EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-20903 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr7:119605200-119607920 
Target genes
Number: 7             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr7:119605365-119605377GTTTGTTTGTTT+6.32
Gata4MA0482.1chr7:119607482-119607493TCTTATCTCCC+6.62
HNF4GMA0484.1chr7:119607443-119607458TGAACTTTGGTCCTC-6.21
NR2C2MA0504.1chr7:119607206-119607221GGAGGTCAGAGGTCA+8.03
Nr2f6MA0677.1chr7:119607207-119607221GAGGTCAGAGGTCA+7.42
RARA(var.2)MA0730.1chr7:119606814-119606831GGGTCACCCCAGGGTCA+7
RARAMA0729.1chr7:119607440-119607458GATTGAACTTTGGTCCTC-6
RXRBMA0855.1chr7:119607207-119607221GAGGTCAGAGGTCA+6.84
RXRGMA0856.1chr7:119607207-119607221GAGGTCAGAGGTCA+6.91
Rarb(var.2)MA0858.1chr7:119606814-119606831GGGTCACCCCAGGGTCA+6.07
RxraMA0512.2chr7:119607207-119607221GAGGTCAGAGGTCA+6.88
SOX10MA0442.2chr7:119607290-119607301TGCTTTGTTTT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_09384chr7:119605961-119607256MEF
Enhancer Sequence
AGCCTCACAG GAGACAGCTA TATCAGGGTC CTTTCTGTTG TTAATGTTAT TATTGAGACA 60
TGGCCTCACT CTGTAGCCCA GGCTACCCTG GAACTTGTAA TTCTCCTGTC TCCTCTAAAA 120
CTGCACACAC ACAAACACAC ACACACATAT ATATTTCTGT TTGTTGTTTG TTTGTTTCTG 180
TATGTAAGCC TCCTGCATGC TGGGACTGCA GGTGCACACT GCCACACCTG GTTCACTATT 240
GTCTGTCACC TTTACTAACT CACTGACCGA AAGAATTGTA TCTTATTCTT TTGATTTAAA 300
TTTTACCAGA GAAGTTCAGT GAGGGGAAAA GAACTTTGTC TTGTTTTTAT TTACCCACAG 360
CCACAATGTA AATCACTTCT GTGGTGGGTC CCACAGAGCT TGTTTAGATC ATGGTGGCTT 420
GCTTGGGGCT GCGAAGGTCT AGTCCTGTGG CATCGGATGT TACTCTCCCA TTCGGTTCTG 480
CGCACCTACC TCCTCCTAGC CCAGCCTGCT TGTGGCTCTG GCATCTGCAT CAGCTGGGGT 540
TGGGCTTGGG GCTTTTGCTC AGCTTCCTCC TCCTCTGTCT TAGGCTGTTT GGCTACCTTA 600
ACAAAAACGC CCTACACTAA GTGGCTTAAA TACAGAAATT AGTTGTTTAA CAGTTTTAGA 660
AGTCGGGTGG CTCAACATGA GTATGCTTAC TGCTTGATGT CTGTGGAGGG TCCTCTTCCT 720
CAGAGATGAT ACCAGCTCTC TGTGTCTTGT GTCCTTGTGT AGGGGTGGGG GTGAGGGGTC 780
TCATGGGGCT CGTCAATGAG GGCACTTATC CCTTGTGTGG AGATTCCATG TCCCGACTCA 840
TTCCCTTTAT TGTACCACAC TGGGCAAGGT TTTAGCATTT GAGTTGGGAG GCGCAAGCTT 900
TCACCCAGAA CTTTCTGGGC TCCACATTTA CAGCTGGGCA AGGGGGTGAG TGAAGAGAAG 960
