EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-23265 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr9:57958000-57964890 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 29             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr9:57964512-57964530GTGAGGAAGGAAGCAAAG+6.24
HES2MA0616.2chr9:57960780-57960790GGCACGTGCC+6.02
HES2MA0616.2chr9:57960780-57960790GGCACGTGCC-6.02
HES5MA0821.1chr9:57960779-57960791TGGCACGTGCCT-6.22
HES5MA0821.1chr9:57960779-57960791TGGCACGTGCCT+6.27
HES7MA0822.1chr9:57960779-57960791TGGCACGTGCCT+6.37
HES7MA0822.1chr9:57960779-57960791TGGCACGTGCCT-6.52
NFKB1MA0105.4chr9:57963174-57963187AGGGGAAGCCCCT+6.02
NFKB2MA0778.1chr9:57963174-57963187AGGGGAAGCCCCT+6.11
NFKB2MA0778.1chr9:57963174-57963187AGGGGAAGCCCCT-6.29
RELMA0101.1chr9:57962105-57962115GGGGATTTCC+6.02
RREB1MA0073.1chr9:57960687-57960707GGGGTGGGGGTGGGGGAGGG-6.27
SPICMA0687.1chr9:57958125-57958139TACTTCCTGATTTC-6.3
Stat4MA0518.1chr9:57962416-57962430CTTCCAGGAAGTGA+6.37
Stat6MA0520.1chr9:57960320-57960335TTGTTCCTCAGAAAT+6.19
TFAP2B(var.2)MA0812.1chr9:57963742-57963753TGCCTCAGGCT-6.14
TFAP2C(var.2)MA0814.1chr9:57963742-57963753TGCCTCAGGCT-6.32
ZNF263MA0528.1chr9:57964263-57964284GGAGGAGCTAGAGAGAGAGGG+6.32
ZNF263MA0528.1chr9:57964305-57964326GAAGGCAGAGGGAGAGGGGGG+6.35
ZNF263MA0528.1chr9:57960438-57960459GGGGGGGGGGGGGGAGGAGGG+6.38
ZNF263MA0528.1chr9:57961786-57961807TCTTTCTTTTCCTGCTCCTCT-6.48
ZNF263MA0528.1chr9:57960686-57960707GGGGGTGGGGGTGGGGGAGGG+6.49
ZNF263MA0528.1chr9:57961783-57961804CTTTCTTTCTTTTCCTGCTCC-6.63
ZNF263MA0528.1chr9:57964279-57964300GAGGGAGAGGGGGGTGGAGGG+6.81
ZNF263MA0528.1chr9:57960432-57960453GGAGCTGGGGGGGGGGGGGGA+6.94
ZNF263MA0528.1chr9:57964312-57964333GAGGGAGAGGGGGGAGGGAGA+7.31
ZNF740MA0753.2chr9:57960438-57960451GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr9:57960439-57960452GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr9:57960618-57960631CCGCCCCCCCCCC+6.64
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04598chr9:57958436-57964317E14.5_Brain
mSE_11618chr9:57960701-57961835Placenta
