EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM091-22677 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E14.5 
Coordinate
chr8:129349360-129352740 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nr5a2MA0505.1chr8:129351959-129351974CCTGGCCTTGAGCCC-6.27
RREB1MA0073.1chr8:129350364-129350384AGGTCGGGGGTGTGTTGGGT-6.43
SPIBMA0081.2chr8:129352214-129352226AATGCGGAAGTG+7.22
ZNF263MA0528.1chr8:129351740-129351761TCCCCTCTCTCTTCCTCTTTC-6.42
Number of super-enhancer constituents: 17             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01555chr8:129347495-129453882Th_Cells
mSE_02472chr8:129351918-129414858Macrophage
mSE_03411chr8:129350160-129351023Bone_Marrow
mSE_03411chr8:129351207-129352434Bone_Marrow
mSE_04318chr8:129349808-129351305Cortex
mSE_04994chr8:129349527-129352601E14.5_Heart
mSE_05598chr8:129349519-129352374E14.5_Limb
mSE_06864chr8:129349572-129352355Heart
mSE_07142chr8:129348110-129358370Intestine
mSE_08017chr8:129348008-129352752Kidney
mSE_08552chr8:129347997-129352618Liver
mSE_09029chr8:129349567-129352513Lung
mSE_09437chr8:129349488-129352655MEF
mSE_11183chr8:129349823-129351638Olfactory_bulb
mSE_11598chr8:129349332-129352694Placenta
mSE_12002chr8:129350201-129352413Spleen
mSE_12948chr8:129349827-129351736Thymus
Enhancer Sequence
AAGAAAATGG CAGTGCTGGA AGGATGGCTC AGTAGTTAAG AGCACTGGCT GCTCTTCCAG 60
AGGTGCTGAG TTCAATTCCC ACCAACCACA CGGTGGCTCA TAACCATCTG TTATGGGATC 120
TGATGTCCTC TTCTGGTGTG TCTAAAGAGA GCAACTGTGT ACTCATATAC ATAAAATAAA 180
ACATAAGTAA ATAAATTTTT TAAAACGGCC CAATGATATG TGGATCCTGA CAACCTGGGT 240
CTAATTCCTG GGCTGCACAG GTAGGAAAGA ACTAATTCCT ACAGCCAGAC TTGCTGGTCA 300
TTGAGGCCCC AAGTCCTCCT GCTTTCCTAC TCTCACACTG GGATTACAGG TTGCACTCCA 360
CCACGCATAA CTTCTTATGT GGGTACTGGG GGCCTCCTCT TTACACAGCA AGCACTTTAC 420
TCAGGGAAGC CATTGCTCTA GCCCCCACGG CTACCCCCAC ACCCACCCCT ATCCCCACCC 480
CCCTCACCAG CTATGTATTT CCAAGAGCTG TGTGTAGTAG GTTAGGTCAG GCAGATGAGA 540
CTCCAGTGAG ACAGGACAGC AAGGTCTATT CCCCACAGAC TGTGTGCACA GTTCACCTCT 600
ACAGCTGGCT CTGGTACTAG CCCAGGCCTT AGCCGCCACA GCTTCCCCTC CCCCCAGGCC 660
CTTTGTTCTT CACTACAGCT GCTCAGCAAA TTCCTTGATT TTAAATTATG ATCACAGGTT 720
GGAGAGCTAC TTAAAATAAT CTTGCCAAAT GTTCTATCTC TGCATTGATG AATATAATGG 780
AGGAGACATT TCGGGGGGGG GGGGAGGTGA ACATTAAGAA TTCACTTTGT TCAGGGGAAA 840
GGGAAAAAAA AAAAAACAGT CGCAGCTTTG GCTTACATCT AAGGATTCTC TCCCTCAGGA 900
AGTTGATTGT GTGCTGACCT TCAGTGAGCC AGTGAACCCT GTGCCAGCAA AGGTGGGCGA 960
GGGAGCTGTT GGTGCGTAGG GCCTGCTGCA GATGCAGGGA GCAAAGGTCG GGGGTGTGTT 1020
GGGTTTGTTT AAGCATGAGT CAGAGGAGGA GGGGGGTCGA TCCCCGCGGT CTCCGATTTC 1080
CAATTTCCTG TGCAAGCCGC TGAACACACA GTGCCCCTTC CCAGCTGGTT TTTTAGGCTG 1140
