EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-24094 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr9:121244570-121247680 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RREB1MA0073.1chr9:121247203-121247223TGTGTGGGTGTGTGTGGGTG-6.06
RREB1MA0073.1chr9:121247201-121247221GGTGTGTGGGTGTGTGTGGG-6.39
RREB1MA0073.1chr9:121247193-121247213TGTGTGTGGGTGTGTGGGTG-6.95
RarbMA0857.1chr9:121244996-121245012CAAGGTCAAGGGTTCA+6.42
TEAD1MA0090.2chr9:121247608-121247618ATGGAATGTG-6.02
TEAD4MA0809.1chr9:121247608-121247618ATGGAATGTG-6.02
Number of super-enhancer constituents: 9             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01125chr9:121241176-121256112Myotubes
mSE_02934chr9:121244628-121270505HFSCs
mSE_04501chr9:121246811-121247628E14.5_Brain
mSE_04824chr9:121246182-121247535E14.5_Heart
mSE_06601chr9:121244422-121248093Heart
mSE_07573chr9:121244569-121245517Intestine
mSE_07573chr9:121246093-121247850Intestine
mSE_09119chr9:121246397-121247505Lung
mSE_10171chr9:121244432-121248183Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
CCCACTCCCC TCTCTATTTA TATACATATA CATACACACA CACACACACA CACACACATA 60
TTCTCTGTCT GTCTGTCTGT CTGTCTCTCT CTCTCTCACA CACACACACA CACACACACA 120
CACATACACA CACACAGAAG AGCTAAGGAA GTTAACTTAG CTGGGTTCAT GACAGCTACC 180
GCCCTTTACC TTGTATGACT TGGCCACGTG AGCCCCAGGC CTTAGGCCCC AGGCAACTCT 240
CCCCACCCAT CCTAGCTCTG TTTTGCCAAA GGCTTTCCCT GGCCTTGCTG CATTGGTCTT 300
TGTGAAAGCC AGGGTGTGTG TCTTTACTTA TTGTTTCCTT TGACAATGCA TTGGGGAAGG 360
CAGCCGGCCC TGGGGATCCT GTCTGTCTCA CCTTCTACTA AGAAGGCCTT GGCCTTGGGG 420
CTGTGCCAAG GTCAAGGGTT CATGAGCTGG ACGATCCTTT AGAGGAGGAC ACCCTCGGCC 480
GCTGCTGTTT CGAGAAAGGA TGAAAGGTGT AGGTTGACCT GAGAAATGGG AGCACAAAAG 540
ACGAGGGGTC TGGGCGCTTC ATTCTGCTTT CAGAACACAG CCCATGTGGC TGTCCAAGTA 600
TGTGTAGCTG AGACTGTTTT CTTATTAAAC GTCTCCCCTT TCTAACCCTG TTCTGTGATT 660
ACAGCCACCT TGTGCCTTTG CAATATGATA CTTAGAGCAG CCCTGGCTTG AGGAGATTGG 720
TATTAGAGCC TCCGGAAGCC ACAAGGAACA TCAGTGTAGT CCAAGCACAC AAGGAGTCAA 780
AGATGTGTAA AAATAATAGC AGACCCCTCT GGGAAGTGGG GTGCATTAGG GGTGTGGTGT 840
CCAACCTGTG TTGGAATTTG GGTGAGGGCT GACTGTTTCA GCCTTCTCTG TGTGGTCCCA 900
GGATCCTCAG CACCACCTCA AGAGACTGTC AGATTCTTGA GTTAGGCATG CAGCTCAGTT 960
GGTAGAGCAC CTGCCTGGCA CGCATGAGGC CCCGGGTCAA CAGTTCCATA TAAACCAGAT 1020
GAGGTATCCT AGTGCCTGTG ATCCTGATGT CGGGTTATGG GGTGTCCCAC ATCCACTCCG 1080
CCACAGGGCT CGGGACATGG GTGGAGGTGG GACACAGGAG TTTTGATTGT GCTTACCCCA 1140
