EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM092-00292 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Liver_E14.5 
Coordinate
chr1:88373730-88378760 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXK1MA0852.2chr1:88375861-88375875GCCTTGTTTACAGA-6.21
Foxd3MA0041.1chr1:88374970-88374982AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:88374974-88374986AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:88375141-88375153AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:88375155-88375167AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:88375159-88375171AAACAAACAAAC-6.32
JUN(var.2)MA0489.1chr1:88374336-88374350CTGAGTCATTTCTC-6
NFE2L1MA0089.2chr1:88374332-88374347ACTGCTGAGTCATTT-7.29
NFYAMA0060.3chr1:88378473-88378484TCTGATTGGCC-6.02
Nfe2l2MA0150.2chr1:88374334-88374349TGCTGAGTCATTTCT-6.63
Nr5a2MA0505.1chr1:88377281-88377296GCTAGCCTTGAACTT-6.14
Nr5a2MA0505.1chr1:88376975-88376990GAGTTCAAGGCCAGC+8.25
Nr5a2MA0505.1chr1:88378707-88378722GAGTTCAAGGCCAGC+8.25
PROP1MA0715.1chr1:88376786-88376797TAATCAAATTA+6.02
TBXTMA0009.2chr1:88375814-88375830TCCCACCTAAGTGTGA-6.19
TBXTMA0009.2chr1:88375814-88375830TCCCACCTAAGTGTGA+6.3
TFAP2B(var.3)MA0813.1chr1:88377822-88377835TCCCCTTAGGGCA+6.34
Number of super-enhancer constituents: 7             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02944chr1:88330130-88420834TACs
mSE_05516chr1:88377944-88379398E14.5_Limb
mSE_06338chr1:88373656-88374819E14.5_Liver
mSE_06338chr1:88375157-88378626E14.5_Liver
mSE_07256chr1:88375426-88376799Intestine
mSE_10015chr1:88377368-88379289Embryonic_stem_cells
mSE_11278chr1:88377349-88379466Placenta
Enhancer Sequence
GAATTTTCAC AGACCCTAGA CTGAGGCCCA GGCTGGCTTC AAACTCTTGA CAATGAATGT 60
TTCATCCTCC CCCTCTAGGG TGCTAGAATT ATAAGCTTGT ACACACACAC ACACACACAC 120
ACACACAATG TAGCCCAGGC TAGCCCTGAA TTTGTCCTTA CAATAAGCTG GAACTCCCCC 180
TTATCTAGGA CTACGACCTG TGCCACTGTG GTTTATTCTT TTTTTTTCTT TTTTCTAGAT 240
TGTGTGTTGT GTGTGTCTAC ATGAAAGCAC ACACAGGTAG GTGTGAGTGT GGAGTGTGGG 300
TGTGCCCACA CGTGCATACA GACTCCCATG AAGCCCAGAA AAGGGCATCA GATCTTTCCT 360
AAGCATGCTT GCAGGAGCCC AGGCTGTTCT GTGAACCTGA ACTCTGCTCC TCGTGATTGG 420
GCAGCAAGCT GTTTGTTGGT TTGTTGTTTT GAGACAGGGT TTCTCTGTTT ATCCTTGGCT 480
GTCCTGGAAC TCACTCTGTA GATCAGGCTG GCCTCAAACT CACAGATATC CACCTGCCAC 540
TGTCCCCCAA GTGCTAGAAC TAAAGGCAAG TCCCACCACT GCCCAGTGTG CAGCAAACTC 600
TTACTGCTGA GTCATTTCTC CAGCCCAACT GAGAATCCAA CCCACGGCCT TGTACATGCT 660
GAACTCCACC ATCTGAACTA TACCCCTGCC TTCAACTTTG TGGCTGTTTG AGGGATCCAA 720
CCCAAAGACC TCACTCGTGC CATGGTAGTA AGCACGGTCC CATACACTTA TGTGTTTAAA 780