CTGCTCTGTG GAACAAAGGC AGATACTGTA TGAGGCCACA CACATAAATA ACCCAGTCAG 1200
ACCACTGCTT CCTTTTTCCA AGGGAGACAT CTGTGGAATC CGGAATCTGG AAGAAACCAA 1260
ACTCTAAGAG AGGCAGGGGG GAAAAGCCCA CCACTGTCTG GCATGTTGGT CATCTGAGGC 1320
CCTAGGTGTT CCCAGCCCAC TTGCTTTTTT TTTTCCTTAG GCCTGGGCCC TTGGCCAGCC 1380
CCAGCAGGCC TTTGGTCAGG GGCTAGCTAT TCCTTCAGGA CAGCCCTGCA GCTCAGGCTG 1440
GAGCCTAGAG GACACAAGGG ACTTCTCCTG AGTCAGAACA AGGTTCCTTT CTCACTCCGT 1500
GTTCTCCTTG AGCAAGGCTG ACCCTGTAAA GGACCTCCCT CCCATATTCC TGGGGTTTCC 1560
TCAAGGCTTG GGGCCAGAGA AGTATATGAG AAAGATAAAC CTCAAGAGAG GATGTTTCTA 1620
CACCTAAATA ACTCCCTGGG AACAAGGAAG CACTTGATTG AGTGGGCCTC AGGGTTAGGC 1680
CAGCCTCTAG CAGGAACCAG GAATCAAAAG GGGACACGTG TCTACTTGTT GCCTTAGAGA 1740
GACTTTGTAC CAGGGAGCCT TCTATAGCAC ACAGGAAAGC CCCACTCTGA GAAAGGCATT 1800
GTCTGTAAAG GGTCTCTCTG CCTGTCTGCC ATGGTGCACT TCAAGGCTTC TCACAGATGA 1860
CTTGTCTGTG TTGTTCTGAA TAACATAAAG CTGGTCTATT GAGTCTGGGG GGTGGGACTC 1920
TGTGCACCCC TTAAAATAAC AGATGAAAAG ACCCCCTGTT ACCTCCTCAG TAGGTTTCAC 1980
CCAGAAACTC CAGGGCCTTT GAGGTTTAGG GGCAGCAGAC TCTAGGGCTA AATGAATCCA 2040
CAACCCTTCT CCTTTGCTTC GAAAGCAGAA AGAGTCCCCG GCCCTTGTTG GAGCCTCAGT 2100
TTTTCTCATC TGTTCAATGG ACAAAGGTCT GTTCACCTCA CTAGTTGATT TCAAGGATGA 2160
GACAAACCTG TCCCCATAGA TAAGCACCAG TCTTCAGGAG AATGGCTCCT GAAGAGGCAG 2220
AAGAAGACAG GATGGGGGTG TTTGGAAGGG GAAGGCATCT TTCTATGCAG GGGTCTGTGA 2280
GTCCTGGTTT ACAGGGCTGT CTGCTGCAGG TCTGCTAACC TATTTCCCTC TGAAGAGGAC 2340
CTGATCCAGG CCCCAAGGTA GGCTCCACTT GAGAGCCCAC TCCCCTCTCT CTTCCTCTTT 2400
CTCACAGGAC TTTTTGACCC CAAGATCCCT TGAGTACCTG TCTCCTCTAG TGCAAAAACA 2460
ACTTGGTCTC TGTGCCTTTA CCCCCATTTA TCCAAGTGCC CTGAGAGGGG CAGAAAGGCC 2520
AGCTGCCCAG ACGGGGAGAT TTTATCACGA ACATTGTTTG GAATTACTAG TGCTTGACAG 2580
TTTAAAGTGT AAAATGCAGC CTGGCCTTGA GCCCAGATTA TTACTGCCTT CTAAACTCTG 2640
GGGGACAACG CGTTTCTCAT CTGAAGCTCC TAAGGCAGAC CCACCATGCC ACTTCTGTGG 2700
CCTTACTAGG TAACCCTCTC CCTCTCTTCT TATGCCTTAG GCACAGGAGG TGAGTGGCCC 2760
TGCTCATACC TCCATGACTC ACCCTTACTG TGCAACAAGG GCCCTCCGGC CTCTTTATTC 2820
TCAGTTTGTT CTGTTTTTGC TGATGACTGA ATTTAATGCG GAAGTGCTGT CAGCAGAAGA 2880
GAAAGGAAAC CTTAACCCAG CACCCCCTCC CCAGGAACCA GTTCCAAGTT GCTTCCCCGT 2940
GAGGTGTGAA TGTTCTCCAA GTTAAGCCAG GTAGTACAGA CCTGCCACCC TAGCTACTTC 3000
AGAAGAGCCG AGGTAGGAGG ATAACTCTCC CCCTTACTCC ATTTTACAAG ATAAAGAGTC 3060
TCAGATTTTT TAAAATAAAT AGATAAATAA ATAGCAAAAG GGGCCAGGGA TATCGGTTAA 3120
TGATAGAGCA CATTCTACCT GGCATGTGCC GGGTCCTGGG TTTAATCAGT CTTCAGTAAC 3180
ACATGCAGAC ACACATACAC ACTCACACAC ACACACCCTC ATACATATAT ATATCACACA 3240
CAAACATGCA CATATCCATA CACACAAATA CGTGCATACA CACAACCACA AACATACACT 3300
CAGACATACA TACACAGAGA CACATATATA CTACTCATAC ACACACACAT ATACTCATAA 3360
TATATACCAC ACACAAGCAT 3380