EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM091-00915 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E14.5 
Coordinate
chr1:138032820-138036550 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESRRBMA0141.3chr1:138035641-138035652AATGACCTTGA-6.32
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:138034857-138034875GGCAGGAAGGAGGGCAGG+6.76
EsrraMA0592.2chr1:138035642-138035653ATGACCTTGAG-6.02
EsrrgMA0643.1chr1:138035642-138035652ATGACCTTGA-6.02
LEF1MA0768.1chr1:138035003-138035018TCCCCTTTGATCTTG-6.63
NR2C2MA0504.1chr1:138033942-138033957TGCCCTTTGACCCCA-6.87
Nr2f6MA0677.1chr1:138033942-138033956TGCCCTTTGACCCC-6.46
Nr5a2MA0505.1chr1:138035641-138035656AATGACCTTGAGCTT-6.53
RXRBMA0855.1chr1:138033942-138033956TGCCCTTTGACCCC-6.8
RXRGMA0856.1chr1:138033942-138033956TGCCCTTTGACCCC-6.46
RxraMA0512.2chr1:138033942-138033956TGCCCTTTGACCCC-6.73
Tcf7MA0769.1chr1:138035006-138035018CCTTTGATCTTG-6.22
ZNF263MA0528.1chr1:138036000-138036021CCTTCCTTTGGTCCCTCCTCC-6.22
ZNF263MA0528.1chr1:138036013-138036034CCTCCTCCCTCCCTCTCCCTC-6.43
ZNF263MA0528.1chr1:138036045-138036066TTCTCTTGCCCCTCCTCCACT-6.4
ZNF263MA0528.1chr1:138035988-138036009CCCTCCCTCTCTCCTTCCTTT-6.72
ZNF263MA0528.1chr1:138035984-138036005TCTCCCCTCCCTCTCTCCTTC-7.16
ZNF263MA0528.1chr1:138036042-138036063CCCTTCTCTTGCCCCTCCTCC-7.73
Number of super-enhancer constituents: 10             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02721chr1:138030318-138061695HFSCs
mSE_03461chr1:138027478-138034626Bone_Marrow
mSE_03461chr1:138034684-138035542Bone_Marrow
mSE_04183chr1:138032756-138034579Cortex
mSE_04183chr1:138034617-138037628Cortex
mSE_07308chr1:138029879-138035516Intestine
mSE_10895chr1:138031105-138034623Olfactory_bulb
mSE_10895chr1:138034628-138037668Olfactory_bulb
mSE_12032chr1:138027259-138035645Spleen
mSE_12949chr1:138027947-138035722Thymus
Enhancer Sequence
TTTTTTTGCT ACTCCACAGC TGTAATTTTG CTACTGTTAT GAATCATAAG AAGATTGGGG 60
GTTGGGGCTC TGAGGGCTCT GTAGCCCTGG GGCAGGCGGT GACCTATTGG ATGCATTGTC 120
CCCATCTCTG GTGGGCTCCT TCATTTACCT CCAGCTTTTC TCGGATATGG GAAAGAGAGT 180