TGCTTGCTCA TAGAGAAAGG CAGGATTAGG AAATGTGGCC TTGTTGGAGT AGGTGTGGCC 840
TTGTAGGAGG AAGTGTGTCA CTAAGGTCTC AGATGCTCAA GCCTGGCCAG GGTGTCACTG 900
TCAATTCCTG CGGCCCACAG ATCAAGATGA AGAGTTCTCA GCTCCTTCTC CAGCTCCCTG 960
TCTGATTACA CTCCACCAGG CTTCTCACCA TAACAATGAT AGATGAAAAG GCTGAACCAT 1020
GAGCCAGCCT CAATGAAATG TTTTCCTTTA TAAGAGTTGC TGGTTGGGGC TGGAAAGCTG 1080
GCTCAGTGGT TAAGAGTGCC GACTGCTCTT CTGAAAGTCC TGAGTTCAAA TCCCAGCAAC 1140
CACATGGTGG CTCACAACCA TCTGTAATGA GATCTGATGC TCTCTTCTGG TGCATCTGAA 1200
GACAGCTACA GTGTACTTGG ATATAATAAT AAATAAATTC AAACAAACAA ACAAACAAAA 1260
AAAGAGTTGC TGGGAGCTGG GCGTAGTGGC GTGTATCTTT GATCCCAGTA CTCGGGAGGC 1320
AGAGGCAGGT GGATTTCTGA GTTCGAGGCC ACCCTGGTCT ACAGAGTAAG TTCCAGGACA 1380
GCCAGGACTA TACAGAGAAA CCCTGTCTCC AAAACAAACA AACAAAAACA AACAAACAAA 1440
CAAAAAGAGT TGCTGGGGCT GGAGAGATGG CTCAGAGGTT AAGAGCACTG AGTTCAAATT 1500
CCAGCAACCA CATGGTGGCT CACAACCATC TGTAATGAGA TCTGATGCTC TCTTCTGGTG 1560
CATCTGAAGA CAGCTAACAG TATACTTACA TATAATAAGT AAATCTTTAA AAAAAAAAAA 1620
AAAGAAAAAA AAAGAAAGAA AAGAAAAGAA TTGCCATAGT TGTGGTGTCT CTTCATAGCA 1680
ATAAAACCCT AAGACACATG CTGAGTCCTA ACCACTAGGC TTCACCACCA GATCTAACCA 1740
GTTTTAAATC TATTTCAACA CGCCTAAGTT TCACACGAGA CTTGCACCTG TAATACTCTT 1800
TTGCAGCTCG ATCTATCAAT CCACAGCTGT CCTTAATGTT AATCCCACTG GATAAGAATA 1860
AGACCACTAC CACAAACTTG AGCCAAATTT AAAGCAAGCT TTACTAAATG CTGGCCAGGA 1920
TAATGGACAC TGGTCAGGTC CATTCCCAGG ATCCCCAGAG AACGGTCATG AATTATGTTA 1980
GTCCATTGTT TACAAAGGCA AAGCCCACAA GGCTACATAC ACACTTCCCA CCTCCTTCAA 2040
TGGAGGGCAA GCATCCATCC TGACACACTT CCTGCCTGTG CACCTCCCAC CTAAGTGTGA 2100
TCAAGCGTAG ACTGTGCAGT TGGGGCAACC AGCCTTGTTT ACAGAAGCGA AAACATGTGA 2160
CTTGTTATCT TAATTGAGCA ACAGTCCCCA GCATTTCAGG AAGTTATCTG TCCTTGGGCA 2220
AGTGGGGCTT GCAGGTTAGA GGCATTTCTG GTATAGAGAT CTTTCAAGAA CAGAAATGTG 2280
AACTTAAAGC GTAACGTAAG CCCTCGTGCT TAAGAGCATT CCTACTTTAT GTTATTGCTA 2340
TAAGTGCAAG AACTGGTCTT GGGTCCAACT TGACATTAAG TTGTTCAACT AGGACTTAGG 2400
ATAAAAGAGG CCAGTGCTAA TTAATGGTTA TTCTTGAGAG GAACAAGAAA ACCATGAAAT 2460
CCTGGGGTGG TCAAAGGTTG AAAGTTGTAA AATCTGGGTG AGGTGGGTTA ATGAATCCTT 2520
TCAATACTTT TCTGCTTTTT AGGGTTTTGT TTTTATTTTC CTGTTGGACT AGATTTTATT 2580
CCTTGGTCCA ACCCCTGGGC TCTCAGCCAT TCTTTGTCTC AGCCTCACCA GTGCTGGGAT 2640
AGCAGGAGCA AGCCATCGGA TCCCGCCAGT ACTTTAGTTT CTTCCTAGTT TTCAATTGTT 2700
TCTTATTTAT TTTTGTATAT GTTCAGGTAG TGTATTTGTA TGCACATGTG TGCACACTTG 2760
AATTCGAAGC CAGAGACTGA TATTAGGTGT TTTTCCCAGT TCCCTACATC TTACTTTTTT 2820
GGAGATAAGT TTCTCACTGA CCCTAGATCT CACTAACTGG CTAAACTGGA TGTCCAGCAG 2880
