr1:89545351-89545366CCCGGTGACTCAGCA+6.38
Nr2f6MA0677.1chr1:89544150-89544164TGACCTTTGTCCTC-6.35
RREB1MA0073.1chr1:89544554-89544574ACACACACCACCACCACCAC+6.27
RXRBMA0855.1chr1:89544150-89544164TGACCTTTGTCCTC-6.19
RxraMA0512.2chr1:89544150-89544164TGACCTTTGTCCTC-6.19
SOX10MA0442.2chr1:89544776-89544787TGCTTTGTTTT-6.02
SP2MA0516.2chr1:89546623-89546640AAGGGGGAGGGACTTGT-6.74
TFAP4MA0691.1chr1:89546206-89546216AACAGCTGAT+6.02
TFAP4MA0691.1chr1:89546290-89546300AACAGCTGAT+6.02
ZNF410MA0752.1chr1:89545750-89545767TGCATCCCACAATATGC+6.3
Number of super-enhancer constituents: 6             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00240chr1:89516600-89556311pro-B_Cells
mSE_03427chr1:89546479-89546967Bone_Marrow
mSE_06310chr1:89544178-89546965E14.5_Liver
mSE_09143chr1:89545291-89547026Lung
mSE_12014chr1:89544818-89545219Spleen
mSE_12014chr1:89545604-89548174Spleen
Enhancer Sequence
AAAAAATCTT TTGGGGCGGG AGAAATGTCT CAGCAGCTAG AAGTACTTGT TGCTCTTTCA 60
GAGGATGTAT GTTTGATTCC CAGCACCCCT GTGGCAGCTT ATAATCATCC ATTTCAGGGG 120
ACCCACTAGG CACATATGTA GTGCACATAC ATTTGTGCAA ATAGGACATC CAAACACATA 180
AAATAAACAA ATCTAAAAAA CCTTTCTAAA TAAAAATATG TTCTTGCCAG GTAATGGTGG 240
TACATGCCTT TCATCCCAGC ACTCAGGAAG GAAAGGCAGG TAGAACTCTG AGTTCAAAGC 300
CAGCCTGGTC TACAGAGTGA GTTCCAGGAC AGGCAAGGCT ACACAAAGAA ACCCTACCTC 360
TGACCTTTGT CCTCCCAATA TACATATATT TAGTAAACTA ATTTTTATTT GATTAGTTTA 420
CTTTTTCTTT TAAAGGGTTT TCCGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTTGT 480
TATTGTTGTT ATATATGTGT GTGGTATGTG TACCACTGTG CCTACAGTGC ACATTACAGC 540
TGGAGGTCAG TGTCTAGTGC CTTTCTCTGA TTACTGTCTT TATTCTTTAA AACAGTGTTT 600
CCCACTGGAC CTTTAGATCA TCAGTTCCTT TAGGCTGTGG GAGCAGTGAG CTGCAGGAAT 660
CCACCTGTCT CTAGTCTCCA CTTCCAAGGC TGGAGTCACA TGCACACACC ACCACCCTGC 720
CACCAAGGCT GGGGTCACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACCACCACCA 780
CCACCACCAC CACCACAGCC ACCACAGCCA CCACCCTGCT GACAAGGCTC GGGTCACATG 840
CACACACCAC TATGCCCTCC CTGCTCTCTA TGTAGTTCTG GGGATCTGAA CTCAGAAAAT 900
TTATAAACTA AATCATCTCT CTAGCCTGTC TTTTTTTCCA GATTATATTA TTATTTCACA 960
AGTCTATCCT GACTTGTGAA ATTTTTTGCT TTGTTTTGTT TTGTTTTTCG AGACAGGGTT 1020
TCTCTGTATA GCCCTGGCTG TCCTGGACCT CACTTTGTAG ACCAGGCTGA CCTCGAACTC 1080
AGAAATCTGC CTGCCTCTGC CTTCCGAGTG CTGGGATTAA AGGCGTGCAC CACCACGCCC 1140
GGCCCTGAAA TTTTTAAACA GAGGCTGGGA TATAGCTCAG TTGGTACTTG CCTAATGCTT 1200