GTACTATGGT CCCTATCCCC AAATGCAAGC TACCTGTCCT CTCTCTATGC TAAGCTGTCC 240
TATTTCAGGG AGGTGCACTT CACCAGAGAG CCAGCTGCCT GAAAACTTGC AATAGGGAAA 300
GGCAGCAGGA CCAGTGTGGT GGAGGGAGGC TGGCTGCCCT CCATCCCAGC CAGCCAGCCA 360
GCCAGCTGCC TGTTGCTTGA CATTCCTCAG CTGGGGAGTG TCCCCTGGGC CCAGCCCCTA 420
CTGAGCTACC CCCTACCAGA TGCAGATGCC GGCACAGCTC TGGGATCTGG GTTACGCCTG 480
ATGCTTCAGT GTCTCCCGTC TCTTGGGAGG TCATGGAAAA CCCCTACCAG ATGCCCTGAG 540
ATGGGGGGTG GAGGGGCAGA GAAAGCATGG CTGAGTGGCA GTTCCCTGAG ATGGACTTGC 600
CCTTTTTCAC AGGCTCCAAA GACAGAGGGG TCAGACCCAA CTCCATCTCA GGAAGCGCCT 660
GGTGCTGCTC ACAGCATGGC CACTGGGCTG GCCAATCACA GGCTGGGGTA TCTCCCTCAG 720
ACAGGGGCTA GCCTTCTCCA AGCCTCCTCC TGCTCTCTGG CTTCTGACAT CTCATTCGTC 780
TGCTTGCTGC TTCAACCCCA GCCTGCTGTC GGTTCTGTTC TGGATTGTGG CCTTGACACC 840
GAGGCCACAG AAAACGAGGT TCGCCTGGTG AAGGTGCCTC AGAGAAGGTG TCCTCTCTGT 900
TTCTGCTTCT GAGTATGACT CAGAGCTCAG TGGCCAGGAC TCTAGGATGA ACTGAAAGTA 960
AAGTTGAGGA CATTCCCTTT GGAGGGGGTG GAGTTAGAAC CCGAGACACC CCAGAGGTTG 1020
TTGTGGAGTG TTATGTCCCT CCCCATGATC TCAGAGGCAG AAGTCAGGCA GAGAGTGTTG 1080
ACCGGCCCTT TTCACCAGGT CTGCCAGAGC CTCGTAAATC CATGCCCTTT GACCCCACAA 1140
TATAAAGCCT TCTTGTTTGG GGGTGCAGCC CCATCGTTTC CCTGGGGGCA ACCACAGGAG 1200
GGCTGGGCTC CAGATGCCTA TGGGAAGCCA GGGGAGGTTC CAATAGGCAA ATAGTGATAG 1260
GGTCCTGGTG GCTCTGCTCC TAGTATACCT GGGATTTCCC TCACTCTACC GAAGAGTTAG 1320
CACCCTGAAT TAGATCTTGC CGCCCTGATG GAGAGAACAC CAACCCTGTG GGAAGATGCC 1380
TTGTCTCAGC AAAGTCAGTT AAAAGCCAGA CTCCCCTGAG GGAGCAAGGA TTTCGCTTCT 1440
AGCAGCCTTC CCCAGAGTTG GCAGGTTGCC AGGCTGCCTA GGAGAAGTGT GTGTGTGTGT 1500
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT TTGCACGCAC ACACAAGCAC GTGTGTTTGG GGGGGTGAGG 1560
GGGTGCTACA GAGGGCAAAG GAAGCCTGCT TTCTACAAAT GGCCCAGCTC AGCCTCCTTA 1620
GCTACAAAGC TTGGAAAATG CTTTCCCTCC AGGCAGGCAG CAGGCAGCAG GCAGCAGGCA 1680
GCAGGCAGCA GGCAGCAGGC AGCAGGCAGC AGGCAGCTGT TGGTGGGATC AGCAGGGATT 1740
CTAAAGGGAT TGGTTTCCTC CAGCCTGACC CCTATGGCCC TGTTTAGGGG TGCCCCCCCC 1800
CCGCCGCACC CCCCCCCCCC GTGACTGGGC ACACTCTTGA GGAGGCTGCT TCAAATTCCG 1860
TCTGCATCAT TGTAAATTGT GGGGACTCTG GGCTTGTGCA ATGTCCCCTT TGGGATTTCA 1920
GTAAAATGGG GCATGCATCC CTCACCCCAT AGTGTTGTGA TAACCCAAGA GTGCATGTGG 1980