GCTCCAAGGA TTTGGCTGTC TCCCATGCCC CTCCTTACCT CTTGCCTTCT CCCCCAGCTG 2940
TGTTACAGAT GTGTACCATC AATACCCAGC TTTTATGTGG GTGCTGGCAA TCTAAATACA 3000
ACCCTCATGC TTGTGTGGCA TGCATTTTAT TGACTTGAGT TATTTCCCCA GCTCCTTAAT 3060
CAAATTAAAT TTGAATTTAA TTCATGGTCT TGCTATGTTG CCCTGACTGG CCTTAACTCC 3120
TGAGTTTAAG TGATTCTTGA ATCTTGGCTC CCTGAGTAGC TGGTAATAAA AGAGTTGTAA 3180
TAGGTCAGGT GTGGTGCTGT ACACCTGCAA TCCCGGCACA AGAGAAACCG AGGCAGGACA 3240
ATCAGGAGTT CAAGGCCAGC CTGGGCTGAA ATAGTGATAT TCTGCCTCAA AAGAAAGAGG 3300
GGGCCCAGTG AGGTGGCTCG GGAGGTCAGG CCTCCTGGGC GAGCTTGATA ACCTGAGTTT 3360
CATCCATCAA GCTGTGGCAT GAACACACAC ATGCACACGC TCACGCACAG AAATGTGTGC 3420
ACACCATTAA TGATCTTTAA TAATAACTGT TTTTGTTTTG ATGGCTTTTT TTTTTTTTAA 3480
GGAGGGGCAG GTTTCAAGAC AGGGTTTCTC TGTGTAGCCC TGGCTGACCT GCAACTTGCT 3540
CTATAGACTA GGCTAGCCTT GAACTTAGAG ATCCACCTGT CTCTGCATTA CTAGTTCTGG 3600
GATTAAAGAT GTGCACCACC ATGCCCAGCA ATAATAATAC ATTTTCAAGA TATAAAAATA 3660
ATCTTTTTGT AACAAAGTGT AACAACACAC ACACACACAC AAAAACCAAC TACACTGAGA 3720
AAGAAAACAT AGTATGAGCA GCCCCTTGAG ATAAGTCCGG GCAGAGCAGA GCTGGAGGCT 3780
TCTTGATATG TCAAAGGTCC TGGAGGAGGA GGTAGCTCAC TCCGGTGTTC TTGACTATCA 3840
CCAGGTGAAG CAATCTGAAA GATGAGGCCC CTGGGATATT TTCTGATCGC AGGGACTCAT 3900
GGTCAGTCAC CTAATGTGAA ATGACCCTGG ACATCTGGGA GAAGAGCCCA GTCTGCCACT 3960
CTTGCATGGC TTTATCACCC AAGGGCTTAG AGGCACCGGA TAGAGCAGCC ATCCATGTAT 4020
ACTACAGACA GGCCTCCTTC CAACCAAGGC AAAGTGTCCA GGGTGGCTGA GACAGTCTTC 4080
AGTCTTGCTC TGTCCCCTTA GGGCAACTCT ACATTATACA CAAAGGGCTG GAGTAGGGTT 4140
GGCCCACTCT GAACTGCTGG ACTTCCAGGA CTGAAGTCTG TTCTCCTCCG GGCCACACTT 4200
TCAGTGCGCT TAACTCAGTG TGATTGGGTA AAAGAATGTC AAGGCCCTTG TTAAAACACA 4260
AACGGCGGTT CAGTGGGTTG GAGAGGGGTG GGAGACTGCA CTGCTTTTTT CTTTTTAATA 4320
TTTGTCGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTACAC ACACACACAA AGAAGGTAAG 4380
AGGAACAAAG AAGGTAAGAG GACAACCATG TCCGGTATTG ACCCTTGCCT CACATCTTGC 4440
TTAGAGCAGG CGCCTCTTGA TTACCGCTGT GTACTCCAGG CGGGGTGAGC CTTGAGCTTC 4500
TGGGAACTCC CATCTCTGCC TTCCATCGCT GTAGAGTGCT CAGATTACAG ACCTGCCTAG 4560
CATGCATGAT CAGCTTTTAC AGAGGCCTGA ATTCAAGCGT GGCCAGAGGT GTCTGTACTC 4620
ACTGAGCTGT GCCCCCTGTC CCCTGACATT TCTAACTAGT GTTGGTGGGA AATGTGGGGC 4680
TCTTGGGACT CACTAATCAG ATTGTGCCTA GAATATGCCA TCAAGAGCTC GTAATCTGTC 4740
CCTTCTGATT GGCCTGTGAA TGTCCATCAA GGTGTGGGTA CCCAGTAGGC CATAATTGCC 4800
CTGACTTGTA ATCCCAAGAT GTGAGATATA AGAGGAAGGA GCAGAAGCAT TTAGTGTTCT 4860
AGGCCAACCA AACCTGAACT ATATGGTAAA GTCCTGTCTG AAAAAACAAT CTAGCCAGGC 4920
GGTGGTGTCG CACGCCTTTA ATCCCAGCAC TTGGGAGGCA GAGGCAGGTG GATTTCTGAG 4980
TTCAAGGCCA GCCTGGTCTA CAGGGTGAGT TCTCCAGCCC TGAGAGATCC 5030