EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-21942 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr8:87182620-87185220 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr8:87182742-87182754AAACAAACAAAC-6.32
HNF4GMA0484.1chr8:87184875-87184890CAGGTTCAAAGTTCA+6.53
Hnf4aMA0114.3chr8:87184876-87184892AGGTTCAAAGTTCAGT+6.82
Nr5a2MA0505.1chr8:87182659-87182674AAGTTCAAGGCCAGC+8.42
RXRBMA0855.1chr8:87184876-87184890AGGTTCAAAGTTCA+6.63
RXRGMA0856.1chr8:87184876-87184890AGGTTCAAAGTTCA+6.67
RxraMA0512.2chr8:87184876-87184890AGGTTCAAAGTTCA+6.55
SMAD3MA0795.1chr8:87184063-87184073CGTCTAGACA+6.02
Number of super-enhancer constituents: 11             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00413chr8:87183683-87188381pro-B_Cells
mSE_03414chr8:87183660-87187212Bone_Marrow
mSE_04947chr8:87182845-87190074E14.5_Heart
mSE_05527chr8:87183459-87189917E14.5_Limb
mSE_06569chr8:87183492-87190001E14.5_Liver
mSE_06917chr8:87182849-87189177Heart
mSE_07264chr8:87183114-87189546Intestine
mSE_08750chr8:87183516-87187934Liver
mSE_09043chr8:87183347-87189642Lung
mSE_10028chr8:87179809-87188012Embryonic_stem_cells
mSE_12064chr8:87183466-87189579Spleen
Enhancer Sequence
CTCCTACCTC TGCCTAACTT GTGAAGCAGG CGGATTTCTA AGTTCAAGGC CAGCATGGTC 60
TACAGAGTGA GTTCCAGGAC AGCTAGGGCT GCACAGAGAG AAACCCTATC TCAAAAAAAT 120
CAAAACAAAC AAACAAAAGG ATTTAAAAGC AGACATTTAT ACAGACACTT GAACACTCAT 180
GCCTGTAGCA CATTCTCAAT CAATATTTAG GTCGCAGTAG AGATGACCTA AATATTCACC 240
AGCAGGTAGA TGGGTAATGA ATGTGGACCT TATACATAAG AGTACTATGA AGATACAGGA 300
GAAGTAAGTG ATTCTTTCAT GTACTACAGC ATTGATGAAC CTGGCAGACA TGATTCAGAC 360
AGGAAGAAGC CTGACATAAG CCAGTTACAT GGTGAGTGCT TCCATTCTCT TGAGCTGTCT 420
ACAACAGGCA AGACACAAAG TAGACTCTCG GTGGCTGAAG GCTGGGGAGA GGAAGGAAAG 480
AGTGTTATCT GGGTTAGGAG ACTTTGAAAC AGTAATGGTA GTGATTCTAT CCATTTAGAA 540
TTGCACAATT TGGATTTGAG TGGAGATGGG TCAGTCAACA GTGTTTGCAT ATTGGTGGGC 600
CTGCATCCCA GTCCCATTCC TAGACAGAGC ACTTTAATCA AGGGAGGCAG AAGCCCCAGC 660
TCAGGGTCAT CCATCCTAAA GTTGTAGAAT AGCCTGGGGC ACAGGAGACA GTATTTCCCA 720
GTATGCACAC ATACACCTCC ACAGTAAATA CAAAGAGTCT CTATTGAAAC CCAAGAGCTG 780
