EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM091-16235 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E14.5 
Coordinate
chr4:108020730-108024510 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr4:108021957-108021968ATATTTACATT-6.32
NR3C1MA0113.3chr4:108020881-108020898TGGGACATGGTGTCCCC+6.17
NR3C1MA0113.3chr4:108020881-108020898TGGGACATGGTGTCCCC-6.21
NR3C2MA0727.1chr4:108020881-108020898TGGGACATGGTGTCCCC-6.26
NR3C2MA0727.1chr4:108020881-108020898TGGGACATGGTGTCCCC+6.32
Nr5a2MA0505.1chr4:108024443-108024458GCTGGCCTTGAAATC-6.91
Nr5a2MA0505.1chr4:108024151-108024166GAGTTCAAGGCCAGC+8.25
POU1F1MA0784.1chr4:108022849-108022863AATATGCAAATTAG+8.42
POU2F1MA0785.1chr4:108022849-108022861AATATGCAAATT+7.22
POU2F2MA0507.1chr4:108022850-108022863ATATGCAAATTAG-7.04
POU3F1MA0786.1chr4:108022850-108022862ATATGCAAATTA+6.74
POU3F2MA0787.1chr4:108022850-108022862ATATGCAAATTA+6.74
POU3F3MA0788.1chr4:108022849-108022862AATATGCAAATTA+6.92
Pou2f3MA0627.1chr4:108022848-108022864CAATATGCAAATTAGA+6.86
RUNX1MA0002.2chr4:108022773-108022784AAACCACAGAG-6.14
SOX10MA0442.2chr4:108021717-108021728TCCTTTGTTTT-6.32
Sox3MA0514.1chr4:108021718-108021728CCTTTGTTTT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04643chr4:108023176-108024152E14.5_Brain
mSE_05360chr4:108020575-108021913E14.5_Heart
mSE_05360chr4:108022457-108024536E14.5_Heart
mSE_05661chr4:108020508-108021974E14.5_Limb
mSE_05661chr4:108022034-108024326E14.5_Limb
Enhancer Sequence
CAGAGAAACC CTGTCTCGAA AAAAAAAAAA AAGACTTGGT TCTGCCTGCA GCCTTCCATT 60
CAGATGCTGG AAACCAAGCA GCACACATAC GGTATCTTGA GGCTTGAGTA GATTCTGGGG 120
AACAGGAGTT AGAAGCTAAG GCCAGCTGCA GTGGGACATG GTGTCCCCAC AGCTCCCTCT 180
GTGCTCCAGA GTCCTCTTGG CTTGGCTACA CGGATGGCCC AGGAGAACAT GCCTAAGCTG 240
GCTATTCTGC TCACCTTTAG CAAACTGCCC CTGGGCCAGG GTTCCCTGAG GGAACCTGAA 300
CCAAGCTGGG TTCCATTACT CCAGGAATAG CAGCTGACAC TGCTCCCCAC CCACCGATGG 360
CTTCTGACCA GGTTCCCCGA GGCCCCAGCA GTCTCCAGAA GCCAGTGGCA GCAAGCTGTG 420
ATCAGGAAGC TGCTGTGGGG TAGGTAGGAA TAGTGACCTT AATTGCCTTC TGTGTACAGG 480
GGCCTCCTGG AAGAGAGTGC CTGGGAGGAA GGCTGGGGCC TGTTTTGCAG ATGAGGAAAT 540
GGGATGGGGG TGGGGACTCA GATATAGTTT GCCCAAGGTC ACGGTGAGTG CGTGGTAGGC 600
CTGGAGTTGA GCTTAGACTG GCCCTGCTGT GACCCTGATT CTGTGAGAAG GAAGGAGTAC 660
TCTTAGGACC TCAGAAGGGT CCTGGCATGG CAGACAATTT CCCAGGCCTC AGAGTTGGTG 720
CCTCAGGGGA ATGTGGCCCA GAATCCTATA AACAGCAGGG ATGAGGGACT GCGTATTTAT 780
AACCCTAGCC CTCCAGTTGC TACAGATTCA AGGCCTATAG AATGAGTTCC AGGCCATCTG 840
GGGCTACAAA CTTAAGACCC TGTTTCAGAA TAACAAAAGA AAAGAAGAAG ATCAGACTGA 900
CTCTCAAGTT AAGGCCCAGC AGCTACATGT AGGTGTTATG CAGCAGTAGA GCCCAGCTGG 960
CCTTTAGCTC TCTTGGAGTC TAATGTTTCC TTTGTTTTGC ACTGTCTAGA CTTAGCTTCT 1020
AGTAGGCACT TGGCAGGAGG AAATGAACAA AAGATGCAGG GTCCACTCAG GACCTGTACC 1080
TCTGCAAAGG GTGGAATTTG GATTAAAATT CCTGGTCAAT GTTTGGTTTG GGCTGGACTT 1140
TTTCGGTGCT CAACCTGTAG GTCATGACCC CTTTGGAAGT CAAACCACCC TTTCAAAGGG 1200
GTTGCCTAAC ACCATCAGAA AACACAGATA TTTACATTAC AATGTGTAAC AGCAAAATTA 1260
