EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-23114 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr9:47712130-47713670 
Target genes
Number: 1             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LEF1MA0768.1chr9:47713013-47713028AGAGATGAAAGGGTT+6.2
RFX1MA0509.2chr9:47712736-47712752GGTTGCCATGGCAATC-6.01
RFX2MA0600.2chr9:47712736-47712752GGTTGCCATGGCAATC-6.68
RFX2MA0600.2chr9:47712736-47712752GGTTGCCATGGCAATC+6.73
RFX3MA0798.1chr9:47712736-47712752GGTTGCCATGGCAATC+6.82
RFX3MA0798.1chr9:47712736-47712752GGTTGCCATGGCAATC-7.15
RFX4MA0799.1chr9:47712736-47712752GGTTGCCATGGCAATC+6.06
RFX4MA0799.1chr9:47712736-47712752GGTTGCCATGGCAATC-6.8
RFX5MA0510.2chr9:47712736-47712752GGTTGCCATGGCAATC-7.14
RFX5MA0510.2chr9:47712736-47712752GGTTGCCATGGCAATC+7.1
RREB1MA0073.1chr9:47712462-47712482TGTGGTGTGGTGTGGTGTGG-6.09
RREB1MA0073.1chr9:47712467-47712487TGTGGTGTGGTGTGGTGTGG-6.09
RREB1MA0073.1chr9:47712472-47712492TGTGGTGTGGTGTGGTGTGG-6.09
RREB1MA0073.1chr9:47712477-47712497TGTGGTGTGGTGTGGTGTGG-6.09
RREB1MA0073.1chr9:47712866-47712886TGTGTGTGTGTGTGTGGGGG-6.95
Enhancer Sequence
CCGAGAGAAG CATCACTGGG GCTGCTTTCT CTTCCAGCCT CCGAAGCCAC CAACGGAGAG 60
GGCTGCCCAG AAGGGGACCT GCCCTTGGCA TCTCTTCCTG AAAGCTTGGT TAAGGTTTAA 120
CAGGACAAGG GGGAGCGTGA GGAATATCAA AATTCTTGCC AGTGCTGAGC AAAGAAAACT 180
TTGTCTGTTT GTCTGTTTGT CTGTCTGTCT GTCTGCTTGT CTGTAGAGCT GGGTTTGCTC 240
TAGGATCGGC CTGAGTGTGT TAGGCATATG CATATGCGCA AACATGAACG TGTTGTGTGT 300
GTGTGTCTGT GTGTCTGTGT GTCTGTGCGT GGTGTGGTGT GGTGTGGTGT GGTGTGGTGT 360
GGTGTGGTGT GCACTCTGGC CTCCCTGGCT GTGCTTGGAT GCTAAGGTTC CTAAGTGAGG 420
CTGTGTGCCC ACCCCTTGGA AGGCTACATG CTAATGAGTG AAGCATTACA ATGCTGCTCC 480
CCAGGGCCCT GAGCCCAGGA TCACATCTCC ATTAATACAC CCCTGGAGTT CATTGTGATT 540
GGCATCGCTA CAATAAACAG TAAATGAGTG AATAATAATT GGCCATCTAT TTGACAGTGT 600
TTCTGAGGTT GCCATGGCAA TCACACCTTT TATTAAGCTT TATTAAGCTG CAGCACAGGG 660
AGTGAGGAGG AGGTGGCCCC AGTACACTGG GCAGCTGCAT TGAAGTCTGA CCTGCTCAGT 720
GACCTTTGAG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGGGGGTACC TGTAGGTGCA GTTACTGGGT 780
CTTGTCTGGG GACACCTCCT TTTCACTGAT GAAAAAAAGA AAAAAAATCC CCCAAACAAT 840
TACCTTCTGT GGGTTTTTGG GAGGGACTAT TTAATGCCTA ACTAGAGATG AAAGGGTTTC 900
TGTCTTCCTT CTTCAAATGT CTGAGAAGTG AAGACTGAAG TGCAGGGACT AAACAATGCT 960
ACTATATGTT TGCCCTGAGC ATTTCCCCCT GAACCACAGT AACAAATAAA CTAAGGCCAA 1020
ACCTGGAAAT CAGAACAATG ACAGAAGTCA CTCAGAGTCG GTGCTGTAAT CCGTCCTGCC 1080
TTGAGTGTGC AGGCTCCACC GCTCTCTCTG TCAGTAAGTT CTGCATCCCT CTCTGCACAG 1140
GCCAGATCCC TGGCATTCCT GTCCACCAGG AGCAAGACCT TGTAACGTCA GCATCATTTG 1200
CACACACAGA AGGAAGGAGC ACACCTGCAC ACAGGGACAA CACCATACCC AACCCCTGCT 1260
TCACACACTT CACAGAAAAT TGGAGCAGGG ACTTCTATGT TTGATTGAGG CTCTGACCTT 1320
CCTTAATTCT TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGCA CACGCGCGCA 1380
TGCACGTGCG TGTATCTGTA TGCCTATCTG TCCCTTTGTC TGTCTGTGTC TCTCTGTCTC 1440
TGTCTTTCTC TCTGAATTAC TGTACTTGTG CAAAGGTCAG AGGAGGTTGT CAGGTGTCTA 1500
TCATTCCCCA CCTTATTCCT TTGGGACAAG ATTCATTACT 1540