EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-20570 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr7:87335820-87338150 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NFKB1MA0105.4chr7:87336485-87336498GGGGGGATCCCCT-6.06
NFKB2MA0778.1chr7:87336485-87336498GGGGGGATCCCCT-6.02
RARAMA0729.1chr7:87336232-87336250CCTTAACCTTCTGACCCC-6.42
Number of super-enhancer constituents: 9             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00390chr7:87327010-87355132pro-B_Cells
mSE_02903chr7:87335641-87354478HFSCs
mSE_03093chr7:87334119-87360425TACs
mSE_03342chr7:87335787-87338028Bone_Marrow
mSE_06038chr7:87335854-87338297E14.5_Liver
mSE_07163chr7:87335300-87338320Intestine
mSE_08112chr7:87335230-87338193Kidney
mSE_10067chr7:87329292-87338224Embryonic_stem_cells
mSE_11993chr7:87335827-87338281Spleen
Enhancer Sequence
GAAACTTTGG AGCTAAAGAG CTCCTCTTCT GTGGGAAGGA AGAGGGAACT GAGGAGCCTC 60
AAGTCTCTGG GAAGGAAGCT TGGTTTTCTG GGGACTGAGG CATGGCGCTG GCCTTCATAA 120
GAGGTCTGGG GGTCAGAGTA AAGTGGATCT AGAGGGAAGA ATTTGATGGC AAATTGGAAG 180
AGAGGTTTTT ATTTTTCAAT CTTTACTCTT TTGAGATAGG GTCTTGCTAA GTAGTTCTGG 240
CTGGCCTGGA ACTCAATCTG TGACCTAGGC TGGCCTTGGG ATTTACAGGT ATCCTCCTGC 300
CTCAGCCCCT CAAGGACCAC AAGCATGAGC CTGTGTCTGG CTCTTTGACT TGAGATCTTG 360
AGTTGAGAAC ATGGTTTCCT AAGCTGGACT GGAGGCTGAG CCTCTGCTAG GTCCTTAACC 420
TTCTGACCCC ATCCCCACCT GGCCTAGGAT CCCGCCTTCC CGCCTGAGTA GCTGCAGCTA 480
TCTGAGAGCG ATCTGTCAGT TTCAGGGGTC ACCCCTGTCC CCCTGACTGG GCAGGCCTAT 540
AGTCACAGAC AGCACCTCCT GAACTCCTGT AGGGAGCACA GGAGTGACAG TGGCAATTTC 600
ATGTTTCACC CTGTCTGGGC AGGGACAGGC TGAGCCCTGC TGGTTGCACC ACAGCCCTGT 660
AGAGTGGGGG GATCCCCTCC CAGGGAGTGG CCAGCTCAGG TCCTAACAGG CCCAGTGGGG 720
GCGGCGCTGT GTGGTGGGCT GCTTGCCACA GTAGGCACGC CCAGGGCTTG GGCTGGGCGG 780
GCTGGTTCCT TCTCTTCAGG AGAGTTGCAG CCTCAGCACC ACGTATGCAG GAGGCAGCTG 840
AACCTGAGGG AGGACTAGGA AGGGGCTTGC TTCTCCAAGG GCTTCTAAGA TGTCAAGGCC 900
ATGGGGTTCC TTTCAGATGG AGAGTCTATA CCAGCCTGGG ACATGGGGCG TTCACTCTGC 960
ACAGTGTGCT GTCTTTATAG GTGCTATCTT GTCATGTTCC CTAACCATGT CATAAAGGAC 1020
TATATATAGT ATTACTATCA CAGGAGAAGC AGCTAACTAT GGTCCACTTA GGACCCGTAT 1080
ATAATGGGTA GTGATGCATT CTTCTCTATT GTATGCTCCG CCACTGAATT CTACCTTTTT 1140
ACGGGGCACA TATTCTGGGT AGGGAGTGGG GAGCACAGCA AAGGGCCTGT AGGGAGAAGC 1200
TGGTTTGGGA AGAAATGGGG CAGTTGTCAG ACCCCATGGA AAGCTTTCTG AGAGAGCTGA 1260
AGACAGTGTT GATTCTGACC CTGGATGGGT GCCCTCTACT GCAGAGGGTG CTGCCTTTCC 1320
CAAGGAAGTG CCCAGCTCTC AGGCCTGGCA ATCATTGGAA GATTTAAAAG CACACACGGA 1380
CTGTGTCTGC TGCTGTGACT TCCTCATGTA AATGTACTGC TGCTGCAGCC CAAGTTGCTG 1440
CCTGGCCCCT GGGGAGGAGA CATAGCCTCG TGCCTAACCG GGGCAGGGTG GGGAACCGCA 1500
GCTGCAGGTT GGCATAAGAA GAGGGCTCGG GGCTACGAGG GGATGGTGGC AGGGGGCCAG 1560
GGCCTAGACA GCTGGGCCAC AGCCAGTTCA CATCTGAGAG ACCTTGCTAG GCAGCCTGCC 1620
AGTCTGTACG CGGTGGTGGG GGAAGGGGTG GGAGGAGCCT GAATGTTGCC CAAGGAAGGG 1680
TGGGCGGGAC CTTTGGGTTC AAGCTCCACT GGGCTTGGCA GGAGGCTCCT CCCCCGCATG 1740
GCCACAAACA AAGCTACAAC TCCAGAGTAA CTGTGGGAGT CCAGCGCCTA GCTCCCCTGG 1800
GTGGGAGTCA GAGGGGGCAG ACCTGGCAAG AGCCCTTTGG CAGGTTTCCT GCATGCCCAA 1860
GGACATCTTA CTGCGTGCAC CTGGGCAGAG GCTGAGGGGC GAGTGTGGAC TGTGATAGGC 1920
TGGCTGTGAG GCAGCGAGAG GGGAGGCTCA GGCAGATGTG TTCGCTCTTT TTCTGGTTTC 1980
AGTCTTTCTT GCCATAATTT CCTCTTTCTT CTCTTGAGGC TTTCTACTAC TGTTCTGTCA 2040
GTGTGTGTTT CTTCCACTTG GTTCTTCAGT CCTGGTCTGC TCCCCTACTC CCTCGTTTTT 2100
TACCTCCCAT GCTAACAGGT ATAAAATACA AGCTTCTAGC GGGACACAGT GGCACACCCT 2160
ACATTCCCAG CACTGAGAAG GCGGAGGCAG AAGATCTAGA GTACAAGGCC AGTGTGGGTT 2220
ATATAGCAAG TTTTAGGCCA CCTTGGCCTA TGTAAGTGAG ACTATCAAAA ACCAAAGAGC 2280
TTAAATAAAG CAAAATGCAT AGATCTTAAG ATCATAAAGC TCAGTACAGG 2330