mSE_11618chr9:57961879-57966931Placenta
Enhancer Sequence
CTTTTTGGGT GCCCAGGGAG GTATGGACTC CGCCTCTGTC AGTCTGGCCC AGAGCAGCTT 60
CCATGACAGA AATCCCAGAG CCTGTGGAGA CACTACTTCC TCTCCTTGGT AGCTCTACAA 120
GTCTTTACTT CCTGATTTCT CCTTACCCGC CAGTTTCTTT CCTGGCTCCA TACCCTGCCT 180
CTACACTGTG TTCCTTCTGA GAGTTCCATT AGAACCCTGC TCTCTTCTGC CCCACCTATC 240
CTTGAGGCAT GGCTCAGCCA CCACCCTGAT GCCTGTGAGG AGGGCTTTAC ACGGACAAGT 300
TCCCATCCTT CCCCTCACCC AAGCCTCGTA GCTTCCCACT AGACTCCACT GCGCCCATTG 360
CTTGGCTGAG GACTACGAGG CCCAAGGAAG TTGGGGACTC TATCTGAGTT GTAACTGTGC 420
AGATGGAGCT GGGAACTGAG GTACAAAGCT ACAATCTTCT AAATCCTCCC CGAACCCCTG 480
TTCTGCAGTG GTCTGAGGCC TTGGGCCTCA TAGATATGGT GGGTTTGGAA AGTCACTGTC 540
CGTGCCTTCT ATCACCTCCC TGTGAATATC TGGGCATGTC TCCAAGGGCT GGACACACAG 600
ACACACCGTC TGCTGCTTGG GAAAGTGGAT AGAATGAAGG CATGTGTGGG TGGGTGGATG 660
GATGAATGGA TGCCACCTAT GTCAAGTGAG GTTGGACCAC AGTACCATAG GGGAGGCTGT 720
GCTGACCCTG GTAGGCCAAG CGTCATGGAG ACCAAAGCAT CCAGGCTGCC AGCTTTCCCT 780
GCTGCCTGCC TCCATCTGCT GTCAGAGTTG AATTAAATAT CAGTTTCACA CAGTGTTTTA 840
ATCTCACCTC ATACATCACA CATGCCATGT TCCCAGGCCT CTCACTCGTT TGGTAGAGAT 900
TGTGCTCTGG AGTCTGTACA GAGACGAAGC CAGGAGGCAC CGGTCTATAT GTAGGGGGCA 960
TGTGTGCTTC TCATGTGTGT GTGCTTCTTA TGGACTTGTC TTTGGGAGAG GACACGGTGT 1020
GGTTTTGCAC ACACATAATC ACTATGTGCA TGTGTGCTCC TGGGTCCCTA AACACCTGTG 1080
AAGGTGATTG CTGGGGATGA CAGGTGGGTA CATGCACGGT TCCCTGGAGC TGGGCTTCTA 1140
CTGGCTAAGA GGACTTCAGA AACAGGCACC TCTTTCCTCT CCATTTTCCC CAACTGGACT 1200
TTTTCTGTCT CTCTCTGTCT ATCTATCTCT ATCTTTCTGT CTGTCTCTCT CATACACACT 1260
TACATGCAGA TACTCTCTCT CTTTCTCTCT CTCTCTTTCA CACACACACA CACACACACA 1320
CACACACACA CACACACACA CATACACACA GAGGCACCCA GGAGGTGTGA GTCAGCACCA 1380
ATCCTTGCCT GTGGGTGTGG GGAGAGGCAG AGAGGAGGCG AGGAGGCGGG CCAGCAGGGC 1440
CATCTGCTCT GTTCCCTTAC AAAAATCTGC TAATGGTGCC ACTTCCCAGA CTAGTACCAA 1500
TACTGGCCCT CTCTACCCTG CGGTGGTGTG GTATCTGACT CGGGGATAGC GGAACTCACA 1560
AGTCCATAGC ATTTCTCATT GGGGAGACCA GCCAGGCAAG AAGTAGCAAT CTTGTTTTCT 1620
AGGTGCAGAA ACGGAGGCCT GAACTATGTC TTGTTCAGCG CAGATTCTTC TGTGCACTCA 1680