CGCTGGCGCC GGGCGGGTGT CAGGCTATGG GAAGCTTCAG GACACCCCTT TTGGGGGTGG 1200
GGGAGCGCAG TCCAGGGGAC AGCCGGAGCT GGCTAGGGGA TCTCCGGGCC TGTGTGGAGG 1260
ACTGGGCTGT CTGGTTCTCA GGCTCTTGGA TATCCAAGCA CCACTGGGAG CCACAGAAGA 1320
GCTGAGAACG GAGTGGGGTC CCAGGGGCTG GATCTAGCCT GGAGCTGAAG GGGAAAAGAG 1380
GGGAGAACTC CTTGCTAGGT CCTGCGGGGA GGAGAGAGCC CTTGGCTTGT TTGGCTTGGC 1440
TTGGTGGGGA CGGAGGCTGG GAGCACTGAG AAACCTTCTG TGGGAGATTA GGCAGCCGGC 1500
TCTTTAGGCA AAGGCCTGTT CCATTGCTCC CCATGGTGGA TCCTGATGAA AAAGAGTGTC 1560
CATGGTTTTA AGACATTCAT TGTCAATGGT GGAAAGTGGA TGACTGAAAA CCATACCGTA 1620
CTTCTCAGGG CGGGCCTGAG GTTAAATACC TTTTGCAGGG AGGAGTGTCT GGGAAGGGGA 1680
GTTTATTGGC TCCAGGCCTT TAGGTACCTC ACTAAAATGG AGATCTGTCT TGAGGCTGTG 1740
TGACCACAAG TCAGTCACAT CTTCTACCTG TGGAGGGGCT TGGGGCATTG CCCTTATGTG 1800
ACTGAAGGAC ACCAATCTAT GGAGGGCTGC GGCCTCATGT TAGGAGCCTA GTGTCCTGGA 1860
GTGCGTCCTA GTACCATCCC TACAGGGTCA CCGGGATTTC AAGCCTGTGC TCGACCAGGA 1920
ACCAGGCTGC CTTTCACGGA CCAACAACAT CCTGGCACTT GGGAGGTAGA GGCAAGAGGG 1980
CCAGAAGTTC AAGGTTACTT AGGGGTTTGA GACCAGCTTG AGCTACACGA GAAACTGTCA 2040
AAAACTAACA CAAAGGAGTG TTTTGCCTTC ACTCAAACTT CCTTGACCTG GGTAGGACTC 2100
AGCATCTGTG TTTTATAAGC CTCCTAGGGT GGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 2160
TGTATGTGTA TGTGTGTCCA GTGCTTACTT CCTGGCTTCC ATGGACTTGA AGGTGGGTGC 2220
AGGGTGGAGC TTCTAGGGTA GGTGGGTTCT ACTCAAGTCT GGAAGGAAGG TGTGGAGAAC 2280
TCCCCTGAGG CCTCTCCAAG GCCGAGTTGC TCTTTCACAG TTGGCTCTGA GCCTGCAGAT 2340
TCTTTCCTCC AAACAATGCC TGCTTCTCTG CATTCTTGTT CCCCGAGGCT GTGCTCAAAC 2400
AATGGGGCTC TTTCTTCTCC ATTGGAGTCT GCCCCGTGGG CCTTATGGGT GCTGTCTGCC 2460
TGATTTTATC TCATGTTGAC TGTTATTATA CTGTGATAGC CTGGCTGGGC TTTTCATTGT 2520
GGGGATAAAG GGAAACAATC TGTCTACCAT CCCTAAGATT CACTCTGAGA GAATGCCAGG 2580
CCCAGAATAA GGGATGGGAT TGGTGGTGTG GGTAGGATGT GTGTGTGTGT GGGTGTGTGG 2640
GTGTGTGTGG GTGTGTGTGT GTGTGTGTCC GTCCTGGAGC ACACTGAAGT GGTGTGCTGC 2700
TATAGCAGTG ATGGCAGGTG GCGTTTGCTC TGTACCAAGT ACTGTGCTAA GCACTTTGGC 2760
ATGATCGTGG GATAATTTAG TTTTAGTCCA CCCTTTGACT AGAGAGTCTC AGTTTGATCC 2820
TTTGACTTAT CTGGTGTCCC GGCCCAGGAA ACTGAGGCAA GAAAGGGCAG GTGCACGCTG 2880
GATAGCAAGC AACTTCTATT TTATTCTAGC ATCATGGGTA GCCATGGGTT ATTGAGGAAT 2940
AACCTGGCCC CTGTGTAGTT TGGATATAGG TTGATGTGCA CGGGGTTGGG GTGGGGGTGT 3000
GTGGAGAGGT GGGGATGGGA TATTTAAAGG TGTGGCCTAT GGAATGTGTG AAAAGAACCC 3060
AGAGCAGCAT TGTGGGACCC TTGAGCATTT TGGGTAGCCA CAACATGTCC 3110