EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM091-14517 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E14.5 
Coordinate
chr3:60303660-60305100 
Target genes
Number: 1             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F6MA0471.1chr3:60304879-60304890CTTTCCCGCCC-6.32
HNF1AMA0046.2chr3:60304167-60304182TTTTAATAATTAACA+6.05
HNF1BMA0153.2chr3:60304168-60304181TTTAATAATTAAC-6.14
Lhx3MA0135.1chr3:60304197-60304210AGTTAATTAATTA-6.64
Lhx3MA0135.1chr3:60304204-60304217TAATTAATTATTT+6.71
Lhx3MA0135.1chr3:60304200-60304213TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr3:60304201-60304214AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr3:60304202-60304212ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:60304202-60304212ATTAATTAAT-6.02
TEAD1MA0090.2chr3:60304019-60304029CACATTCCAT+6.02
TEAD4MA0809.1chr3:60304019-60304029CACATTCCAT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02212chr3:60275845-60315730Macrophage
mSE_06725chr3:60302694-60304136Heart
mSE_06725chr3:60304246-60308185Heart
mSE_07877chr3:60302536-60304206Intestine
mSE_07877chr3:60304291-60306932Intestine
Enhancer Sequence
TGATCCCAGC ACTGTGGTTA CAGACACTTG CCTAGATGTT CGGAATTTGA ACTCAGGTTC 60
TCAGACCTGA GCTCCAGCTT CTTTACGCAG GAGTCATCTC CCTAGCCAGC TAGCCTATCC 120
AGGCAACTCT CTTTTTATCT TAGCAACTTC TGCACATCCT TCAAGGCGCT GCTTGCATAA 180
GTTCCTCCAG GGAGCCTTCC CTCCTTTTCT CAAGGGCATT TTGGATATTT GCCTACCATC 240
TTAGCACCAG CTGGCTGGTG CTCTTTTCTA CCATGCTGCT CCAAAAAGTA CAATCCGTGT 300
ACTCCATCCT CCTGCACTTA CCTCCATCCT ACCTATACTT AACTACTTCT GCCATAGCTC 360
ACATTCCATC CAGTTGCTGG AATGAATGCT GAGAAAGTCC TCAGGCGCTG GTGGTTACTA 420
ATTGTCAGTT AGAAACTCCC TGTCTCTGTT CTCTGAGAAA ATGCTACTGT CATTCTACTT 480
TGTTTCCATT GTTGGGGACT TGGGAACTTT TAATAATTAA CACTGAGAAG TGGTACTAGT 540
TAATTAATTA ATTATTTCAG GAAGGGATCA GTAAGCAGCA AGTCCGTGTT TCATGGACCA 600
GCAGAGGATC AAGATCTGTT ACTAGTACCT CTGCAAACTA GTGGAGTACT TTATTTATTT 660
ATTTATTTAT TTACTCCGCC TAGGAGAGTG TGCCTGACCC ACTCAACAGA AACAGGGAGG 720
GAGAAATCCA GTTTGCATTC ACTCACCTCA ACTCATGTTC AAACCATGAA ACAAACGTTT 780
TTATAGTTAA AAATCATCCC TGACGAAGTT ATCAGAATTC CTTGAAATTC ACTGGAAATC 840
CCGTCCGCAG ATCTTCAAAC TTTATCTCTT CTCAGAAGCC CAGAATTCTT TTCTTTCAAA 900
GCCAAGTTAC AGGACAGCAG CTAATGAACT AGGAGCTGGT GTTTCATTTG CTCAGGCGGG 960
CAGTTGCCCA GGGCTTGTTT GCGTGGGAGT ACCTCTGCAG CGCCTAAGAT GTTATTTTAT 1020
TTTAAAAGAG GGAGCCCTGC TTGCTTTCTG TACACCACAC TGCAGAGTTG GAAGTAAGGG 1080
AGCCTTTAAA CTGCAAGTTT TATTTGCCGA TAGGACAGGA AGGTGGCCTG GGTTTGTGTT 1140
TGGGTGACGA TCAGTTTTCT CGCAGAACTC CAAAACTGTG AGTGCTGAGA AAGATACCCA 1200
CCAACACCCG TGCAAGCTTC TTTCCCGCCC TTCGCCTTCC AGGTTCCAGG CGATGCGCTG 1260
CTTCTGCTGC TGCAGGCCGG GCAGCTAACT CTAACCTTCC GTCTAACCTT GCGGGCCTCG 1320
CGGGCTGGGC GCGGAGCCCC GGGAGCTGGA GCGGCGGTGA GCGGCGCGGG CCCGGGCGAG 1380
CGAGCGGGCG GGCGGGCGGG GGCCGGGGCT GCGCGTGGGA GCTCTGCGCG TCCGCGCGCC 1440