EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-20561 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr7:87010850-87011830 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EsrraMA0592.2chr7:87010949-87010960ATGACCTTGAA-6.62
EsrrgMA0643.1chr7:87010949-87010959ATGACCTTGA-6.02
HNF4GMA0484.1chr7:87010920-87010935TGGACTTTGAACTCC-7.28
Hnf4aMA0114.3chr7:87010918-87010934GGTGGACTTTGAACTC-7.09
IRF1MA0050.2chr7:87011141-87011162ACTTACTTTCTTTTTTTATTT+6.51
Nr5a2MA0505.1chr7:87010948-87010963GATGACCTTGAACTT-8.12
RFX1MA0509.2chr7:87011616-87011632TGTTACTATGGTAACT+6.35
RFX1MA0509.2chr7:87011616-87011632TGTTACTATGGTAACT-6.35
RFX2MA0600.2chr7:87011616-87011632TGTTACTATGGTAACT-6.56
RFX2MA0600.2chr7:87011616-87011632TGTTACTATGGTAACT+6.58
RFX3MA0798.1chr7:87011616-87011632TGTTACTATGGTAACT+6.2
RFX3MA0798.1chr7:87011616-87011632TGTTACTATGGTAACT-6.48
RFX4MA0799.1chr7:87011616-87011632TGTTACTATGGTAACT-6.07
RFX4MA0799.1chr7:87011616-87011632TGTTACTATGGTAACT+6.44
RFX5MA0510.2chr7:87011616-87011632TGTTACTATGGTAACT-6.81
RFX5MA0510.2chr7:87011616-87011632TGTTACTATGGTAACT+6.86
Enhancer Sequence
CTGCTCTGTC CTATTCCCTA GCCCACTTTT ACTCTTATTA CTTTAAAGAT ATTCTCTTTT 60
GTATCCCAGG TGGACTTTGA ACTCCTTATG TAGCTAAGGA TGACCTTGAA CTTCTGACTC 120
ACCCGTGTCT TTCTTCTGCG TACTGGCCGT ACAGATATGT GTCACCACAC CCTGGGTTAT 180
GTGGTACTCC AAGGGAACCC AGGGTGTTTG CATGCTAGGC GAGTGCTCTC CCAAGCTCTT 240
CCCCACCTTT GCTTTTAGGA AACTCTAGTT AGTTTGCTTG TTTCTTTGAA GACTTACTTT 300
CTTTTTTTAT TTTTTTAAAA GAATTTATTT TTTGTATATG AGTACACTGT AGCTGTCTTC 360
AGACACACCA GATCTCATTA CAGATGGTTG TGAGCTACCA TGTGGTTGCT GGGAATTGAA 420
CTCAGGCCCT CTGGAAGAGC AGTCCGTGCT CTCAACCGCT GAGCCATCTC TCCAGGCTGA 480
CTTACTTTAT TTTTCATTAT GTATGTGTAT GTGTTTTGGT ACAGGTGAGG TCAGAAGAGG 540
TGCTGCATTC CTGGAGCTGG AGTTTTATGG GTGACTGCAA ACTCTCCAGC CCTTGTTTTC 600
AATAAACTTT AAGTATAAGC ATCTCTAGTT TAATTTTTCA CAATGGCTGT GCTGAACCCA 660
TGAACCCATG AAATGGTGGA ATTTTAACAA GCCACTGTCC CAAGCACATT CAAGCTGGGC 720
CCCAGCACCT CACTATACCT TGTTGGGTCT CCCTTCCCAA GGCCGTTGTT ACTATGGTAA 780
CTCTAGGACC AGACCTCTGC ACATCAACAG CACCCCCTCC CCCCACTTTC CACCCCATTA 840
AACTCTTTTG GAATGCTAGG CATATGTAGA AGCTGCCTCT GGCATAATGC CCTGTAACCT 900
GGAGACCCCT GGTCTGCCAG TCAAATACCA TTACAAAGCT GAGGTGGTAG CACATGTCTG 960
TAATTCCAGT GTGAGGCAGG 980