TTGCTAGAAC AGCAAGCTTC CTTTAAATGC CTGCTGCAGG GCATGCTGGA CTGTATACCA 1740
CTCAGATCTT CCCAGCAACA GTGGACATGG GAGTTGTTCT CATCCATTTC ACAGGTGGGG 1800
AAGCAGAGGC TGAGAAAATC CTGTAACTTA AACAAGGTGG GGGTGCTGCT AGATAAACTT 1860
GCATCCAGGT CATTCTGATC CATGTGCCTG CTGGTCACCA GAAGCTGGCT GCTCTGTCCA 1920
CCTAGCTGAT AAAGCAGGGG CCCCCACGAC AAGATTCCAA GGGCCTATAG AGACAGTTTA 1980
AAGATCAGGC AGTGTGGAGG CAGAGCCACA GGCTTATGCA GGGACATAAA TGTGGGACCC 2040
CTACAACTGA TGCTTACCAA GGAGAGCAGG TGGTCGACAG GCCATTATGG GGCCAGTCAG 2100
CCCCTGGCTC CTCCCCATGG TTGTGTGTCC TTCCCTTAGG GTACGAGAGT ATGTGTGTGT 2160
GTGTTGGGGG AGGGCTTGGA AATACTCTGC CCTATCCTCC CCAGGGCCAG AACTGGCTAC 2220
TCCACTGCTC TGCCAGCCGC AGCCTCACCA CCATAGAGAC AGGCTACACC CCTCCCTGTG 2280
TGGGTGACAG TGCTCTCTGA GAACGCCTTG ACAGTTGCCT TTGTTCCTCA GAAATAAAAG 2340
AAAATCGAGG TACAAAGGGA AACCTCAGGT AGCTTTTAGC AGGGCTCAGC TGCCTGGGGC 2400
AGACTGTGTT TAAGCTAGAG GCACTTGTCA CTGGAGCTGG GGGGGGGGGG GGAGGAGGGC 2460
ACCTCAGACC CCGCCCAGTC CCTATGTGGT AAGAGGGGTG GGAGGGTGGA TGGCCCCATC 2520
ATCACGTTTA CTCAAGAAAA AAGCTCTTTC AAATAATGGC AAAGGAGAGA AAAAAAAATC 2580
AATGAAAATT GATAGGGAAA TGTAAAACAG GGCTCTCCCC GCCCCCCCCC CGCCCTCGTG 2640
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTAGA GAGAGAGGGG GTGGGGGTGG 2700
GGGAGGGGCA TTTACCAGGG CCTAAACTGA CCAGCTTGGG GCTCCAGGCC CGGAAAGGTG 2760
GGGGCTGGGA GTCAATCCCT GGCACGTGCC TGCAGAAAGG GGCTGGTGGC TGGGGGGAGG 2820
GGTGGCAGCT GAGTCTCTAA CTCGAGTTAA GAGAGAGATT AATATATTCA ATCTGCTCCA 2880
GGGTAATTGA GGGAACAATT GGAGTGTTTT TCTAAAGCCC ATAAAACTGC CTCATTTGCA 2940
AGGAAGAAGC TGCCCCTGCT GCAGGCCGCA GATTTGATGG AGGCAAGACA GCAGAGAAGG 3000
GACAGCTTGG GGATCCCGGT CCAGAGCAGA TTCTCCGAGA GTCAGCCATA TCAGCCAGGG 3060
AAGGGGCTGG CAGCTCTGTT CTAACCTGCG CTCTCCTTCT GCACCTCCAA CCACTTCCTA 3120
TTTGTAGTCC TGCACCTATC TCCCAACCTG TGAAATGGGC CACTGCGTTC CTCTCTACCA 3180
GGACCGTAGC AGGTGGAAGC TTTGAAAGAC CAGAGAAGCA GGTCGGCACG GAAGGACGGG 3240
GGACAACAAA GAGGTGCCCA GGCCTCCCTC CCCACCCTTC CAGGCCAGCC CCCTGAGAGT 3300
GAATGGGCAG TAAAGAGTGG AGTTAATGAA ATCCGTATCG TGCGCCTCTC CCCCTTGAAC 3360
CACTCTAGTC TCCAGGGCAA TGGGAATAAA GCACGCAATA GCGAGCAATA AAAGGCATAA 3420
