EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM091-20025 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E14.5 
Coordinate
chr7:16989650-16992030 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXP1MA0481.2chr7:16991332-16991344GTGTAAACAGAA+6.22
Foxd3MA0041.1chr7:16991895-16991907GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr7:16991899-16991911GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr7:16991903-16991915GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr7:16991907-16991919GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr7:16991911-16991923GTTTGTTTGTTT+6.32
Hnf4aMA0114.3chr7:16989794-16989810AATGGGCTTTGACCCT-6.07
ZfxMA0146.2chr7:16991667-16991681GCGGGCCAGGCCTG+6.24
Number of super-enhancer constituents: 19             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01538chr7:16949466-16991821Th_Cells
mSE_03325chr7:16989781-16992098Bone_Marrow
mSE_03900chr7:16989812-16991937Cerebellum
mSE_04081chr7:16989807-16992112Cortex
mSE_04849chr7:16989830-16992054E14.5_Heart
mSE_05582chr7:16990037-16991341E14.5_Limb
mSE_06028chr7:16989579-16993326E14.5_Liver
mSE_06683chr7:16989616-16992736Heart
mSE_07153chr7:16989526-16992864Intestine
mSE_08043chr7:16989583-16992129Kidney
mSE_08508chr7:16989602-16992344Liver
mSE_08967chr7:16989552-16992161Lung
mSE_09498chr7:16989522-16992122MEF
mSE_10419chr7:16990400-16992044Embryonic_stem_cells
mSE_10849chr7:16989848-16992085Olfactory_bulb
mSE_11412chr7:16989728-16992125Placenta
mSE_11967chr7:16989702-16992123Spleen
mSE_12641chr7:16989971-16991685Testis
mSE_12920chr7:16989629-16992024Thymus
Enhancer Sequence
GCAAAAGCAA AAGAAAAGGG TGTCACTGGG AATCCCTGAT TTTAACAGCA AAGCTTATAC 60
ATACTTTGTA AGCTTGGAAG TTTTTGTTTC CTCTGGATGA AAGATTTCAT TTGAAAGTAA 120
GTCAAAATCT CCCAGTAGGA GCAGAATGGG CTTTGACCCT GTAGTTACTC CAAGGTAGAG 180
TCCCTAGCTC CCAATTCTCC AGTTGCTCCA CCAAAGAGGA AAGAGCGCAT TCAGCATGTG 240
CAGGCTTTCT CACTCCTAGT CTGTCTCTAA GCACTTTTCC TTCATGTACT GTAAGGTTGA 300
CATCTTTGAT TTTTGACAAG ACAGACCTTT CTGGAAGTAA AGGTAGCTAG CAGTTTTAGA 360
AAGTCATCCT TGTGGTTTTT CCTTATCCAA AAAGACCTAT GCTAAAGGGA ATTTGTTTGG 420
GAAGGCAGGC TGTCCTGGCT GCTCTGCCTG GTGAAAGTGT GGCTCTTGGA TTTGTTTCTA 480
TATAGCTGAA CCCTGGGACA GATTTCTAGG CGCTGGCTCT GCCTCCACTC CAGCCCATCG 540