GCTAGAACAC AGGGAGCCGG CCCTGTGATC AGTCCTCAGC ATCATAAAAG CAGCATGGTA 1260
GCACACACCT GGAATCCCAG TACTTGGGAG GCAGGGCTGG GACACACAGA AGATCAGGGT 1320
CATTTTCAGC TAAATAGGGA ATTTGCAGCC AGCCTGTGCA ACACGGGCTT CTGTTATAAA 1380
ACAACAACAA AATCATTTTA GCTTATCAGT TTTTCTCCTG TGGATTCTAG ATCTTGTGAC 1440
TCACCAACCT TAATTATTGG GGGGAAAATA GTATTTTTTA TTTTCTAACA CTTTTATCAT 1500
GTTTCTATGT CAAGTGCTTT ATTTTGACAT TTGCTTTAAA ATGGGGACTA CAACTCTTCT 1560
TCCCGGTGAC TCAGCAGCCT CCGATAGTAA ACAGTCCCCC CTTTCCTGCC GACTCACGGT 1620
TCCTCAGCCC ATATGCTAAC GTCCCACTTC CTCTCAGATG CTGGATGTAG ACTCCTCCTC 1680
CTGTTCCACT TATTGATTAG TCTCTACTTG CAATAATGCA GCGATGCACA TTGGTAGCAG 1740
TGACATTCTT ATGGCCTGTT TCGGATTTCT GCTCCAGAAG GAGACTATAA ATCAAGACCA 1800
GGGCAGCAAA GGGGAAGAGG AAGTGGGTAA ATAAGATGGG GGTCAGCATA GGTCCTGTAT 1860
GAAGGTTCCA GCCAGTCCAC TGGGGACTTC TTCTTAGGTA AAGCTGAATG CTAGGTGAGT 1920
GGTCAGAACC AGACACCAGG AACTCTCAGG GGATAACCTG TGCATCCCAC AATATGCTCC 1980
TTAAAGGAGA AAGACATCTG ACTCCTAGGA CCATTCCTAC CCCAGCTGGT TCTTCCTCTC 2040
ACAAGGAGAG TTCTAGCCAC CATTCTGCAT GTCCACCCTA ACCTATGATG TACTCTCCCT 2100
TTCCCAAAGG ACCTTAGGAG CCCAGTGCTG CAGAGTTCAC TTCCTCTCCC ATTCAGCACT 2160
CTCCTAAGAG CTCAGCTTGA CCCACCCTAC CTCTGGGAAG GGAAGGCCCT TTTATTTACA 2220
CTGCGCTTAC TCTTATCTTC CTTGTGTGCA CTTTTTCCTA CCTCGATGCA GAGCCCCAGC 2280
TTGGTTTTCT CATAAACTTC CCATTGTCTG GTCTAGCATA TTCAGATCAC CCAGGGTCTG 2340
CTTGTGCTTC TGTCACCCAG AAGGGTGGAG ATGCCTCCTA GCTGACTGGC AACCCTGTAA 2400
GCCCACGTCT GGTGTGAACA GCTGATGGCA TGGAGAGACG TATGTCTGTT CTGACTTGAC 2460
TGGGATCTGA CTGAGCTGGT CTTTTTTCTG GGTGGTCCTC AACAGCTGAT GAATGAATCT 2520
CACAAGATGC TTTGCCCAAA TCTACATAGA TGAGCTTGAT GGTGGCAGGC AGGTGGCTGC 2580
TGTGATGTTG TAGCCATCAA GGCTTAGCAC TGTTGGTTAT CTGACACATG GTTTTCTTTA 2640
AGTATGGACC AGTGAGAAAC AGTTCTTAAA ATTAACAGAT TTTTTTTTTC CACATAATTA 2700
TTTGAAGTTC TTAGCTCCTT TGCAGGGAGA GGGGGGGGGG GCTCCAATGA GCTTGGGCTT 2760
GTTCCCTCCT TGCCTACCAT CTCACCCCAG GACTGTTCTG CTTCTGATAC AGAAAAGGAT 2820
CTTCTTATGG GGGAAGGGGG AGGGACTTGT GCGGTCCCAT CACCCCCTGA AGATCTGTCG 2880
GTGGTTAACA ATACCAGGGG AGGCAGTCAG TTTCTCCAGT GGTGTAGCTA CTGGCCAGGC 2940
ATCCATGCTC CTGTCAATAA CCTCTCATCT ATGCTCTCTT ATGAACAACC CAAACTAAAC 3000
TCATCGGCAT ATGTGTGTGT GCATGCATGC ATGCGCTTGC TCTCATGTGC ACACGCGTGC 3060
GCGAACCCAC ACTGCATAAA TGAGAGATAA AAGAGGGGAT TAGAAACAGA AAGAGATCAG 3120
CAGGTATGTG AGGGGGACAA CAGAGGGTCA TAGGAGGTAA ATGTGAACAA AATGTGTGTG 3180