ATTCCAGACC TTGTATACAC TGTTTTGGAT TTTTTTTTTT TTTTTTTTAA GATGGAACCC 840
GGGCTTCAGC GCCTCCCTTA TCAGCACTGC TGGCTTCTGA TTCAAGGCTG TTTATTGATT 900
CAGTAATTTT TCCCAGGACG CTTTGGAAGC TAGCAGTTCT TCTCAAACTG TAAGCTTTAC 960
CCACCCATCA TTCCCTCAGT AATAAGGTGT CTTCGAGGTC CCACGGAATC TAAGTTGGCT 1020
TCAAACTATA GAGTTAAGAA TGATCTTAAA CTTCCGGGGG GGGGGAGCGC ACCACATCCA 1080
CCCTATTTAA TTCTGTTTAA TTATGAGACA GATTCGTGTG TAGCCCGGGC TGGACTTGAA 1140
TTTACTAATC CTCCTGCTTC AGCTTCTCAA GTGCTGGGAG TCCAGGCTGT GACTGTGACA 1200
GTTTTTCATG TAGCTCATCA CCCCTGCGAG AATGCGTGCA GGAGCTGAAG ACTTGCTTTC 1260
AGTCCTCATC CTACAGTGAC TGCGGCACCG GAAGTCCTGG TATGGGTTGA ACAAACCACC 1320
TCCCTGGGAA GGAAGGGCCC CACGGTTCCT GGGACAGGAT GTACACCGAG GCCCCCTCCC 1380
TAGCCACCAG GGACTTCCCA GGCCTGGCCA CGTTTCTGTG TCCAAGTTCC ACGAGAACTC 1440
GAGCGTCTAG ACAAAGTGGG CAGCGCTAGG GATCTTCCAC GTTTTCAAGA AAATATCAGT 1500
TCTGGTAGAG GCTCGGCTGG GTCTCCTGGG AGTGCAGAAC CCTTACTTTC TAGGAGGGAG 1560
AAGCTGGGGG CTGGGACTTT CTAGGAGCAA TCCCCTCCCT CCAGCTCTCC GCCCTAGGGT 1620
CAAAAGAGGC CGGAGGAGGC GGGGACTGCT GTCGGGCGCT TTCCTTGAGC TTCCTGCACC 1680
TGCGGTTCCT TTGTCCTTAG AGCCTGGAGC TCCCTCCTAC CCTCGTTCCC AGGTTATGCC 1740
TAAAGCATGT CGGAAACCAA AGTGAGAGAA ATTCTCTCTG GTTGGATAAC CCGCAGCTGG 1800
ATGGGAAAGT AGCCTGGCTT CTTGGAGAGC CACGTGCCTC TGCTTTCCTC TTTCTGGGAT 1860
TTAAAGGTGC GCAGCACCCT GCCCGATTTA AAAAACCAAA AAACATTTAG GGACTTGCTG 1920
TTTCTTGAGC TGGTCTACCC ACGAAACCCC GTTGAATTAA ACGTGAAACA CCAGCGTTAA 1980
CACTGTTAAA ACCTAAGTGT TCTGAGGAAG CGGTTTATAG GTTCATTTAT TTCGTTTTTT 2040
TACGAGATAG GGTTTCTTGT GTAGCCTTGG CTGTCCTGGA ACTCGTTCTG TAGACCAGGA 2100
TGGCCTCGAA CCTTCTACTT CTGCCTCCCC AGTGATAGCA TTGAGGGCTT TAGGCATTAT 2160
GCTCGTCTTA GGGATATTTC ATAGACAGGT AACTTAAGTT AGCACTCAAT TATCTGCCTG 2220
AGCCACACTA AAGAAATCGT GTAAGGGGCT GAACGCAGGT TCAAAGTTCA GTCACCGCCA 2280
CTCTACCCGT GGGGGCCCTA CGCAATTCCG GTCGAGGGGG AGAAACGCCA TCATTTAAAA 2340
TTCCTCAGCT CTTCTTGAAA CACTGCACCC AATACCCCCC TCCCCAATTG TAAACTAAGC 2400
TTTCCACACA CTATTCCCCC AGAGTTTGTT AATTTCTAAG GCACTCCCAA ATTACAGGGC 2460
TAGCTTAAGC AGGTAAACTT GTGGCAAAGA AATGGGGCCC GGCCTCCCTC TGGCTCCGCA 2520
CCCAGTCAAA CCAGTTCCGG AGGCTTAGGG AGCGGCTGAC CCCTTAACCC CACCCCTCCC 2580
CCACCAGGGA AGCAAGCCAG 2600