EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-23346 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr9:61229360-61234660 
Target genes
Number: 2             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 28             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Ascl2MA0816.1chr9:61231277-61231287AGCAGCTGCT+6.02
Ascl2MA0816.1chr9:61231277-61231287AGCAGCTGCT-6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr9:61233846-61233864ACTTCCTTCCTCTCTGCC-6.13
Foxj3MA0851.1chr9:61230711-61230728GCCTTTGTTTATCTTGG-6.12
HSF1MA0486.2chr9:61234486-61234499TTCTGGAATCTTC+6.2
HSF2MA0770.1chr9:61234486-61234499TTCTGGAATCTTC+6.18
HSF4MA0771.1chr9:61234486-61234499TTCTGGAATCTTC+6.25
NFYAMA0060.3chr9:61232175-61232186TCTGATTGGCC-6.02
NRLMA0842.2chr9:61231532-61231545TGTCAGCAGATTT-6.23
RFX1MA0509.2chr9:61233075-61233091GGTTGCCATGGCAACC+8.45
RFX1MA0509.2chr9:61233075-61233091GGTTGCCATGGCAACC-8.45
RFX2MA0600.2chr9:61233075-61233091GGTTGCCATGGCAACC+8.85
RFX2MA0600.2chr9:61233075-61233091GGTTGCCATGGCAACC-8.85
RFX3MA0798.1chr9:61233075-61233091GGTTGCCATGGCAACC+9.03
RFX3MA0798.1chr9:61233075-61233091GGTTGCCATGGCAACC-9.03
RFX4MA0799.1chr9:61233075-61233091GGTTGCCATGGCAACC+8.59
RFX4MA0799.1chr9:61233075-61233091GGTTGCCATGGCAACC-8.59
RFX5MA0510.2chr9:61233075-61233091GGTTGCCATGGCAACC+9.03
RFX5MA0510.2chr9:61233075-61233091GGTTGCCATGGCAACC-9.03
RREB1MA0073.1chr9:61233463-61233483GGGACGGGGGTGGGGTGGGG-6.4
RREB1MA0073.1chr9:61233469-61233489GGGGTGGGGTGGGGTGGGGG-6.74
RREB1MA0073.1chr9:61233468-61233488GGGGGTGGGGTGGGGTGGGG-7.67
Sox6MA0515.1chr9:61231108-61231118CCATTGTTTT+6.02
TFAP2BMA0811.1chr9:61232413-61232425TGCCCTGGGGCT-6.11
TFAP2CMA0524.2chr9:61232413-61232425TGCCCTGGGGCT-6.11
ZNF263MA0528.1chr9:61233863-61233884CCTCCTCTCTGTTCCTCCCTC-6
ZNF263MA0528.1chr9:61233850-61233871CCTTCCTCTCTGCCCTCCTCT-7.01
ZNF740MA0753.2chr9:61231599-61231612TTGGGGGGGGTGG-6.37
Enhancer Sequence
AGCAGTGGCA GAAATCCACT AGGCTCGCCC AAGGCATCAT CCACTCCCAA CCCAAAGGCC 60
AGTTGGCCTT TCCCTGCTGA CACCAGCACT GGAGCAGAGA CAAGTGTTGG CTGGCATAGA 120
