EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-23469 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr9:65015560-65018200 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr9:65018183-65018200GGAATTAATTAATTAAA+6.36
Lhx3MA0135.1chr9:65018184-65018197GAATTAATTAATT+6.29
Lhx3MA0135.1chr9:65018185-65018198AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr9:65018186-65018196ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr9:65018186-65018196ATTAATTAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr9:65016385-65016405GGGGCGGGGGTGGGCGGGGG-6.07
RREB1MA0073.1chr9:65016415-65016435TGGGCGGGGGTGGGCGGGGG-6.07
Stat6MA0520.1chr9:65015779-65015794GGTTCTCTGGAAGAG-6.39
TCF3MA0522.2chr9:65017711-65017721AGCAGGTGTT-6.02
ZNF263MA0528.1chr9:65016460-65016481TTCCCTTCCCCCTCCACCCTC-6.33
ZNF263MA0528.1chr9:65016576-65016597AGTGGAGGAGTCGGAGGAGGG+6
ZNF263MA0528.1chr9:65016579-65016600GGAGGAGTCGGAGGAGGGAGG+7.12
ZNF740MA0753.2chr9:65016837-65016850GCACCCCCCCCAC+6.74
Enhancer Sequence
CTCCTCAGTG CTGGGATTAA AAGAGTGCTA TGCCACCACT CAGCTCAATG GACCTGTTTT 60
TAGAACTATA TTTTAAAATC TTTTGCTTAT GTGTATGGGT GTTTTGTCTG TATGTATATC 120
TGTGTACCAC ATATACATCT GGTATCCTCA GAGGCCAGAA GAGGGCATTG GAATTATAGA 180
CTATTGTGAG CCACAAATGG GTGCTAGATA TCAAATCTAG GTTCTCTGGA AGAGCAGCCA 240
GTGCTCTTAA CTGCTGAGCC ATCTCGCCAG GCCTCACAGG CATGTTATTG TGACAGCTCC 300
GAGAGCCCAG TGATTTCACT AGGTTCTTTC CAGAGTGTAC TGAGAACATC TAAGGACAGT 360
GCCCAGGGGT GAGCACCTTT GCTCCTGGGG TGCCAGAGAG TCTGATGCTG GCACTCTTTT 420
TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTAAGATTTA CTTATTTAGT ATATGTAAGT ACACTGTAGA 480
GTGTCTTCAG ACACTCCAGA AGAGGGCGTC AGATTTCAAT ATGGATGTTT GTGAGCTACC 540
ATGTGGTTGC TGGGATTTGA GCTCAGGACC TTCAGAAGAG CAGTCAGTGC TCTTAACCTC 600
TGAGCCACCT CTCCATCCCT GATGCCGGCA CTCTTACTCA GTGTGTATCT GTGGGATGAA 660
TGTTCGGGGT GGGCTCAGCA GGTCTGTTAT GTGACGGGGA CAGGTGACTG TACTTCCTGA 720
ACCAAACCCC AGGACATATA TTCACCTGAT ATGAAGCAGG GAAACAGGAC AAAATGCTTG 780
AAACTGGACT AGCTTTTGAA ACCATAGTTG GTGGAAGGAC CACATGGGGC GGGGGTGGGC 840
GGGGGTGGGC AGGGGTGGGC GGGGGTGGGC GGGGGTGGAG GCTCCCTTAC ACTTCCTGTG 900
TTCCCTTCCC CCTCCACCCT CTAATGCTCC AGAGGCCCCC ACAATGTGTC ACATCCACCC 960
TTAGGCACAC ACACCTAATA GGCAAGCACA CTTCACACTC TCCATGGGAG GCTGGAAGTG 1020
GAGGAGTCGG AGGAGGGAGG AGTCGTCCAG GGAAGACCTG GAACCTCCAA GCTTCCAAGC 1080
TAAGTGATTA AAAGTAGAGC TTTGAGGACT TTTATTCTCC TAGGACTGTA AAAGTCCAGC 1140
CTAGGGGCTC TGGATAGCCC CAGCTCCTGG TCTCCCCTGC CATTTTGCCT TTGACCTACC 1200
GTGGTACCAA AGTTTGGAAG TTCCCCAGTC TTGAAGGAGC CAATAGCTGG AAGCACAAAC 1260
TTTCCTAAAG GGAACACGCA CCCCCCCCAC ACACACACCA TTCCACACAC ACACACCATC 1320
CCACACCACT CTCCTTTCCA GGCCCCCATT TGTCAGAGGT GGCTGCAGAG GGGTGAGCTG 1380
TGGATTTATG ACTGGGGACT TGAAAGACAA AGTTGCCTTT TGTGTTGGAA TTGGGGCCAG 1440
AGTAGGGGGA TTGGTGAGCT GGTGGCTGAG CCGGGAGGTG GGAGAGAGAG CCTGGAGTTC 1500
AGGGGCCCAA GAAGGGGTCA GGAGCTTGAG GAGGCATACT GAAGGATACA CAGGCTTCTC 1560
GGTAGGGTCA CCTGGCAAAA GCTGGGCAGC AAAGCCCCGC AGGCTTCTAA ACCACCAGGG 1620
TCTTAGCTGC TTTAGATCCA ACTACTCTCC TTCTATTTCA GCATCCACAA CCCTTCCCAC 1680
CTCCTAGTGC ACTCTTTGGA TTCAGAACTC CAGTTTCACC CACAGTGAAG CACACACAGC 1740
TACTGAGTTG TGCTTTTTAC CCCTGGGTGA CCACAGCTGC TTAATGCCTG TTGCTCCTTA 1800
ATAGAGCCAA AGTGACGGAC AAAGGGGGAT ATGGATGGCG GCGTCATGGG AGTATTGGGA 1860
GTGTTGAGTC TGGCCTGGAG AGCTGGCTTA GAAGGCCTGT ACTTCCCACA CCCATGGATA 1920
AAGGGCAGCT TGGGTAATAT ACCAGCCGCC CCAGGACGCT TTCCATCTCT GCCCTCCTTC 1980
CCCTAGTCTT TTGGAATGTG GCGTTTACTG AGGTGCCCAC GGGATTAGAG AACATGGGAG 2040
GTGGAACACA ACTGGCTCCT CACCCTCCAG AGTCCAAATC CCACTAGACC TTACCGCTGC 2100
TTCTGTTGAG TGGGTCTGGA AGGAGGCCAG CGTCGCCATG GGGCCTAGTT CAGCAGGTGT 2160
TTTAACTACA CCTCAGAGAG CCACATCCAA GGGCCAGAAT GAGCCTGGCC AATAAAGGCA 2220
TGAGTTTATG GGCTTCGTAA ACATTTTACT AGAGAAATCA AGGCCTCACT TACCCAGCGG 2280
CCTCTTCCAA CTGACAGCTT GTCTCTATGA AACTTCCAAG CCTAAGTCAG ATAGAAGACC 2340
ACACTCTGGT TAACACCTTG CTGTCCCTCA CCTCCAATGA CCCCCTCCCC AGTCACCATT 2400
TTCTTGCAAA TTCTCTCCTG GCCTATCTCC AGAGGACTTG AGGTGCCTGC TTTGCCTTGT 2460
CCTCTCTTGG AAAAGATGCT CGACTTAAAA TAATAATAAT AATAATAAAG GTGGCCAGTA 2520
ATTGGGAGGA GACACTTGTC TTCAGCCTCT GGCTTCCACA CACACTTGCA CACACCCACA 2580
CTGACAAGTT CACACCGGAC ACCACAATGT ACCCATACCA AATGGAATTA ATTAATTAAA 2640