EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM091-07899 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E14.5 
Coordinate
chr15:25702730-25705770 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr15:25702921-25702933GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr15:25702925-25702937GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr15:25702929-25702941GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr15:25702933-25702945GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr15:25702937-25702949GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr15:25703328-25703340AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr15:25703332-25703344AAACAAACAAAC-6.32
LHX6MA0658.1chr15:25703873-25703883ACTAATTAGC+6.02
Nr5a2MA0505.1chr15:25703027-25703042GCTGGCCTTGAACTC-8.25
RFX1MA0509.2chr15:25703896-25703912GGTTGTCATGGTGACC+6.31
RFX1MA0509.2chr15:25703896-25703912GGTTGTCATGGTGACC-6.31
RFX2MA0600.2chr15:25703896-25703912GGTTGTCATGGTGACC-6.19
RFX2MA0600.2chr15:25703896-25703912GGTTGTCATGGTGACC+6.23
RFX3MA0798.1chr15:25703896-25703912GGTTGTCATGGTGACC+6.06
RFX3MA0798.1chr15:25703896-25703912GGTTGTCATGGTGACC-6.34
RFX4MA0799.1chr15:25703896-25703912GGTTGTCATGGTGACC-6.25
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00789chr15:25691500-25704859Myotubes
mSE_04513chr15:25702984-25705660E14.5_Brain
mSE_09963chr15:25702945-25705541MEF
mSE_10057chr15:25701025-25704620Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
TTGGTTTTTT TCCATTTAGA TTATTTATCC ACCTTTGAAA GGAACATATT CATGGGTGGG 60
GTCAGTTCCC TTCTATGTGT CCCTGGGGTA AAATTCTGGT GGAAACACTT TTACCTACAG 120
AGCCAATTCA GTGACCTACC AGATTATTTT TAGTCAAGGC CTCCCACTGA ACCTGAAACC 180
CTCTGGGTTT TGTTTGTTTG TTTGTTTGTT TGTTTGTTTT GGGGTGTGGC AGGGGTGTTT 240
CCAATCATTG TTTCTCTGTG TAGCCCTGGC TGTCCTAGAA CTCACTCTGT AGACCAGGCT 300
GGCCTTGAAC TCAGAAATCC ACCTGCCTCT GCCTCCCAAA TGCTAGGAGC CCGGCTGGAG 360
CTCTGTTTGG GCTAGACTGG TGGGCCTAGT GAGGTCCTAA GATCTGCCTG TCTCTGCTGC 420
CCAGTACCAG GGTCACAGAA GTGCCACTGT GAGCAGCTTC CATTTAGATC ATCTCCGCAG 480
CCCTGATCAG TAGTGATTTT TTGACACGGC TGACAGACAA CCTGCCAAAC TTCAGAAACC 540
TGGGGGACAA AATGCAGTTT CTACTGCAGT GAACCTTCCT TGAGTATGAA TCAGCAAAAA 600
ACAAACAAAC AAACAAAAAA ATAAAAAACA AAACCTTTGC ACATAGTAGG TGTTTAATAG 660
CTATTCACAA TGCTATCTAG CTGGGGCTGT AATTGCCTGG GGTTGGGACT GTTCCTTCCA 720
AAAATCCAGT CTATTTGTTC TCATAAAAAC CTAGCTCTTA GTGCTCTGCA GGCAGTCTTT 780
GTTGGGGTGC AGCCCTGCCT TGGAGAACTG GTAACCCATG AGGACTAGCA AGCATTAGGC 840
TGGCTTTGAA AAGCAAAATG CTCCTTGTCC AGCCTCCAGC TGTGACAGCT TTGAAAGTTA 900