GTTTTCAAGT CCTTTTGTTG GCTGGGCATG GTGCATGTCA GCCAGAGACT AGGGGATTCG 180
AGCTACTGAG CTGTGGCTGA GTGCAGAGGC TGCCATGATA GGACATGGAG AATAGGTAAG 240
CCTTGGAGCT AGACGGAGTG CCAAGTCTCC CTGTCTGGTC AGATAACAGG AGGATCACCC 300
TTCTGCAGAG CCCTTGGGTC TAAGGAGCCT GTCTGGAAAA CCAGGAGGGC GGTGTATGGG 360
ACTGGTATTC TTAACTGAAA GATTGTACCA CACTTGAGGG GAGCCAGAGG AGGTCGCTGA 420
TAACTCCAGA GATTTTACTG GACAAGAGGT CCCCTTTTTC TTCACTTCAT CCACCATCGG 480
TGGCAAAGTA CATACCCAAG TGCCTAGCTA TGGGAAGGGG AGGAGTGAGG TCCAAGAGCC 540
AGAGAAACCC TGTCTGTAAA TGGTCCTCAC TTCTCTCCAT AGCCAAATTT CTCTTGGGGG 600
AAAAAAAATG GAGCCTGGGT CCCTTCCCTT TACCCACGCA CGCCTCGAGT GACAGTCTGA 660
AGTTCTGATA TTGCTATTAC TACATCCTTG CATATGAACA CACACACACA CACACACACA 720
CACACACACA CACAAACCCA GGTGATCGTG CAAATGTCAG AGACGAGAGT AACATGGCCG 780
CTTGAGATTC CTGTAGCACT TGACTGCCAA GCAGGTGAGG CATTTTTCTC CGGAAATACT 840
GGGGCGTTTG CTTCCAGAAC CCGAGGATCA GACACCAGAA GAGCTGGGTG TGGGTGGAGG 900
TGACCTGTGT GTGCCTGGAG GGGCTTGCCC GTCGATTCGG GTGTGGTGGG GTGGAGGTGT 960
GGAGCCCGGG ACTGAGGAAC AGGAGTGTTC TGTGCTGACT GAGCCTTGCT GTCTGCCTGG 1020
CAGTGAGGTG ACAACACTTC ATCCTGTAGG AGACTCACTC GGACACTGCG GTCTAGGCTT 1080
CTCTTCCTGA TTGCCTGCTG ACCAAGGTTA TGGTTGTAAA AGGGATGATG GTCAGTGACC 1140
TGTACCTTGA TTTGGAGAGT CTTTTCTGTT TGTTTTCCTT GTTATCTCCT ATCAAGTCAA 1200
AGGGGGGAAG TGGGGGGGAG ATGCAGAAGA AGGGGGTGAT AAAGCTGAGG TGTGGAGACA 1260
GGAATGAGGA AGCGCCAGGG AACACCTCTC TGTCTGGGCT GCTTGAAGCT TGCCTTACCT 1320
TGGCGTTTGG TGGTGGGGTT CCTAGGGCGT GGCCTTTGTT TATCTTGGCT TGACAACCTC 1380
TTCCAGGTTT GGGTTGGTTG CTGGTAATTC TGGGAACGAC TCTGACCCTC TTTAAACTTG 1440
TTTATACTGG AAGGGACCAT CTTCCCACAG ATGGAGACAC AAAGTCAGCC AGGGGTTCTT 1500
TCCCATCCCA TGGTCCTGTC TCCAGGACTG TGCAGTCCAG CCTGGGTCAG GCGGGAAACC 1560
CATCGTGTAG CCATGTGAGT GAAAGAGAGA AGAGGGGCCA AGGTCACTAC CACTGCCCAA 1620
GACCATAAAG TCTTTCTTTA CTCCGGGTTT GACACTGAGG ACATTGGTCA GACAGGCAGC 1680
ACACATGTTG CTTCAGGAGC CAGGGAAGAG GAGGGCAGTT TAGCTTAGAC CAGTGTCTTG 1740
GGGCCTTACC ATTGTTTTTC CTAGCAGAGC CCCTTCTTCT GCTTTCTCTC AAGGAGGAGA 1800
CCGCAGCCCA ATTTAGCTTT GCCTCAGAGT AGAAGTCCTG GGGGCCAGCC TGGAGGAATT 1860
