EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM091-08844 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E14.5 
Coordinate
chr16:13366120-13368060 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GATA2MA0036.3chr16:13366924-13366935AGAGATAAGAA-6.32
Gata1MA0035.3chr16:13366924-13366935AGAGATAAGAA-6.32
NFE2L1MA0089.2chr16:13367757-13367772TATGCTGAGTCAGTG-6.06
RFX1MA0509.2chr16:13367321-13367337TGTTTCCATGGCAACA-6.89
RFX1MA0509.2chr16:13367321-13367337TGTTTCCATGGCAACA+6.91
RFX2MA0600.2chr16:13367321-13367337TGTTTCCATGGCAACA+7.11
RFX2MA0600.2chr16:13367321-13367337TGTTTCCATGGCAACA-7.17
RFX3MA0798.1chr16:13367321-13367337TGTTTCCATGGCAACA+7.2
RFX3MA0798.1chr16:13367321-13367337TGTTTCCATGGCAACA-7.37
RFX4MA0799.1chr16:13367321-13367337TGTTTCCATGGCAACA-6.67
RFX4MA0799.1chr16:13367321-13367337TGTTTCCATGGCAACA+6.91
RFX5MA0510.2chr16:13367321-13367337TGTTTCCATGGCAACA+7.05
RFX5MA0510.2chr16:13367321-13367337TGTTTCCATGGCAACA-7.06
RREB1MA0073.1chr16:13367833-13367853GTGGGTGGGGTGGTTGGTTG-6.05
RREB1MA0073.1chr16:13367812-13367832TTGGTTGGGTTGGTTGGGTG-6.15
RREB1MA0073.1chr16:13367828-13367848GGTGGGTGGGTGGGGTGGTT-6.28
RREB1MA0073.1chr16:13367837-13367857GTGGGGTGGTTGGTTGGTTG-6.29
RREB1MA0073.1chr16:13367824-13367844GTTGGGTGGGTGGGTGGGGT-6.97
SOX10MA0442.2chr16:13367865-13367876TGCTTTGTTTT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04220chr16:13366432-13368075Cortex
Enhancer Sequence
AGCATCCTTG TTCAATGGCT CAAATTGTAC ATTTTCTTAC TTATTTTAGT GGAAAGAGCA 60
CAGCCAGTCA GTTGTCCATC ATATAATCTA AACACCAATC AGCAATCTTT CTCTTTGTGC 120
ATGCAATGCT GTTGTAATCC CAGAAATATG GTACTGTTGT GTAAAGGACA GCTGGGTGAC 180
CCTTCAGGCC ACTTACAGCT GCTCAGTGTG TCACCTAGAT CAGTGTGAGT AGCTACAGTG 240
CTGCTAGCAT AATACAAATT GTAACAGTGT TCACATGTCT TTATGCTTTG ATGTACACTG 300
CACATATATG AACATGGATA GATAAATGAG TCTACATATA AAAATGTATG CATTTACACG 360
TTTATATGAG TCAGAGGGCT CTCTGCCAGC TCTGTGCTAT CCTTCTAACA AGGACACTAA 420
CCCTATAAAT GAAGGCCTCA GCTCACCACA TTCCTGATCC CACCAAATGA GAAAAGCTGG 480
GCAGGCAGGG AGCCTGGACC AGGCTACTTC CTTAGAGCAG CTGGCACTGG TTGCTCTGGG 540
GTAGTGAATA GAACTGTTTT CCTGTGTAGT TTCTGGTTGG TTCCTGTTCA GAGCACTCAC 600
CTTAGATGTT TATGCTAAAA TAAATTACAG AATTGTTTAG ACAACTGCAT ACTGTGTCAT 660
TGCAGAAAGA TTAAGAAGTG AATGAAGGTT TAACTAGAGC CTGCCATAAG AGACCTCCAC 720
TCTTCTTCTG CTTTAGCAAA GGAATGATGG GTTTTCATTA CACCCAAAGC AGGAAAAATA 780
AGCATTGTGT TCCCTTGGAA CCATAGAGAT AAGAAATCTT CACATAAAGA GCCTCATGAT 840
TCTTCCAGTC AAAAACTGGG AGAAAAAAAA ATCAAACCTT GTTCTTTCTG ATCTCTCTTG 900
CATCAGGCAA GTACATGGAC ATGTCTGCTT CTTCAGAGCT TGTTAGAGCC CTGGGCCTGC 960
AGAGGTGCCG CTGTGGGCTT TTTCTCTGTT GCTATTTCAC CAACTGAGAC AATGGGTCTG 1020
TCTTTCTGGA ATTCTGCTAC AGCTAGTGTG ATCTCATCTC TGCCCTTCCA TCCCAACTGA 1080
ATATCAGTCA CATTGTCATA CCAGGACGAG CAGACGTTCC TTGCAACTTC TGCAAAAAGG 1140
GGTAAGGAAT CTGTGTGAAG GTATGCTCAG TTTAAAGAAA CATGCCCCAT TTTTAGCTGT 1200
CTGTTTCCAT GGCAACATAA GCAGCAGCCA AACAGAGTTC TCAAAGCTCC TGTAAATTTC 1260
CAGGGCTGAG TAGTGAAAAC ATTGTCTTCC TGCCCCGATT CTGCAGATCA GTGCAGGGAA 1320
CCAGTGCACC TGGAGTGCAT TTCAGCTTGG TTGTAGTGGG TGTCTCCCTC AGCCTGTGTG 1380
CCTGTAAGAA TGCAGCAGAG GGCATCCACT GGCATTCTGA AGAGGAAGGC ATTCCTTCCA 1440
GCTCCACCCA TAGGCAGCTT TCTTTGGAAA CTTATCTGCA CAGCATTTTG GTTAATCTGG 1500
TGTTGCTCCT GTTTTAGTCA GAAAAGAGTC CTAAAATCCC TGATGCAGAT ACTGTTTGTT 1560
CCTGCTCATG GCTGAGCCTT GAGTCAAGGG GTGCCCTATA CAGTTGCCTT TATTCCAGAC 1620
AGGAAGTAAA GTGTAAGTAT GCTGAGTCAG TGCAAACAGC ACGGCTTGCA GGGCACGCTG 1680
CTACTGTTTG GTTTGGTTGG GTTGGTTGGG TGGGTGGGTG GGGTGGTTGG TTGGTTGGTT 1740
TGCTTTGCTT TGTTTTGGAG GGTTGTGCTT TCTTTTTTTT GTTTTGTTTT GTTTTGTTTT 1800
CATCTCTGCC TTACTTTTTA AAAATTTACT GAAGAACCTT ACTTTACTAT GAGCAAACTA 1860
GACCCTGAAA ATACAGCTAA AGCCATGTGA CCTTTGACGG CTCCTTTAGC GTCTGAGGAT 1920
TTGTAGGTTC ACATGGATTT 1940