AATTCACCAG AAAAGGAAGT TGCCACTGAA AACCGAAGCG CCAATGGAGA GCGGGGGTTG 960
TCCCCTCGTG ACCACCGGAG GCGGGTTGCC CAGGGCGACA ATCGCCTATA GATCCCCCTT 1020
TTCCCGGTTA AATTACTGGG AAGGGGCAGG AACACAATGG CACTGGGAGT CTGCAAAAAG 1080
CTACAGCTCC CAGCGTCCCT CACTCCCTTC CCAGAGCTGT ATCAACTCCT AGAACCACAC 1140
CACACTAATT AGCCCGGAGT GGAAGGGGTT GTCATGGTGA CCGGGTACTT TTTAAAGCAC 1200
AGGAATGGTG TTCATTATTG TTCCAAGTCT TTAGCTGTGG GGAAAAGGTC AGGGTAGCAG 1260
TTGTTTTCCC GTATGAAGTT TGGCCAGAGA GCCTAACAGA AGGTGGAATG TCCTTTGGAG 1320
ACGCCGGAAG ATGGTGAGTG TTGATCGGGC GTGGAGGGGT GGCCCTCGGA GTCATATCTT 1380
TCAGAATGTT TTAATAACTT GGGTGCCAGG CTAAGGAATT ATACGGAGGA AGGAGAAGGC 1440
GGCAGGGCCA GAATGTGGGT CGGGCACAGC CACAGCTGGA GGGAAGGGGG GTTAAGAATT 1500
CTCCCTCCAA ACCTCACATC ATTAAACCAG TTAAAAGTTT CTCTGCTTCC AAGGAAGTGT 1560
AACCAAATTG AAACAGTCTG GCACTTTCTT TGAAATTCAC TTTGTAAATA AACTCAGTGC 1620
TGGTCCTTGT AGATCATTAC CACTCAGATT TTATTTTCCA GTCTATAAAG CCCAAAGTGC 1680
CAGGGACACA CGCATTTAGA GCAGCCACTT AGCATGCTGT AAGCCAGAAG TTAAAGTGTG 1740
TCAGGACTGA CTTGGTTTCA TAGCCTTATG CTTTCTTCCT TTTCTAAGGA GTTCAGACGC 1800
ATAGACTAAA AATCCAAGCA AGCCACTGGT CTCTGGCTGC TTGCCGTAAA TTGCCGGCTA 1860
CACTTGGTTA GAATACAGCT AAGTAAAGAC AACGTGACCA CTGTGTTTGT ATAAGACATT 1920
TTTGGGAGAC GTCTGCCTGC CAGAGACAGG GCAGCTGTTC CATCAGGGTG TGTGTGTGTG 1980
TGTGTGTGCG CGCGCGCGCG CGCGCACGCA GCGCTCTGTC TTAATTTTAG TTTTTAAAAC 2040
TGTAGAATAC CCTAGCTTTA AGCCTACTTT GGTGTTCATG GCTCATTGTG TGTTTTTTTA 2100
AGGGTCAGGG AGTAAGCCAC TGTGTTTTTT GGACTTTCCA ACAGTATGGC TCCGTCTTTC 2160
GGTCCTTTTA TTAGACTTCT ATAGAATAAC AGCATACAAG TTAATTAAGG GGACTAGGAG 2220
CCTGGAGTAG AAGAGCGACT TGTCATCCAA AAAGCTGCAA GTGGGAAATG ACCCACTCTG 2280
CTTTCCCCTG GCAGACGATG GTTCAGCAGC AGTGCCAGCT GGCAGCTGCA GAGCTGAGCT 2340
GGGAGCACAG ACTGCAGAGG AGGCAGCTTG GCCCGACTCC TCCCTCAGGC CTGTGTGTCC 2400
TTGGGCTCAC TTCTGGTGGG ACTCCCAATA AGTGGGGTAT AAGGCTGGAA CAAACTAGGA 2460
GTCGTCTTGT CTCTTTTACC CTCTGGCATT TCTAGCCCCC CTCCCTCATT CCTGTGTGTG 2520
TGTTTGTGTG TGTGTGCGCT TGTGTGTGCT TGCAAGTCCA TGTAATGTGT GCTCCTCAGT 2580
GAATACTGTA TTGTTTAACT CAGGAACACC TCTATATCCT AAGTTAAATA AACAGGTGTG 2640
TGCCTGATAC TTTAGACTTT TGAAAAAGGT GATCACAGAG ATGAGAGTGA ACAGCAGTGT 2700
CTTTGTGACA CGGACACTTT GTGACATGTG TGAACGTGGA CACTGATGTT TTAGGAATTT 2760
TTGGTACCTT TCAAGACACA ATAATGGTGA AACTATGATA TATGCTAAAG TATCTACTGA 2820
AATTAAATTG GCAAAAGATC TGAAGCAGTA AGCAGGCTGG TGGGCATCAC AGTGTCGTTC 2880
TGGAGCTGGG GGAACCAGTG ACTTGACTCC ACAGATGTAC ACTGGCCAGT GTATATTTTG 2940
TGTAGGCTCT AAATTACTAT GTATGCGCAT GGGCTTCCTA GAAGCCCGGC AAGGGCGGCC 3000
TTGTGAGCAC TGTGTCCTCT AACTCTATCC CACCTCACGG 3040