TGAATTTAAA AGCAGCCAGG AGAGGGAGAG TGAAGACTGG CAGCGCTCCG GCCGAAGCTG 3480
GAGGGTTCCC GGGGCGGCGA AAGTGCAGAC CTGCCGCTCT AGCCAGAATC GCGACCAGGA 3540
AGAAACAGGC AGGATGGGGG TGGGGAGAGA GAGGGAACAA AGGGAAAGGC AAAGGGTTAC 3600
CACCAAGGTG TAGGGACAGA GGGTGGAGGT GAGCTAGCCA CTCCGCCCTC TCCTCGGCAC 3660
TTGGTTCTCC TCCACTTCTT AATAAAAGCC CCCACCTTCT TAGTGCCAGA GCTACAGTTA 3720
GAAGCCACAG GCTTCGAGCC AGGTGCTTCT CATTTAGTGA TTGCTTTGTT AGCTTTCTTC 3780
TTTCTTTCTT TCTTTTCCTG CTCCTCTGGG GCAAAAATAA ATAAATAAAT GAAAAGGTGT 3840
TTTAAATGGA AGAAATAAAA AAAAATTAAA AGCGTCTTTT AAAAGGCTCC AGGGAAACAG 3900
AATCATTTCC ATGAAACAAA ACCATGATTG TTTGGAAGAG GTACTGCGGG GTCGATCTCA 3960
TCACACCCTC CTCCCTCTTC CACAGGAACC TGGACCGCAG GGTCTTGCGG GAGGAAATTA 4020
CGGTTCAAAA TCGCAGGAAT CCCCAAGGTG GCCCCCGGAA CTATGAGCAA GGAATTCAAT 4080
TCATGTTTCC AGAAACTCCT TACCTGGGGA TTTCCAGTTC AAAGTTTCCC TCTTCAACAG 4140
CTCTGCCTGT GGGAAGATGT CCCTCAACTA GTGACCTTTG AGGGCAGAAT GGCTCAGGGA 4200
CTGAAGACAC CGGTCCTCTT TTCCCTCCCC AACCTCACCA GGAGACACAG TAGGGTATTT 4260
GGGAGGGGGG AGCTGGTCAT AGCTCAGGCT TGCCTGCACT TTCTACTCTT CTCCCCCAGG 4320
TCCCTCTTCC CAGCACTGTA CAGACCACCT GCTTCCTCTC TGATCACTGA ACCATCTTTT 4380
AGACAAAGAC AGAGGATTAG TTGTGTGATC TCAAAGCTTC CAGGAAGTGA ATACAGGTAG 4440
TATCAGGAAA GGGCAGGCTT CTAAGGAAGC CCCTGTGCCC CAGGGGAGGA TGACAGCCGT 4500
TGGCTGCAGG GAACTTGGGG TAGCTCCTGC CAGTGTGCTC CTAGGGTCCT CCTTGGTGAA 4560
TCAGGGCACC CCTGAGGGAC CTCCACCCTC AGTCTCTGGC TGCTCCTGTT GGAAATAGTC 4620
TCGGGAACAG TTCCTGCTAA CCGCCCCCAC CCCCTGGAAA ATATTAGCTC AGAGCAACAA 4680
CATTTGGTGT GGCCATTTAG AACCAAGGGC ACCATGGCTA GGAAGCAAAA GGATTCAGAC 4740
TCAGTCAGCA GACATGGATA CTTAGCCCTT TTCCCTGTAG CCCAGTTAGA TGCCTGCCTG 4800
CCCTTCATCT TCTTGTTCTA TTGCCCCACC CCATGACCTT TAACTGTTAT GCTTGGGAGA 4860
AAATGTCACA CACCATGTAA AGCAAAAAGC ACTCTTGAAA CCAAAGTCCT ACACTGAACC 4920
AGTTGTTGAG CCGTCTGGTG CCAGCAGGGC TGAGAACAGG GTTGAATGGA TGAACCCTGT 4980
GCTGGGGAAA GCTTCCTGGA GGAAATGCCT TTGAATTGAA GCTTTTGCTC CTGGAGCCCA 5040
GAAATTTGTT CTTGGGCTTG AACTGAATGT TGCCGAGGTT GCTCTGGAGC CCCAAAATGA 5100
AGTTCTCTCT TGTCCCTTTT ATTCCCCCTG TTCACTGCCT TCCTCTCTCC TCTTCAGCTG 5160