TAGTTATAAA GTAGTAACAA AATAATTTTA GGCTTGGGGT CATTACGACA TGAGGAACGG 1320
TTAAAGGGTT TCAGCTTTAA AAGGCTCAGA ACCACTGGGC TAGAGGGTCT TTAGGCTTCC 1380
TTCTCTCTCT GCCCTCAGAG CTTCATAGAA GACATGGCAC ATGCCAGTGG CTGGCAGTAT 1440
CTGTACAATT CCCACTGTCC CCAAAGCAAA TTTACCAAGC ACGCTAAGCT CTCGGAGCCA 1500
CAGGTGGTAC ATCTTGCGTG AGGGACTCAC ATGAGCTAGC TAAAAAGCTG AACCTTTCTC 1560
CTCTGTCACT GGGGAACCAG AGACAACCTC ACCTCTGGGT CTGCTTCCGC TCTAGCCTCC 1620
AGGTTCAGGC CTTGAGCTCC TGCCCCGGTT TCCCTCAATG TGGAGGTGTA AATCAACTAA 1680
ACCCTTTCCT CCCCCAAATT GCTTTTGGTC ATGGTGTTTA TTACAGCCAC AGACACTACA 1740
CTAGGACACC CCGCGTTTTC AATTATATAC TGGACCCTGC AAATTATGTA GTTTGTTTCT 1800
GTAGCTGCTG GGCTCTGGAG TGAAAGGCAT CTGCTCCGGA CCTGCAGTGG TTCTGGGATC 1860
TGTCAGAGGC TTGTCAGTTC TGTGAGCCCA TCATTTAGGT TAATGACTGA GTCACCAACA 1920
GACAGGAAGG AAGCTAGCCA CAGCCACACC AGGCAGGTCT GGTTGCTACT GCAAATCTCT 1980
TCAAGATTGT AGAGATTACC AGGGAGAAGC CTGGTGCAAG ACAAATTCTG GGGATCAAAC 2040
TGGAAACCAC AGAGGAGAAA TGTGTGATGT GAGGGGTCTT AGGCTCAGAA AGACTCCCTA 2100
ATAGCCAAAA TGTAATCACA ATATGCAAAT TAGACCCCCA ATAAAGCTGT CAAAACGCGA 2160
CTGCGATGTT GGCAGCTGAT AGAGACAGAG CAGTTCCTGT GTGAGAAAGT TGAGAAAGTT 2220
ACTGTACCTC ATGGAAAGGA ATGCAATAGC AGCTTGCCGC TGCACAATGG TCTCCACGGG 2280
AGGTTAAGTC CTATCTCCAC CACTTGTTAG CCATGTGTGT GACTTGGGGC AAGTTATTTG 2340
GCCTCTCTGA CCTTCCATTT TATCACCTCA AAGGTAAGGA AGAAAATATC CCCTCCCCTG 2400
GATTTGTGTG AGGATAAAAT TTACATATAT ATAAACTTGC TAGTAGAACC AACATAAATG 2460
AAGTACAACA AGCAGTGTTA GTCATTTTAT CTAATCCTTA GAACAACTCT ACAGTATGGG 2520
AACGGCACAG AGTCCCCCTG TAAACGGAGT CTTGGTGAGG TAAGTGGCTT GCCGTTCACA 2580
GCACTGAAGT AGGTTCTGTC CTAAAAGTTA AGTCAGACTT CATGGCCATT ATCCTAGAAT 2640
TTCAACCACA GTAGGTGTCT AACCAATGTT CTCTAAGCCT CTGGGAAATG AGTATCAGAC 2700
AGATTCCTCT CTGAGCCTTC AGAACCAATC CCATTTGCTC CCTCCCTCCC TGCAGGCACA 2760
GTCCACGCTC AGTCTCTCTG GCCTCTGAAC TCACCTCGGT CTGCTAGTCT CGGCCCCTCA 2820
CATCTGCACA GCATTCCACG GTGTCATGTT CTCACTTTCT GTGTCTCATT GTTTTGTGGC 2880
CGCCTTCCTG GCACACAGCC CAGTGTGCCA GTCCTCCAGA CAGATCCCAG CCAGCCAAGG 2940
CTGCCGGCCC CCAGAGACCA TCGAGCCACA TGGGAAGGGG CTGTGCAGTC TAAACACCAG 3000
GAACTCAGGA GAGGCTATGT CTGGGTGTGT TTGGAGTCAC TCGCAGAGTG TGGTAACAGA 3060
GGCAAGGCCA CAGGGCCTGT CCACTCTCCT ACTTAATGTA GCTCATGTGA GATTCCAGAG 3120
TTCCTCACTC TGCTCCAGAC TCTGAAGTTT GTCCATTGTG CCTAGGAACC TCCATGGTCC 3180
TTTATAACTA CTGAGGGCTA ACCCCTACAG CCTGTCTCTG TGACAGGGTC TTTTGCCAAA 3240
TTCCCAGCAG GGCTTCTATG CAAAATTACC ACAGGAAATA CAGGAGATGG ACTGGGGCTG 3300
CAGCTCAGTT GGTAGAGCGC TTGATAAGTC TGCCTGACAC CCTGCAATTC ATCCTCAGCA 3360
CACATGTAGT GGTATATGCC TCGAAGCCAA GCACTTGGAG GGGTGGATTG GAGAGGATCA 3420
GGAGTTCAAG GCCAGCTTGG GCTACATAAA ACCCCGTTTC AAAAATGTAA ACCAAAAATC 3480
TGAAGACACA AAACAAATTA CCCGAGTTTA ATACACTTGG AAGATCACTC TTCATCCGCT 3540
GCTGCTGAGG GACCAAACCC AGCCCAAGTG ACCCATTGGC AACAACAGCC ACAGCCCACA 3600
ATACTGAGCC TTTTAAATTT TTATAGCAAT GTTGTGAGAT AGGTACATTT TTTTTTCCCG 3660
AGACAGGGTT TCTCTATAGC TCTGTCTATC CTGGAACTCA CTTTGTAGAC CAGGCTGGCC 3720
TTGAAATCAG AAATCTGCCT GCCTCTGCCT CCCCAGTGCT GGGATTAAAG GCATGCACCA 3780