GGACAGATGC CCTCTTGAGT TGGTGTCATT GTCACAGTCT CCGGCCACTG TTGGCTTGCA 1020
AGGCTGGTTT TTCAAAGGAG CCTCTGAAGA GGTCTTCCCT GGGCTTAGCT CAGTTGGAAT 1080
GCAGGATGCA AAGGTCCCAG TTGGGTCTGC AGTCTCCAGA GCTGTGTGGA GACAAGTTGA 1140
GCCGCACCTT TAACCTTCAC ACGGCCCCAA AATTCTGACG TTCAGAATGT GCGAGGCCGG 1200
ACTATGACGA AGGGTGACTG CTCAGAGGCT GTGGCATCTT GGTAAAGACT CATTCCCAAA 1260
GCTGGAGTCC CCCTGCGATG CCTTGAGAAG GCAGCGGTGT GGGATACAGC GCTCTGCTGC 1320
AGTCACAGGA GAACCGGAGG CCGAGACCAG AGAAGGAAGG GGCTACAGGC TGTTGTTCTT 1380
TGGAATTGAA GCATTGGGGA GATAAACCAT GGAAGGATAT TTTAACGTGT TTCATTTAAA 1440
ACACTCCCAA TAACTAAGGA ATTCCTTCCA GCAGGCTCTC TGGGATGCTT TCTGAGGTCA 1500
GGAAACTGTA AACACTCCCC TTAGGGCTGT GGGAGAGGCT GGGAAACTTA GCTCCTTTTC 1560
AGTTCTCATC TTACACCTCC CAGGTGTCCC CAGCTGCTCA GCCTGCAAGT GTTAGGGTCA 1620
CCCCAGGGTC ACTGTCAGGG CCTTAGATGA GGGCAGAGCC CGAGGTGCAG AGGCATTGGT 1680
GGCCTGAGGT CTTTTTGTCA CACCCTGCTT GACAAGGGAT GGATTTGACT GACTTTCAGT 1740
CCATACTGGC TTCTGCTAAC AGAAGAGAAT AATATGTTTA AAACTCTGGC CTTTCTGATG 1800
CTCAAAAACC TGCCACACCT CTGTCCATTC CCCGCTTTTT AAGGCAGAGT CTCAGTGTGT 1860
AGCCAAGGCT TCTGCCCTCA TCTCCTGCCT TCTGGATCCC TGGTATGTCC TGCCATGCTC 1920
AACCTACCCC ATCTTTTTGT GTGTCTATGT ATTGGGGGGG GGGGGAGGAA GCATGTGTAT 1980
AGGGACATAT GTGCACATGT GTGTATGGAG GTCAGAGGTC AACCTCGAGT GATGTACCTT 2040
CCATGTCATT CACCTTGGGG TATCTTTGGC TGGTTGGCTG GTGTTTGGTT TGCTTTGTTT 2100
TTGTGACACG GTCTCTAATG GGAGTCCAGG GCTTGCTGGG TAGGCTAGGC TTGCTGTCTA 2160
GTGAGCCCCA GGAATCTATC TGTCGCTGCC TCCCCAGTGC TGTCATTACA AGCACACTAC 2220
CTACCACATC CATAGTTCCA GATTGAACTT TGGTCCTCAA GCTTGCACTA CCCACTGAAC 2280
CATCTTATCT CCCAATTCTC CCCCCCATCC TTTAAAGACG ATTTGAGATG AGCTGGGTGG 2340
TGGTGGCATG TGACTTTAAT CCCAGCACTC AGGAAGCAGA GGCAGGTGGA TCTCTAAATT 2400
TGAGACCACT CTAGAGTGAG TTTCAGGATA GCCAGGGGCT ACACAGAGAA ACCCTGCCTT 2460
GGGAAAAAAG AAAACAATGA TTTAAGATGA AGTGTGCATT CTTCCCCGGA GCCCCCTCCC 2520
CCAGCTCGCT TCTTCTGCCA GTTGTCTTTC TAACTTGTAT CTTCCCTTTG CTTTAGGCTC 2580
GGCGCATCCC CTCCTGTGCT CACCCTCTGT CATCCTCTCC TGAGCACACC TGGTCTTGCA 2640
GCTCCCCGTG CCTCAGCAGT GAACCCTGCA TCTCTGGCTC TTGTTTTGAA TTGGTTTTCC 2700
AAACTTGATT GAGAATTCCT 2720