EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM091-10179 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E14.5 
Coordinate
chr17:35369960-35371890 
Target genes
Number: 35             
NameEnsembl ID
RdbpENSMUSG00000024369
Ehmt2ENSMUSG00000013787
Neu1ENSMUSG00000007038
Hspa1bENSMUSG00000090877
Hspa1lENSMUSG00000007033
Gm10501ENSMUSG00000073415
Lsm2ENSMUSG00000007050
VarsENSMUSG00000007029
Ng23ENSMUSG00000036185
Clic1ENSMUSG00000007041
Ddah2ENSMUSG00000007039
AU023871ENSMUSG00000073414
Ly6g6cENSMUSG00000092586
Ly6g6eENSMUSG00000013766
Ly6g6dENSMUSG00000073413
Abhd16aENSMUSG00000007036
Ly6g5bENSMUSG00000043807
Gpank1ENSMUSG00000092417
Csnk2bENSMUSG00000024387
D17H6S53EENSMUSG00000043311
Gm20522ENSMUSG00000092241
ApomENSMUSG00000024391
Bag6ENSMUSG00000024392
SNORA38ENSMUSG00000064853
Prrc2aENSMUSG00000024393
Gm17705ENSMUSG00000090936
Aif1ENSMUSG00000024397
Lst1ENSMUSG00000073412
LtbENSMUSG00000024399
TnfENSMUSG00000024401
LtaENSMUSG00000024402
Gm16181ENSMUSG00000081650
Nfkbil1ENSMUSG00000042419
Ddx39bENSMUSG00000019432
H2ENSMUSG00000073411
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr17:35371545-35371557AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr17:35371549-35371561AAACAAACAATC-6.92
RREB1MA0073.1chr17:35371029-35371049GGGGTGGGGGTGGGGTGAGT-6.23
Sox6MA0515.1chr17:35370990-35371000CCATTGTTTT+6.02
ZNF263MA0528.1chr17:35370332-35370353GGGGGAGCAGGGGCAGGAGAG+6.9
ZNF410MA0752.1chr17:35369978-35369995GGTATCCCATAATAAAC+6.6
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00589chr17:35309410-35373028pro-B_Cells
mSE_01352chr17:35301415-35412021Th_Cells
mSE_03645chr17:35367669-35371015Bone_Marrow
Enhancer Sequence
GGGGACTTCT TCTCTTCAGG TATCCCATAA TAAACTCAGC CAGGCAGCTG CAGCCTTCCT 60
CTCTTTAAGC TTAAAGAAAA TCAACTACGC AGGCCCATCT TATTTGTGTT AGAGGATTTT 120
GGGTTTGGTT TTGGTTTTGA TCAAGGAGAG GCCAAGCTGG AGATGAGTGA GTGAGCAGGG 180
TTGTTGATCT GTGGGCAGAA GGCCGTCCGT CTCTTAACAG ACGGGCCTCT CCTCCAGTTC 240
TAGTCTGGAA GCTGCTCTCC AGGGAATTGC TTCTGCTGTC ACTGCAAAGG CAACACCTAC 300
GCTGTTTCCA GAACTGTGGG ATTTGGCAAA ACTGATCTAG AAGTATGCCA TCTGGGGCTA 360
GGTCAAGAGG CTGGGGGAGC AGGGGCAGGA GAGTGCAGGG TTCTGGTAGG AAACCCCTGA 420
GTGTTAACCT CAGCGGGATA AAACTAGTCA CACCATAGCC GCCATGTAGG TTAGGTGAGA 480
TCTGCTTGAT GGCTTTTTTT TCCTTCACTT TTTGAGACTC TTAGGCCCTG CCCAGACTGG 540
CCTTGAGGTG TTCCCGAGGG CTGGGATTAC AGGAGTGTGT TGTGAACTTC CTGTCTTTCT 600
AGGCGGGGAG GCTGTTTCTG GGCTGGCTAT CTGCCAGTAA GTAACACAAA TGAACTAGAA 660
AGAGGCTGTC TGCACTGTGG AGCCACTACC GATGCTGACT GGAGATGTTT TGTTGACGTC 720
TCTCTACCGT GGCTCCGGCT AGCTTGGATG TAGAGCAGAC TGGCCTTGAG TTTGCAGAGC 780
CCGGACTGCC TCCGCCTCCA GACCGCACCA CCAGCTTAAG TAGGATTTTT GTTACAGAAT 840
TTTGGTGAGA ATGAAGAAAA CTGGTCTGGC GCCTGGTATG TGTCAAGGGA CATGAGTCCA 900
TCCCTAACAC ACAGCAGCAG ATCTCCGGCA TAACACCAAG TAAAAGTTTC AAGTCCTCTG 960
GCCGGCCCAG CTGATCATGT GACAAAGCAT GGATACTTTG TAAGGTGTTT GTGGCATTAT 1020
TACAAGGTTG CCATTGTTTT GATTATGCAA GGAGAGAAGC AAAATTAAGG GGGTGGGGGT 1080
GGGGTGAGTG GAGCTGGGAT CTGACCTGAG CAGTCAACTG CAAGGTAAAA AACCATCAAA 1140
GAAACAAAGT AGTCACTGAG CTGAAAGCTA GGAAATGTAA AGAAAGAGTT GCGAGCTATG 1200
CGGCTGGGTG TGGGAGACAC ATGCCTACAA CCTCAGCACT TGGGATGCAG AGGCCAGCCT 1260
GAGAGACTCG GTAAGACCCT GACTCAAAAA CAAAAACAAT CGGGCTGGTG AGATGGCTCA 1320
GTGGGTAAGA GCACTGACTG CCCTTCTGAA GGTCCTGAGT TCAAATCCCA GCAACCACAT 1380
GGTGGCTCAC AACCATCTGT CGTGAGATCT GACGCCCACT TCTGGCACGT CTGAAGTCAG 1440
CTACAGTGTA CTTATTTATA ATAATAAATA TGGGCAGGAG AGAGTGCGGT TGCCCTAAAA 1500
TTCAATTCCG AACAACCAGA TGAAGACTCA CAACTATCCG TACTGCTACA GTGTGTACTC 1560
ATATACATAA AATAAATAAA TCTTCAAACA AACAAACAAT CACACCATGC TAGCACACAC 1620
CCCTTAGTTG ATTGGGCGAT GTTAGGATAA GCTTTTCTGT TACTAGAGAG ATATGGCCAC 1680
ATCCCAACCA GGGATCTTCA ACAGTTCCCA AGGACCAAAG AACTAACTTA TTTCCCAACT 1740
ATTTTGTTGT ATGATACAGG GTCTCTCTGT AGTCTTGGAG CTCACTGTGT AGGCTACATA 1800
CTTAGAGAGA TTCTCCTGCC TCTGCTTGCC CAGAGTCAAA AGACCTGCGC CACCACACCA 1860
GGCCTTTATT TCCCACGCAT TCTTTCAGTT CAGATCTGGC CAGCTTCTCA AGACCAGTTC 1920
CCACGGACCC 1930