EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM091-02110 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E14.5 
Coordinate
chr10:79318610-79319240 
Target genes
Number: 47             
NameEnsembl ID
Shc2ENSMUSG00000020312
Madcam1ENSMUSG00000020310
Gm16517ENSMUSG00000020308
Cdc34ENSMUSG00000020307
GzmmENSMUSG00000054206
BsgENSMUSG00000023175
Hcn2ENSMUSG00000020331
PolrmtENSMUSG00000020329
Rnf126ENSMUSG00000035890
Fstl3ENSMUSG00000020325
PalmENSMUSG00000035863
9130017N09RikENSMUSG00000035852
Ptbp1ENSMUSG00000006498
E130317F20RikENSMUSG00000091994
Gm17134ENSMUSG00000090860
Prtn3ENSMUSG00000057729
BC005764ENSMUSG00000035835
ElaneENSMUSG00000020125
CfdENSMUSG00000061780
Med16ENSMUSG00000013833
Kiss1rENSMUSG00000035773
C030046I01RikENSMUSG00000035781
Arid3aENSMUSG00000019564
Wdr18ENSMUSG00000035754
Grin3bENSMUSG00000035745
ORF61ENSMUSG00000013858
Cnn2ENSMUSG00000004665
Abca7ENSMUSG00000035722
Hmha1ENSMUSG00000035697
Polr2eENSMUSG00000004667
Gpx4ENSMUSG00000075706
Sbno2ENSMUSG00000035673
Stk11ENSMUSG00000003068
Atp5dENSMUSG00000003072
DosENSMUSG00000035640
MidnENSMUSG00000035621
CirbpENSMUSG00000045193
1600002K03RikENSMUSG00000035595
Efna2ENSMUSG00000003070
Ndufs7ENSMUSG00000020153
Dazap1ENSMUSG00000069565
Gm15122ENSMUSG00000087672
Rps15ENSMUSG00000063457
Mbd3ENSMUSG00000035478
Uqcr11ENSMUSG00000020163
Tcf3ENSMUSG00000020167
Csnk1g2ENSMUSG00000003345
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr10:79319021-79319042TTTTTCTTTCCTTTTCTTTTT+6.53
Number of super-enhancer constituents: 9             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04845chr10:79317280-79321426E14.5_Heart
mSE_05508chr10:79314099-79318777E14.5_Limb
mSE_07352chr10:79317327-79320772Intestine
mSE_08114chr10:79317279-79321551Kidney
mSE_09089chr10:79317227-79320858Lung
mSE_10291chr10:79317318-79320924Embryonic_stem_cells
mSE_12235chr10:79317287-79319040Spleen
mSE_12235chr10:79319175-79320673Spleen
mSE_12638chr10:79315040-79319178Testis
Enhancer Sequence
ATTCTTTGAA AACAGTAAAC CAAGCAGAGG GTTACACATA CCCCAGCCAC CACTTCTGGT 60
GGAATCCCTT CACGAGGCAG ACCCCTGAGA GCCATTTGGT AACCTGCCAG CTGTGGTAGG 120
CTTGCTGCTG CCTGTAAGCA GGCTAGGTGT GAGGCGGCAG GGTGCAGTCA CGAGGGGCTG 180
GGGTTGATCA GTAACCTAGG GTGTATCCCG GCAGCTCTGT TGGTTTGTAA ATGGTAACAA 240
GGCCACTTTG CCTGCCATCA GCAGTGTGGC CCTGGAGGAG CTCCCAGCCC CCATCAGGAA 300
GCACTGTCTT GGGCTGCTCC TTACCTATAT TTCAGGCTCC CTGGCGTTGT AGGATGCTCA 360
GGAGTTGAGT TTTGACCCAG GTCACTGGTA TGCTTTATAA AAACTGGGCT TTTTTTCTTT 420
CCTTTTCTTT TTTTTTTTTT CCTGTACTAA AACTGGATTT AATGTGTTGA AAGGCAGGGT 480
CTGGGTCCTG TGTGGAAGAA GGGAGGGTCT TCAAGGACAA TGATGGCCCT CTTTCAAGTT 540
GAGACTCAAT GGATGGCTCA CTTCCCTGCC TTTCTAAGCC GGACTGGCAG AGGGCCCTAC 600
AGGCCACACA GTGCTGATGT CTACTTTTCT 630