TCAACCAGAA AGCCAGGGGA AGCCCCTCTC TCCTGGGGAA TGTCCTTTTC TTATGAAATA 5220
CTCTTATCTG GACTTCCTGT CCCTATCCAC AAGGCAGGGA GACAATATGA CTGCTGGGGC 5280
TCCTATAGTT CCAGGATACA GGTCCAAAGA GCAATAGAGC CCCACTAGCC CTTTGTGTCC 5340
TGCCACCGCC CCCAGGTATC TATAGGGACA GGAGCTTGCT CTCCTTAGCC TGAGCTGCTG 5400
GGCTGAGTCT GTCTAACTAC AAGCACCCTT CCCTTGTTCA CAGGGAAGCC TCCATTGTCT 5460
GTGGCTCTGG CACTGCCATC AGGGCTGTGA TTGCTGACCC CTCCCATCCC CCCTAAGGGG 5520
TGTGATTTTC CTCTCCCCTG AAAGCTATTT TCTTGTCTCG GTAGAAGCAG ACATCTGACA 5580
CTTTAAGAGG GAGTATGGCG CAGAGATGAT AGCTTTAAAT AACAGAAATT AGAGCTGCTG 5640
AGGTCGACTG CAGCCATCGC GCCAGCCCTC CTCCCCGCAG CAGTTCCCAA CCTCCTTTCA 5700
CCCATTTTAC ACTGTAGCCT GAGTACACCA TCCACATCCA TGTGCCTCAG GCTGGCCAGG 5760
CCAGGGAGAC CCAAAGAGCA GGGACAGTTC CTGAGTTCTT GACCTCCTCC AGAGTGTCTG 5820
TCCCTAGATG ATAGCATTAG ACAGAGGAGC TGGGCCCAGG CTAGGAGCAC AGGGAGTTTC 5880
AGCCTCACCT AGACTGTCCA TCTCGTCCAT ACACTTAGCC TCCAGAACGG ATTGGGGCTG 5940
AGCACAGGAG TAGGTCAGAA AGGTGTGTTC ATTGATTGAG AAATGAATGG ACAAAGGTCA 6000
GAGTGGGCCA TGTTAGAGGC CTGGATGAGA GCATTGCTTC TGGGTCCCTG TCACATGCTG 6060
CCTGCTTACT TTGCATACAA TCCTGTCCTT ACAGGCCCCT CCCACACCTC ACCTTTTGCC 6120
TCCAGAATTG AATACCTCCC TCTGCTCGGT GCCAGGATAG CTTCAGCTCC TCCCACTTCT 6180
TTCCCTATTG AACCTCTCCA TGACCTAACT CAGTTTCCCT CCCTGCCTCT ACTCAGTGCC 6240
AGGCAAGAAA AGTGTGTGGG CGGGGAGGAG CTAGAGAGAG AGGGAGAGGG GGGTGGAGGG 6300
AGAGAGAAGG CAGAGGGAGA GGGGGGAGGG AGAGAGAGCA AGCTCTGAGC TCCATCTCAA 6360
CTCGTCCCTC TGCTGCCCGC TGACTGAGCC ACCTTCTTCT CTTTGCTAGC TTATACTAGA 6420
CCTCACCCAT GGAACCTTCT CCAAATTGCT ACCCGTAAAC CTCACTCACC TAGTCTGAAA 6480
GACAAATACA GGATGGAGGA GCCCGTAAAT GAGTGAGGAA GGAAGCAAAG AGCCCTTTCA 6540
AAATGACACA TCTTCTGAGA AAGCCTGTCC TGGGCTTACA CCCTGACCCC TTTCAGAGCC 6600
TTCATGACAG TGTCAAGGAC TGTGTGTAAT ACCAATATTT TATCCAAATG TATTGGCTCT 6660
AGTGACATTC CATACTTAGT GGCTGTCCTG GCATTGGGTA CCACACGCTA CTATGTATGT 6720
CCTGAGGTTT CCAGTAACTG TTGACATTTC GTGGAACCTA GAATCCTGAG GTGTGTTTTC 6780
TCCATCTGTG CAATGAACTA CTGCTTGCTC TGTGAGTTCT CAATTGGATG TGATGCCTAA 6840
ATGAGAGAGA ACGTAGTAGG GAACCCTCCC ACAGAAGGGC TGGTGCCCCT 6890