CTCCTCCCTA AGGCTGTCAG AACCAGGTCA GAGTCTTCAC TTGGTTTTGT AGAGGGGCTG 600
GGGAGGCTTG GGCACTGTTG AGCCCCCAGA AACCTTTTTC ATGGAGGTAA GGATTAGGGA 660
TCCATTTGTG AATACCTCTG TTGAAAGTCA CTGATTAAAC TGTCTCAAGG TCTCTGGATA 720
GCTTTAGGTC AAACCAAATT CAGGGAACCT ACTCATGGTC TCTGTGGATG GACTTTTTTA 780
GTAGTACCAG AGTGCTGATT CTGCCTGCCT GCCATGGCAT CTGAAGTGAG ACGATGGCTT 840
GAGTTGAGCC TGGCCCATGG CTGTGCCTCA CCAGTGCTGG GGTGCACAAC AGGCAAACAG 900
GAAGGTTGCA GCTTTCTGGC AGTTACTTGC TGACTTTTGA AGGCCTGGGA GGAGCAGCCT 960
GCTCTTTGGC AGTGGTAATG GAGGAAATGG TCTGGAGTCA GTTACATAAT TAAGGCCTCA 1020
TAGACTATGG CAAGCTGCCT GTTTGGATAA GTTAAGGCAA ACTTTCCAGC TCTGGCTTTC 1080
CAAGTTTTGA GCCTCATCTG CTATAAAGCT CTGTTGCGTC TGAATGCTGT AGATACACTG 1140
CTAGAAACAG TGCAGCAATT CATATTGTGT TAGTGCTGTG CGGTGAGGTG GAGTGGTTTC 1200
AAAATCAATT TCAGGCACGT TGCACATTGA GATAATTCTT GAGCTGATGT GATAGAAATG 1260
AAGACACGAC CTCTTGGTTG GTGCTAGTTA CAGCTACATC ATCATAGAGA TAATTTTTCA 1320
TTAGGATTGG AGGCTGTCTG CTAGGAGTAA GTAGCTTGTT TCTCCTGGCC ACATTGCTCC 1380
TCCCAATAGA GAATTACTCT CATTTTCCCT GCTTCGGTTT TGTTGATTGG TGACTCAGCT 1440
CCCTGTTTGT CAGGCAAGTG GTGACATCTC TGAACGCTGG AGATAGCAAC AGGATGTGAA 1500
GGAAGGGTGT GGGTATGTGA AAGCAGCTAC TGCTGTCCAG GGCTGGTGCC CTCCAGCACC 1560
AATGCCCACT CCTCAGGGTT ACCACAGTCC AATGGGTGCT ACAGAGCACC CACACAGTGG 1620
CTGCCGCTCA GTGCCTCTGT CCTTACTGGG AGAAATTCTA AATAGAACAC TGGCTGTTCC 1680
GTGTGTAAAC AGAAGCAGGA TGTGTCTGAC TGACGGAAGT AGGCCTCTCG GGTGCTGGGC 1740
AGCTTTCTTA AAGGGAGCTG GTGGGGACTA AAGTCCATGG AAGCCATCTT GTGACACTTC 1800
TTGTTTCACA GTGTTTGGTA TAGATGCTGA AATGGTCCAG CTGTCTTGAG CCAATGCCCA 1860
GTGTACCGGC ATGCATTTGG TTTTGCAATT AGAATGGAGT GAGTCAGCAT TCCAAGCTGA 1920
GGTTGGCCCC CTGAGAACCA GGAAGTTAGG GATCCAAAGC CAACCCCACT CCTACTCCCC 1980
TTTGCTCTGC TTCAGCCAAC CCTTGGCCTG AATCTCTGCG GGCCAGGCCT GTTAGACTCC 2040
AGGATCTCGC ACCCCTTGTA ATTTGACTGA GTCCCTATGT TTGTTGAGCA GCTAGGTTTG 2100
TCCTGCCCTT GGCTTGGAAC AGAAATGTTT CATATTTCTG TTTTGGTTTG GATACTAGGG 2160
CAGGAACCCT AGGCCCTGCA CTTGTTCGAT GGTTTGTGTT TGTGAGGCAA GGTCTCACAG 2220
TGTAATACAC ATTGGCCTCC AACTCGTTTG TTTGTTTGTT TGTTTGTTTG TTTAAAAGAC 2280
TTAAAAGAGA GGGTCTCACA TAGCTGGTCT TCTATCCCAG ACTGGGTAGC TCACCAAGCT 2340
GAGGCAGCTC ACCTTCTGCC TCTGCCTGCT AAGTCCTGCA 2380