EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-20293 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr7:52568430-52569570 
Target genes
Number: 59             
NameEnsembl ID
Nr1h2ENSMUSG00000060601
Vrk3ENSMUSG00000002205
Akt1s1ENSMUSG00000011096
Tbc1d17ENSMUSG00000038520
PnkpENSMUSG00000002963
Ptov1ENSMUSG00000038502
Med25ENSMUSG00000002968
Ap2a1ENSMUSG00000060279
Cpt1cENSMUSG00000007783
Prmt1ENSMUSG00000052429
Irf3ENSMUSG00000003184
Bcl2l12ENSMUSG00000003190
Scaf1ENSMUSG00000038406
RrasENSMUSG00000038387
Prr12ENSMUSG00000046574
NosipENSMUSG00000003421
Prrg2ENSMUSG00000007837
Rcn3ENSMUSG00000019539
Rps11ENSMUSG00000003429
Rpl13aENSMUSG00000074129
Flt3lENSMUSG00000089989
Pih1d1ENSMUSG00000003423
Aldh16a1ENSMUSG00000007833
Ccdc155ENSMUSG00000038292
Dkkl1ENSMUSG00000030792
Tead2ENSMUSG00000030796
Cd37ENSMUSG00000030798
Rpl14ENSMUSG00000046721
Trpm4ENSMUSG00000038260
HrcENSMUSG00000038239
Ppfia3ENSMUSG00000003863
Mtag2ENSMUSG00000091510
Lin7bENSMUSG00000003872
SNORA67ENSMUSG00000084519
Snrnp70ENSMUSG00000063511
Kcna7ENSMUSG00000038201
Ntf5ENSMUSG00000074121
Gys1ENSMUSG00000003865
Ruvbl2ENSMUSG00000003868
AC151602.1ENSMUSG00000076036
Ftl1ENSMUSG00000050708
BaxENSMUSG00000003873
Tulp2ENSMUSG00000023467
DhdhENSMUSG00000011382
Nucb1ENSMUSG00000030824
Ppp1r15aENSMUSG00000040435
Plekha4ENSMUSG00000040428
Hsd17b14ENSMUSG00000030825
Bcat2ENSMUSG00000030826
0610005C13RikENSMUSG00000085214
Rasip1ENSMUSG00000044562
Gm16047ENSMUSG00000084882
MamstrENSMUSG00000042918
Rpl18ENSMUSG00000059070
Sphk2ENSMUSG00000057342
Sult2b1ENSMUSG00000003271
Cyth2ENSMUSG00000003269
Grwd1ENSMUSG00000053801
Kdelr1ENSMUSG00000002778
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BATF3MA0835.1chr7:52569416-52569430TGATGACATCATCC+6.1
JUNMA0488.1chr7:52569418-52569431ATGACATCATCCT-7.34
JUND(var.2)MA0492.1chr7:52569417-52569432GATGACATCATCCTT-7.99
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_07504chr7:52567318-52570292Intestine
Enhancer Sequence
CACATGTACA CACATAATTA AAAATAAAAT CTTTTAAAGT GTCTAAAGGG TTAAACCAGC 60
ACAGCTTGCC AGTCACTTGT CCCAGAGTCT TTCTCTGCCC CAGGGAGTCT GAGTCACTTG 120
AAGGAGAGGG AAAGATTAAT TATCTCCTAA ATGATACAAT ACGATACAGT TTACTTTTGT 180
TTCCCTGGAG ACCGCAATCC TACTCCTCCA CATGCAACCT GCCCGATTTT CTGACTCCTA 240
ACTCAGAAAA ACAATCTTTC CTTCTCCGTT TCTTTGTCTT TGTTTGTTTT GGATTCTTCC 300
CAAAGCCTAG ACTTAATTTC CTTGGTGCTC TGGGCCACCC GTCCCTTCTC ACCAGCATGC 360
TACTGTTTTC TAACCTCCCC AGCAAAAGGA GTGGCTTCCT CCCTTCCTCT TCATAGTCGC 420
CTGCTCTGTT CCTTTTCTCT CAGCATCTAA TAAAAGGGTC CCAAGCTTCC TTCTGAGTCC 480
ATTTCAAAAT CGTTTTATCA GCCAGACTAA GACGTGAGAG GTTGGGGTTT GATGTCTCCT 540
TCAGTCGTTT TCACTCTTAT TTTTAAACAC AGGACTTGCT GATTCGGCTA TCCCGACTGG 600
CCCACAACAC CCCAGGGACC CTTCCTTCTC TGTCTAGCAG CACTAGTGCA GGCATGCGTT 660
GCCACACCTT AGATTTTATT ACAGAGGCTG GGAGTCTGAA CTCAGCTCTT TATGCTTGTG 720
CGCTAGGCAC CTAACTGGCT GACTCCCCGA GGTTTCCTGT AGGTTTTGTG TTGTTTGGCC 780
TGGGATGGAA CCTAGGGCTA TGAGGAGCTT AGACAAATAC TTAGCAACTA TACGTATTGA 840
GCCTGGTCTT TAAAAGATCT CCATGGGGAC TGCAACATAG TGACAGGGCA AGAGCCCCAG 900
GGACAGAAAC ATAATAGAAA AGTGAATAAA TACTAAGTAA CCAACAGCAA GGGAGCGCAG 960
GTCGCCCAAC CCAAACTAAG TTCTTGTGAT GACATCATCC TTCTGCCCCT GGCGCTCTGC 1020
ACTCCAATGG GTGAACTAAG AAAGGTGGAA GTCAGGAGCA TTTAAGAATT GTTTCTCCAG 1080
GGCTGGAGAG AGGCCCAGCA GTTAAGAGCA CTGACTGTGC TTCCAGAGGT CCTGGGTTCA 1140