EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-22637 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr8:129258690-129261200 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr8:129260912-129260929GATGATTAATTAATGTG-6.13
Alx4MA0853.1chr8:129260912-129260929GATGATTAATTAATGTG-6.79
HNF1AMA0046.2chr8:129258794-129258809GGTTAATAATTTATT-6.67
HNF1BMA0153.2chr8:129258795-129258808GTTAATAATTTAT+6.11
Lhx3MA0135.1chr8:129260915-129260928GATTAATTAATGT-6.03
MEF2AMA0052.3chr8:129259304-129259316TTTATTTTTAGA-6.07
MEF2CMA0497.1chr8:129259303-129259318ATTTATTTTTAGATC-6.13
POU4F1MA0790.1chr8:129260913-129260927ATGATTAATTAATG+6.04
POU6F1MA0628.1chr8:129260916-129260926ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr8:129260916-129260926ATTAATTAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr8:129258709-129258729CCCCACCTCACCCCATCCCA+6.3
RREB1MA0073.1chr8:129259128-129259148GGGGATGGGGTGGGGTGGGG-7.15
ZNF143MA0088.2chr8:129260232-129260248TTCCCACAATGCTCCT+6
ZNF263MA0528.1chr8:129260364-129260385TCCTCTTCCTCCTTCAGCTCC-6.08
ZNF263MA0528.1chr8:129260352-129260373TCCTCTCTCCCCTCCTCTTCC-7.23
ZNF263MA0528.1chr8:129260355-129260376TCTCTCCCCTCCTCTTCCTCC-7.81
ZNF263MA0528.1chr8:129260349-129260370CCCTCCTCTCTCCCCTCCTCT-8.27
ZNF263MA0528.1chr8:129260358-129260379CTCCCCTCCTCTTCCTCCTTC-9.3
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_07360chr8:129258457-129266168Intestine
mSE_09989chr8:129257449-129261190MEF
Enhancer Sequence
CTCCCTAGCC ATCTCAACAC CCCACCTCAC CCCATCCCAC CCCTGATTGT TTTTAAGTAG 60
TACCAAGCAG GCGCTCCCTA CAGCAACCAA AATATCCTGA CTCAGGTTAA TAATTTATTG 120
CCTCCCACAG TGGAAACATA AATAAGACCA GCTTCTAGTC CTATTTGGGT TTGCTCTGGC 180
CTGTGGGTCA TTCACCCATG TGTGGTGAGC GTACATGTAG TCCTGTATGC TCCACTCTGG 240
ATACTGCCCT CGACAACAGA CTATCCTGGT GACAGCCAAG TGGACAAAAC CTTTTGTGGT 300
TGTGTGGATG AGGATGCTTC CTATATGGGG GCACTAACCC TGGGCTCTGA AGAGCAGCCA 360
GAAGCCACGG AGAAAGCAGG GAGGGAGCAT GCCCAGTGGG AAGAGAAGCC TATAGCTGCC 420
AGCAAGCAGG GAGACCTGGG GGATGGGGTG GGGTGGGGTT AGAACCAGCC CTCAGCAGGC 480
CACATGCCTG GAAGAAACCA CACTACTGTG GAGACAGTTG TCAGGCAGTG CTGTCCGACT 540
GAAATATGAC ACCCATCACA TAGATGGCAT TTTCTAGTAG CCATGTTTAT AAAGGTCAAA 600
ACGCACAGGT GCAATTTATT TTTAGATCAT ATTTTACTGG AACACACTTC CTCTGGAATA 660
