EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-23603 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr9:72511670-72513890 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EN2MA0642.1chr9:72512881-72512891GCTAATTGGG-6.02
FOXA1MA0148.4chr9:72512189-72512205CACTAAATAAACAAAC+6.53
Foxd3MA0041.1chr9:72512197-72512209AAACAAACAAAC-6.32
HNF4GMA0484.1chr9:72513563-72513578AAAGGTCAAAGGTCA+6.97
NR2C2MA0504.1chr9:72513563-72513578AAAGGTCAAAGGTCA+7.68
NR2F1MA0017.2chr9:72513562-72513575AAAAGGTCAAAGG+6.11
Nr2f6MA0677.1chr9:72513564-72513578AAGGTCAAAGGTCA+8.12
RXRBMA0855.1chr9:72513564-72513578AAGGTCAAAGGTCA+7.82
RXRGMA0856.1chr9:72513564-72513578AAGGTCAAAGGTCA+7.82
RxraMA0512.2chr9:72513564-72513578AAGGTCAAAGGTCA+7.82
ZNF740MA0753.2chr9:72513150-72513163CCCCCCCCCCCAC+6.92
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04461chr9:72511845-72513834E14.5_Brain
mSE_04882chr9:72511568-72512881E14.5_Heart
mSE_09447chr9:72510184-72513177MEF
mSE_09447chr9:72513199-72513952MEF
mSE_10312chr9:72509308-72512248Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
TTGTTAGTAA AGGGTCTGAA GAGGTGGCTC GGTGGCCGAG CTCTTGTAAA GGACCAGTGT 60
ACAGCCCCAT GGTGGGGCCC CTCATAACAG TAATTCCAGC TCTGGATCTC TGTGGCACCA 120
GCACACATGG CATACATTCA CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCACTCACA CACACACACA 180
CACACACACA CACACACACA CGAGTACATT ACTGGAGCTG GGGAGAGCAG TTGGGGAAGA 240
GAGGCCAAAG CAAAGGCCAG TGAGAGTACT GAGTCACAGT AGCTGTAAGC TCTGCTGGGC 300
TGTTAAATGC ACGGTGGGCT GAATGCTTAT ATACTTTGGA ATGCTACAAG ATGGGCTGTA 360
GAGAGGACTT AGTTAAGAGC ATTTGGTCTT TCAGAGAACT TAGGTTTGGT TCCCAGCACT 420
CACATGGTGG TTTACAGTCC TCAGAAATGA TGCCCTCTTC TGACCTCTGT GGAAGTCAGC 480
TATAGACATG GTGCACATAA GCACATGCAG CAAGACACAC ACTAAATAAA CAAACAAACC 540
AACCAACCTT TAGAAAAAAG CCCAGTTCTC AGGTAACATT TAGAATATGG TAACAGGCAG 600
ATACAGAAGG TTCTAGGTAC TCAGAAGCAG CCCTCCCCCT CCTCTAGCCA GGGGTGACGG 660
TCTGCGCAGT GCCCACTATT TCATAGGAGT CAGGAGTTAC TGTTGCCCTG TGGCTAGGAT 720
GCCTTTCCTC TACCCTGCCT GCTGCATACC CACTCAATTT GGAAGATCTC AAGTTGGTAT 780
CCTACTCTGG CCTTGGGCTT CTGGCTGGCT CGTCCAGCTA CCTCTTCCAG CAGAGCTAGC 840
TGGTCACAGA CTAAATAATG TTAAAGTTAT CTTTCTCTGT CTCTTTTCTC CCTCTTGGCC 900
CAGTATCTGT TTTCCAGATT GTCCTTTTCA TCTGCCCAGC TGAAATAAAG AAAGATCTGT 960
GTGGCCGCTA GTGGGTGCGC AGCAGCAGCT GGGGCTCGGA GCTCCCTCTG TAGTAAGGAC 1020
TAACTGAACT TAGTGAAGGA TCTATACTTC TGAAGAGCTT ATGATCCGGG GCCTGTTACA 1080
TTCCCATGAT AAAGGTTTAG ATGTGGGTTC TGGGACTCAA ATTTTTCTCC CCTCTTTCTG 1140
TGTCTACTTT GTGCTCACTA AGGGAGAGAG GCAGGAAGAC AGATAGGGTT GTGAGCGTCT 1200
TCCACTGCGG GGCTAATTGG GTTATTAATA TTCACTCAGC AGACGTTCAT TAATGTTCTG 1260
TGTGCCGTGT GCCAAGCACC AGGGATACAG AGGATAAAAG ACCAGCCTCC AAGGAGCTCA 1320
CTGTCTGGTG AACAAGCTAG AAATGGCTCG TTTGCTGGTT GCAGCTGGAA GCTCATTCCT 1380
CTCATTGGGC ATTTATTTAT TTATTTATTT TCTGGTTTAT CACAGAACCA AATGGCAGCT 1440
TGGAACACAG CCCACCCCAC ACACACCCAA ATACCACATG CCCCCCCCCC CACACCACGA 1500
ACACTACTAC ACACGTACAC ATCACACACA CATACATACA TACCACAACA CCCCCCACCC 1560
CCATACACAT TTTGTTCTTT ATTTAAAGAT GGAAACATGG CGGCTGTGTC ATCTCTTGAG 1620
CTCAGACTAG TCAGAGTAGG CAGCCTGCTG CTGTTGATTA AAAGTGTTTG GACTGGGGTG 1680
TGGTTTAGTT GGTTGAGTGC TTGCCTAGTG TGTCTGAAGC CATGGTTGAA TATCCTGCAT 1740
TGCGTACAAC GGATGTGTTA GCCCATGCTT TTAATACCAG CACCTGGGAG ACAGGCAAGA 1800
GGAATTCTGT GAGTTCGAGG TCAGTATCAT CTACATAGCA AGGTCCTGAA CAGCTAGGGT 1860
TACATAATGA GACCTCTCAG AGGGGGGAAA AAAAAAGGTC AAAGGTCATG TAGCAGTACG 1920
TCAGAGCACA CATCTGTCAT GGCAAGTGGA AACGGAGGGC CAGAGGCATG AGCGCCTGAC 1980
TAAGACCAAC CAGAGCTGTG CTGTGAGCGC CTGTCTCCAA AAGAAGGAAA TGGATTCAAA 2040
CAAATCTGAA ACAAGGAGAA AGATGAATAG AAATGGCACA GAATGTAGAG AATTGTGGCT 2100
TAATCTTACA GAGCGATTAG GACTCACTGG GTGATGTGAC GGAGGGTATT AAAGCATGCT 2160
GAAATTGGAT CTAATACCTG CCCCCTTTTG GATGAGTTTT AGTTTTTTGG GTTTTTTTTT 2220