EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-23309 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr9:59869540-59870630 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr9:59869853-59869871GCTTGCTTCCCTGCTTCC-6.31
LMX1BMA0703.2chr9:59869596-59869607GATTTAATTAA+6.02
Lhx3MA0135.1chr9:59869597-59869610ATTTAATTAATTT-6.07
Enhancer Sequence
CTGGTGAGTT ATCAAAATGT ATATACTAAA GCTTGGATCC TATCTGCAGA GTTTCTGATT 60
TAATTAATTT GGAGGTGTAG GCGGGGCCAC TGGAGGTATC GAAGTTTCCA AGGTGGTTCC 120
AGTTTGGAGT AAAGTTCGAT CCCGTTGCTT CAGGAGAGCT GAGACCCATA CGTTTAGAGT 180
GCCCATCCCA ACCTCTCCCC ACCCAGCCTT CAGCAGAGCG TTTCACAGTC TTCCCCTCCC 240
AGTAATTACC CTGTTTCTCC CCCACAAGTG TCCTCTGCTC CCTAGCGCCT GGCTGGCCTC 300
TTTCTGGAGA CTGGCTTGCT TCCCTGCTTC CCAACACACC AAGATGAAAC TTGTTCTGTG 360
TACTACTTCC ACTGCTGCAG CTTCCTCGGC CCATGTGTGG TAAGCCTTGT TTTCACACAG 420
GTACCTCTAC AACTCCCTAC CCCCCAGTTT TGAATTCCGA CAGTTTCTGA CTGAGGCTTA 480
GCAATAACCA GAAAATCAAA TTAGTAGAGC CTGCAGACTC CTCCTTTTCC ACTGTGTGGC 540
ATTTAATGGT TTACAAACTA AACCCACACA CATATTTCCC CTCAGCCCTC CACCTTCCAA 600
TTCTCATTTT CAGGTGAAGG AACTGAATTT AAAATACAGC CATATACCCT AAGCCACAGA 660
AGCTGGGGAT GTGACCCAAA GCTCCTTTTA GCGGTCCTCA TACAAGGCCT CAGAGCCACC 720
CATGAACTGT GTTGTCCAAA GTAGGCTGGT GACGGGACCT CACAGAACTT GAAACCTCTA 780
GCTAGTGCCG GTGTTTGACA TGGCAGCACT CCAGGGCCAC CCAGGCACAG TTGTGTGTAG 840
CTGGACAACC ACAGGGCAGG AGGCAATACC ACAGTGCTGA GGGAACAGGC CAGGGTTCAG 900
GGCAGCAGGG AAGGCCCCTG TCTAGATGCT GACAGAATTA TGTGGTTACT TAAAAACATC 960
TGTGGAGAAA GGTTGCCATG TGGTCACACA CATATGCATG CAACACACAC ACACACACAC 1020
ACACACACAC ACACACACAC ACACACAAAT TTATAGCAAC CTGCTTGGCA AAAATCAAAA 1080
CGTATCCCAC 1090