TTATTGCTTG AACAGGTGAG ACCGCTCACT TTTTTTTTTT TCTAAAGGAA CTCTTCGAAA 720
TCCACCCTGC GGCTGGCACA GTTGTCCAGC TCCATTTGGT GCGGCTGTGA TTCAACTGCT 780
CTGAGTCACG TGGGCTCGAG GCTGCCACGT CTGGCTGCAC AAGCCCATAT GTGGTTGTAC 840
GTCATGAATA GTAACCTCTC CTCCAGCTCA GGGTCCAAAA GAGAGGTCAG GCCAACGGGA 900
AGGGAAGGGG CTAAAGATCC ACAAAGGAGG TAAAGCCTCC CACCTCCTCC AAGAGAGAGC 960
AGATTGGGCA ACCCGGCTCT CTAACCAGGG CAGGACAGGA GATGGAGACA GCGGTCCCCT 1020
TCCCCCACAG TCCCAAGGGT GTCAGTGTGA ATAGTGTAAC CAAGAAACAG AGCCCTGAGG 1080
AACATTTGCT AAATTCTGCC AAGTGCCTGG ACACCAGATC ACAAGGCTGA CCCAGAAAAG 1140
AGCAATTGTA CCTGCAGGGG AGGCAGGGCA GGCGAGGCCA CCCCGGGTCA GCAGGCGCCT 1200
CCCACACTGC CAGGGAGGCG TGCCGGTGGT GGCCTAATGT GGAAATGTTT GAATGTGGGG 1260
CAGCGAGGCA CTTGGGCTGG CTGGAGTCAG CCAGGGTGAC AGGAACCAGT CATGCTGGGG 1320
CGGGACGATG GAGAAAGCTT GCCAAGACCC CGACAACATC TTTCCTAATA AGTCTGGCAG 1380
GCTCCAGGCC TTGGTCCCCC TCTGAACGAC CTCTCCCTTC CACTCCGGTC TTCTCCAAGG 1440
AGGAAGGAGA GCGAGCCAAA CAGAGCAGGA ATTTGGACCC AGGCCTGGCT TTCCCCTCAC 1500
GGGGCTCTGC AGCTACTCCA GTGCAGAGTG GATGAAGGCC TTTTCCCACA ATGCTCCTCT 1560
GGACACTTGA CTGCGCTGGC CACACTCCAT CTGCAACCTG GGCACAACCT GGGCTCAACT 1620
GTTGCAGCCC CGTGCCAGGA GAGACCCTTA TGGAAACACC CCTCCTCTCT CCCCTCCTCT 1680
TCCTCCTTCA GCTCCCTGGG CAGAAGCCTC CACCTCATTT TAGGAGGCCC CTCCCTGCAG 1740
TGGGAGCCTG GAGCCACCCT GCTGGCTGTG GATCCTGGCT GCTGGGCCTG CTTGCTCAGG 1800
AGAGGTTTGC TAAGTCGGAT GTCCCAGCCC CACTCAAAGG ACAGGCACAA TGACAACATG 1860
TGTGTTTGGG TCGGGACACT TTGAACTATG ATTCCCAGAA AGAACAGCTT GTACAGCCAC 1920
TCCGAGTCTC CCAGCAACAA AGAATGTACC GTAGATTAGG CCTGGCTTGC AAAACATTTT 1980
TTTTTTTAAA GAGGCACAGC CCAGTCCTTT TATAGGGTCC TGGAACAACG GTGGCTGAGT 2040
TAAAAAGCAC AGAACAGCAG CGTCACCCAC TGTCAATACT TCGTGACCTC CCTCGGCTCA 2100
TCAGTTCTCC TAAGGTTGGC TTTTTCCCCG AGTCTCTAGA CCCGGGTGTT GGTGAAGGTC 2160
AGCTGCAAAT GGATGAGACC TTTAGGAGGA GGTGACCAAG AATAATTTGC TCAAAGTCTG 2220
TAGATGATTA ATTAATGTGC TTCTGTTAAG CATAGTTAAT CTTTACTCGG AACAGTCGCT 2280
GATAAGGGAG AGCTTGGGGG AAAAATGAGT ACGTTAACCA TTAATCCTGG GAAACACCAT 2340
AAAAATTAGG ATGGAAAACC GTGGATCTGG GAGAGGAATT AGGAGGCTAG AGGGGTCAGC 2400
CAGAGGAACC TGACCATGCA AGGAGGTGCA CAGAAAGCTG GATGGGAGAC CTTAAAGTTC 2460
ATGCATGCTC AGAGCTGGGG ACATGCATTT GTGTTTATAT GCTCGTGTGT 2510