GAGCTCTTAA CAGTGCTTGC CTCTGCCTGT CAGTCTTAGG GGTCTCAACA TGTCACCAGC 1920
AGCTGCTGCT CTCTGCTGCC AGGGTTCTCC TGTGTGGGTT TGACACTACC TTTTATGTCA 1980
TAGCCTAATG GGGGAGGGGT ATCCTGTAAC CTTTAGCTTT CCTCCACCCC ATTCTTTCAC 2040
TTGAATCTCA CCCCACTTCT CAAGAGACCC CTTCTTTGCA GACACCTTAA ACTCTTAAGT 2100
CAAAAACCCA GGGCCATACA GGATTAGGGA GGGTTTCTGA CAACCCTGTT TTTATGTGGG 2160
TGAGAATGGA GGTGTCAGCA GATTTGGAGT TTCTCACAGA GAATCCAGGT TCTCTAGAGG 2220
GAGAGAAAGA ACCAGGAGCT TGGGGGGGGT GGGGGGATGG AATTCTCTGG AAGGCTAGAG 2280
TGGTGCTTTA GAGTCTTAAA AATATGGGTG TCTGTACCTT CTGTTCCCAC CAGTGTGACT 2340
CTGGACAGCT TCTTGTCCTT TGTAAGGTTT TGTGAGTGGT AGGATGGGTA ATATGACCCT 2400
ACCTGCTAGG GTAGCCAGAG TTTTCTAGGA TTTTCACAGC TGTGGAAGTA CAGCCCAACG 2460
TGGTCGACAT TAGCTACGTG GACTGCTGAC CAATTGAAAC GCGTGGCCCT GTGGTGGCTG 2520
AAGCACTGAG CTTTAGAACT GATGCAAATC CAGTTGCACG AGGTCCTGTG TGGCCCCTGG 2580
CTTTCTAGAC ATTGGGGGTT TAGGAAGTGC GATGGGATTA TGGGTGGGAG TGGATGCCCA 2640
GGACGTTAGC ACACAGACGG CCTCACATTG GGACAGATAA GAGCCTCAAA ATTTCCAAGG 2700
CCTCAGAGAG GGAGAAGGGA CTCAAGAGGA GAGGAAGGGG CCGGGCTGCT TAGGTTGCTT 2760
AGGCTCTGAG CCCATCTCAT TGTTAAGTAG CTACTCATTT CAGCCCTGCA GTGTCTCTGA 2820
TTGGCCCAGT ACCTTGAAGC AGGTGCCCCT GCTGTTGGAA GGGTTTGGAT GACGTGTGTG 2880
GTTGAAAGGT GGCCCACTGG TAGGGTCAGA TCAGGACCAC ATCTGTTTGA CCTGGCCTGT 2940
ATCATGATCA TGAACCACTC TGGGCTTTGG TTCCAGTGCC CACAAGTCTT TATATAAAAT 3000
CTTTTAAGAA CTCATTTTTT TTTTAAAGTG CATGCATTGG GTCAGAATCA GCCTGCCCTG 3060
GGGCTCTTAC CCACTGGTTG GTTGTCAGCA GCACTGTTGT GGTCCTGACA AATGTTTGCA 3120
GACATTGCAA ACATTTGCAA TGTCCTGTCC TCCAAGAACC AGAATTCGCT AGCAGTGCCT 3180
GAGGAGACCT TTGGTATAAG GGAAGACTCA GGCTCTAGAC CTGGGAGATG TGGTTACCTT 3240
CGTCTTGATC TGTGGAGAGC GATCCCTCGC CCTCTCTATA CCTCATCTTT GGCTTCCGAG 3300
AGGTGGGAGG TTTCCTGTCT GTCAGAGCAG TCGGTTTGCG AGTGAGGAGA TGGTGAGACA 3360
AGTGCCTGAA CTTGATTTCC ACGGCCTGTG AAATGTCTCC ACGTACTTGA GGAAAGGAGA 3420
CCCGCTGACC CTCTGAATTT TAATGTAAGC AGGGGACGTG CTCCGTGCTT GTGAGAGCAA 3480
ATAGAATAGG GCTCTGTTTC TCCCTACTCG GTCCGCTGTG TGCTACCTTG GTTTCTCAGT 3540
GAGCCCCTGT CCTCAAAATG TCAAAGCAGT TGGTTTCATT TGTAACCCTG ACCTGGTGAG 3600