CACCCAGGTT CTCAGATGCT CTGTTATGTC GTCAGATGAA GCTAGGGAGT GAGAGGAGGC 2040
AGGAAGGAGG GCAGGCCTGC TACTGCTACC CCCAAGGAAT GATTTCCTCC GCTCTCAGGC 2100
TTGCCCTTCC AGGATCCAAC AATCTTTACA GGCAGGAAGT TCTTTTTGCT AGCTTATCTA 2160
AATCCCTGTG GCTGTGGCTA AGTTCCCCTT TGATCTTGCC CAGTCTCTGC TGAGGAAGAG 2220
CGGTGTCCTT GGCAGGTCAC ATAGCTTAGC GAAGTGACTG TATGAAAGGC AGTCTGGAGA 2280
CCACGAGGGT CCTCTGGGTC CCTTCTGTGT CTCTTGCATC CGTGAGCCAA ACACGCACCA 2340
CGAAGAAGAC AGCAGCTGGC CTTTCCCTCT GCCCCACCAC CTGTGGTTGG AGCTAGGCAT 2400
GGGGATTCAG GCTGGGCACG AGGAGGAGCC AGCGGGTCTA AGCTGCCTTT GGTTTCTATC 2460
AAGCTTGGAT ACAGTACAGC CAGATGCTGG GTGATAGGAG TCCTTTATGG TCCCTCTGGA 2520
GCTCTCCCAC CAGCCCCCAA GGGCTCATTC TCAACATCCC AAGGGACTCC TTACAACAAG 2580
ACAGACATGC TTTTAGCCCC ATGAAACTCC TTCCGAAGTG TCTATGTTGA TTATTGTGGC 2640
CATCTGAGGG GTAACTCTAG ATCAGGCCTC TGGTTCCTGA AAGCCTGGGG GTAGAACTGG 2700
GGAGAGAGTG TCTCTCGGTC TAGAATCCCT CTAGTGCAAA TCTTACACCA GCTAGTGTTT 2760
GTGTGCATGC TAATTTTGTG CAAATCTCAG GAAAAGGCAG CCTCTGGTTC CTTATCAGTC 2820
AAATGACCTT GAGCTTGGGA CAGGATAGAG ACAAATTGCT CCTCACTGGC TATGTGATAT 2880
ACTATACTGT GGTGGCCCAC CGTGGGCAAA GTGATGGATG GTATCTATCA AGAAGTTGTC 2940
TCACCCCTAA GTACTGATGT CTACTGTACT GGGTGAAATG AGTTCCAGGT AAAGCCTCAG 3000
GTGCATATTT TACATATCAA AGCAGACCTG GCCTCCAAGT TCTCCCAGCA TCCCTCAGTC 3060
CCTACCTGGC ACACCCTTCC CCCAACCCTG GTCTTTCCAG ACCCTTCCCT CAGGAGGCTC 3120
TTTCTTATAT AATCCAGACA TTTTGCGCAC ATGCTCTCTC CCTATCTCCC CTCCCTCTCT 3180
CCTTCCTTTG GTCCCTCCTC CCTCCCTCTC CCTCTCTCCT TTCCCTTCTC TTGCCCCTCC 3240
TCCACTTCCC ATGGTGACTT CCCTCCCTGG CCTTGGTCCT TGGGGCCAGT GAACTCATCT 3300
GAGAGTAGCT TCCAAATAAA CCTGCCTTTA TTATATTCTA ATCCGGCTTG AACGGTCTCA 3360
TTTCACTGGC AGAGAAATAA CCTATCACTA AGGACCAGAG AGATGGCTCA GCCTGTAAAA 3420
GTACTTGATG CTAAATCTGA TAACATAAAT TAAATTCCCA GGACCCAAAT AGTGGAAGAA 3480
GTAGATTCCA GTGGTTGTCC TCTGGCCTCC ACATGTGCAT CCTGCCATAC ACACACCTTC 3540
ACAGGTTTAT TACATGCATG CATCCATACA CACATACAAA CATAAAATGC TTTGAAAAAA 3600
AAGTTTCTGG CTCTGGAACA GCTCTTGGTT ATTTTAATGT CACCGCCTGT TACTTTTCAT 3660
TAGCAGAAAG TCTTTAAGTG TAAAAAGCTG CAGCCTTGGA GGTCTTGAGT GAGGAATAGG 3720
GGAGAGTCCG 3730