GAGACCCCCA AAATTTAATG AGCTGCCTCA GCAAGGGTAA TGTGACTTTT ACAGCCTGTT 3660
GAGGGGCAAG GGGAAGATTT GCATAACGCT CCAAGGGGGG GATTAGGTGG CTGGGGGTTG 3720
CCATGGCAAC CCTACAGGGA TGAATCGAGA ATTTTTCCTC CTCACAGGAG TTGGCCAGTG 3780
GAGTCTGGGA AGGTGGGGGA GGGGACAGGG GGTTATCCAA GGGGAGGGCT GAGGAGAGGG 3840
GAGGGGGATC CCTTGGATGA GTGGGCAGCT TGGGGGAAGG TGTAATCTGA AAAACCCCCT 3900
CTGTTCTATC CATACAAGCA GGCTCTTTGA GAGCCGTCTC CCTTCGTAGG GGTTGGGAGG 3960
CAAGCAGTTT AATGTGTTTG GGAACCAAGA AATTAAAGTG AACAAATATT TAAAGATTAT 4020
TGGATCTTGT TAACAGGAAG CTGGATGGGT GGAAAGTGAG AGTTAGGGAA ATGAAAGTCT 4080
TAAGGAGTCT TAGAGCCCGG GAAGGGACGG GGGTGGGGTG GGGTGGGGGG AGGGGTTTGT 4140
CATCTGATTC AGTTCCGTCT TACCAAGTAG GGTGCTTCCA TCCCCCTGCC CTCTGCCACC 4200
CTCCCCCCCC CCGAATTTCT AAGAGCCCTC ATCGTGCAGT ACCCCTCCTC CACACCTCGT 4260
CAGTGCTGCG TAAAGGCCCA GTGGGAGGAC TGCCCCAGGA CGGGTGCAGG CTCCTGACGG 4320
GGGTTGCAGT TTCTTCCTCC TCAACCCCTC CCACTCTCAC TTTGCCTGGT GTGTAGACTT 4380
CTTAACTTAC CAGAACAAGG AAGGCCCATT GCTTTCAGGA AAGTGCCTAG AAGGGTCATG 4440
TCACCACTCA GAAACCCCAG GCTCTCTTGC TGGGGTGGCC CTCGTGACTT CCTTCCTCTC 4500
TGCCCTCCTC TCTGTTCCTC CCTCTCATGG GAAGGGCACA GGGCCTGATG CAGGAGGTGT 4560
CTGTTGCTCC CAGGCCAGCT TTGCCGTTCT TGCCCTGTAA GACAGAGATC TTAGGGGTCA 4620
TGCGGAGACA CAGGTGCTTC CCTGTACTCA GTCTTCCTAG CAGAAAGGCT CCAGCAGGCT 4680
TTCTCGGAGG GCGTAAATAT TTAATGGTGT TGTAGTTATA TATAATTTGA TCAATATGTC 4740
AGTGTTAAGA GGTCCTTTAA GGAGGCCCAT CCTATCACTA AGCAATCTGT GATGTAAGCC 4800
AGCACCCCCT CCCTTCCCTC TGCCCCCACA AGCAGCAAGC ATCATCTCCC AGGCTGCTAA 4860
ATGGGTCATT TATCCCTTTC TTAGTCCTCA GCGGGGGTTT GTAGCATGGA GGGAATGGGG 4920
CCTGGGAACA CCACCCTGGC TTTTGTTCCT TCCTTGTTGC TCCCTCTCCC CTGATTTTCT 4980
TTCCTTTGTT GATAGATACC ACCTGTCTTA ACCCAAGGAG AAACTGCCTG GCCAAGGGCG 5040
CCATCTTATT CAGTAATTGA GGGGCTATCA ATTTAGAATT GCCCAGGAAA TAACAAGGGA 5100
TATGTCAAGT CAAGATTGCC CAGACATTCT GGAATCTTCT AATACTTGCT TGCTGGGTTG 5160
TTATGGAGCC CTAGTTCTGG GAAGGTAAAG GCCAGAGCCG CTTCCGTCTA CACATAGCTA 5220
CTGGCCCCAA ACTCTTCTCT TTTTAATTCA CGATGAAGCA GGTTTGCTTT AGTTACCCCA 5280
AGAACTAAGT AGGTAAAACC 5300